MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010159	CAT	2	6	105191	105196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418263
2003	NC_010159	CAGT	2	8	105197	105204	25 %	25 %	25 %	25 %	162418263
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2006	NC_010159	CGA	2	6	105359	105364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418263
2007	NC_010159	CGC	2	6	105393	105398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418263
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2012	NC_010159	ATA	2	6	105703	105708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418263
2013	NC_010159	ACAG	2	8	105716	105723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2014	NC_010159	T	6	6	105905	105910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_010159	TACA	2	8	106047	106054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_010159	TCG	2	6	106094	106099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_010159	TCA	2	6	106143	106148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2021	NC_010159	GCA	2	6	106233	106238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_010159	ATG	2	6	106279	106284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2126	NC_010159	CTT	2	6	111835	111840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_010159	T	6	6	111923	111928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_010159	AAC	2	6	111940	111945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_010159	GC	3	6	111953	111958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2130	NC_010159	GGT	2	6	111976	111981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_010159	TAT	2	6	111996	112001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_010159	TAT	2	6	112010	112015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_010159	ATTC	2	8	112060	112067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2134	NC_010159	TGA	2	6	112074	112079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_010159	T	6	6	112082	112087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_010159	GCT	2	6	112099	112104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_010159	GTA	2	6	112114	112119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_010159	TATCGG	2	12	112159	112170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162421432
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2149	NC_010159	TAT	2	6	112774	112779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2156	NC_010159	GTA	2	6	113163	113168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418907
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2179	NC_010159	TAA	2	6	114417	114422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2181	NC_010159	ATA	2	6	114477	114482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2242	NC_010159	ATG	2	6	117462	117467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2246	NC_010159	TCA	2	6	117691	117696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420014
2247	NC_010159	CAT	2	6	117773	117778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420014
2248	NC_010159	G	7	7	117798	117804	0 %	0 %	100 %	0 %	162420014
2249	NC_010159	ACG	2	6	117900	117905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420014
2250	NC_010159	GCG	2	6	118021	118026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420014
2251	NC_010159	GCT	2	6	118106	118111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420014
2252	NC_010159	CTT	2	6	118112	118117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420014
2253	NC_010159	AGC	2	6	118150	118155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420014
2254	NC_010159	TAA	2	6	118187	118192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420014
2255	NC_010159	TCC	2	6	118196	118201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420014
2256	NC_010159	TTAC	2	8	118296	118303	25 %	50 %	0 %	25 %	162421874
2257	NC_010159	CA	3	6	118578	118583	50 %	0 %	0 %	50 %	162421874
2258	NC_010159	TTG	2	6	118775	118780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421874
2259	NC_010159	A	8	8	118898	118905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_010159	TTA	2	6	118949	118954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2261	NC_010159	GGTA	2	8	118984	118991	25 %	25 %	50 %	0 %	162419256
2262	NC_010159	TCG	2	6	119002	119007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419256
2263	NC_010159	CCA	2	6	119011	119016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419256
2264	NC_010159	TTC	2	6	119109	119114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419256
2265	NC_010159	GCA	2	6	119135	119140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419256
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2267	NC_010159	T	6	6	119291	119296	0 %	100 %	0 %	0 %	162419256
2268	NC_010159	CAAC	2	8	119366	119373	50 %	0 %	0 %	50 %	162419256
2269	NC_010159	AC	4	8	119480	119487	50 %	0 %	0 %	50 %	162419256
2270	NC_010159	GTT	2	6	119507	119512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419256
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2272	NC_010159	TTA	2	6	119605	119610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419256
2273	NC_010159	TCG	2	6	119620	119625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419256
2274	NC_010159	GTT	2	6	119626	119631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419256
2275	NC_010159	T	6	6	119682	119687	0 %	100 %	0 %	0 %	162419256
2276	NC_010159	CTT	2	6	119690	119695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419256
2277	NC_010159	TTAA	2	8	119719	119726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2278	NC_010159	A	6	6	119725	119730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2279	NC_010159	TTG	2	6	119761	119766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2280	NC_010159	ATT	2	6	119773	119778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2281	NC_010159	TATCT	2	10	119814	119823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2282	NC_010159	GCC	2	6	119915	119920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421601
2283	NC_010159	TGTCA	2	10	119927	119936	20 %	40 %	20 %	20 %	162421601
2284	NC_010159	TGT	2	6	119991	119996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421601
2285	NC_010159	GTT	2	6	120019	120024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421601
2286	NC_010159	TGG	2	6	120045	120050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421601
2287	NC_010159	ATT	2	6	120179	120184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421601
2288	NC_010159	TGC	2	6	120189	120194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421601
2289	NC_010159	ATC	2	6	120369	120374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421601
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2291	NC_010159	AAC	2	6	120702	120707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421601
2292	NC_010159	CAT	2	6	120750	120755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421601
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2296	NC_010159	CAA	2	6	120988	120993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420661
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2302	NC_010159	ATAA	2	8	121610	121617	75 %	25 %	0 %	0 %	162420661
2303	NC_010159	TAA	2	6	121873	121878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420661
2304	NC_010159	ATA	2	6	121965	121970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420661
2305	NC_010159	CCAC	2	8	122028	122035	25 %	0 %	0 %	75 %	162420661
2306	NC_010159	ATT	2	6	122036	122041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420661
2307	NC_010159	CTTG	2	8	122071	122078	0 %	50 %	25 %	25 %	162420661
2308	NC_010159	GA	3	6	122160	122165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2309	NC_010159	CAT	2	6	122200	122205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2310	NC_010159	TG	3	6	122246	122251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2311	NC_010159	GTT	2	6	122297	122302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2312	NC_010159	CAA	2	6	122388	122393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421065
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2327	NC_010159	TGC	2	6	122987	122992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421065
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2331	NC_010159	ACT	2	6	123140	123145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420303
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2335	NC_010159	ATT	2	6	123554	123559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2336	NC_010159	CAG	2	6	123577	123582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420223
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2350	NC_010159	TCA	2	6	124499	124504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420223
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2353	NC_010159	GAT	2	6	124696	124701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2354	NC_010159	ATTT	2	8	124968	124975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2355	NC_010159	TAC	2	6	125073	125078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2356	NC_010159	CT	3	6	125119	125124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2357	NC_010159	A	6	6	125154	125159	100 %	0 %	0 %	0 %	162420666
2358	NC_010159	GCT	2	6	125165	125170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420666
2359	NC_010159	CTGG	2	8	125197	125204	0 %	25 %	50 %	25 %	162420666
2360	NC_010159	TAA	2	6	125213	125218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420666
2361	NC_010159	CAC	2	6	125219	125224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420666
2362	NC_010159	ACA	2	6	125227	125232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420666
2363	NC_010159	ATG	2	6	125233	125238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420666
2364	NC_010159	AGT	2	6	125277	125282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420666
2365	NC_010159	ATG	2	6	125347	125352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420666
2366	NC_010159	CGC	2	6	125358	125363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420666
2367	NC_010159	TTTA	2	8	125414	125421	25 %	75 %	0 %	0 %	162420666
2368	NC_010159	TCAA	2	8	125473	125480	50 %	25 %	0 %	25 %	162420666
2369	NC_010159	CTG	2	6	125641	125646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420666
2370	NC_010159	ATG	2	6	125674	125679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420666
2371	NC_010159	ACG	2	6	125709	125714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420666
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2496	NC_010159	CGT	2	6	133300	133305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2498	NC_010159	GGC	2	6	133373	133378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2499	NC_010159	GGT	2	6	133387	133392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_010159	ATG	2	6	133562	133567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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