MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010159	GTG	2	6	53575	53580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420613
1002	NC_010159	GT	3	6	53747	53752	0 %	50 %	50 %	0 %	162420613
1003	NC_010159	AGCC	2	8	53788	53795	25 %	0 %	25 %	50 %	162420613
1004	NC_010159	TTC	2	6	53816	53821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420613
1005	NC_010159	A	7	7	53844	53850	100 %	0 %	0 %	0 %	162420613
1006	NC_010159	GGCGG	2	10	53883	53892	0 %	0 %	80 %	20 %	162420613
1007	NC_010159	G	6	6	53950	53955	0 %	0 %	100 %	0 %	162420613
1008	NC_010159	CTT	2	6	53968	53973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420613
1009	NC_010159	ATTT	2	8	54021	54028	25 %	75 %	0 %	0 %	162420613
1010	NC_010159	AT	3	6	54042	54047	50 %	50 %	0 %	0 %	162420613
1011	NC_010159	GTT	2	6	54084	54089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420613
1012	NC_010159	GATG	2	8	54096	54103	25 %	25 %	50 %	0 %	162420613
1013	NC_010159	CCA	2	6	54105	54110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420613
1014	NC_010159	GCAA	2	8	54111	54118	50 %	0 %	25 %	25 %	162420613
1015	NC_010159	GGGTG	2	10	54123	54132	0 %	20 %	80 %	0 %	162420613
1016	NC_010159	TCTCCG	2	12	54172	54183	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162420613
1017	NC_010159	CAA	2	6	54230	54235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420613
1018	NC_010159	TGT	2	6	54321	54326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420613
1019	NC_010159	CAC	2	6	54353	54358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420613
1020	NC_010159	AGG	2	6	54395	54400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162420613
1021	NC_010159	GGCA	2	8	54419	54426	25 %	0 %	50 %	25 %	162420613
1022	NC_010159	GGT	2	6	54528	54533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420613
1023	NC_010159	TGA	2	6	54558	54563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420613
1024	NC_010159	TCG	2	6	54573	54578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420613
1025	NC_010159	G	6	6	54820	54825	0 %	0 %	100 %	0 %	162420613
1026	NC_010159	GGC	2	6	54835	54840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420613
1027	NC_010159	GGC	2	6	54847	54852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420613
1028	NC_010159	TTAA	2	8	54880	54887	50 %	50 %	0 %	0 %	162420613
1029	NC_010159	TTA	2	6	54904	54909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420613
1030	NC_010159	A	6	6	54962	54967	100 %	0 %	0 %	0 %	162420613
1031	NC_010159	AGC	2	6	54992	54997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420613
1032	NC_010159	GTTG	2	8	55010	55017	0 %	50 %	50 %	0 %	162420613
1033	NC_010159	GTT	2	6	55039	55044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420613
1034	NC_010159	CCA	2	6	55097	55102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420613
1035	NC_010159	GTT	2	6	55198	55203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420613
1036	NC_010159	TCC	2	6	55226	55231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_010159	CAGG	2	8	55273	55280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_010159	TGA	2	6	55323	55328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010159	TAATGA	2	12	55332	55343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010159	GCG	2	6	55359	55364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010159	TTTC	2	8	55419	55426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_010159	GTA	2	6	55464	55469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010159	CCA	2	6	55472	55477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_010159	CGG	2	6	55494	55499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010159	AAT	2	6	55510	55515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010159	AAT	2	6	55552	55557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010159	TCA	2	6	55614	55619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_010159	GGT	2	6	55633	55638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010159	CGA	2	6	55656	55661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010159	CCAA	2	8	55687	55694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_010159	AAT	3	9	55756	55764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010159	GGC	2	6	55785	55790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010159	AAT	2	6	55834	55839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010159	GTTA	2	8	55952	55959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010159	CATT	2	8	55979	55986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_010159	ATTT	2	8	55989	55996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010159	A	7	7	56001	56007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010159	TCA	2	6	56049	56054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010159	AAT	2	6	56149	56154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010159	AATC	2	8	56165	56172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_010159	T	6	6	56231	56236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010159	TCAA	2	8	56297	56304	50 %	25 %	0 %	25 %	162421145
1063	NC_010159	CAT	2	6	56389	56394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421145
1064	NC_010159	GGC	3	9	56403	56411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421145
1065	NC_010159	CTT	2	6	56418	56423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421145
1066	NC_010159	TCT	2	6	56424	56429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421145
1067	NC_010159	TGT	2	6	56436	56441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421145
1068	NC_010159	CTT	2	6	56553	56558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421145
1069	NC_010159	GCT	2	6	56652	56657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421145
1070	NC_010159	TGC	2	6	56674	56679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421145
1071	NC_010159	CAG	2	6	56772	56777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421145
1072	NC_010159	TCA	2	6	56825	56830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421145
1073	NC_010159	AACT	2	8	56860	56867	50 %	25 %	0 %	25 %	162421145
1074	NC_010159	TGC	2	6	57114	57119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421145
1075	NC_010159	ATC	2	6	57122	57127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421145
1076	NC_010159	AAAGA	2	10	57144	57153	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010159	G	6	6	57155	57160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010159	CAG	2	6	57260	57265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421592
1079	NC_010159	AGC	2	6	57270	57275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421592
1080	NC_010159	CAA	2	6	57277	57282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421592
1081	NC_010159	GTTG	2	8	57336	57343	0 %	50 %	50 %	0 %	162421592
1082	NC_010159	GAA	2	6	57382	57387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421592
1083	NC_010159	GC	3	6	57475	57480	0 %	0 %	50 %	50 %	162421592
1084	NC_010159	TGG	2	6	57618	57623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421592
1085	NC_010159	GTG	2	6	57644	57649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421592
1086	NC_010159	TGC	2	6	57729	57734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421592
1087	NC_010159	TGTC	2	8	57737	57744	0 %	50 %	25 %	25 %	162421592
1088	NC_010159	AGA	2	6	57786	57791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421592
1089	NC_010159	TGA	2	6	57821	57826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421592
1090	NC_010159	GAT	2	6	57840	57845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421592
1091	NC_010159	GAA	2	6	57886	57891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421592
1092	NC_010159	GGC	2	6	57951	57956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421592
1093	NC_010159	TTA	2	6	57972	57977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010159	T	7	7	57995	58001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010159	CAA	2	6	58119	58124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420108
1096	NC_010159	TG	3	6	58316	58321	0 %	50 %	50 %	0 %	162420108
1097	NC_010159	GTAA	2	8	58596	58603	50 %	25 %	25 %	0 %	162420108
1098	NC_010159	GGA	2	6	58698	58703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010159	TATT	2	8	58704	58711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010159	TTA	2	6	58804	58809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010159	GGAGA	2	10	58829	58838	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010159	TTC	2	6	58945	58950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420480
1103	NC_010159	GTT	2	6	58959	58964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420480
1104	NC_010159	TGC	3	9	59004	59012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420480
1105	NC_010159	ACA	2	6	59080	59085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420480
1106	NC_010159	CCG	2	6	59087	59092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420480
1107	NC_010159	CAT	2	6	59107	59112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420480
1108	NC_010159	AAG	2	6	59144	59149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420480
1109	NC_010159	GAT	2	6	59215	59220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420480
1110	NC_010159	CCG	2	6	59228	59233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420480
1111	NC_010159	TGA	2	6	59294	59299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420480
1112	NC_010159	GCGTGG	2	12	59319	59330	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	162420480
1113	NC_010159	ATG	2	6	59399	59404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420480
1114	NC_010159	TGG	2	6	59447	59452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420480
1115	NC_010159	TAA	2	6	59503	59508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010159	TC	3	6	59579	59584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_010159	CAAT	2	8	59645	59652	50 %	25 %	0 %	25 %	162419507
1118	NC_010159	GAAC	2	8	59698	59705	50 %	0 %	25 %	25 %	162419507
1119	NC_010159	CAA	2	6	59736	59741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419507
1120	NC_010159	TCA	2	6	59761	59766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419507
1121	NC_010159	CAG	2	6	59946	59951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419507
1122	NC_010159	GCT	2	6	60085	60090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419507
1123	NC_010159	GCG	2	6	60109	60114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419507
1124	NC_010159	GTA	2	6	60124	60129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419507
1125	NC_010159	TTTTCT	2	12	60208	60219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	162419507
1126	NC_010159	TAA	2	6	60254	60259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010159	GGC	2	6	60299	60304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010159	T	6	6	60317	60322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010159	GGTT	2	8	60340	60347	0 %	50 %	50 %	0 %	162419944
1130	NC_010159	ACC	2	6	60370	60375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419944
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1132	NC_010159	GTT	2	6	60659	60664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419944
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1262	NC_010159	TATT	2	8	67280	67287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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