MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010159	A	6	6	27028	27033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010159	TAT	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010159	CT	3	6	27051	27056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_010159	TTG	2	6	27075	27080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010159	AGG	2	6	27321	27326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010159	A	6	6	27393	27398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010159	GCC	2	6	27415	27420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_010159	T	6	6	27421	27426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010159	TCT	2	6	27432	27437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010159	GGC	2	6	27491	27496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010159	TA	3	6	27540	27545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010159	AGC	2	6	27587	27592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420098
513	NC_010159	CAC	2	6	27602	27607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420098
514	NC_010159	AGA	2	6	27652	27657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
515	NC_010159	TGA	2	6	27666	27671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
516	NC_010159	AGA	2	6	27704	27709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
517	NC_010159	GCA	2	6	27752	27757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420098
518	NC_010159	GTA	2	6	27803	27808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
519	NC_010159	GAA	2	6	27904	27909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
520	NC_010159	GCT	2	6	27948	27953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420098
521	NC_010159	AGA	2	6	27987	27992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
522	NC_010159	TGA	2	6	28062	28067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
523	NC_010159	GAT	2	6	28072	28077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
524	NC_010159	GAGAA	2	10	28085	28094	60 %	0 %	40 %	0 %	162420098
525	NC_010159	GGT	2	6	28161	28166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010159	CTA	2	6	28180	28185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_010159	TTA	2	6	28207	28212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010159	GGC	2	6	28223	28228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010159	CGCAA	2	10	28232	28241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
530	NC_010159	ACA	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010159	ATT	2	6	28381	28386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421654
532	NC_010159	CAG	2	6	28455	28460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421654
533	NC_010159	TGA	2	6	28577	28582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421654
534	NC_010159	TGG	2	6	28588	28593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421654
535	NC_010159	GCC	2	6	28620	28625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421654
536	NC_010159	GTCAG	2	10	28639	28648	20 %	20 %	40 %	20 %	162421654
537	NC_010159	G	10	10	28660	28669	0 %	0 %	100 %	0 %	162421654
538	NC_010159	TGC	2	6	28717	28722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421654
539	NC_010159	TTGAT	2	10	28954	28963	20 %	60 %	20 %	0 %	162421654
540	NC_010159	GCTGA	2	10	29019	29028	20 %	20 %	40 %	20 %	162421654
541	NC_010159	GCC	2	6	29079	29084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421654
542	NC_010159	CGG	2	6	29116	29121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421654
543	NC_010159	GCA	2	6	29141	29146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421654
544	NC_010159	GGAT	2	8	29188	29195	25 %	25 %	50 %	0 %	162421654
545	NC_010159	GAT	2	6	29211	29216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421654
546	NC_010159	CAG	2	6	29232	29237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421654
547	NC_010159	TTGGG	2	10	29296	29305	0 %	40 %	60 %	0 %	162421654
548	NC_010159	AGC	2	6	29497	29502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421654
549	NC_010159	ATT	2	6	29524	29529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421654
550	NC_010159	GCT	2	6	29546	29551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421654
551	NC_010159	TGG	2	6	29575	29580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421654
552	NC_010159	C	6	6	29608	29613	0 %	0 %	0 %	100 %	162421654
553	NC_010159	GC	3	6	29673	29678	0 %	0 %	50 %	50 %	162421654
554	NC_010159	AGC	2	6	29680	29685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421654
555	NC_010159	ACT	2	6	29758	29763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421177
556	NC_010159	CAG	2	6	29813	29818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421177
557	NC_010159	TGC	2	6	29822	29827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421177
558	NC_010159	GGT	2	6	29861	29866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421177
559	NC_010159	TGA	2	6	29913	29918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421177
560	NC_010159	AACGC	2	10	29923	29932	40 %	0 %	20 %	40 %	162421177
561	NC_010159	AAT	2	6	30012	30017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421177
562	NC_010159	CTT	2	6	30298	30303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421177
563	NC_010159	CCCGA	2	10	30374	30383	20 %	0 %	20 %	60 %	162421177
564	NC_010159	A	7	7	30456	30462	100 %	0 %	0 %	0 %	162421177
565	NC_010159	GCC	2	6	30573	30578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421177
566	NC_010159	TACCGG	2	12	30649	30660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162421177
567	NC_010159	GAG	2	6	30687	30692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421177
568	NC_010159	ATA	2	6	30747	30752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421177
569	NC_010159	ACTG	2	8	30767	30774	25 %	25 %	25 %	25 %	162421177
570	NC_010159	CGGG	2	8	30783	30790	0 %	0 %	75 %	25 %	162421177
571	NC_010159	TTG	3	9	30791	30799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421177
572	NC_010159	TCG	2	6	30843	30848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421177
573	NC_010159	CGG	2	6	30901	30906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421177
574	NC_010159	ATG	2	6	30933	30938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421177
575	NC_010159	TTTG	2	8	30967	30974	0 %	75 %	25 %	0 %	162421177
576	NC_010159	CCAT	2	8	30987	30994	25 %	25 %	0 %	50 %	162421177
577	NC_010159	AAC	2	6	31017	31022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421177
578	NC_010159	CAGT	2	8	31099	31106	25 %	25 %	25 %	25 %	162421177
579	NC_010159	GC	3	6	31107	31112	0 %	0 %	50 %	50 %	162421177
580	NC_010159	CGA	2	6	31144	31149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421177
581	NC_010159	GT	3	6	31213	31218	0 %	50 %	50 %	0 %	162418453
582	NC_010159	GATA	2	8	31275	31282	50 %	25 %	25 %	0 %	162418453
583	NC_010159	GCC	2	6	31455	31460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418453
584	NC_010159	CAG	2	6	31500	31505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418453
585	NC_010159	TGA	2	6	31627	31632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418453
586	NC_010159	AAT	2	6	31713	31718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418453
587	NC_010159	TAA	2	6	31764	31769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418453
588	NC_010159	TTG	2	6	31848	31853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418453
589	NC_010159	CAA	2	6	31973	31978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418453
590	NC_010159	CT	3	6	32023	32028	0 %	50 %	0 %	50 %	162418453
591	NC_010159	TAA	2	6	32061	32066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418453
592	NC_010159	ATC	3	9	32151	32159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418453
593	NC_010159	CAG	2	6	32163	32168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418453
594	NC_010159	GAT	2	6	32331	32336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010159	ACGAAA	2	12	32338	32349	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
596	NC_010159	AAAT	2	8	32357	32364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010159	TCC	2	6	32366	32371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_010159	TTAC	2	8	32466	32473	25 %	50 %	0 %	25 %	162421858
599	NC_010159	CA	3	6	32748	32753	50 %	0 %	0 %	50 %	162421858
600	NC_010159	TTG	2	6	32945	32950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421858
601	NC_010159	A	6	6	33068	33073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010159	CAA	2	6	33107	33112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010159	GT	3	6	33135	33140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010159	GCT	2	6	33143	33148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010159	TCGC	2	8	33150	33157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
606	NC_010159	ACGC	2	8	33237	33244	25 %	0 %	25 %	50 %	162418660
607	NC_010159	TCT	2	6	33253	33258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418660
608	NC_010159	CAT	2	6	33287	33292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418660
609	NC_010159	CCA	2	6	33304	33309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418660
610	NC_010159	CTT	3	9	33386	33394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418660
611	NC_010159	CGG	2	6	33396	33401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418660
612	NC_010159	TGA	2	6	33449	33454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418660
613	NC_010159	GCCA	2	8	33465	33472	25 %	0 %	25 %	50 %	162418660
614	NC_010159	GCG	2	6	33481	33486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418660
615	NC_010159	CAA	2	6	33554	33559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418660
616	NC_010159	TGG	2	6	33650	33655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418660
617	NC_010159	TGA	2	6	33692	33697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418660
618	NC_010159	CCG	2	6	33700	33705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418660
619	NC_010159	GCC	2	6	33732	33737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418660
620	NC_010159	TTA	2	6	33760	33765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418660
621	NC_010159	TGCG	2	8	33855	33862	0 %	25 %	50 %	25 %	162418660
622	NC_010159	ACG	2	6	33874	33879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418660
623	NC_010159	GTG	3	9	33966	33974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418660
624	NC_010159	ACC	2	6	33982	33987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418660
625	NC_010159	GGA	2	6	34048	34053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162418660
626	NC_010159	GCC	2	6	34098	34103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418660
627	NC_010159	TGC	2	6	34169	34174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418660
628	NC_010159	GAA	2	6	34200	34205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418660
629	NC_010159	TTCTGG	2	12	34206	34217	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	162418660
630	NC_010159	AAC	2	6	34222	34227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418660
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755	NC_010159	GCGA	2	8	40623	40630	25 %	0 %	50 %	25 %	162420449
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