MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010159	CAA	2	6	297988	297993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_010159	TGC	2	6	298023	298028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_010159	ACA	2	6	298029	298034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_010159	GAA	2	6	298047	298052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419761
6005	NC_010159	CTT	2	6	298063	298068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419761
6006	NC_010159	CTGG	2	8	298081	298088	0 %	25 %	50 %	25 %	162419761
6007	NC_010159	TGC	2	6	298118	298123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419761
6008	NC_010159	AAGC	2	8	298132	298139	50 %	0 %	25 %	25 %	162419761
6009	NC_010159	GCT	2	6	298171	298176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419761
6010	NC_010159	A	6	6	298196	298201	100 %	0 %	0 %	0 %	162419761
6011	NC_010159	CT	3	6	298314	298319	0 %	50 %	0 %	50 %	162419761
6012	NC_010159	GC	3	6	298356	298361	0 %	0 %	50 %	50 %	162419761
6013	NC_010159	CT	3	6	298480	298485	0 %	50 %	0 %	50 %	162419761
6014	NC_010159	AAC	2	6	298530	298535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419761
6015	NC_010159	GCC	2	6	298621	298626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419761
6016	NC_010159	TAA	2	6	298629	298634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419761
6017	NC_010159	AG	3	6	298650	298655	50 %	0 %	50 %	0 %	162419761
6018	NC_010159	TAT	2	6	298678	298683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419761
6019	NC_010159	CGT	2	6	298694	298699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419761
6020	NC_010159	TAA	2	6	298740	298745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419761
6021	NC_010159	AAG	2	6	298754	298759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419761
6022	NC_010159	CTTT	2	8	298774	298781	0 %	75 %	0 %	25 %	162419761
6023	NC_010159	AAT	2	6	298927	298932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419761
6024	NC_010159	GGT	2	6	298984	298989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419761
6025	NC_010159	CCA	2	6	298991	298996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419761
6026	NC_010159	GTT	2	6	299043	299048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419761
6027	NC_010159	TCA	2	6	299086	299091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419761
6028	NC_010159	TAA	2	6	299094	299099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419761
6029	NC_010159	CAG	2	6	299115	299120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419761
6030	NC_010159	ACA	2	6	299250	299255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419761
6031	NC_010159	AATC	2	8	299283	299290	50 %	25 %	0 %	25 %	162419761
6032	NC_010159	GCT	2	6	299383	299388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419761
6033	NC_010159	TAC	2	6	299403	299408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419761
6034	NC_010159	TAA	2	6	299447	299452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010159	CAA	2	6	299629	299634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420104
6036	NC_010159	TG	3	6	299826	299831	0 %	50 %	50 %	0 %	162420104
6037	NC_010159	GTAA	2	8	300106	300113	50 %	25 %	25 %	0 %	162420104
6038	NC_010159	GGA	2	6	300208	300213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_010159	TATT	2	8	300214	300221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010159	T	6	6	300220	300225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010159	CCTC	2	8	300227	300234	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6042	NC_010159	AGCA	2	8	300284	300291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_010159	A	6	6	300305	300310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_010159	ATAA	2	8	300446	300453	75 %	25 %	0 %	0 %	162420639
6045	NC_010159	TGA	2	6	300454	300459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420639
6046	NC_010159	ATCA	2	8	300474	300481	50 %	25 %	0 %	25 %	162420639
6047	NC_010159	GCTG	3	12	300554	300565	0 %	25 %	50 %	25 %	162420639
6048	NC_010159	A	6	6	300568	300573	100 %	0 %	0 %	0 %	162420639
6049	NC_010159	TGA	2	6	300605	300610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420639
6050	NC_010159	CAC	2	6	300647	300652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420639
6051	NC_010159	AAG	2	6	300673	300678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420639
6052	NC_010159	TG	3	6	300717	300722	0 %	50 %	50 %	0 %	162420639
6053	NC_010159	GCA	2	6	300804	300809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420639
6054	NC_010159	GCA	2	6	300823	300828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420639
6055	NC_010159	ATG	2	6	300855	300860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420639
6056	NC_010159	GAT	2	6	300866	300871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420639
6057	NC_010159	GCG	2	6	300874	300879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420639
6058	NC_010159	AGCC	2	8	300881	300888	25 %	0 %	25 %	50 %	162420639
6059	NC_010159	CCA	2	6	300970	300975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420639
6060	NC_010159	GTG	2	6	301045	301050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420639
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6062	NC_010159	ACC	2	6	301113	301118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420639
6063	NC_010159	GTTTTC	2	12	301207	301218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	162421886
6064	NC_010159	CATG	2	8	301223	301230	25 %	25 %	25 %	25 %	162421886
6065	NC_010159	TAC	2	6	301257	301262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421886
6066	NC_010159	GAA	2	6	301293	301298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421886
6067	NC_010159	ACC	2	6	301299	301304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421886
6068	NC_010159	TTG	2	6	301391	301396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421886
6069	NC_010159	TCAT	2	8	301409	301416	25 %	50 %	0 %	25 %	162421886
6070	NC_010159	TC	3	6	301434	301439	0 %	50 %	0 %	50 %	162421886
6071	NC_010159	GCT	2	6	301484	301489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421886
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6073	NC_010159	TGC	2	6	301666	301671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421886
6074	NC_010159	CTG	2	6	301679	301684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421886
6075	NC_010159	ATTT	2	8	301834	301841	25 %	75 %	0 %	0 %	162421886
6076	NC_010159	CCA	2	6	301882	301887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421886
6077	NC_010159	GCTG	2	8	301909	301916	0 %	25 %	50 %	25 %	162421886
6078	NC_010159	AGCC	2	8	301918	301925	25 %	0 %	25 %	50 %	162421886
6079	NC_010159	TGT	2	6	301963	301968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421886
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6082	NC_010159	AAG	2	6	302104	302109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421886
6083	NC_010159	GAA	2	6	302136	302141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421886
6084	NC_010159	GAT	2	6	302144	302149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421886
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6086	NC_010159	CCTT	2	8	302333	302340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_010159	GCA	2	6	302374	302379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_010159	AAGT	2	8	302407	302414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_010159	GAGC	2	8	302424	302431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_010159	GCT	2	6	302432	302437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_010159	AAC	2	6	302438	302443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_010159	GCG	2	6	302447	302452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_010159	GCA	2	6	302497	302502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_010159	AAGT	2	8	302530	302537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010159	GCT	2	6	302555	302560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_010159	AAC	2	6	302561	302566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_010159	GCG	2	6	302570	302575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_010159	ACA	2	6	302610	302615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421554
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6100	NC_010159	TGGAT	2	10	302719	302728	20 %	40 %	40 %	0 %	162421554
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6103	NC_010159	CAA	2	6	302892	302897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421554
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6105	NC_010159	TGC	2	6	302920	302925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421554
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6107	NC_010159	TTG	2	6	303094	303099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421554
6108	NC_010159	CCG	2	6	303210	303215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421554
6109	NC_010159	ATC	2	6	303251	303256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421554
6110	NC_010159	TTC	2	6	303310	303315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421554
6111	NC_010159	A	7	7	303396	303402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010159	CTTT	2	8	303439	303446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_010159	ATG	2	6	303468	303473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_010159	AGG	2	6	303505	303510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010159	GGCAT	2	10	303541	303550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6116	NC_010159	GGT	2	6	303569	303574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010159	AGC	2	6	303589	303594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_010159	ATA	2	6	303616	303621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_010159	AAC	3	9	303657	303665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_010159	CAA	2	6	303686	303691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_010159	TAA	2	6	303733	303738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_010159	CCAG	2	8	303753	303760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_010159	CCAG	2	8	303787	303794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_010159	ATA	2	6	303807	303812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_010159	GCC	2	6	303868	303873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419686
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6148	NC_010159	CTG	2	6	304782	304787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6251	NC_010159	TAA	2	6	309642	309647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418328
6252	NC_010159	TGGC	2	8	309667	309674	0 %	25 %	50 %	25 %	162418328
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6285	NC_010159	TA	3	6	311529	311534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6356	NC_010159	GGTA	2	8	315767	315774	25 %	25 %	50 %	0 %	162420138
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6367	NC_010159	A	7	7	316261	316267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6372	NC_010159	AAG	2	6	316406	316411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6497	NC_010159	ACC	2	6	321769	321774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420372
6498	NC_010159	GTAT	2	8	321785	321792	25 %	50 %	25 %	0 %	162420372
6499	NC_010159	ATCA	2	8	321868	321875	50 %	25 %	0 %	25 %	162420372
6500	NC_010159	TTG	2	6	321983	321988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420372

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