MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010159	T	6	6	251108	251113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_010159	AAC	2	6	251132	251137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_010159	T	8	8	251179	251186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010159	CAC	2	6	251230	251235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_010159	ATAG	2	8	251238	251245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010159	A	7	7	251287	251293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010159	AG	3	6	251306	251311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_010159	A	6	6	251331	251336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_010159	ATT	2	6	251415	251420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010159	TATT	2	8	251449	251456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010159	AAG	2	6	251461	251466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010159	GCC	2	6	251478	251483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_010159	CCAAC	2	10	251528	251537	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5014	NC_010159	TGAC	2	8	251549	251556	25 %	25 %	25 %	25 %	162419818
5015	NC_010159	CAA	2	6	251571	251576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419818
5016	NC_010159	A	6	6	251675	251680	100 %	0 %	0 %	0 %	162419818
5017	NC_010159	CAA	2	6	251684	251689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419818
5018	NC_010159	TGA	2	6	251694	251699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419818
5019	NC_010159	AAT	2	6	251797	251802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419818
5020	NC_010159	TGGC	2	8	251828	251835	0 %	25 %	50 %	25 %	162419818
5021	NC_010159	CAT	2	6	251862	251867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419818
5022	NC_010159	GTG	3	9	251884	251892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419818
5023	NC_010159	TAT	2	6	251916	251921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419818
5024	NC_010159	CAT	2	6	251993	251998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418133
5025	NC_010159	CTG	2	6	252009	252014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418133
5026	NC_010159	CTG	2	6	252024	252029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418133
5027	NC_010159	CTG	2	6	252042	252047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418133
5028	NC_010159	AGG	2	6	252052	252057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162418133
5029	NC_010159	G	7	7	252056	252062	0 %	0 %	100 %	0 %	162418133
5030	NC_010159	ATCCTG	2	12	252123	252134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	162418133
5031	NC_010159	TTG	2	6	252150	252155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418133
5032	NC_010159	ATG	2	6	252162	252167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418133
5033	NC_010159	TGA	3	9	252169	252177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418133
5034	NC_010159	TAT	2	6	252194	252199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418133
5035	NC_010159	CCG	2	6	252243	252248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418133
5036	NC_010159	TCGCCC	2	12	252268	252279	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	162418133
5037	NC_010159	TCA	2	6	252317	252322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418133
5038	NC_010159	GAA	2	6	252395	252400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418133
5039	NC_010159	ATG	2	6	252441	252446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418133
5040	NC_010159	CAG	2	6	252477	252482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418133
5041	NC_010159	ATG	3	9	252612	252620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418133
5042	NC_010159	TG	3	6	252670	252675	0 %	50 %	50 %	0 %	162418133
5043	NC_010159	ATG	2	6	252730	252735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419711
5044	NC_010159	TGA	2	6	252785	252790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419711
5045	NC_010159	CCA	2	6	252851	252856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419711
5046	NC_010159	CA	3	6	252855	252860	50 %	0 %	0 %	50 %	162419711
5047	NC_010159	GAT	3	9	252936	252944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419711
5048	NC_010159	GTTG	2	8	252990	252997	0 %	50 %	50 %	0 %	162419711
5049	NC_010159	GGT	2	6	253188	253193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419491
5050	NC_010159	ATG	2	6	253345	253350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419491
5051	NC_010159	CCA	2	6	253358	253363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419491
5052	NC_010159	CGG	2	6	253376	253381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419491
5053	NC_010159	AAT	2	6	253392	253397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419491
5054	NC_010159	GT	3	6	253409	253414	0 %	50 %	50 %	0 %	162419491
5055	NC_010159	T	8	8	253418	253425	0 %	100 %	0 %	0 %	162419491
5056	NC_010159	TTG	2	6	253459	253464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419491
5057	NC_010159	TGT	2	6	253673	253678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419491
5058	NC_010159	CTG	2	6	253684	253689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419491
5059	NC_010159	CTG	3	9	253693	253701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419491
5060	NC_010159	CAG	2	6	253790	253795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420905
5061	NC_010159	A	7	7	253844	253850	100 %	0 %	0 %	0 %	162420905
5062	NC_010159	TTA	2	6	253931	253936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420905
5063	NC_010159	TGA	2	6	253991	253996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420905
5064	NC_010159	GATCCC	2	12	254063	254074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162420905
5065	NC_010159	GTT	2	6	254075	254080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420905
5066	NC_010159	CGG	2	6	254105	254110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420905
5067	NC_010159	ACCTG	2	10	254138	254147	20 %	20 %	20 %	40 %	162420905
5068	NC_010159	GCA	2	6	254230	254235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420905
5069	NC_010159	TGA	2	6	254276	254281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420905
5070	NC_010159	AGA	2	6	254309	254314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420905
5071	NC_010159	ACC	2	6	254341	254346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420905
5072	NC_010159	TTG	2	6	254371	254376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420905
5073	NC_010159	GCC	2	6	254385	254390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420905
5074	NC_010159	TCA	2	6	254408	254413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420905
5075	NC_010159	A	7	7	254424	254430	100 %	0 %	0 %	0 %	162420905
5076	NC_010159	AGG	2	6	254446	254451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162420905
5077	NC_010159	ATG	2	6	254473	254478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420905
5078	NC_010159	TAA	2	6	254540	254545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420905
5079	NC_010159	TTA	3	9	254566	254574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420905
5080	NC_010159	AACCC	2	10	254577	254586	40 %	0 %	0 %	60 %	162420905
5081	NC_010159	GAT	2	6	254655	254660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420905
5082	NC_010159	CCA	2	6	254718	254723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420905
5083	NC_010159	GC	4	8	254727	254734	0 %	0 %	50 %	50 %	162420905
5084	NC_010159	TACCA	2	10	254739	254748	40 %	20 %	0 %	40 %	162420905
5085	NC_010159	GCAA	2	8	254844	254851	50 %	0 %	25 %	25 %	162420905
5086	NC_010159	ATG	2	6	254902	254907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420905
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5088	NC_010159	CCG	2	6	255112	255117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419744
5089	NC_010159	GGT	2	6	255237	255242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419744
5090	NC_010159	TGT	2	6	255258	255263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419744
5091	NC_010159	TGT	2	6	255270	255275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419744
5092	NC_010159	ATC	2	6	255280	255285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419744
5093	NC_010159	TGA	2	6	255287	255292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419744
5094	NC_010159	TCA	2	6	255293	255298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419744
5095	NC_010159	ATTA	2	8	255411	255418	50 %	50 %	0 %	0 %	162419744
5096	NC_010159	AAG	2	6	255446	255451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419744
5097	NC_010159	ATGG	2	8	255481	255488	25 %	25 %	50 %	0 %	162419744
5098	NC_010159	GAT	3	9	255525	255533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419744
5099	NC_010159	GCCA	2	8	255592	255599	25 %	0 %	25 %	50 %	162419744
5100	NC_010159	TGG	2	6	255641	255646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419744
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5102	NC_010159	ATT	2	6	255685	255690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419744
5103	NC_010159	GAGT	2	8	255698	255705	25 %	25 %	50 %	0 %	162419744
5104	NC_010159	GGC	2	6	255709	255714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419744
5105	NC_010159	TGA	2	6	255723	255728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419744
5106	NC_010159	TGC	2	6	255768	255773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419744
5107	NC_010159	CTG	2	6	255847	255852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419744
5108	NC_010159	CGC	2	6	255855	255860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419744
5109	NC_010159	GCA	2	6	255864	255869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419744
5110	NC_010159	A	7	7	255874	255880	100 %	0 %	0 %	0 %	162419744
5111	NC_010159	AGCA	2	8	255884	255891	50 %	0 %	25 %	25 %	162419744
5112	NC_010159	TGG	2	6	256019	256024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419744
5113	NC_010159	ATC	2	6	256075	256080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419744
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5117	NC_010159	TTA	2	6	256429	256434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419744
5118	NC_010159	CCA	2	6	256568	256573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419744
5119	NC_010159	ATT	2	6	256608	256613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419744
5120	NC_010159	GAT	2	6	256672	256677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419744
5121	NC_010159	AAT	2	6	256702	256707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419744
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5123	NC_010159	CAA	2	6	256747	256752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419744
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5247	NC_010159	GTAA	2	8	262983	262990	50 %	25 %	25 %	0 %	162419743
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5251	NC_010159	TGAT	2	8	263194	263201	25 %	50 %	25 %	0 %	162419743
5252	NC_010159	GTA	2	6	263223	263228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419743
5253	NC_010159	ATT	2	6	263238	263243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419743
5254	NC_010159	CAGCA	2	10	263244	263253	40 %	0 %	20 %	40 %	162419743
5255	NC_010159	ATC	2	6	263307	263312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
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5257	NC_010159	ATC	2	6	263421	263426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
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5260	NC_010159	TGT	2	6	263519	263524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419743
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5265	NC_010159	CAT	3	9	263672	263680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
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5270	NC_010159	GTTCA	2	10	263985	263994	20 %	40 %	20 %	20 %	162419743
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5280	NC_010159	GCA	2	6	265025	265030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419743
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5287	NC_010159	ATT	2	6	265324	265329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419743
5288	NC_010159	TAA	2	6	265363	265368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_010159	TGT	2	6	265382	265387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_010159	ATC	2	6	265402	265407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5292	NC_010159	A	6	6	265436	265441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_010159	ACA	2	6	265450	265455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5294	NC_010159	TAA	2	6	265538	265543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_010159	AATA	2	8	265545	265552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5296	NC_010159	T	7	7	265562	265568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5297	NC_010159	ATAAA	2	10	265575	265584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5298	NC_010159	TCC	2	6	265587	265592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5299	NC_010159	TTAC	2	8	265687	265694	25 %	50 %	0 %	25 %	162421105
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5303	NC_010159	CTG	2	6	266307	266312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5306	NC_010159	TAT	2	6	266391	266396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5310	NC_010159	TTCA	2	8	266455	266462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5311	NC_010159	TAT	3	9	266503	266511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421658
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5321	NC_010159	TAT	2	6	266838	266843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421130
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5342	NC_010159	TGG	2	6	267798	267803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5344	NC_010159	ATA	2	6	267884	267889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5345	NC_010159	ATT	2	6	267898	267903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5347	NC_010159	A	8	8	267943	267950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5352	NC_010159	AAAT	2	8	268046	268053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_010159	TA	3	6	268069	268074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_010159	GGCGA	2	10	268129	268138	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5355	NC_010159	A	6	6	268147	268152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_010159	AG	4	8	268158	268165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_010159	TTA	2	6	268202	268207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5359	NC_010159	ATG	2	6	268385	268390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5375	NC_010159	AATT	2	8	269302	269309	50 %	50 %	0 %	0 %	162419965
5376	NC_010159	A	6	6	269331	269336	100 %	0 %	0 %	0 %	162419965
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