MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 2151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010158	CGAG	2	8	80106	80113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_010158	ATA	2	6	80118	80123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010158	TACT	2	8	80130	80137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_010158	ATC	2	6	80139	80144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_010158	CGG	2	6	80236	80241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_010158	GA	3	6	80243	80248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010158	CAT	2	6	80291	80296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010158	GGTT	2	8	80327	80334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_010158	T	6	6	80561	80566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010158	TA	3	6	80609	80614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010158	GAAA	2	8	80628	80635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010158	GAAG	2	8	80654	80661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010158	GGGGT	2	10	80669	80678	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010158	TGA	2	6	80687	80692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010158	GGA	2	6	80798	80803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010158	TGGGTT	2	12	80866	80877	0 %	50 %	50 %	0 %	162417879
1517	NC_010158	CAG	2	6	80879	80884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417879
1518	NC_010158	GCTGC	2	10	80910	80919	0 %	20 %	40 %	40 %	162417879
1519	NC_010158	CAC	2	6	80947	80952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417879
1520	NC_010158	A	6	6	81049	81054	100 %	0 %	0 %	0 %	162417879
1521	NC_010158	TAG	2	6	81055	81060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417879
1522	NC_010158	GCC	2	6	81076	81081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_010158	CT	3	6	81155	81160	0 %	50 %	0 %	50 %	162417834
1524	NC_010158	GCGAT	2	10	81218	81227	20 %	20 %	40 %	20 %	162417834
1525	NC_010158	GTG	3	9	81440	81448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417834
1526	NC_010158	CA	3	6	81563	81568	50 %	0 %	0 %	50 %	162417834
1527	NC_010158	TAAG	2	8	81581	81588	50 %	25 %	25 %	0 %	162417834
1528	NC_010158	TTG	2	6	81626	81631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417834
1529	NC_010158	CTT	2	6	81647	81652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417834
1530	NC_010158	TCA	2	6	81672	81677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417834
1531	NC_010158	A	6	6	81693	81698	100 %	0 %	0 %	0 %	162417834
1532	NC_010158	CCG	2	6	81700	81705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_010158	CAA	2	6	81841	81846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_010158	TG	3	6	82038	82043	0 %	50 %	50 %	0 %	162417889
1535	NC_010158	GTAA	2	8	82318	82325	50 %	25 %	25 %	0 %	162417889
1536	NC_010158	GGA	2	6	82420	82425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010158	TATT	2	8	82426	82433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010158	CAG	2	6	82620	82625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417914
1539	NC_010158	GAC	2	6	82685	82690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417914
1540	NC_010158	CGCCAG	2	12	82722	82733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162417914
1541	NC_010158	GAT	2	6	82755	82760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417914
1542	NC_010158	TGG	2	6	82781	82786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417914
1543	NC_010158	GCC	2	6	82822	82827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417914
1544	NC_010158	TCT	2	6	82841	82846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417914
1545	NC_010158	TTG	3	9	83034	83042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417899
1546	NC_010158	GTC	2	6	83243	83248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1547	NC_010158	CAT	2	6	83281	83286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417899
1548	NC_010158	GTC	2	6	83351	83356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1549	NC_010158	GCC	2	6	83373	83378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417899
1550	NC_010158	TCA	2	6	83386	83391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417899
1551	NC_010158	ACACGC	2	12	83582	83593	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	162417899
1552	NC_010158	GCC	2	6	83639	83644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417899
1553	NC_010158	ATG	2	6	83664	83669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417899
1554	NC_010158	AGC	2	6	83689	83694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1555	NC_010158	CAG	2	6	83701	83706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1556	NC_010158	TGG	2	6	83783	83788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417899
1557	NC_010158	GCA	2	6	83862	83867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1558	NC_010158	CAG	2	6	83878	83883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1559	NC_010158	TTG	2	6	83946	83951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417899
1560	NC_010158	TTC	2	6	83967	83972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417899
1561	NC_010158	CAG	2	6	84040	84045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1562	NC_010158	CTT	2	6	84076	84081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417899
1563	NC_010158	CG	3	6	84122	84127	0 %	0 %	50 %	50 %	162417899
1564	NC_010158	GTG	2	6	84141	84146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417899
1565	NC_010158	ACG	2	6	84189	84194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1566	NC_010158	GTC	2	6	84410	84415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1567	NC_010158	AGC	2	6	84513	84518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1568	NC_010158	CT	3	6	84636	84641	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
1569	NC_010158	CGA	2	6	84802	84807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1570	NC_010158	CGC	2	6	84860	84865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417899
1571	NC_010158	TCC	2	6	84948	84953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417899
1572	NC_010158	GCA	2	6	84987	84992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1573	NC_010158	CGCAG	2	10	85020	85029	20 %	0 %	40 %	40 %	162417899
1574	NC_010158	TTCA	2	8	85088	85095	25 %	50 %	0 %	25 %	162417899
1575	NC_010158	TGA	2	6	85171	85176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417899
1576	NC_010158	AGA	2	6	85188	85193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417899
1577	NC_010158	CAC	2	6	85230	85235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417899
1578	NC_010158	CCA	2	6	85237	85242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417899
1579	NC_010158	TCA	2	6	85303	85308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417899
1580	NC_010158	GGT	2	6	85407	85412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417899
1581	NC_010158	GT	3	6	85411	85416	0 %	50 %	50 %	0 %	162417899
1582	NC_010158	GTA	2	6	85431	85436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417899
1583	NC_010158	CAGC	2	8	85459	85466	25 %	0 %	25 %	50 %	162417899
1584	NC_010158	TCA	2	6	85468	85473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417899
1585	NC_010158	TCG	2	6	85485	85490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1586	NC_010158	TGG	2	6	85511	85516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417899
1587	NC_010158	GTT	2	6	85563	85568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417899
1588	NC_010158	GGC	2	6	85636	85641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417899
1589	NC_010158	TGG	2	6	85665	85670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417899
1590	NC_010158	TGT	2	6	85705	85710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417899
1591	NC_010158	CGT	2	6	85744	85749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1592	NC_010158	TAA	2	6	85761	85766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417899
1593	NC_010158	TCC	2	6	85886	85891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417899
1594	NC_010158	CAG	2	6	85961	85966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1595	NC_010158	GAT	2	6	85967	85972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417899
1596	NC_010158	GCC	2	6	85992	85997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417899
1597	NC_010158	TCA	2	6	86056	86061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417899
1598	NC_010158	AT	3	6	86142	86147	50 %	50 %	0 %	0 %	162417899
1599	NC_010158	CT	3	6	86148	86153	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
1600	NC_010158	GGCG	2	8	86167	86174	0 %	0 %	75 %	25 %	162417899
1601	NC_010158	TCG	2	6	86193	86198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1602	NC_010158	TCG	2	6	86235	86240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1603	NC_010158	CAG	2	6	86299	86304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417899
1604	NC_010158	TC	3	6	86316	86321	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
1605	NC_010158	TGG	2	6	86488	86493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417911
1606	NC_010158	AG	3	6	86551	86556	50 %	0 %	50 %	0 %	162417911
1607	NC_010158	TCT	2	6	86590	86595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417848
1608	NC_010158	TGGA	2	8	86626	86633	25 %	25 %	50 %	0 %	162417848
1609	NC_010158	CAT	2	6	86681	86686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417848
1610	NC_010158	AGC	3	9	86703	86711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417848
1611	NC_010158	TGGC	2	8	86726	86733	0 %	25 %	50 %	25 %	162417848
1612	NC_010158	TGC	2	6	86742	86747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417848
1613	NC_010158	TCT	2	6	86785	86790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417848
1614	NC_010158	CAGC	2	8	86818	86825	25 %	0 %	25 %	50 %	162417848
1615	NC_010158	CGC	2	6	86891	86896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417848
1616	NC_010158	TCG	2	6	86931	86936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417848
1617	NC_010158	TGA	2	6	87019	87024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417848
1618	NC_010158	CTGG	2	8	87046	87053	0 %	25 %	50 %	25 %	162417848
1619	NC_010158	AC	3	6	87055	87060	50 %	0 %	0 %	50 %	162417848
1620	NC_010158	TCA	2	6	87090	87095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417848
1621	NC_010158	CGCCAG	2	12	87122	87133	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162417848
1622	NC_010158	CGAG	2	8	87165	87172	25 %	0 %	50 %	25 %	162417848
1623	NC_010158	CTT	2	6	87193	87198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417848
1624	NC_010158	CAG	2	6	87239	87244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417848
1625	NC_010158	GAAGA	2	10	87262	87271	60 %	0 %	40 %	0 %	162417848
1626	NC_010158	CAT	2	6	87323	87328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417848
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1628	NC_010158	GT	3	6	87403	87408	0 %	50 %	50 %	0 %	162417848
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1890	NC_010158	ATG	2	6	100816	100821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417919
1891	NC_010158	CTA	2	6	100824	100829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417919
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1970	NC_010158	GAAA	2	8	105335	105342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1971	NC_010158	TC	4	8	105344	105351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1974	NC_010158	ACA	2	6	105478	105483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1975	NC_010158	GA	3	6	105644	105649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_010158	AAG	2	6	105693	105698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_010158	TTG	2	6	105703	105708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1982	NC_010158	CAC	2	6	105913	105918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1983	NC_010158	AGGC	2	8	105981	105988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1986	NC_010158	CCTC	2	8	106375	106382	0 %	25 %	0 %	75 %	162417928
1987	NC_010158	CA	3	6	106386	106391	50 %	0 %	0 %	50 %	162417928
1988	NC_010158	CGCTT	2	10	106394	106403	0 %	40 %	20 %	40 %	162417928
1989	NC_010158	TTA	2	6	106480	106485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417928
1990	NC_010158	ATG	2	6	106494	106499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417928
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1992	NC_010158	GTTATT	2	12	106674	106685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	162417928
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