MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 2151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010158	TTGC	2	8	24928	24935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_010158	GCT	2	6	24957	24962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010158	CTTC	2	8	24987	24994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_010158	CACG	2	8	25063	25070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_010158	GACTG	2	10	25110	25119	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
506	NC_010158	GCG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010158	TCG	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010158	TCT	2	6	25230	25235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010158	CCA	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_010158	CCA	2	6	25257	25262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_010158	CCA	2	6	25273	25278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_010158	T	6	6	25390	25395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010158	TCT	2	6	25450	25455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417925
514	NC_010158	GGC	2	6	25470	25475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417925
515	NC_010158	AAC	2	6	25490	25495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417925
516	NC_010158	GCA	2	6	25524	25529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417925
517	NC_010158	ATCA	2	8	25538	25545	50 %	25 %	0 %	25 %	162417925
518	NC_010158	ATG	2	6	25569	25574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417925
519	NC_010158	GAA	2	6	25624	25629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417925
520	NC_010158	CTC	2	6	25655	25660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417925
521	NC_010158	AGC	2	6	25730	25735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417925
522	NC_010158	GCGT	2	8	25760	25767	0 %	25 %	50 %	25 %	162417925
523	NC_010158	CATTG	2	10	25814	25823	20 %	40 %	20 %	20 %	162417925
524	NC_010158	ACA	2	6	25987	25992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417925
525	NC_010158	GTC	2	6	26015	26020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417925
526	NC_010158	GCT	2	6	26058	26063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417925
527	NC_010158	TGG	2	6	26073	26078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417925
528	NC_010158	TGCG	2	8	26124	26131	0 %	25 %	50 %	25 %	162417925
529	NC_010158	GAT	2	6	26217	26222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417866
530	NC_010158	CGT	2	6	26297	26302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417866
531	NC_010158	AG	3	6	26371	26376	50 %	0 %	50 %	0 %	162417866
532	NC_010158	CAC	2	6	26402	26407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417866
533	NC_010158	TTC	2	6	26482	26487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417866
534	NC_010158	TG	3	6	26591	26596	0 %	50 %	50 %	0 %	162417866
535	NC_010158	TAA	2	6	26729	26734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417866
536	NC_010158	CGCGCC	2	12	26782	26793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417866
537	NC_010158	GAT	2	6	26874	26879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417866
538	NC_010158	TCT	2	6	27037	27042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417866
539	NC_010158	CGAG	2	8	27117	27124	25 %	0 %	50 %	25 %	162417866
540	NC_010158	CAG	2	6	27204	27209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417866
541	NC_010158	CTT	2	6	27224	27229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417866
542	NC_010158	AGCG	2	8	27292	27299	25 %	0 %	50 %	25 %	162417866
543	NC_010158	GCCA	2	8	27336	27343	25 %	0 %	25 %	50 %	162417866
544	NC_010158	CGC	2	6	27371	27376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417866
545	NC_010158	GCC	2	6	27409	27414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417866
546	NC_010158	TGCG	2	8	27482	27489	0 %	25 %	50 %	25 %	162417866
547	NC_010158	CTT	2	6	27554	27559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417866
548	NC_010158	GT	3	6	27689	27694	0 %	50 %	50 %	0 %	162417866
549	NC_010158	ATG	2	6	27772	27777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417866
550	NC_010158	T	7	7	27823	27829	0 %	100 %	0 %	0 %	162417866
551	NC_010158	CGT	2	6	27848	27853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417866
552	NC_010158	TCA	2	6	27905	27910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417866
553	NC_010158	TCT	2	6	28235	28240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417937
554	NC_010158	GCC	2	6	28357	28362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417843
555	NC_010158	CGC	2	6	28390	28395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417843
556	NC_010158	CAT	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417843
557	NC_010158	GAC	2	6	28483	28488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417843
558	NC_010158	CTT	2	6	28533	28538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417843
559	NC_010158	CAA	2	6	28548	28553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417843
560	NC_010158	GTG	2	6	28639	28644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417843
561	NC_010158	AGCC	2	8	28677	28684	25 %	0 %	25 %	50 %	162417843
562	NC_010158	ACC	2	6	28733	28738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417843
563	NC_010158	GCA	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417843
564	NC_010158	CTT	2	6	28749	28754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417843
565	NC_010158	TGTGGT	2	12	28755	28766	0 %	50 %	50 %	0 %	162417843
566	NC_010158	ACA	3	9	28776	28784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417843
567	NC_010158	TTG	2	6	28850	28855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417843
568	NC_010158	AG	3	6	29033	29038	50 %	0 %	50 %	0 %	162417843
569	NC_010158	TGA	2	6	29124	29129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417843
570	NC_010158	CAC	2	6	29178	29183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417843
571	NC_010158	CCA	2	6	29205	29210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417843
572	NC_010158	CTT	2	6	29250	29255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417843
573	NC_010158	TGT	2	6	29305	29310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417843
574	NC_010158	GAT	2	6	29328	29333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417843
575	NC_010158	AAC	2	6	29426	29431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_010158	ACA	2	6	29436	29441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010158	AGA	2	6	29448	29453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010158	TAAG	2	8	29487	29494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010158	CGTCA	2	10	29548	29557	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
580	NC_010158	CAG	2	6	29590	29595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417934
581	NC_010158	GCTTAT	2	12	29656	29667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	162417934
582	NC_010158	TAT	2	6	29726	29731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010158	T	7	7	29741	29747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010158	CGG	2	6	29847	29852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010158	G	7	7	29905	29911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010158	CCTG	2	8	29917	29924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_010158	A	6	6	29956	29961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010158	AC	3	6	29985	29990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010158	CTG	2	6	30017	30022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010158	CTT	2	6	30143	30148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010158	GTT	2	6	30155	30160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010158	ATG	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010158	GAAA	2	8	30385	30392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010158	GGC	2	6	30469	30474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010158	AGA	2	6	30562	30567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010158	TGC	2	6	30655	30660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010158	A	6	6	30679	30684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010158	TAT	2	6	30761	30766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010158	CAAG	2	8	30787	30794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_010158	TAT	2	6	30865	30870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010158	TCT	2	6	30924	30929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010158	ACT	2	6	30934	30939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010158	TC	4	8	30950	30957	0 %	50 %	0 %	50 %	162417893
604	NC_010158	TCGT	2	8	31030	31037	0 %	50 %	25 %	25 %	162417893
605	NC_010158	GCC	3	9	31064	31072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417893
606	NC_010158	GTC	2	6	31322	31327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417918
607	NC_010158	TCT	2	6	31378	31383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417918
608	NC_010158	GCA	2	6	31423	31428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417918
609	NC_010158	GAT	2	6	31475	31480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417918
610	NC_010158	GAT	2	6	31586	31591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417918
611	NC_010158	CAG	2	6	31607	31612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417918
612	NC_010158	ACGTA	2	10	31617	31626	40 %	20 %	20 %	20 %	162417918
613	NC_010158	CGT	2	6	31657	31662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417918
614	NC_010158	TGTT	2	8	31731	31738	0 %	75 %	25 %	0 %	162417918
615	NC_010158	GCGT	2	8	31795	31802	0 %	25 %	50 %	25 %	162417918
616	NC_010158	ATT	2	6	31899	31904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010158	AAT	2	6	31919	31924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010158	AG	3	6	31934	31939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010158	AGA	2	6	31947	31952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010158	AG	3	6	32043	32048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010158	ATA	2	6	32050	32055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010158	CT	3	6	32079	32084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010158	AGG	2	6	32115	32120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010158	AT	3	6	32182	32187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010158	GTTT	2	8	32210	32217	0 %	75 %	25 %	0 %	162417869
626	NC_010158	CCA	2	6	32218	32223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417869
627	NC_010158	CA	3	6	32222	32227	50 %	0 %	0 %	50 %	162417869
628	NC_010158	AG	3	6	32415	32420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010158	ACCA	2	8	32445	32452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_010158	AG	3	6	32457	32462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010158	TGA	2	6	32498	32503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010158	CCA	2	6	32533	32538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_010158	GTT	2	6	32640	32645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417825
634	NC_010158	CAA	2	6	32663	32668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417825
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657	NC_010158	CT	3	6	33847	33852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
658	NC_010158	GTT	2	6	34023	34028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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