MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	CG	3	6	424	429	0 %	0 %	50 %	50 %	162417772
2	NC_010157	TA	3	6	860	865	50 %	50 %	0 %	0 %	162417748
3	NC_010157	AT	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	162417748
4	NC_010157	AT	3	6	968	973	50 %	50 %	0 %	0 %	162417748
5	NC_010157	TC	3	6	2149	2154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010157	TA	3	6	2249	2254	50 %	50 %	0 %	0 %	162417807
7	NC_010157	TA	3	6	2256	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	162417807
8	NC_010157	AT	3	6	2612	2617	50 %	50 %	0 %	0 %	162417753
9	NC_010157	AT	3	6	2776	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010157	GT	3	6	3007	3012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010157	AC	3	6	3093	3098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010157	TC	3	6	4120	4125	0 %	50 %	0 %	50 %	162417816
13	NC_010157	GA	4	8	4347	4354	50 %	0 %	50 %	0 %	162417816
14	NC_010157	AT	3	6	6167	6172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010157	AT	3	6	6365	6370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010157	AC	3	6	7204	7209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010157	AT	3	6	7319	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010157	CA	3	6	7331	7336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010157	TG	3	6	8228	8233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010157	AG	3	6	9467	9472	50 %	0 %	50 %	0 %	162417795
21	NC_010157	AT	3	6	10065	10070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010157	AT	3	6	10320	10325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010157	GA	3	6	10681	10686	50 %	0 %	50 %	0 %	162417779
24	NC_010157	TC	3	6	11125	11130	0 %	50 %	0 %	50 %	162417779
25	NC_010157	TA	3	6	11830	11835	50 %	50 %	0 %	0 %	162417737
26	NC_010157	TA	4	8	12046	12053	50 %	50 %	0 %	0 %	162417737
27	NC_010157	AT	3	6	13235	13240	50 %	50 %	0 %	0 %	162417805
28	NC_010157	AT	3	6	13333	13338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010157	CT	3	6	14219	14224	0 %	50 %	0 %	50 %	162417819
30	NC_010157	CT	3	6	14922	14927	0 %	50 %	0 %	50 %	162417819
31	NC_010157	TA	3	6	15277	15282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010157	TA	3	6	15285	15290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010157	TA	3	6	16854	16859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010157	CT	3	6	17276	17281	0 %	50 %	0 %	50 %	162417734
35	NC_010157	CA	3	6	19371	19376	50 %	0 %	0 %	50 %	162417760
36	NC_010157	AG	3	6	19438	19443	50 %	0 %	50 %	0 %	162417760
37	NC_010157	CA	3	6	20742	20747	50 %	0 %	0 %	50 %	162417768
38	NC_010157	GA	3	6	21024	21029	50 %	0 %	50 %	0 %	162417803
39	NC_010157	AT	3	6	21625	21630	50 %	50 %	0 %	0 %	162417764
40	NC_010157	AT	3	6	21681	21686	50 %	50 %	0 %	0 %	162417764
41	NC_010157	GA	3	6	21961	21966	50 %	0 %	50 %	0 %	162417764
42	NC_010157	AT	3	6	22804	22809	50 %	50 %	0 %	0 %	162417764
43	NC_010157	CG	3	6	22907	22912	0 %	0 %	50 %	50 %	162417764
44	NC_010157	AG	3	6	22995	23000	50 %	0 %	50 %	0 %	162417764
45	NC_010157	GC	3	6	23683	23688	0 %	0 %	50 %	50 %	162417766
46	NC_010157	CT	3	6	26751	26756	0 %	50 %	0 %	50 %	162417750
47	NC_010157	AG	3	6	27980	27985	50 %	0 %	50 %	0 %	162417754
48	NC_010157	CG	3	6	28540	28545	0 %	0 %	50 %	50 %	162417754
49	NC_010157	GC	3	6	28625	28630	0 %	0 %	50 %	50 %	162417754
50	NC_010157	CA	3	6	29723	29728	50 %	0 %	0 %	50 %	162417770
51	NC_010157	CT	3	6	31234	31239	0 %	50 %	0 %	50 %	162417741
52	NC_010157	GC	3	6	31641	31646	0 %	0 %	50 %	50 %	162417792
53	NC_010157	AT	3	6	32219	32224	50 %	50 %	0 %	0 %	162417792
54	NC_010157	AT	3	6	32837	32842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010157	AT	3	6	32859	32864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010157	TG	3	6	33206	33211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010157	CA	3	6	33350	33355	50 %	0 %	0 %	50 %	162417775
58	NC_010157	CT	3	6	33502	33507	0 %	50 %	0 %	50 %	162417775
59	NC_010157	AT	3	6	33711	33716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010157	TA	3	6	33827	33832	50 %	50 %	0 %	0 %	162417806
61	NC_010157	TC	3	6	34212	34217	0 %	50 %	0 %	50 %	162417806
62	NC_010157	TA	4	8	34946	34953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010157	GT	3	6	37178	37183	0 %	50 %	50 %	0 %	162417759
64	NC_010157	CG	3	6	37442	37447	0 %	0 %	50 %	50 %	162417809
65	NC_010157	AG	3	6	38597	38602	50 %	0 %	50 %	0 %	162417784
66	NC_010157	AC	3	6	39969	39974	50 %	0 %	0 %	50 %	162417738
67	NC_010157	AG	3	6	41273	41278	50 %	0 %	50 %	0 %	162417771
68	NC_010157	TC	3	6	41500	41505	0 %	50 %	0 %	50 %	162417755
69	NC_010157	GC	3	6	41530	41535	0 %	0 %	50 %	50 %	162417755
70	NC_010157	AT	3	6	42113	42118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010157	TA	3	6	42678	42683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010157	GA	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010157	AT	3	6	43197	43202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010157	CT	3	6	43432	43437	0 %	50 %	0 %	50 %	162417745
75	NC_010157	GC	4	8	45584	45591	0 %	0 %	50 %	50 %	162417751
76	NC_010157	GT	3	6	45662	45667	0 %	50 %	50 %	0 %	162417751
77	NC_010157	CT	3	6	46018	46023	0 %	50 %	0 %	50 %	162417751
78	NC_010157	CT	3	6	46109	46114	0 %	50 %	0 %	50 %	162417751
79	NC_010157	AT	3	6	46329	46334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010157	TC	4	8	48154	48161	0 %	50 %	0 %	50 %	162417798
81	NC_010157	AT	3	6	48599	48604	50 %	50 %	0 %	0 %	162417798
82	NC_010157	TA	4	8	48995	49002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010157	AT	3	6	49081	49086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010157	TC	3	6	49176	49181	0 %	50 %	0 %	50 %	162417777
85	NC_010157	GC	3	6	49617	49622	0 %	0 %	50 %	50 %	162417777
86	NC_010157	GT	3	6	49649	49654	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
87	NC_010157	GT	3	6	50635	50640	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
88	NC_010157	GT	3	6	51058	51063	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
89	NC_010157	AG	3	6	51133	51138	50 %	0 %	50 %	0 %	162417777
90	NC_010157	GC	3	6	51561	51566	0 %	0 %	50 %	50 %	162417782
91	NC_010157	CA	3	6	51668	51673	50 %	0 %	0 %	50 %	162417782
92	NC_010157	CA	3	6	51756	51761	50 %	0 %	0 %	50 %	162417782
93	NC_010157	AT	3	6	51818	51823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010157	GT	3	6	52089	52094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010157	GC	3	6	53379	53384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010157	GC	3	6	54089	54094	0 %	0 %	50 %	50 %	229270461
97	NC_010157	CG	3	6	54594	54599	0 %	0 %	50 %	50 %	229270461
98	NC_010157	TG	3	6	54738	54743	0 %	50 %	50 %	0 %	229270461
99	NC_010157	TC	3	6	55103	55108	0 %	50 %	0 %	50 %	162417820
100	NC_010157	GT	3	6	55810	55815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010157	GT	3	6	55967	55972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010157	AT	3	6	56205	56210	50 %	50 %	0 %	0 %	162417746
103	NC_010157	CA	3	6	56217	56222	50 %	0 %	0 %	50 %	162417746
104	NC_010157	CG	3	6	57448	57453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010157	GA	3	6	58002	58007	50 %	0 %	50 %	0 %	162417774
106	NC_010157	TC	3	6	58827	58832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010157	AT	3	6	59542	59547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010157	AT	3	6	59664	59669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010157	TA	3	6	59952	59957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010157	TG	3	6	60311	60316	0 %	50 %	50 %	0 %	162417818
111	NC_010157	TC	3	6	60789	60794	0 %	50 %	0 %	50 %	162417740
112	NC_010157	AC	3	6	62845	62850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010157	TG	3	6	62866	62871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010157	CG	3	6	62956	62961	0 %	0 %	50 %	50 %	162417814
115	NC_010157	GT	3	6	63198	63203	0 %	50 %	50 %	0 %	162417814
116	NC_010157	GA	3	6	63325	63330	50 %	0 %	50 %	0 %	162417814
117	NC_010157	TA	3	6	63729	63734	50 %	50 %	0 %	0 %	162417776
118	NC_010157	AC	3	6	64098	64103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010157	GA	3	6	65013	65018	50 %	0 %	50 %	0 %	162417780
120	NC_010157	TC	3	6	66258	66263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010157	GT	3	6	67673	67678	0 %	50 %	50 %	0 %	162417736
122	NC_010157	CT	3	6	68146	68151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.