MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 1381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010157	GGTC	2	8	46880	46887	0 %	25 %	50 %	25 %	162417773
1002	NC_010157	ATG	2	6	46903	46908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417773
1003	NC_010157	CAGA	2	8	46965	46972	50 %	0 %	25 %	25 %	162417773
1004	NC_010157	GGC	2	6	47167	47172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417773
1005	NC_010157	TTC	2	6	47198	47203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417773
1006	NC_010157	TCA	2	6	47240	47245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417773
1007	NC_010157	GGGA	2	8	47286	47293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010157	CTG	2	6	47325	47330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_010157	T	6	6	47343	47348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010157	CTA	2	6	47474	47479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010157	TAC	2	6	47516	47521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010157	AAT	2	6	47534	47539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010157	TAA	2	6	47543	47548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010157	T	6	6	47605	47610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010157	CTTT	2	8	47615	47622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_010157	GAA	2	6	47634	47639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010157	ACC	2	6	47672	47677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_010157	AGC	2	6	47686	47691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010157	CAGG	2	8	47758	47765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_010157	AGAA	2	8	47800	47807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010157	T	8	8	47965	47972	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
1022	NC_010157	AAC	2	6	47976	47981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417798
1023	NC_010157	T	6	6	48027	48032	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
1024	NC_010157	TAT	2	6	48125	48130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417798
1025	NC_010157	TC	4	8	48154	48161	0 %	50 %	0 %	50 %	162417798
1026	NC_010157	T	7	7	48171	48177	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
1027	NC_010157	CCA	2	6	48233	48238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417798
1028	NC_010157	T	6	6	48454	48459	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
1029	NC_010157	AAGATT	2	12	48492	48503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	162417798
1030	NC_010157	AAT	2	6	48569	48574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417798
1031	NC_010157	ATCC	2	8	48590	48597	25 %	25 %	0 %	50 %	162417798
1032	NC_010157	AT	3	6	48599	48604	50 %	50 %	0 %	0 %	162417798
1033	NC_010157	ATTT	2	8	48690	48697	25 %	75 %	0 %	0 %	162417798
1034	NC_010157	ATTT	2	8	48715	48722	25 %	75 %	0 %	0 %	162417798
1035	NC_010157	GCA	2	6	48827	48832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417762
1036	NC_010157	TTG	2	6	48963	48968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010157	TA	4	8	48995	49002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010157	T	6	6	49008	49013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010157	TAA	2	6	49028	49033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010157	ATT	2	6	49041	49046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010157	AT	3	6	49081	49086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010157	GTC	2	6	49155	49160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417777
1043	NC_010157	TC	3	6	49176	49181	0 %	50 %	0 %	50 %	162417777
1044	NC_010157	AGT	2	6	49230	49235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417777
1045	NC_010157	ATC	2	6	49265	49270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417777
1046	NC_010157	CCT	2	6	49285	49290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417777
1047	NC_010157	GCC	2	6	49311	49316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417777
1048	NC_010157	ATC	2	6	49317	49322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417777
1049	NC_010157	CTG	4	12	49466	49477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417777
1050	NC_010157	TGC	2	6	49491	49496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417777
1051	NC_010157	GC	3	6	49617	49622	0 %	0 %	50 %	50 %	162417777
1052	NC_010157	GT	3	6	49649	49654	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
1053	NC_010157	CGA	2	6	49693	49698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417777
1054	NC_010157	GAT	2	6	49720	49725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417777
1055	NC_010157	C	6	6	49848	49853	0 %	0 %	0 %	100 %	162417777
1056	NC_010157	CCA	2	6	49876	49881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417777
1057	NC_010157	C	8	8	49906	49913	0 %	0 %	0 %	100 %	162417777
1058	NC_010157	TGC	2	6	49931	49936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417777
1059	NC_010157	CTT	2	6	49979	49984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417777
1060	NC_010157	CTC	2	6	50063	50068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417777
1061	NC_010157	TGA	2	6	50155	50160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417777
1062	NC_010157	TGGAT	2	10	50202	50211	20 %	40 %	40 %	0 %	162417777
1063	NC_010157	GTT	2	6	50413	50418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417777
1064	NC_010157	AAC	2	6	50450	50455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417777
1065	NC_010157	TAC	2	6	50510	50515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417777
1066	NC_010157	GT	3	6	50635	50640	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
1067	NC_010157	AAC	2	6	50644	50649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417777
1068	NC_010157	CATC	2	8	50665	50672	25 %	25 %	0 %	50 %	162417777
1069	NC_010157	TCC	2	6	50682	50687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417777
1070	NC_010157	CAC	2	6	50705	50710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417777
1071	NC_010157	GCCAT	2	10	50712	50721	20 %	20 %	20 %	40 %	162417777
1072	NC_010157	GCT	2	6	50836	50841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417777
1073	NC_010157	TAT	2	6	50855	50860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417777
1074	NC_010157	TGGCT	2	10	50975	50984	0 %	40 %	40 %	20 %	162417777
1075	NC_010157	GT	3	6	51058	51063	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
1076	NC_010157	AG	3	6	51133	51138	50 %	0 %	50 %	0 %	162417777
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1079	NC_010157	CTG	2	6	51368	51373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417782
1080	NC_010157	TCG	2	6	51442	51447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417782
1081	NC_010157	TTC	2	6	51480	51485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417782
1082	NC_010157	A	7	7	51538	51544	100 %	0 %	0 %	0 %	162417782
1083	NC_010157	GCG	2	6	51553	51558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417782
1084	NC_010157	GC	3	6	51561	51566	0 %	0 %	50 %	50 %	162417782
1085	NC_010157	TCA	2	6	51622	51627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417782
1086	NC_010157	ATA	2	6	51637	51642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417782
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1088	NC_010157	GGT	2	6	51744	51749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417782
1089	NC_010157	CA	3	6	51756	51761	50 %	0 %	0 %	50 %	162417782
1090	NC_010157	AT	3	6	51818	51823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_010157	CAC	2	6	51927	51932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_010157	GAA	2	6	51953	51958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010157	CCA	2	6	52069	52074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010157	GT	3	6	52089	52094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010157	TAA	2	6	52097	52102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010157	ATG	2	6	52135	52140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010157	TCC	2	6	52242	52247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_010157	CCCT	2	8	52282	52289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1100	NC_010157	CAG	2	6	52303	52308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010157	TTG	2	6	52370	52375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010157	GGC	2	6	52387	52392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_010157	TGT	2	6	52479	52484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010157	GGT	2	6	52642	52647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417794
1105	NC_010157	TGA	2	6	52655	52660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417794
1106	NC_010157	TAA	2	6	52673	52678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417794
1107	NC_010157	AGT	2	6	52710	52715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417794
1108	NC_010157	T	6	6	52717	52722	0 %	100 %	0 %	0 %	162417794
1109	NC_010157	TGC	2	6	52757	52762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417791
1110	NC_010157	GTC	2	6	52784	52789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417791
1111	NC_010157	CGC	2	6	52863	52868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_010157	CCGGTT	2	12	53085	53096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417749
1113	NC_010157	CCAATC	2	12	53109	53120	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162417749
1114	NC_010157	ACA	2	6	53305	53310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010157	CGGGG	2	10	53347	53356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_010157	GC	3	6	53379	53384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_010157	T	7	7	53413	53419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010157	TGT	2	6	53434	53439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010157	TAA	2	6	53443	53448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010157	AGG	2	6	53476	53481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010157	GGGC	2	8	53526	53533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_010157	GAC	2	6	53559	53564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_010157	TTAT	3	12	53572	53583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010157	AAAAG	2	10	53590	53599	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010157	AAG	2	6	53608	53613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010157	A	6	6	53671	53676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010157	CGA	2	6	53748	53753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010157	AGA	2	6	53792	53797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010157	AGG	2	6	53844	53849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010157	TCC	2	6	53863	53868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_010157	ACG	2	6	53894	53899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010157	GC	3	6	54089	54094	0 %	0 %	50 %	50 %	229270461
1133	NC_010157	CATC	2	8	54184	54191	25 %	25 %	0 %	50 %	229270461
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1147	NC_010157	CACT	2	8	55033	55040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1156	NC_010157	ACC	2	6	55534	55539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1381	NC_010157	CT	3	6	68146	68151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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