MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 1381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010157	ACG	2	6	23109	23114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417764
502	NC_010157	GTG	2	6	23172	23177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417764
503	NC_010157	AAC	2	6	23274	23279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417764
504	NC_010157	G	8	8	23326	23333	0 %	0 %	100 %	0 %	162417764
505	NC_010157	CAT	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417764
506	NC_010157	CAG	2	6	23366	23371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417764
507	NC_010157	AAT	2	6	23456	23461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417766
508	NC_010157	GTT	2	6	23501	23506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417766
509	NC_010157	CTT	2	6	23570	23575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417766
510	NC_010157	TTA	3	9	23596	23604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417766
511	NC_010157	GC	3	6	23683	23688	0 %	0 %	50 %	50 %	162417766
512	NC_010157	AACC	2	8	23713	23720	50 %	0 %	0 %	50 %	162417766
513	NC_010157	AGC	2	6	23725	23730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417766
514	NC_010157	TGT	2	6	23740	23745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417766
515	NC_010157	ATT	2	6	23790	23795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417797
516	NC_010157	ATC	3	9	23807	23815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417797
517	NC_010157	TTG	2	6	23816	23821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417797
518	NC_010157	AGC	2	6	23829	23834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417797
519	NC_010157	GACT	2	8	23859	23866	25 %	25 %	25 %	25 %	162417797
520	NC_010157	GGT	2	6	23867	23872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417797
521	NC_010157	GCTT	2	8	23971	23978	0 %	50 %	25 %	25 %	162417797
522	NC_010157	GGC	2	6	24030	24035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417797
523	NC_010157	G	6	6	24109	24114	0 %	0 %	100 %	0 %	162417797
524	NC_010157	TTA	2	6	24118	24123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417797
525	NC_010157	TGC	2	6	24149	24154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417811
526	NC_010157	TCA	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417811
527	NC_010157	ACC	2	6	24249	24254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417811
528	NC_010157	GCC	2	6	24287	24292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417811
529	NC_010157	TGT	2	6	24377	24382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417811
530	NC_010157	ATG	2	6	24479	24484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417811
531	NC_010157	ACTC	2	8	24496	24503	25 %	25 %	0 %	50 %	162417811
532	NC_010157	TTC	2	6	24506	24511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417793
533	NC_010157	ATCG	2	8	24533	24540	25 %	25 %	25 %	25 %	162417793
534	NC_010157	CTC	2	6	24575	24580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417793
535	NC_010157	A	7	7	24782	24788	100 %	0 %	0 %	0 %	162417778
536	NC_010157	TCAC	2	8	24811	24818	25 %	25 %	0 %	50 %	162417778
537	NC_010157	TAA	2	6	24851	24856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417778
538	NC_010157	TTG	2	6	24888	24893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417778
539	NC_010157	AAT	2	6	24928	24933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417778
540	NC_010157	GGTA	2	8	25022	25029	25 %	25 %	50 %	0 %	162417778
541	NC_010157	TTC	2	6	25236	25241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417778
542	NC_010157	AGC	2	6	25309	25314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417778
543	NC_010157	TCAC	2	8	25315	25322	25 %	25 %	0 %	50 %	162417778
544	NC_010157	CTC	2	6	25374	25379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417778
545	NC_010157	ACT	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417778
546	NC_010157	CGT	2	6	25620	25625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417778
547	NC_010157	ACT	2	6	25630	25635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010157	AATTAC	2	12	25656	25667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
549	NC_010157	TGC	2	6	25725	25730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010157	T	6	6	25769	25774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010157	TCA	2	6	25849	25854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417750
552	NC_010157	GTAG	2	8	25871	25878	25 %	25 %	50 %	0 %	162417750
553	NC_010157	TTA	2	6	25925	25930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417750
554	NC_010157	TTAC	2	8	25969	25976	25 %	50 %	0 %	25 %	162417750
555	NC_010157	ACA	2	6	25986	25991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417750
556	NC_010157	TCT	2	6	26072	26077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417750
557	NC_010157	GGGT	2	8	26118	26125	0 %	25 %	75 %	0 %	162417750
558	NC_010157	CTG	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417750
559	NC_010157	G	6	6	26174	26179	0 %	0 %	100 %	0 %	162417750
560	NC_010157	CGG	2	6	26193	26198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417750
561	NC_010157	TTA	2	6	26247	26252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417750
562	NC_010157	CAC	2	6	26256	26261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417750
563	NC_010157	GCC	2	6	26333	26338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417750
564	NC_010157	G	9	9	26339	26347	0 %	0 %	100 %	0 %	162417750
565	NC_010157	TGCT	2	8	26358	26365	0 %	50 %	25 %	25 %	162417750
566	NC_010157	GTG	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417750
567	NC_010157	ACC	2	6	26656	26661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417750
568	NC_010157	CGC	2	6	26666	26671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417750
569	NC_010157	TCC	2	6	26677	26682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417750
570	NC_010157	CT	3	6	26751	26756	0 %	50 %	0 %	50 %	162417750
571	NC_010157	CGA	2	6	26800	26805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417750
572	NC_010157	ATT	2	6	26831	26836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417750
573	NC_010157	TGA	2	6	26904	26909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417750
574	NC_010157	GAA	2	6	26975	26980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417750
575	NC_010157	CGC	2	6	27148	27153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417817
576	NC_010157	GCTT	2	8	27214	27221	0 %	50 %	25 %	25 %	162417817
577	NC_010157	GCAG	2	8	27222	27229	25 %	0 %	50 %	25 %	162417817
578	NC_010157	TCA	2	6	27240	27245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417817
579	NC_010157	TGA	2	6	27288	27293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417817
580	NC_010157	A	6	6	27318	27323	100 %	0 %	0 %	0 %	162417817
581	NC_010157	CAC	2	6	27324	27329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417817
582	NC_010157	AGG	2	6	27386	27391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417817
583	NC_010157	ATT	2	6	27417	27422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417817
584	NC_010157	TGAGCG	2	12	27438	27449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	162417817
585	NC_010157	TGC	2	6	27470	27475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417817
586	NC_010157	CGA	2	6	27517	27522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417817
587	NC_010157	GAAGAT	2	12	27523	27534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	162417817
588	NC_010157	CAA	2	6	27544	27549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417817
589	NC_010157	GAA	2	6	27559	27564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417817
590	NC_010157	CAAGAA	2	12	27565	27576	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	162417817
591	NC_010157	CAC	2	6	27617	27622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417754
592	NC_010157	CAT	2	6	27666	27671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417754
593	NC_010157	ATA	3	9	27712	27720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417754
594	NC_010157	AGA	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417754
595	NC_010157	A	6	6	27780	27785	100 %	0 %	0 %	0 %	162417754
596	NC_010157	TGCG	2	8	27808	27815	0 %	25 %	50 %	25 %	162417754
597	NC_010157	GCG	2	6	27828	27833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417754
598	NC_010157	GGAA	2	8	27846	27853	50 %	0 %	50 %	0 %	162417754
599	NC_010157	AAT	2	6	27888	27893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417754
600	NC_010157	CAG	2	6	27951	27956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417754
601	NC_010157	TGA	2	6	27968	27973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417754
602	NC_010157	AG	3	6	27980	27985	50 %	0 %	50 %	0 %	162417754
603	NC_010157	TAT	2	6	27986	27991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417754
604	NC_010157	ATG	2	6	28081	28086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417754
605	NC_010157	GCT	2	6	28170	28175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417754
606	NC_010157	A	6	6	28232	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	162417754
607	NC_010157	AGA	2	6	28268	28273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417754
608	NC_010157	TCA	2	6	28286	28291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417754
609	NC_010157	GAT	2	6	28338	28343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417754
610	NC_010157	AGC	2	6	28491	28496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417754
611	NC_010157	ACC	2	6	28511	28516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417754
612	NC_010157	CG	3	6	28540	28545	0 %	0 %	50 %	50 %	162417754
613	NC_010157	CAA	2	6	28618	28623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417754
614	NC_010157	GC	3	6	28625	28630	0 %	0 %	50 %	50 %	162417754
615	NC_010157	TAGAAC	2	12	28687	28698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	162417754
616	NC_010157	GCG	2	6	28702	28707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417754
617	NC_010157	TAT	2	6	28757	28762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417754
618	NC_010157	TCT	2	6	28853	28858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417754
619	NC_010157	GAG	2	6	28950	28955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417754
620	NC_010157	GAA	2	6	28965	28970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417754
621	NC_010157	CAA	2	6	29039	29044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417770
622	NC_010157	ACT	2	6	29046	29051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417770
623	NC_010157	CCT	2	6	29090	29095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417770
624	NC_010157	CCG	2	6	29184	29189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417770
625	NC_010157	TGT	2	6	29511	29516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417770
626	NC_010157	AAAT	2	8	29599	29606	75 %	25 %	0 %	0 %	162417770
627	NC_010157	GGC	2	6	29703	29708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417770
628	NC_010157	CA	3	6	29723	29728	50 %	0 %	0 %	50 %	162417770
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