MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	TA	3	6	303	308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009704	TA	3	6	1431	1436	50 %	50 %	0 %	0 %	153930590
3	NC_009704	TA	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009704	TA	3	6	3355	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	153930608
5	NC_009704	TA	3	6	3577	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	153930608
6	NC_009704	TA	3	6	3593	3598	50 %	50 %	0 %	0 %	153930608
7	NC_009704	AG	3	6	4041	4046	50 %	0 %	50 %	0 %	153930566
8	NC_009704	CT	4	8	4961	4968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009704	CT	3	6	5852	5857	0 %	50 %	0 %	50 %	153930626
10	NC_009704	TC	3	6	6960	6965	0 %	50 %	0 %	50 %	153930606
11	NC_009704	AT	3	6	7099	7104	50 %	50 %	0 %	0 %	153930606
12	NC_009704	TA	3	6	7507	7512	50 %	50 %	0 %	0 %	153930587
13	NC_009704	AT	3	6	7831	7836	50 %	50 %	0 %	0 %	153930569
14	NC_009704	TA	3	6	8031	8036	50 %	50 %	0 %	0 %	153930569
15	NC_009704	TA	3	6	8579	8584	50 %	50 %	0 %	0 %	153930569
16	NC_009704	TG	3	6	8654	8659	0 %	50 %	50 %	0 %	153930569
17	NC_009704	CT	3	6	10092	10097	0 %	50 %	0 %	50 %	153930569
18	NC_009704	GA	4	8	11630	11637	50 %	0 %	50 %	0 %	153930568
19	NC_009704	TA	3	6	11743	11748	50 %	50 %	0 %	0 %	153930568
20	NC_009704	CA	4	8	12234	12241	50 %	0 %	0 %	50 %	153930617
21	NC_009704	TC	3	6	12536	12541	0 %	50 %	0 %	50 %	153930612
22	NC_009704	GC	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	153930612
23	NC_009704	CT	3	6	13566	13571	0 %	50 %	0 %	50 %	153930612
24	NC_009704	TC	3	6	14841	14846	0 %	50 %	0 %	50 %	153930596
25	NC_009704	AT	3	6	16555	16560	50 %	50 %	0 %	0 %	153930585
26	NC_009704	TA	3	6	17591	17596	50 %	50 %	0 %	0 %	153930571
27	NC_009704	TA	3	6	18366	18371	50 %	50 %	0 %	0 %	153930571
28	NC_009704	AC	3	6	19200	19205	50 %	0 %	0 %	50 %	153930563
29	NC_009704	TC	3	6	20397	20402	0 %	50 %	0 %	50 %	153930575
30	NC_009704	AT	3	6	20464	20469	50 %	50 %	0 %	0 %	153930575
31	NC_009704	GA	3	6	21319	21324	50 %	0 %	50 %	0 %	153930575
32	NC_009704	AT	3	6	21326	21331	50 %	50 %	0 %	0 %	153930575
33	NC_009704	AT	3	6	21363	21368	50 %	50 %	0 %	0 %	153930575
34	NC_009704	TA	3	6	21444	21449	50 %	50 %	0 %	0 %	153930575
35	NC_009704	AT	3	6	22336	22341	50 %	50 %	0 %	0 %	153930625
36	NC_009704	CT	4	8	22345	22352	0 %	50 %	0 %	50 %	153930625
37	NC_009704	TC	3	6	22515	22520	0 %	50 %	0 %	50 %	153930625
38	NC_009704	TA	3	6	23270	23275	50 %	50 %	0 %	0 %	153930625
39	NC_009704	AG	3	6	23423	23428	50 %	0 %	50 %	0 %	153930625
40	NC_009704	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	153930581
41	NC_009704	CA	3	6	23915	23920	50 %	0 %	0 %	50 %	153930581
42	NC_009704	TA	3	6	23940	23945	50 %	50 %	0 %	0 %	153930581
43	NC_009704	AT	3	6	23996	24001	50 %	50 %	0 %	0 %	153930581
44	NC_009704	TA	3	6	24073	24078	50 %	50 %	0 %	0 %	153930581
45	NC_009704	AT	3	6	25023	25028	50 %	50 %	0 %	0 %	153930579
46	NC_009704	TA	3	6	25833	25838	50 %	50 %	0 %	0 %	153930595
47	NC_009704	CG	3	6	25888	25893	0 %	0 %	50 %	50 %	153930595
48	NC_009704	AT	3	6	26178	26183	50 %	50 %	0 %	0 %	153930572
49	NC_009704	GA	3	6	26771	26776	50 %	0 %	50 %	0 %	153930572
50	NC_009704	GT	3	6	27023	27028	0 %	50 %	50 %	0 %	153930572
51	NC_009704	GC	3	6	27100	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	153930572
52	NC_009704	TA	3	6	27298	27303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009704	TG	3	6	28518	28523	0 %	50 %	50 %	0 %	153930604
54	NC_009704	CT	3	6	28812	28817	0 %	50 %	0 %	50 %	153930604
55	NC_009704	TA	3	6	28961	28966	50 %	50 %	0 %	0 %	153930604
56	NC_009704	TA	3	6	29886	29891	50 %	50 %	0 %	0 %	153930609
57	NC_009704	GT	3	6	30310	30315	0 %	50 %	50 %	0 %	153930602
58	NC_009704	CA	3	6	30381	30386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009704	AT	3	6	30452	30457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009704	AT	3	6	30898	30903	50 %	50 %	0 %	0 %	153930567
61	NC_009704	CA	3	6	31503	31508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009704	TC	3	6	31519	31524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009704	AT	3	6	31595	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009704	AT	3	6	32353	32358	50 %	50 %	0 %	0 %	153930594
65	NC_009704	AT	3	6	32414	32419	50 %	50 %	0 %	0 %	153930594
66	NC_009704	AT	3	6	32454	32459	50 %	50 %	0 %	0 %	153930594
67	NC_009704	AT	3	6	35389	35394	50 %	50 %	0 %	0 %	153930600
68	NC_009704	AG	3	6	35396	35401	50 %	0 %	50 %	0 %	153930600
69	NC_009704	AT	3	6	35435	35440	50 %	50 %	0 %	0 %	153930600
70	NC_009704	TA	3	6	35747	35752	50 %	50 %	0 %	0 %	153930600
71	NC_009704	TC	3	6	35916	35921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009704	GA	3	6	36185	36190	50 %	0 %	50 %	0 %	153930614
73	NC_009704	AG	3	6	36729	36734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009704	CA	3	6	37632	37637	50 %	0 %	0 %	50 %	153930610
75	NC_009704	TA	3	6	37818	37823	50 %	50 %	0 %	0 %	153930610
76	NC_009704	TG	4	8	38208	38215	0 %	50 %	50 %	0 %	153930610
77	NC_009704	GT	3	6	38294	38299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009704	AT	3	6	39663	39668	50 %	50 %	0 %	0 %	153930589
79	NC_009704	AT	3	6	40228	40233	50 %	50 %	0 %	0 %	153930580
80	NC_009704	TA	3	6	40272	40277	50 %	50 %	0 %	0 %	153930580
81	NC_009704	TA	3	6	41536	41541	50 %	50 %	0 %	0 %	153930580
82	NC_009704	AT	3	6	41758	41763	50 %	50 %	0 %	0 %	153930580
83	NC_009704	TC	3	6	43333	43338	0 %	50 %	0 %	50 %	153930584
84	NC_009704	GT	3	6	43560	43565	0 %	50 %	50 %	0 %	153930584
85	NC_009704	TC	3	6	44687	44692	0 %	50 %	0 %	50 %	153930584
86	NC_009704	TA	3	6	44808	44813	50 %	50 %	0 %	0 %	153930584
87	NC_009704	AT	3	6	44905	44910	50 %	50 %	0 %	0 %	153930584
88	NC_009704	AG	4	8	45119	45126	50 %	0 %	50 %	0 %	153930620
89	NC_009704	CT	3	6	46143	46148	0 %	50 %	0 %	50 %	153930564
90	NC_009704	TG	3	6	46839	46844	0 %	50 %	50 %	0 %	153930564
91	NC_009704	AT	3	6	47170	47175	50 %	50 %	0 %	0 %	153930564
92	NC_009704	AT	3	6	47218	47223	50 %	50 %	0 %	0 %	153930564
93	NC_009704	GA	3	6	48552	48557	50 %	0 %	50 %	0 %	153930611
94	NC_009704	AT	3	6	48804	48809	50 %	50 %	0 %	0 %	153930611
95	NC_009704	CG	3	6	49830	49835	0 %	0 %	50 %	50 %	153930611
96	NC_009704	TG	3	6	50090	50095	0 %	50 %	50 %	0 %	153930576
97	NC_009704	AG	3	6	50589	50594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009704	AG	3	6	50842	50847	50 %	0 %	50 %	0 %	153930578
99	NC_009704	AT	3	6	51209	51214	50 %	50 %	0 %	0 %	153930593
100	NC_009704	CA	3	6	52377	52382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009704	TC	3	6	52582	52587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009704	TA	3	6	52893	52898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009704	TA	3	6	54506	54511	50 %	50 %	0 %	0 %	153930615
104	NC_009704	AC	3	6	54587	54592	50 %	0 %	0 %	50 %	153930615
105	NC_009704	CG	3	6	55107	55112	0 %	0 %	50 %	50 %	153930619
106	NC_009704	AC	3	6	55213	55218	50 %	0 %	0 %	50 %	153930619
107	NC_009704	GC	3	6	56279	56284	0 %	0 %	50 %	50 %	153930577
108	NC_009704	AT	3	6	56599	56604	50 %	50 %	0 %	0 %	153930613
109	NC_009704	AT	3	6	57655	57660	50 %	50 %	0 %	0 %	153930613

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.