MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	ATAA	2	8	75	82	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009704	TATT	2	8	95	102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009704	GGAG	2	8	208	215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009704	CAAC	2	8	388	395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009704	CTTT	2	8	677	684	0 %	75 %	0 %	25 %	153930590
6	NC_009704	AGTG	2	8	808	815	25 %	25 %	50 %	0 %	153930590
7	NC_009704	TATT	2	8	919	926	25 %	75 %	0 %	0 %	153930590
8	NC_009704	CATC	2	8	944	951	25 %	25 %	0 %	50 %	153930590
9	NC_009704	CATT	2	8	2181	2188	25 %	50 %	0 %	25 %	153930621
10	NC_009704	TTGC	2	8	2853	2860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009704	CGGC	2	8	2894	2901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009704	TGTT	2	8	3718	3725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009704	TCTT	2	8	4298	4305	0 %	75 %	0 %	25 %	153930566
14	NC_009704	GTTG	2	8	4495	4502	0 %	50 %	50 %	0 %	153930566
15	NC_009704	GCCA	2	8	4998	5005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009704	ACAA	2	8	6068	6075	75 %	0 %	0 %	25 %	153930606
17	NC_009704	TCTT	2	8	6340	6347	0 %	75 %	0 %	25 %	153930606
18	NC_009704	ATGG	2	8	7570	7577	25 %	25 %	50 %	0 %	153930599
19	NC_009704	CTTT	2	8	7649	7656	0 %	75 %	0 %	25 %	153930599
20	NC_009704	ATCA	2	8	8093	8100	50 %	25 %	0 %	25 %	153930569
21	NC_009704	CTGG	2	8	8121	8128	0 %	25 %	50 %	25 %	153930569
22	NC_009704	GTTG	2	8	8517	8524	0 %	50 %	50 %	0 %	153930569
23	NC_009704	TTTA	2	8	9822	9829	25 %	75 %	0 %	0 %	153930569
24	NC_009704	AGAA	2	8	10379	10386	75 %	0 %	25 %	0 %	153930573
25	NC_009704	AAAG	2	8	10724	10731	75 %	0 %	25 %	0 %	153930573
26	NC_009704	CAAC	2	8	10990	10997	50 %	0 %	0 %	50 %	153930573
27	NC_009704	TTCA	2	8	11579	11586	25 %	50 %	0 %	25 %	153930568
28	NC_009704	AAGC	2	8	12245	12252	50 %	0 %	25 %	25 %	153930617
29	NC_009704	TATC	2	8	12397	12404	25 %	50 %	0 %	25 %	153930617
30	NC_009704	AGGA	2	8	12422	12429	50 %	0 %	50 %	0 %	153930617
31	NC_009704	TCCA	2	8	12464	12471	25 %	25 %	0 %	50 %	153930612
32	NC_009704	GTCA	2	8	13408	13415	25 %	25 %	25 %	25 %	153930612
33	NC_009704	GCAA	2	8	14254	14261	50 %	0 %	25 %	25 %	153930607
34	NC_009704	CAAT	2	8	14431	14438	50 %	25 %	0 %	25 %	153930607
35	NC_009704	GTTG	2	8	15313	15320	0 %	50 %	50 %	0 %	153930596
36	NC_009704	GGCT	2	8	15383	15390	0 %	25 %	50 %	25 %	153930596
37	NC_009704	CAAG	2	8	15466	15473	50 %	0 %	25 %	25 %	153930596
38	NC_009704	GGTA	2	8	15481	15488	25 %	25 %	50 %	0 %	153930596
39	NC_009704	CTTC	2	8	15603	15610	0 %	50 %	0 %	50 %	153930596
40	NC_009704	GAAT	2	8	16065	16072	50 %	25 %	25 %	0 %	153930596
41	NC_009704	TGAT	2	8	16167	16174	25 %	50 %	25 %	0 %	153930596
42	NC_009704	ATGA	2	8	16539	16546	50 %	25 %	25 %	0 %	153930585
43	NC_009704	GCTT	2	8	16829	16836	0 %	50 %	25 %	25 %	153930585
44	NC_009704	TAAT	2	8	16862	16869	50 %	50 %	0 %	0 %	153930585
45	NC_009704	ATAG	2	8	16965	16972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009704	TAGA	2	8	17048	17055	50 %	25 %	25 %	0 %	153930622
47	NC_009704	ATTT	2	8	17153	17160	25 %	75 %	0 %	0 %	153930622
48	NC_009704	ATAC	2	8	17182	17189	50 %	25 %	0 %	25 %	153930622
49	NC_009704	TTTA	2	8	17364	17371	25 %	75 %	0 %	0 %	153930622
50	NC_009704	ATTA	2	8	17415	17422	50 %	50 %	0 %	0 %	153930622
51	NC_009704	TGGA	2	8	17827	17834	25 %	25 %	50 %	0 %	153930571
52	NC_009704	TTAT	2	8	18353	18360	25 %	75 %	0 %	0 %	153930571
53	NC_009704	CCAA	2	8	18812	18819	50 %	0 %	0 %	50 %	153930563
54	NC_009704	TTTA	2	8	19399	19406	25 %	75 %	0 %	0 %	153930563
55	NC_009704	ATTG	2	8	19454	19461	25 %	50 %	25 %	0 %	153930563
56	NC_009704	AAAC	2	8	19703	19710	75 %	0 %	0 %	25 %	153930563
57	NC_009704	TAAA	2	8	19884	19891	75 %	25 %	0 %	0 %	153930563
58	NC_009704	AGAC	2	8	20312	20319	50 %	0 %	25 %	25 %	153930575
59	NC_009704	TTAT	2	8	20741	20748	25 %	75 %	0 %	0 %	153930575
60	NC_009704	TTTA	2	8	20766	20773	25 %	75 %	0 %	0 %	153930575
61	NC_009704	AGAA	2	8	20831	20838	75 %	0 %	25 %	0 %	153930575
62	NC_009704	TGAG	2	8	21192	21199	25 %	25 %	50 %	0 %	153930575
63	NC_009704	TTAT	2	8	21462	21469	25 %	75 %	0 %	0 %	153930575
64	NC_009704	CTAT	2	8	21516	21523	25 %	50 %	0 %	25 %	153930597
65	NC_009704	TTAA	2	8	22037	22044	50 %	50 %	0 %	0 %	153930625
66	NC_009704	TCCA	2	8	22108	22115	25 %	25 %	0 %	50 %	153930625
67	NC_009704	CCTG	2	8	22995	23002	0 %	25 %	25 %	50 %	153930625
68	NC_009704	TATT	2	8	23122	23129	25 %	75 %	0 %	0 %	153930625
69	NC_009704	CTTT	2	8	23832	23839	0 %	75 %	0 %	25 %	153930581
70	NC_009704	TGCT	2	8	23855	23862	0 %	50 %	25 %	25 %	153930581
71	NC_009704	TTTA	2	8	23897	23904	25 %	75 %	0 %	0 %	153930581
72	NC_009704	GTTT	2	8	23979	23986	0 %	75 %	25 %	0 %	153930581
73	NC_009704	TCAT	2	8	24008	24015	25 %	50 %	0 %	25 %	153930581
74	NC_009704	GAAA	2	8	24390	24397	75 %	0 %	25 %	0 %	153930581
75	NC_009704	AAAG	2	8	24528	24535	75 %	0 %	25 %	0 %	153930579
76	NC_009704	GCAA	2	8	25123	25130	50 %	0 %	25 %	25 %	153930595
77	NC_009704	GAAT	2	8	25218	25225	50 %	25 %	25 %	0 %	153930595
78	NC_009704	GAAT	2	8	25314	25321	50 %	25 %	25 %	0 %	153930595
79	NC_009704	CATT	2	8	25688	25695	25 %	50 %	0 %	25 %	153930595
80	NC_009704	ATCA	2	8	25960	25967	50 %	25 %	0 %	25 %	153930595
81	NC_009704	AATC	2	8	26888	26895	50 %	25 %	0 %	25 %	153930572
82	NC_009704	CAGG	2	8	27115	27122	25 %	0 %	50 %	25 %	153930572
83	NC_009704	GAAA	2	8	27564	27571	75 %	0 %	25 %	0 %	153930570
84	NC_009704	TGTT	2	8	27834	27841	0 %	75 %	25 %	0 %	153930570
85	NC_009704	ACAG	2	8	28246	28253	50 %	0 %	25 %	25 %	153930618
86	NC_009704	CCGT	2	8	28291	28298	0 %	25 %	25 %	50 %	153930618
87	NC_009704	TATC	2	8	29104	29111	25 %	50 %	0 %	25 %	153930583
88	NC_009704	ATAA	2	8	29497	29504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009704	AAAT	2	8	29593	29600	75 %	25 %	0 %	0 %	153930609
90	NC_009704	TTAT	2	8	29703	29710	25 %	75 %	0 %	0 %	153930609
91	NC_009704	AACA	2	8	29940	29947	75 %	0 %	0 %	25 %	153930609
92	NC_009704	AGAA	2	8	30157	30164	75 %	0 %	25 %	0 %	153930602
93	NC_009704	AAAG	2	8	30209	30216	75 %	0 %	25 %	0 %	153930602
94	NC_009704	TAAT	2	8	30419	30426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009704	AGTA	2	8	30929	30936	50 %	25 %	25 %	0 %	153930567
96	NC_009704	TGGT	2	8	31002	31009	0 %	50 %	50 %	0 %	153930567
97	NC_009704	CTAT	2	8	31477	31484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009704	AATA	2	8	31732	31739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009704	ATTT	2	8	31881	31888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009704	ATTG	2	8	32824	32831	25 %	50 %	25 %	0 %	153930601
101	NC_009704	GCCA	2	8	32863	32870	25 %	0 %	25 %	50 %	153930601
102	NC_009704	ATTT	2	8	33332	33339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009704	ATGT	2	8	33543	33550	25 %	50 %	25 %	0 %	153930623
104	NC_009704	AGAA	2	8	34208	34215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009704	CAGC	2	8	34338	34345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009704	TGGC	2	8	34506	34513	0 %	25 %	50 %	25 %	153930586
107	NC_009704	AGTC	2	8	35311	35318	25 %	25 %	25 %	25 %	153930565
108	NC_009704	ATTC	2	8	35656	35663	25 %	50 %	0 %	25 %	153930600
109	NC_009704	AAAG	2	8	35996	36003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009704	TGAA	2	8	36068	36075	50 %	25 %	25 %	0 %	153930614
111	NC_009704	ATGA	2	8	36179	36186	50 %	25 %	25 %	0 %	153930614
112	NC_009704	AATA	2	8	36521	36528	75 %	25 %	0 %	0 %	153930614
113	NC_009704	TAAA	2	8	37101	37108	75 %	25 %	0 %	0 %	153930603
114	NC_009704	ATTT	2	8	37113	37120	25 %	75 %	0 %	0 %	153930603
115	NC_009704	CTTT	2	8	37977	37984	0 %	75 %	0 %	25 %	153930610
116	NC_009704	TGAT	2	8	38024	38031	25 %	50 %	25 %	0 %	153930610
117	NC_009704	TGAT	2	8	38060	38067	25 %	50 %	25 %	0 %	153930610
118	NC_009704	AGAC	2	8	38417	38424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009704	TATT	2	8	38527	38534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009704	CGAC	2	8	39423	39430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009704	TGAG	2	8	39687	39694	25 %	25 %	50 %	0 %	153930589
122	NC_009704	CTTT	2	8	41158	41165	0 %	75 %	0 %	25 %	153930580
123	NC_009704	TGCT	2	8	41900	41907	0 %	50 %	25 %	25 %	153930580
124	NC_009704	CTGT	2	8	42073	42080	0 %	50 %	25 %	25 %	153930580
125	NC_009704	TGGC	2	8	42288	42295	0 %	25 %	50 %	25 %	153930580
126	NC_009704	GCTT	2	8	42415	42422	0 %	50 %	25 %	25 %	153930580
127	NC_009704	TGTT	2	8	42635	42642	0 %	75 %	25 %	0 %	153930580
128	NC_009704	CTCA	2	8	42691	42698	25 %	25 %	0 %	50 %	153930582
129	NC_009704	GTTT	2	8	42844	42851	0 %	75 %	25 %	0 %	153930582
130	NC_009704	AATA	2	8	43149	43156	75 %	25 %	0 %	0 %	153930584
131	NC_009704	TAAT	2	8	43238	43245	50 %	50 %	0 %	0 %	153930584
132	NC_009704	CACT	2	8	43754	43761	25 %	25 %	0 %	50 %	153930584
133	NC_009704	TAGT	2	8	43916	43923	25 %	50 %	25 %	0 %	153930584
134	NC_009704	ATTT	2	8	43982	43989	25 %	75 %	0 %	0 %	153930584
135	NC_009704	TCCC	2	8	44260	44267	0 %	25 %	0 %	75 %	153930584
136	NC_009704	AATA	2	8	44880	44887	75 %	25 %	0 %	0 %	153930584
137	NC_009704	GTCA	2	8	45035	45042	25 %	25 %	25 %	25 %	153930620
138	NC_009704	ATAA	2	8	45401	45408	75 %	25 %	0 %	0 %	153930620
139	NC_009704	TCTT	2	8	45656	45663	0 %	75 %	0 %	25 %	153930564
140	NC_009704	CAGT	2	8	45693	45700	25 %	25 %	25 %	25 %	153930564
141	NC_009704	TTGG	2	8	46230	46237	0 %	50 %	50 %	0 %	153930564
142	NC_009704	AGAT	2	8	46339	46346	50 %	25 %	25 %	0 %	153930564
143	NC_009704	TCCA	2	8	46466	46473	25 %	25 %	0 %	50 %	153930564
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.