MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 11679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009381	CTTA	2	8	216	223	25 %	50 %	0 %	25 %	145597325
2	NC_009381	CAGC	2	8	308	315	25 %	0 %	25 %	50 %	145597325
3	NC_009381	TTGG	2	8	875	882	0 %	50 %	50 %	0 %	145597325
4	NC_009381	GATT	2	8	1083	1090	25 %	50 %	25 %	0 %	145597325
5	NC_009381	GCCC	2	8	1228	1235	0 %	0 %	25 %	75 %	145597325
6	NC_009381	AACC	2	8	1269	1276	50 %	0 %	0 %	50 %	145597325
7	NC_009381	GCCT	2	8	1280	1287	0 %	25 %	25 %	50 %	145597325
8	NC_009381	TGAC	2	8	2445	2452	25 %	25 %	25 %	25 %	145597326
9	NC_009381	GCCA	2	8	2483	2490	25 %	0 %	25 %	50 %	145597326
10	NC_009381	CTTG	2	8	2543	2550	0 %	50 %	25 %	25 %	145597327
11	NC_009381	CGCA	2	8	2621	2628	25 %	0 %	25 %	50 %	145597327
12	NC_009381	GCAG	2	8	2868	2875	25 %	0 %	50 %	25 %	145597327
13	NC_009381	GCGG	2	8	3577	3584	0 %	0 %	75 %	25 %	145597327
14	NC_009381	TCAA	2	8	4408	4415	50 %	25 %	0 %	25 %	145597328
15	NC_009381	GTTG	2	8	4872	4879	0 %	50 %	50 %	0 %	145597328
16	NC_009381	GCGG	2	8	5086	5093	0 %	0 %	75 %	25 %	145597328
17	NC_009381	CTGG	2	8	5527	5534	0 %	25 %	50 %	25 %	145597328
18	NC_009381	GATT	2	8	5691	5698	25 %	50 %	25 %	0 %	145597328
19	NC_009381	ATGG	2	8	6462	6469	25 %	25 %	50 %	0 %	145597329
20	NC_009381	GCGG	2	8	7013	7020	0 %	0 %	75 %	25 %	145597329
21	NC_009381	GCTG	2	8	7043	7050	0 %	25 %	50 %	25 %	145597329
22	NC_009381	CGAG	2	8	7481	7488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009381	TTCT	2	8	8573	8580	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009381	GGTT	2	8	9065	9072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009381	AGCC	2	8	9833	9840	25 %	0 %	25 %	50 %	145597331
26	NC_009381	CTCA	2	8	10335	10342	25 %	25 %	0 %	50 %	145597332
27	NC_009381	TGGC	2	8	10493	10500	0 %	25 %	50 %	25 %	145597332
28	NC_009381	AGAT	2	8	10990	10997	50 %	25 %	25 %	0 %	145597332
29	NC_009381	CATA	2	8	11244	11251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009381	TTGC	2	8	11606	11613	0 %	50 %	25 %	25 %	145597333
31	NC_009381	GCTG	2	8	11832	11839	0 %	25 %	50 %	25 %	145597334
32	NC_009381	GATG	2	8	11893	11900	25 %	25 %	50 %	0 %	145597334
33	NC_009381	TTGT	2	8	13990	13997	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009381	GTCA	2	8	14664	14671	25 %	25 %	25 %	25 %	145597338
35	NC_009381	ATCG	2	8	14763	14770	25 %	25 %	25 %	25 %	145597338
36	NC_009381	GCCA	2	8	14948	14955	25 %	0 %	25 %	50 %	145597338
37	NC_009381	TGTT	2	8	15373	15380	0 %	75 %	25 %	0 %	145597338
38	NC_009381	CGGA	2	8	15446	15453	25 %	0 %	50 %	25 %	145597338
39	NC_009381	TATT	2	8	15973	15980	25 %	75 %	0 %	0 %	145597339
40	NC_009381	ATTC	2	8	16075	16082	25 %	50 %	0 %	25 %	145597339
41	NC_009381	CCCG	2	8	16396	16403	0 %	0 %	25 %	75 %	145597339
42	NC_009381	ATCA	2	8	16591	16598	50 %	25 %	0 %	25 %	145597339
43	NC_009381	AAAT	2	8	16795	16802	75 %	25 %	0 %	0 %	145597339
44	NC_009381	CATC	2	8	17181	17188	25 %	25 %	0 %	50 %	145597339
45	NC_009381	CTTT	2	8	17660	17667	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009381	AAAT	2	8	18229	18236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009381	ATAA	2	8	18286	18293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009381	TGAC	2	8	18687	18694	25 %	25 %	25 %	25 %	145597340
49	NC_009381	CCGC	2	8	18800	18807	0 %	0 %	25 %	75 %	145597340
50	NC_009381	CCAG	2	8	21898	21905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009381	CAGT	2	8	21947	21954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009381	GCCA	2	8	22430	22437	25 %	0 %	25 %	50 %	145597342
53	NC_009381	AGCA	2	8	22967	22974	50 %	0 %	25 %	25 %	145597342
54	NC_009381	CCGC	2	8	23335	23342	0 %	0 %	25 %	75 %	145597343
55	NC_009381	CGCC	2	8	23632	23639	0 %	0 %	25 %	75 %	145597343
56	NC_009381	GCCC	2	8	24261	24268	0 %	0 %	25 %	75 %	145597344
57	NC_009381	CCCA	2	8	25670	25677	25 %	0 %	0 %	75 %	145597346
58	NC_009381	CCTG	2	8	25682	25689	0 %	25 %	25 %	50 %	145597346
59	NC_009381	CCGA	2	8	25744	25751	25 %	0 %	25 %	50 %	145597346
60	NC_009381	TACT	2	8	25986	25993	25 %	50 %	0 %	25 %	145597346
61	NC_009381	CTGC	2	8	26275	26282	0 %	25 %	25 %	50 %	145597346
62	NC_009381	GGCA	2	8	26868	26875	25 %	0 %	50 %	25 %	145597347
63	NC_009381	CGTC	2	8	26946	26953	0 %	25 %	25 %	50 %	145597347
64	NC_009381	ATCA	2	8	27144	27151	50 %	25 %	0 %	25 %	145597347
65	NC_009381	GACC	2	8	27480	27487	25 %	0 %	25 %	50 %	145597347
66	NC_009381	CGCC	2	8	27723	27730	0 %	0 %	25 %	75 %	145597347
67	NC_009381	TGAA	2	8	27764	27771	50 %	25 %	25 %	0 %	145597347
68	NC_009381	CTCG	2	8	28546	28553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009381	GCTG	2	8	29052	29059	0 %	25 %	50 %	25 %	145597348
70	NC_009381	ATCA	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	145597348
71	NC_009381	ACAA	2	8	30074	30081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009381	GTTT	2	8	30268	30275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009381	GGCT	2	8	30510	30517	0 %	25 %	50 %	25 %	145597349
74	NC_009381	GTTG	2	8	30845	30852	0 %	50 %	50 %	0 %	145597349
75	NC_009381	GGCT	2	8	30868	30875	0 %	25 %	50 %	25 %	145597349
76	NC_009381	ATTT	2	8	31161	31168	25 %	75 %	0 %	0 %	145597349
77	NC_009381	TAAG	2	8	32257	32264	50 %	25 %	25 %	0 %	145597349
78	NC_009381	GCCA	2	8	33026	33033	25 %	0 %	25 %	50 %	145597350
79	NC_009381	GAAA	2	8	34738	34745	75 %	0 %	25 %	0 %	145597352
80	NC_009381	AAGA	2	8	34853	34860	75 %	0 %	25 %	0 %	145597352
81	NC_009381	AATT	2	8	35282	35289	50 %	50 %	0 %	0 %	145597353
82	NC_009381	AGAT	2	8	35346	35353	50 %	25 %	25 %	0 %	145597353
83	NC_009381	ATAC	2	8	35407	35414	50 %	25 %	0 %	25 %	145597353
84	NC_009381	CTTA	2	8	35649	35656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009381	GTCA	2	8	35696	35703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009381	TTCA	2	8	35891	35898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009381	TTAA	2	8	35906	35913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009381	GTAT	2	8	36094	36101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009381	CCGT	2	8	36453	36460	0 %	25 %	25 %	50 %	145597354
90	NC_009381	CCCG	2	8	37181	37188	0 %	0 %	25 %	75 %	145597355
91	NC_009381	TCAT	2	8	37292	37299	25 %	50 %	0 %	25 %	145597355
92	NC_009381	ATTG	2	8	37365	37372	25 %	50 %	25 %	0 %	145597355
93	NC_009381	TCAT	2	8	37568	37575	25 %	50 %	0 %	25 %	145597355
94	NC_009381	CCAG	2	8	39212	39219	25 %	0 %	25 %	50 %	145597356
95	NC_009381	TTAA	2	8	39668	39675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009381	CGCC	2	8	40067	40074	0 %	0 %	25 %	75 %	145597357
97	NC_009381	GACC	2	8	40366	40373	25 %	0 %	25 %	50 %	145597357
98	NC_009381	GCCA	2	8	40746	40753	25 %	0 %	25 %	50 %	145597357
99	NC_009381	ATTC	2	8	40947	40954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009381	AAAG	2	8	41268	41275	75 %	0 %	25 %	0 %	145597358
101	NC_009381	ACCA	2	8	41694	41701	50 %	0 %	0 %	50 %	145597359
102	NC_009381	CTGA	2	8	42414	42421	25 %	25 %	25 %	25 %	145597359
103	NC_009381	TACC	2	8	42491	42498	25 %	25 %	0 %	50 %	145597359
104	NC_009381	GCTG	2	8	42946	42953	0 %	25 %	50 %	25 %	145597359
105	NC_009381	CCGG	2	8	43287	43294	0 %	0 %	50 %	50 %	145597359
106	NC_009381	GTTT	2	8	43555	43562	0 %	75 %	25 %	0 %	145597359
107	NC_009381	ATGT	2	8	44793	44800	25 %	50 %	25 %	0 %	145597360
108	NC_009381	ATGA	2	8	45371	45378	50 %	25 %	25 %	0 %	145597361
109	NC_009381	GCCA	2	8	46276	46283	25 %	0 %	25 %	50 %	145597362
110	NC_009381	TAAT	2	8	46848	46855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009381	GCAA	2	8	47366	47373	50 %	0 %	25 %	25 %	145597363
112	NC_009381	CAGG	2	8	47440	47447	25 %	0 %	50 %	25 %	145597363
113	NC_009381	GGTT	2	8	47903	47910	0 %	50 %	50 %	0 %	145597363
114	NC_009381	AACC	2	8	48942	48949	50 %	0 %	0 %	50 %	145597364
115	NC_009381	ATAA	2	8	49224	49231	75 %	25 %	0 %	0 %	145597364
116	NC_009381	GGGC	2	8	49677	49684	0 %	0 %	75 %	25 %	145597364
117	NC_009381	TGAT	2	8	49738	49745	25 %	50 %	25 %	0 %	145597364
118	NC_009381	GGAG	2	8	49757	49764	25 %	0 %	75 %	0 %	145597364
119	NC_009381	GTGG	2	8	49780	49787	0 %	25 %	75 %	0 %	145597364
120	NC_009381	GATT	2	8	50288	50295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009381	GCCA	2	8	51706	51713	25 %	0 %	25 %	50 %	145597366
122	NC_009381	TTTC	2	8	52640	52647	0 %	75 %	0 %	25 %	145597367
123	NC_009381	TTTC	2	8	52874	52881	0 %	75 %	0 %	25 %	145597367
124	NC_009381	CTTG	2	8	53190	53197	0 %	50 %	25 %	25 %	145597367
125	NC_009381	CCTT	2	8	53234	53241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009381	TAGA	2	8	53503	53510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009381	CCAG	2	8	53652	53659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009381	AGGC	2	8	54455	54462	25 %	0 %	50 %	25 %	145597369
129	NC_009381	CAAT	2	8	54700	54707	50 %	25 %	0 %	25 %	145597369
130	NC_009381	AAAG	2	8	54881	54888	75 %	0 %	25 %	0 %	145597369
131	NC_009381	CTGG	2	8	55042	55049	0 %	25 %	50 %	25 %	145597369
132	NC_009381	TAAT	2	8	55166	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009381	CGAG	2	8	55472	55479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009381	TTCT	2	8	56564	56571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009381	GGTT	2	8	57056	57063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009381	CTGG	2	8	57225	57232	0 %	25 %	50 %	25 %	145597371
137	NC_009381	CGCT	2	8	57353	57360	0 %	25 %	25 %	50 %	145597371
138	NC_009381	AATA	2	8	57644	57651	75 %	25 %	0 %	0 %	145597371
139	NC_009381	GCCC	2	8	58313	58320	0 %	0 %	25 %	75 %	145597372
140	NC_009381	GCCA	2	8	58432	58439	25 %	0 %	25 %	50 %	145597372
141	NC_009381	AGTA	2	8	58917	58924	50 %	25 %	25 %	0 %	145597373
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143	NC_009381	TCTG	2	8	60005	60012	0 %	50 %	25 %	25 %	145597374
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