MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009381	ACT	2	6	155525	155530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597467
3002	NC_009381	AAG	2	6	155568	155573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597467
3003	NC_009381	GTAGGC	2	12	155583	155594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145597467
3004	NC_009381	GTG	2	6	155619	155624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597467
3005	NC_009381	TC	3	6	155641	155646	0 %	50 %	0 %	50 %	145597467
3006	NC_009381	GCA	2	6	155748	155753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597467
3007	NC_009381	CGT	2	6	155769	155774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597467
3008	NC_009381	CGA	2	6	155810	155815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597467
3009	NC_009381	AAG	3	9	155838	155846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597467
3010	NC_009381	AGC	2	6	155870	155875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597468
3011	NC_009381	CGT	2	6	155883	155888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597468
3012	NC_009381	CGC	2	6	155901	155906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597468
3013	NC_009381	TGG	2	6	155935	155940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597468
3014	NC_009381	AGC	2	6	156005	156010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597468
3015	NC_009381	CAA	2	6	156056	156061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597468
3016	NC_009381	GCA	2	6	156069	156074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597468
3017	NC_009381	GC	3	6	156098	156103	0 %	0 %	50 %	50 %	145597468
3018	NC_009381	TGC	2	6	156182	156187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597468
3019	NC_009381	AGT	2	6	156337	156342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597469
3020	NC_009381	GCA	2	6	156469	156474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597469
3021	NC_009381	TAT	2	6	156538	156543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597469
3022	NC_009381	GGT	2	6	156548	156553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597469
3023	NC_009381	GC	3	6	156559	156564	0 %	0 %	50 %	50 %	145597469
3024	NC_009381	CTA	2	6	156615	156620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597469
3025	NC_009381	GAA	2	6	156710	156715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597469
3026	NC_009381	CAAA	2	8	156757	156764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_009381	CGT	2	6	156820	156825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_009381	CTG	2	6	156857	156862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_009381	GAG	2	6	156904	156909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009381	TGG	3	9	157041	157049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597470
3031	NC_009381	CGT	2	6	157054	157059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597470
3032	NC_009381	GGT	2	6	157069	157074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597470
3033	NC_009381	TCG	2	6	157089	157094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597470
3034	NC_009381	GAT	2	6	157128	157133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597470
3035	NC_009381	GTCT	2	8	157148	157155	0 %	50 %	25 %	25 %	145597470
3036	NC_009381	GTT	2	6	157213	157218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597470
3037	NC_009381	TGC	2	6	157311	157316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597470
3038	NC_009381	GCT	2	6	157324	157329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597470
3039	NC_009381	TGTT	2	8	157428	157435	0 %	75 %	25 %	0 %	145597471
3040	NC_009381	AGC	2	6	157518	157523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3041	NC_009381	AG	3	6	157524	157529	50 %	0 %	50 %	0 %	145597471
3042	NC_009381	CAT	2	6	157534	157539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597471
3043	NC_009381	TGG	2	6	157561	157566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597471
3044	NC_009381	ATT	2	6	157625	157630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597471
3045	NC_009381	GGT	2	6	157645	157650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597471
3046	NC_009381	AAAG	2	8	157672	157679	75 %	0 %	25 %	0 %	145597471
3047	NC_009381	CGT	2	6	157694	157699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3048	NC_009381	ATCG	2	8	157750	157757	25 %	25 %	25 %	25 %	145597471
3049	NC_009381	AATC	2	8	157804	157811	50 %	25 %	0 %	25 %	145597471
3050	NC_009381	GCTTT	2	10	157815	157824	0 %	60 %	20 %	20 %	145597471
3051	NC_009381	TGT	2	6	157837	157842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597471
3052	NC_009381	TTG	2	6	157941	157946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597471
3053	NC_009381	TCC	2	6	157954	157959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597471
3054	NC_009381	TCC	2	6	158007	158012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597471
3055	NC_009381	GTTG	2	8	158020	158027	0 %	50 %	50 %	0 %	145597471
3056	NC_009381	CTT	2	6	158050	158055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597471
3057	NC_009381	GTT	2	6	158057	158062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597471
3058	NC_009381	CGT	2	6	158081	158086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3059	NC_009381	CAA	2	6	158111	158116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597471
3060	NC_009381	GTC	2	6	158118	158123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3061	NC_009381	GCA	2	6	158132	158137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3062	NC_009381	CA	3	6	158143	158148	50 %	0 %	0 %	50 %	145597471
3063	NC_009381	CAT	2	6	158229	158234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597471
3064	NC_009381	GAC	2	6	158266	158271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3065	NC_009381	ATC	2	6	158330	158335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597471
3066	NC_009381	TTC	2	6	158336	158341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597471
3067	NC_009381	TCT	2	6	158346	158351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597471
3068	NC_009381	CAG	2	6	158382	158387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597471
3069	NC_009381	GAA	2	6	158395	158400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597471
3070	NC_009381	TGG	2	6	158560	158565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597471
3071	NC_009381	GTG	2	6	158585	158590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597471
3072	NC_009381	TCA	2	6	158592	158597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597471
3073	NC_009381	TGA	2	6	158625	158630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597471
3074	NC_009381	GAA	2	6	158656	158661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597471
3075	NC_009381	AGCC	2	8	158888	158895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_009381	TAG	2	6	158972	158977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_009381	TCGGCA	2	12	159054	159065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145597472
3078	NC_009381	TGC	2	6	159091	159096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597472
3079	NC_009381	CGT	2	6	159194	159199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597472
3080	NC_009381	TCG	2	6	159259	159264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597472
3081	NC_009381	AAT	2	6	159339	159344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597472
3082	NC_009381	AAT	2	6	159356	159361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597473
3083	NC_009381	AAGA	2	8	159395	159402	75 %	0 %	25 %	0 %	145597473
3084	NC_009381	CTT	2	6	159433	159438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597473
3085	NC_009381	CAA	2	6	159440	159445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597473
3086	NC_009381	TTGGG	2	10	159483	159492	0 %	40 %	60 %	0 %	145597473
3087	NC_009381	CAG	2	6	159496	159501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597473
3088	NC_009381	GCA	2	6	159555	159560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597473
3089	NC_009381	GCGCT	2	10	159563	159572	0 %	20 %	40 %	40 %	145597473
3090	NC_009381	CTA	2	6	159643	159648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597473
3091	NC_009381	GTC	2	6	159721	159726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597473
3092	NC_009381	GCT	2	6	159751	159756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_009381	GA	4	8	159770	159777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_009381	CGT	2	6	159816	159821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597474
3095	NC_009381	CG	3	6	159855	159860	0 %	0 %	50 %	50 %	145597474
3096	NC_009381	AAC	2	6	159883	159888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597474
3097	NC_009381	GTCT	2	8	159919	159926	0 %	50 %	25 %	25 %	145597474
3098	NC_009381	ACT	2	6	160000	160005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597474
3099	NC_009381	AGC	2	6	160013	160018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597474
3100	NC_009381	GTC	2	6	160066	160071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597474
3101	NC_009381	GTT	2	6	160164	160169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597474
3102	NC_009381	CTT	2	6	160177	160182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597474
3103	NC_009381	GCTG	2	8	160259	160266	0 %	25 %	50 %	25 %	145597474
3104	NC_009381	GT	3	6	160318	160323	0 %	50 %	50 %	0 %	145597474
3105	NC_009381	TCG	2	6	160378	160383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597474
3106	NC_009381	AG	3	6	160414	160419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009381	ACGC	2	8	160489	160496	25 %	0 %	25 %	50 %	145597475
3108	NC_009381	TAC	2	6	160616	160621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597475
3109	NC_009381	AAG	2	6	160637	160642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597475
3110	NC_009381	ATG	2	6	160775	160780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597475
3111	NC_009381	GCA	2	6	160803	160808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597475
3112	NC_009381	CGTGGT	2	12	160867	160878	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145597475
3113	NC_009381	ATTC	2	8	160900	160907	25 %	50 %	0 %	25 %	145597475
3114	NC_009381	GAA	2	6	160909	160914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597475
3115	NC_009381	GTC	2	6	160931	160936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597475
3116	NC_009381	TAG	2	6	160940	160945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597475
3117	NC_009381	AGC	2	6	160989	160994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597475
3118	NC_009381	CGAT	2	8	161054	161061	25 %	25 %	25 %	25 %	145597475
3119	NC_009381	CCG	2	6	161076	161081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597475
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3121	NC_009381	CGATC	2	10	161172	161181	20 %	20 %	20 %	40 %	145597475
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3236	NC_009381	TAT	2	6	166463	166468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3242	NC_009381	TCA	2	6	166702	166707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597482
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