MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009381	AAC	2	6	129860	129865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597431
2502	NC_009381	GGT	2	6	129877	129882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597431
2503	NC_009381	GCACC	2	10	129999	130008	20 %	0 %	20 %	60 %	145597431
2504	NC_009381	AGA	2	6	130014	130019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597431
2505	NC_009381	AGA	2	6	130046	130051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597431
2506	NC_009381	ATT	2	6	130107	130112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597431
2507	NC_009381	AAT	2	6	130137	130142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597431
2508	NC_009381	AAAG	2	8	130156	130163	75 %	0 %	25 %	0 %	145597431
2509	NC_009381	T	6	6	130179	130184	0 %	100 %	0 %	0 %	145597431
2510	NC_009381	CAC	2	6	130194	130199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597431
2511	NC_009381	GCA	2	6	130230	130235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597431
2512	NC_009381	GAT	2	6	130237	130242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597431
2513	NC_009381	CTAC	2	8	130290	130297	25 %	25 %	0 %	50 %	145597431
2514	NC_009381	GCG	2	6	130302	130307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597431
2515	NC_009381	CGA	2	6	130322	130327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597431
2516	NC_009381	TTA	2	6	130369	130374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_009381	GGC	2	6	130396	130401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_009381	CCA	2	6	130518	130523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_009381	CGG	2	6	130566	130571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_009381	CGC	2	6	130597	130602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_009381	GTC	2	6	130609	130614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_009381	GACA	2	8	130628	130635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_009381	TGC	2	6	130658	130663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_009381	GTT	2	6	130671	130676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_009381	CTG	2	6	130677	130682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_009381	TTA	2	6	130772	130777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_009381	C	6	6	130811	130816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2528	NC_009381	GTC	2	6	130970	130975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_009381	CCA	2	6	131055	131060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_009381	AGC	2	6	131070	131075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_009381	GCC	2	6	131098	131103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_009381	TC	3	6	131156	131161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_009381	GATT	2	8	131223	131230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_009381	CTG	3	9	131257	131265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_009381	GTT	2	6	131272	131277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_009381	TTAA	2	8	131385	131392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_009381	TTAT	2	8	131442	131449	25 %	75 %	0 %	0 %	145597432
2538	NC_009381	GC	3	6	131453	131458	0 %	0 %	50 %	50 %	145597432
2539	NC_009381	T	6	6	131608	131613	0 %	100 %	0 %	0 %	145597432
2540	NC_009381	TAA	2	6	131617	131622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597432
2541	NC_009381	GGT	2	6	131678	131683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597432
2542	NC_009381	GGC	2	6	131692	131697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597432
2543	NC_009381	ATA	2	6	131717	131722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597432
2544	NC_009381	GCG	2	6	131740	131745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597432
2545	NC_009381	GGT	2	6	131854	131859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597432
2546	NC_009381	TTG	2	6	131989	131994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597432
2547	NC_009381	CTG	2	6	132103	132108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597432
2548	NC_009381	CTG	2	6	132115	132120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597432
2549	NC_009381	GCCA	2	8	132146	132153	25 %	0 %	25 %	50 %	145597432
2550	NC_009381	ATC	2	6	132154	132159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597432
2551	NC_009381	CTG	2	6	132235	132240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597432
2552	NC_009381	AGT	2	6	132284	132289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597432
2553	NC_009381	AAT	2	6	132325	132330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597432
2554	NC_009381	CGC	2	6	132477	132482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2555	NC_009381	TA	3	6	132571	132576	50 %	50 %	0 %	0 %	145597433
2556	NC_009381	TTG	2	6	132672	132677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597433
2557	NC_009381	GC	3	6	132705	132710	0 %	0 %	50 %	50 %	145597433
2558	NC_009381	TGT	2	6	132865	132870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597433
2559	NC_009381	CCA	2	6	132932	132937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597433
2560	NC_009381	CTG	2	6	132942	132947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2561	NC_009381	CGT	2	6	132986	132991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2562	NC_009381	GGT	2	6	133011	133016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597433
2563	NC_009381	ACC	3	9	133045	133053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597433
2564	NC_009381	ATCA	2	8	133068	133075	50 %	25 %	0 %	25 %	145597433
2565	NC_009381	TCCAAA	2	12	133102	133113	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	145597433
2566	NC_009381	TGGT	2	8	133114	133121	0 %	50 %	50 %	0 %	145597433
2567	NC_009381	CAG	2	6	133131	133136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2568	NC_009381	AAT	2	6	133158	133163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597433
2569	NC_009381	TC	3	6	133187	133192	0 %	50 %	0 %	50 %	145597433
2570	NC_009381	GCGG	2	8	133203	133210	0 %	0 %	75 %	25 %	145597433
2571	NC_009381	GGTC	2	8	133214	133221	0 %	25 %	50 %	25 %	145597433
2572	NC_009381	ACC	2	6	133245	133250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597433
2573	NC_009381	TGC	2	6	133267	133272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2574	NC_009381	GGC	2	6	133292	133297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597433
2575	NC_009381	TGC	2	6	133303	133308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2576	NC_009381	TCA	2	6	133318	133323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597433
2577	NC_009381	AAT	2	6	133420	133425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597433
2578	NC_009381	GCA	2	6	133553	133558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2579	NC_009381	GCTT	2	8	133666	133673	0 %	50 %	25 %	25 %	145597433
2580	NC_009381	TGG	2	6	133679	133684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597433
2581	NC_009381	TGCTGA	2	12	133735	133746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145597433
2582	NC_009381	TTG	3	9	133755	133763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597433
2583	NC_009381	TGG	2	6	133772	133777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597433
2584	NC_009381	ATTC	2	8	133814	133821	25 %	50 %	0 %	25 %	145597433
2585	NC_009381	ATA	2	6	133855	133860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597433
2586	NC_009381	CCAG	2	8	133928	133935	25 %	0 %	25 %	50 %	145597433
2587	NC_009381	ATCCAA	2	12	133944	133955	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	145597433
2588	NC_009381	TGGT	3	12	133957	133968	0 %	50 %	50 %	0 %	145597433
2589	NC_009381	GCCA	2	8	134030	134037	25 %	0 %	25 %	50 %	145597433
2590	NC_009381	ATGG	2	8	134130	134137	25 %	25 %	50 %	0 %	145597433
2591	NC_009381	ATGGC	2	10	134164	134173	20 %	20 %	40 %	20 %	145597433
2592	NC_009381	CAT	2	6	134174	134179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597433
2593	NC_009381	T	7	7	134179	134185	0 %	100 %	0 %	0 %	145597433
2594	NC_009381	CAG	2	6	134361	134366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597433
2595	NC_009381	A	6	6	134480	134485	100 %	0 %	0 %	0 %	145597433
2596	NC_009381	ATC	2	6	134524	134529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_009381	TGAC	2	8	134578	134585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_009381	ACCT	2	8	134618	134625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_009381	GAC	2	6	134721	134726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_009381	ATG	2	6	134740	134745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597434
2601	NC_009381	GCC	2	6	134751	134756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597434
2602	NC_009381	TGC	2	6	134765	134770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597434
2603	NC_009381	CAG	2	6	134830	134835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597434
2604	NC_009381	TCA	2	6	134895	134900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597434
2605	NC_009381	AGC	2	6	134903	134908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597434
2606	NC_009381	ATC	2	6	134921	134926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597434
2607	NC_009381	TA	3	6	134951	134956	50 %	50 %	0 %	0 %	145597434
2608	NC_009381	GGC	2	6	135028	135033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597434
2609	NC_009381	ACC	2	6	135070	135075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597434
2610	NC_009381	AGG	2	6	135083	135088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597434
2611	NC_009381	CGG	2	6	135155	135160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597434
2612	NC_009381	GAT	2	6	135189	135194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597434
2613	NC_009381	GCT	2	6	135340	135345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597435
2614	NC_009381	CGT	2	6	135483	135488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597435
2615	NC_009381	GGCA	2	8	135632	135639	25 %	0 %	50 %	25 %	145597435
2616	NC_009381	GTC	2	6	135669	135674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597435
2617	NC_009381	GGC	2	6	135727	135732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597435
2618	NC_009381	TTG	2	6	135892	135897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597435
2619	NC_009381	GTT	2	6	135903	135908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597435
2620	NC_009381	TGG	2	6	135962	135967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597435
2621	NC_009381	GTTT	2	8	136109	136116	0 %	75 %	25 %	0 %	145597435
2622	NC_009381	T	6	6	136114	136119	0 %	100 %	0 %	0 %	145597435
2623	NC_009381	GGCAT	2	10	136129	136138	20 %	20 %	40 %	20 %	145597435
2624	NC_009381	CTG	2	6	136177	136182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597435
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2746	NC_009381	AAC	2	6	142211	142216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2871	NC_009381	GGAAT	2	10	149153	149162	40 %	20 %	40 %	0 %	145597453
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2873	NC_009381	GTT	3	9	149246	149254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597453
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