MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009381	TCC	2	6	52623	52628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009381	TTTC	2	8	52640	52647	0 %	75 %	0 %	25 %	145597367
1003	NC_009381	ATC	2	6	52660	52665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597367
1004	NC_009381	TTATT	2	10	52689	52698	20 %	80 %	0 %	0 %	145597367
1005	NC_009381	GTA	2	6	52756	52761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597367
1006	NC_009381	AT	3	6	52772	52777	50 %	50 %	0 %	0 %	145597367
1007	NC_009381	ATA	2	6	52852	52857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597367
1008	NC_009381	TTTC	2	8	52874	52881	0 %	75 %	0 %	25 %	145597367
1009	NC_009381	GTA	2	6	52931	52936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597367
1010	NC_009381	ACT	2	6	52975	52980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597367
1011	NC_009381	GAT	2	6	53011	53016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597367
1012	NC_009381	CAA	2	6	53085	53090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597367
1013	NC_009381	CTTG	2	8	53190	53197	0 %	50 %	25 %	25 %	145597367
1014	NC_009381	CCTT	2	8	53234	53241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_009381	T	7	7	53282	53288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009381	ATT	2	6	53295	53300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597368
1017	NC_009381	TAT	2	6	53343	53348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597368
1018	NC_009381	CTT	2	6	53360	53365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597368
1019	NC_009381	GA	3	6	53366	53371	50 %	0 %	50 %	0 %	145597368
1020	NC_009381	TAT	2	6	53418	53423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597368
1021	NC_009381	T	7	7	53466	53472	0 %	100 %	0 %	0 %	145597368
1022	NC_009381	TAT	2	6	53492	53497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009381	TAGA	2	8	53503	53510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009381	TA	3	6	53529	53534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009381	ATT	2	6	53543	53548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009381	CCAG	2	8	53652	53659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_009381	AT	3	6	53763	53768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009381	GT	3	6	53836	53841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009381	CTG	2	6	53884	53889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009381	CTC	2	6	53906	53911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_009381	CAG	2	6	53912	53917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009381	GGC	2	6	53953	53958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597369
1033	NC_009381	TCA	2	6	53998	54003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597369
1034	NC_009381	ATC	2	6	54078	54083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597369
1035	NC_009381	ATC	2	6	54090	54095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597369
1036	NC_009381	CGG	2	6	54202	54207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597369
1037	NC_009381	CGG	2	6	54247	54252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597369
1038	NC_009381	ATC	2	6	54255	54260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597369
1039	NC_009381	CAA	2	6	54265	54270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597369
1040	NC_009381	AG	3	6	54398	54403	50 %	0 %	50 %	0 %	145597369
1041	NC_009381	AGGC	2	8	54455	54462	25 %	0 %	50 %	25 %	145597369
1042	NC_009381	GCG	2	6	54497	54502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597369
1043	NC_009381	GCA	2	6	54669	54674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597369
1044	NC_009381	CAAT	2	8	54700	54707	50 %	25 %	0 %	25 %	145597369
1045	NC_009381	CTT	2	6	54748	54753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597369
1046	NC_009381	AAG	2	6	54816	54821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597369
1047	NC_009381	GGCAA	2	10	54863	54872	40 %	0 %	40 %	20 %	145597369
1048	NC_009381	AAAG	2	8	54881	54888	75 %	0 %	25 %	0 %	145597369
1049	NC_009381	GAC	2	6	54910	54915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597369
1050	NC_009381	CGG	2	6	54921	54926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597369
1051	NC_009381	C	7	7	54962	54968	0 %	0 %	0 %	100 %	145597369
1052	NC_009381	CTGG	2	8	55042	55049	0 %	25 %	50 %	25 %	145597369
1053	NC_009381	AG	3	6	55096	55101	50 %	0 %	50 %	0 %	145597369
1054	NC_009381	TAAT	2	8	55166	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009381	AAT	2	6	55263	55268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009381	TTAGT	2	10	55274	55283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009381	TAA	2	6	55379	55384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009381	TTTTGA	2	12	55387	55398	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009381	AGC	2	6	55428	55433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009381	GAA	2	6	55439	55444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009381	CGAG	2	8	55472	55479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_009381	ATG	2	6	55523	55528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009381	TAA	2	6	55705	55710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597370
1064	NC_009381	AT	3	6	55714	55719	50 %	50 %	0 %	0 %	145597370
1065	NC_009381	CTT	2	6	55758	55763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597370
1066	NC_009381	GAA	2	6	55794	55799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597370
1067	NC_009381	CTT	2	6	55931	55936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597370
1068	NC_009381	CTTTCA	2	12	55943	55954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	145597370
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1070	NC_009381	AAT	2	6	56016	56021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597370
1071	NC_009381	ATT	2	6	56025	56030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597370
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1073	NC_009381	T	6	6	56187	56192	0 %	100 %	0 %	0 %	145597370
1074	NC_009381	CCG	2	6	56193	56198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597370
1075	NC_009381	TCA	2	6	56225	56230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597370
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1077	NC_009381	GTC	2	6	56315	56320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597370
1078	NC_009381	TCA	2	6	56359	56364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597370
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1081	NC_009381	CTG	2	6	56450	56455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009381	T	6	6	56477	56482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009381	CTG	2	6	56483	56488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_009381	TCT	2	6	56505	56510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_009381	T	6	6	56526	56531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009381	CG	3	6	56546	56551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_009381	TTCT	2	8	56564	56571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_009381	TAG	2	6	56635	56640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009381	CTT	2	6	56665	56670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_009381	TCC	2	6	56672	56677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_009381	CAT	2	6	56768	56773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_009381	TCCAG	2	10	56829	56838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_009381	CCG	2	6	56950	56955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_009381	GAACC	2	10	56985	56994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_009381	GGTT	2	8	57056	57063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009381	AAC	2	6	57094	57099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_009381	ACC	2	6	57153	57158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_009381	TGC	2	6	57201	57206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597371
1099	NC_009381	TCA	2	6	57217	57222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597371
1100	NC_009381	CTGG	2	8	57225	57232	0 %	25 %	50 %	25 %	145597371
1101	NC_009381	CA	3	6	57329	57334	50 %	0 %	0 %	50 %	145597371
1102	NC_009381	AAT	2	6	57347	57352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597371
1103	NC_009381	CGCT	2	8	57353	57360	0 %	25 %	25 %	50 %	145597371
1104	NC_009381	AAT	2	6	57479	57484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597371
1105	NC_009381	CCA	2	6	57486	57491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597371
1106	NC_009381	TCT	2	6	57534	57539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597371
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1108	NC_009381	TCA	2	6	57601	57606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597371
1109	NC_009381	GTG	2	6	57630	57635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597371
1110	NC_009381	AATA	2	8	57644	57651	75 %	25 %	0 %	0 %	145597371
1111	NC_009381	TTC	2	6	57704	57709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597371
1112	NC_009381	GCC	2	6	57765	57770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597371
1113	NC_009381	CCA	2	6	57771	57776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597371
1114	NC_009381	TGA	2	6	57777	57782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597371
1115	NC_009381	TTTTG	2	10	57790	57799	0 %	80 %	20 %	0 %	145597371
1116	NC_009381	AAT	2	6	57902	57907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597371
1117	NC_009381	CAT	2	6	57910	57915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597371
1118	NC_009381	TAG	2	6	58014	58019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597372
1119	NC_009381	AAT	2	6	58023	58028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597372
1120	NC_009381	ACC	2	6	58206	58211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597372
1121	NC_009381	GCCC	2	8	58313	58320	0 %	0 %	25 %	75 %	145597372
1122	NC_009381	ACC	3	9	58325	58333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597372
1123	NC_009381	GCA	2	6	58355	58360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597372
1124	NC_009381	AAG	2	6	58372	58377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597372
1125	NC_009381	GCT	2	6	58413	58418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597372
1126	NC_009381	GCCA	2	8	58432	58439	25 %	0 %	25 %	50 %	145597372
1127	NC_009381	ACA	2	6	58493	58498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597372
1128	NC_009381	GGC	2	6	58602	58607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597372
1129	NC_009381	TCA	2	6	58675	58680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597372
1130	NC_009381	TGG	2	6	58735	58740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597372
1131	NC_009381	ATT	2	6	58806	58811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009381	TTG	2	6	58910	58915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597373
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1134	NC_009381	TGC	2	6	58939	58944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597373
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1139	NC_009381	TTA	2	6	59263	59268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_009381	AG	3	6	59287	59292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_009381	CGA	2	6	59300	59305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_009381	ATC	2	6	59504	59509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_009381	CAT	2	6	59539	59544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597374
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1150	NC_009381	GTT	2	6	59853	59858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597374
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1153	NC_009381	GCG	2	6	60070	60075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597374
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1163	NC_009381	GGC	2	6	60669	60674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597374
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1169	NC_009381	TTCAC	2	10	60953	60962	20 %	40 %	0 %	40 %	145597374
1170	NC_009381	GCCA	2	8	60983	60990	25 %	0 %	25 %	50 %	145597374
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1253	NC_009381	AGC	2	6	64997	65002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597376
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