MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009381	CGC	2	6	25738	25743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597346
502	NC_009381	CCGA	2	8	25744	25751	25 %	0 %	25 %	50 %	145597346
503	NC_009381	ACA	2	6	25782	25787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597346
504	NC_009381	TAT	2	6	25789	25794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597346
505	NC_009381	ACA	2	6	25826	25831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597346
506	NC_009381	TTCGT	2	10	25892	25901	0 %	60 %	20 %	20 %	145597346
507	NC_009381	TACT	2	8	25986	25993	25 %	50 %	0 %	25 %	145597346
508	NC_009381	G	7	7	26004	26010	0 %	0 %	100 %	0 %	145597346
509	NC_009381	ACC	2	6	26125	26130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597346
510	NC_009381	ATC	2	6	26147	26152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597346
511	NC_009381	AAG	2	6	26234	26239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597346
512	NC_009381	CTGC	2	8	26275	26282	0 %	25 %	25 %	50 %	145597346
513	NC_009381	CTG	2	6	26320	26325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597346
514	NC_009381	TGG	2	6	26495	26500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597347
515	NC_009381	GCC	2	6	26520	26525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597347
516	NC_009381	GGTGA	2	10	26602	26611	20 %	20 %	60 %	0 %	145597347
517	NC_009381	CGC	2	6	26619	26624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597347
518	NC_009381	CGGCC	2	10	26694	26703	0 %	0 %	40 %	60 %	145597347
519	NC_009381	GCT	2	6	26820	26825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
520	NC_009381	GGCA	2	8	26868	26875	25 %	0 %	50 %	25 %	145597347
521	NC_009381	CGTC	2	8	26946	26953	0 %	25 %	25 %	50 %	145597347
522	NC_009381	CTG	2	6	27100	27105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
523	NC_009381	ATCA	2	8	27144	27151	50 %	25 %	0 %	25 %	145597347
524	NC_009381	TGG	2	6	27236	27241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597347
525	NC_009381	GGT	2	6	27249	27254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597347
526	NC_009381	CAA	2	6	27412	27417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597347
527	NC_009381	GGT	2	6	27438	27443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597347
528	NC_009381	TTC	2	6	27469	27474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597347
529	NC_009381	GACC	2	8	27480	27487	25 %	0 %	25 %	50 %	145597347
530	NC_009381	A	6	6	27490	27495	100 %	0 %	0 %	0 %	145597347
531	NC_009381	GGGTT	2	10	27591	27600	0 %	40 %	60 %	0 %	145597347
532	NC_009381	TGT	2	6	27647	27652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597347
533	NC_009381	TGA	2	6	27665	27670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597347
534	NC_009381	CGCC	2	8	27723	27730	0 %	0 %	25 %	75 %	145597347
535	NC_009381	CGTTGC	2	12	27750	27761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
536	NC_009381	TGAA	2	8	27764	27771	50 %	25 %	25 %	0 %	145597347
537	NC_009381	TGA	2	6	27795	27800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597347
538	NC_009381	AC	3	6	27851	27856	50 %	0 %	0 %	50 %	145597347
539	NC_009381	GCG	2	6	27922	27927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597347
540	NC_009381	TCG	2	6	27947	27952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
541	NC_009381	TCG	2	6	28128	28133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
542	NC_009381	TGC	3	9	28197	28205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
543	NC_009381	GCT	2	6	28213	28218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597347
544	NC_009381	CAA	2	6	28221	28226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597347
545	NC_009381	TGG	2	6	28328	28333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597347
546	NC_009381	TTC	2	6	28426	28431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597347
547	NC_009381	GTGATG	2	12	28438	28449	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	145597347
548	NC_009381	CTCG	2	8	28546	28553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009381	CTG	2	6	28601	28606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009381	TCG	2	6	28734	28739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009381	TA	3	6	28882	28887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009381	TTA	2	6	28998	29003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009381	GCTG	2	8	29052	29059	0 %	25 %	50 %	25 %	145597348
554	NC_009381	AAC	2	6	29121	29126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597348
555	NC_009381	ATCA	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	145597348
556	NC_009381	CAG	2	6	29360	29365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597348
557	NC_009381	CAA	2	6	29393	29398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597348
558	NC_009381	GTG	2	6	29465	29470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597348
559	NC_009381	CAG	2	6	29523	29528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597348
560	NC_009381	GGT	2	6	29533	29538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597348
561	NC_009381	CAG	2	6	29585	29590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597348
562	NC_009381	TAA	2	6	29608	29613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597348
563	NC_009381	GCA	2	6	29638	29643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597348
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565	NC_009381	GAT	2	6	29662	29667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597348
566	NC_009381	GAT	2	6	29695	29700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597348
567	NC_009381	TGA	2	6	29718	29723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597348
568	NC_009381	TGT	2	6	29742	29747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009381	CTG	2	6	29778	29783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009381	TC	3	6	29906	29911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_009381	CT	3	6	29976	29981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_009381	TCC	2	6	30027	30032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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574	NC_009381	ATC	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009381	T	6	6	30119	30124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_009381	TTA	2	6	30150	30155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009381	CAA	2	6	30179	30184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009381	GTT	2	6	30202	30207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_009381	GTTT	2	8	30268	30275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009381	AAT	2	6	30337	30342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009381	GGCT	2	8	30510	30517	0 %	25 %	50 %	25 %	145597349
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599	NC_009381	ATTT	2	8	31161	31168	25 %	75 %	0 %	0 %	145597349
600	NC_009381	TGA	2	6	31180	31185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597349
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602	NC_009381	ACCCTG	2	12	31236	31247	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145597349
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610	NC_009381	CGG	2	6	31777	31782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597349
611	NC_009381	GCT	2	6	31784	31789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597349
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613	NC_009381	GTG	2	6	32100	32105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597349
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620	NC_009381	GCT	2	6	32353	32358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009381	ATT	2	6	32378	32383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009381	GAA	2	6	32420	32425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009381	GTT	2	6	32559	32564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597350
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