MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009381	CAC	2	6	282355	282360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597569
5502	NC_009381	CCAC	2	8	282414	282421	25 %	0 %	0 %	75 %	145597569
5503	NC_009381	ATT	4	12	282449	282460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597569
5504	NC_009381	GCC	2	6	282461	282466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597569
5505	NC_009381	CGGG	2	8	282479	282486	0 %	0 %	75 %	25 %	145597569
5506	NC_009381	GGC	2	6	282590	282595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597569
5507	NC_009381	ATTC	2	8	282656	282663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_009381	TA	3	6	282668	282673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_009381	ATT	2	6	282724	282729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_009381	TAA	2	6	282748	282753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009381	AC	3	6	282866	282871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_009381	GAA	2	6	282879	282884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_009381	C	7	7	282910	282916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5514	NC_009381	TAT	2	6	282955	282960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_009381	T	6	6	282986	282991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_009381	GGCA	2	8	283065	283072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_009381	TCA	2	6	283148	283153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597570
5518	NC_009381	G	6	6	283181	283186	0 %	0 %	100 %	0 %	145597570
5519	NC_009381	ACG	2	6	283195	283200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597570
5520	NC_009381	GCCGAT	2	12	283202	283213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145597570
5521	NC_009381	TGC	2	6	283277	283282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597570
5522	NC_009381	GCATT	2	10	283313	283322	20 %	40 %	20 %	20 %	145597570
5523	NC_009381	ATT	2	6	283374	283379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597570
5524	NC_009381	CG	3	6	283427	283432	0 %	0 %	50 %	50 %	145597570
5525	NC_009381	AGA	2	6	283514	283519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597570
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5527	NC_009381	GTG	2	6	283668	283673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597570
5528	NC_009381	ACA	2	6	283765	283770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597570
5529	NC_009381	ATTC	2	8	283789	283796	25 %	50 %	0 %	25 %	145597570
5530	NC_009381	ATT	2	6	283803	283808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597570
5531	NC_009381	C	6	6	283891	283896	0 %	0 %	0 %	100 %	145597570
5532	NC_009381	AAC	2	6	283982	283987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597571
5533	NC_009381	TCAC	2	8	284128	284135	25 %	25 %	0 %	50 %	145597571
5534	NC_009381	GTG	2	6	284260	284265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597571
5535	NC_009381	TCC	2	6	284278	284283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597571
5536	NC_009381	CGT	2	6	284299	284304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597571
5537	NC_009381	GCTG	2	8	284316	284323	0 %	25 %	50 %	25 %	145597571
5538	NC_009381	A	7	7	284367	284373	100 %	0 %	0 %	0 %	145597571
5539	NC_009381	TGTT	2	8	284468	284475	0 %	75 %	25 %	0 %	145597571
5540	NC_009381	AAT	2	6	284512	284517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597571
5541	NC_009381	TGA	2	6	284594	284599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597571
5542	NC_009381	TGA	2	6	284702	284707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597571
5543	NC_009381	CGT	2	6	284869	284874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_009381	AGG	2	6	284877	284882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_009381	A	6	6	284935	284940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_009381	TGT	2	6	284991	284996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_009381	GGGT	2	8	285014	285021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_009381	AGG	2	6	285034	285039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_009381	TGA	2	6	285041	285046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597572
5550	NC_009381	AGT	2	6	285090	285095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597572
5551	NC_009381	CAT	2	6	285119	285124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597572
5552	NC_009381	ACCG	2	8	285146	285153	25 %	0 %	25 %	50 %	145597572
5553	NC_009381	G	6	6	285194	285199	0 %	0 %	100 %	0 %	145597572
5554	NC_009381	CACT	2	8	285206	285213	25 %	25 %	0 %	50 %	145597572
5555	NC_009381	CAT	2	6	285265	285270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597572
5556	NC_009381	CTTT	2	8	285274	285281	0 %	75 %	0 %	25 %	145597572
5557	NC_009381	GC	3	6	285293	285298	0 %	0 %	50 %	50 %	145597572
5558	NC_009381	GAG	2	6	285319	285324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597572
5559	NC_009381	CG	3	6	285328	285333	0 %	0 %	50 %	50 %	145597572
5560	NC_009381	GTG	2	6	285349	285354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597572
5561	NC_009381	GGC	2	6	285378	285383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597572
5562	NC_009381	GAAA	2	8	285556	285563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_009381	AAG	2	6	285577	285582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_009381	GA	3	6	285648	285653	50 %	0 %	50 %	0 %	145597573
5565	NC_009381	ATCT	2	8	285715	285722	25 %	50 %	0 %	25 %	145597573
5566	NC_009381	C	6	6	285739	285744	0 %	0 %	0 %	100 %	145597573
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5569	NC_009381	GTC	2	6	285878	285883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597573
5570	NC_009381	TGGTG	2	10	285915	285924	0 %	40 %	60 %	0 %	145597573
5571	NC_009381	TGT	2	6	285980	285985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597573
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5574	NC_009381	G	6	6	286090	286095	0 %	0 %	100 %	0 %	145597573
5575	NC_009381	TGG	2	6	286139	286144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597573
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5579	NC_009381	TGA	3	9	286388	286396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597573
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5582	NC_009381	GGCATG	2	12	286534	286545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145597573
5583	NC_009381	A	6	6	286553	286558	100 %	0 %	0 %	0 %	145597573
5584	NC_009381	GCG	3	9	286563	286571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597573
5585	NC_009381	TTC	2	6	286573	286578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597573
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5590	NC_009381	ATC	2	6	286717	286722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597573
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5592	NC_009381	GTG	2	6	286840	286845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597573
5593	NC_009381	ACTG	2	8	286854	286861	25 %	25 %	25 %	25 %	145597573
5594	NC_009381	GGT	2	6	286863	286868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597573
5595	NC_009381	G	7	7	286881	286887	0 %	0 %	100 %	0 %	145597573
5596	NC_009381	TG	3	6	287170	287175	0 %	50 %	50 %	0 %	145597574
5597	NC_009381	AAG	2	6	287290	287295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597574
5598	NC_009381	CTG	2	6	287296	287301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597574
5599	NC_009381	CGC	2	6	287336	287341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597574
5600	NC_009381	GGCA	2	8	287414	287421	25 %	0 %	50 %	25 %	145597574
5601	NC_009381	GC	3	6	287546	287551	0 %	0 %	50 %	50 %	145597574
5602	NC_009381	CGA	2	6	287600	287605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597574
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5605	NC_009381	A	6	6	287792	287797	100 %	0 %	0 %	0 %	145597575
5606	NC_009381	CAT	2	6	287900	287905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597575
5607	NC_009381	TGA	2	6	287926	287931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597575
5608	NC_009381	TGA	2	6	288010	288015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597575
5609	NC_009381	TGA	2	6	288022	288027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597575
5610	NC_009381	ACAGAT	2	12	288116	288127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145597575
5611	NC_009381	A	8	8	288143	288150	100 %	0 %	0 %	0 %	145597575
5612	NC_009381	GAT	2	6	288206	288211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597575
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5614	NC_009381	AAT	2	6	288249	288254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597575
5615	NC_009381	AG	3	6	288291	288296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_009381	TTAAC	2	10	288309	288318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5617	NC_009381	AAGG	2	8	288330	288337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_009381	TCT	2	6	288342	288347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_009381	CGGG	2	8	288370	288377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_009381	AG	3	6	288393	288398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_009381	TTTG	2	8	288479	288486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009381	CAGA	2	8	288509	288516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_009381	TCA	2	6	288566	288571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_009381	TAAA	2	8	288593	288600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5626	NC_009381	GCT	2	6	288758	288763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5740	NC_009381	TAA	2	6	294281	294286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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