MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009381	TGTA	2	8	256284	256291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_009381	CTGCC	2	10	256435	256444	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5003	NC_009381	CGA	2	6	256509	256514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_009381	ATC	2	6	256538	256543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_009381	ATCAAA	2	12	256551	256562	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5006	NC_009381	GTT	2	6	256589	256594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_009381	ACA	2	6	256738	256743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597546
5008	NC_009381	TGA	2	6	256789	256794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597546
5009	NC_009381	CTG	2	6	256796	256801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597546
5010	NC_009381	TTG	2	6	256836	256841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597546
5011	NC_009381	AG	3	6	256936	256941	50 %	0 %	50 %	0 %	145597546
5012	NC_009381	GGT	2	6	256957	256962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597546
5013	NC_009381	TGC	2	6	257055	257060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597546
5014	NC_009381	TCG	2	6	257070	257075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597546
5015	NC_009381	GGT	2	6	257086	257091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597546
5016	NC_009381	AGA	2	6	257140	257145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597546
5017	NC_009381	TAA	2	6	257237	257242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597546
5018	NC_009381	TCTT	2	8	257263	257270	0 %	75 %	0 %	25 %	145597547
5019	NC_009381	TCG	2	6	257274	257279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
5020	NC_009381	TAT	2	6	257325	257330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597547
5021	NC_009381	C	6	6	257557	257562	0 %	0 %	0 %	100 %	145597547
5022	NC_009381	GCT	2	6	257575	257580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
5023	NC_009381	CTG	2	6	257590	257595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
5024	NC_009381	GCC	2	6	257610	257615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597547
5025	NC_009381	CTGAA	2	10	257672	257681	40 %	20 %	20 %	20 %	145597547
5026	NC_009381	CA	3	6	257717	257722	50 %	0 %	0 %	50 %	145597547
5027	NC_009381	CTG	2	6	257792	257797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
5028	NC_009381	CTA	2	6	257853	257858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
5029	NC_009381	CCG	2	6	257861	257866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597547
5030	NC_009381	TTG	2	6	257869	257874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597547
5031	NC_009381	CAG	2	6	257977	257982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597547
5032	NC_009381	ATC	2	6	258098	258103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
5033	NC_009381	C	6	6	258106	258111	0 %	0 %	0 %	100 %	145597547
5034	NC_009381	TGC	2	6	258144	258149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
5035	NC_009381	CAA	2	6	258151	258156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597547
5036	NC_009381	CAGC	2	8	258226	258233	25 %	0 %	25 %	50 %	145597547
5037	NC_009381	CCA	2	6	258253	258258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597547
5038	NC_009381	CAT	2	6	258269	258274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
5039	NC_009381	CAT	2	6	258284	258289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
5040	NC_009381	ATC	2	6	258300	258305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
5041	NC_009381	ATC	2	6	258360	258365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
5042	NC_009381	AAT	2	6	258386	258391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597547
5043	NC_009381	TACC	2	8	258434	258441	25 %	25 %	0 %	50 %	145597548
5044	NC_009381	CG	3	6	258481	258486	0 %	0 %	50 %	50 %	145597548
5045	NC_009381	GGT	2	6	258541	258546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597548
5046	NC_009381	GT	3	6	258545	258550	0 %	50 %	50 %	0 %	145597548
5047	NC_009381	GCC	2	6	258592	258597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597548
5048	NC_009381	CAT	2	6	258651	258656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597548
5049	NC_009381	GCC	2	6	258670	258675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597548
5050	NC_009381	AGGC	2	8	258676	258683	25 %	0 %	50 %	25 %	145597548
5051	NC_009381	AGA	2	6	258747	258752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597548
5052	NC_009381	TG	3	6	258819	258824	0 %	50 %	50 %	0 %	145597548
5053	NC_009381	CCG	2	6	258901	258906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597548
5054	NC_009381	GGC	2	6	258937	258942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597548
5055	NC_009381	GCA	2	6	258949	258954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597548
5056	NC_009381	A	6	6	259025	259030	100 %	0 %	0 %	0 %	145597548
5057	NC_009381	GAG	2	6	259033	259038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597548
5058	NC_009381	GCG	2	6	259051	259056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597548
5059	NC_009381	GC	3	6	259128	259133	0 %	0 %	50 %	50 %	145597548
5060	NC_009381	GAT	2	6	259159	259164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597548
5061	NC_009381	CAG	2	6	259183	259188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597548
5062	NC_009381	CAG	2	6	259216	259221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597548
5063	NC_009381	CTGCA	2	10	259229	259238	20 %	20 %	20 %	40 %	145597548
5064	NC_009381	CGG	2	6	259239	259244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597548
5065	NC_009381	AAGA	2	8	259246	259253	75 %	0 %	25 %	0 %	145597548
5066	NC_009381	GGGGC	2	10	259301	259310	0 %	0 %	80 %	20 %	145597548
5067	NC_009381	GAA	2	6	259414	259419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597548
5068	NC_009381	GTGA	2	8	259429	259436	25 %	25 %	50 %	0 %	145597548
5069	NC_009381	TTG	2	6	259438	259443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597548
5070	NC_009381	ACC	2	6	259465	259470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597548
5071	NC_009381	CAACC	2	10	259493	259502	40 %	0 %	0 %	60 %	145597548
5072	NC_009381	GAG	2	6	259556	259561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597548
5073	NC_009381	ATG	2	6	259566	259571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597549
5074	NC_009381	TGG	2	6	259630	259635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597549
5075	NC_009381	TGGC	2	8	259637	259644	0 %	25 %	50 %	25 %	145597549
5076	NC_009381	GGTT	2	8	259662	259669	0 %	50 %	50 %	0 %	145597549
5077	NC_009381	GTG	2	6	259732	259737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597549
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5080	NC_009381	TCA	2	6	259822	259827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597549
5081	NC_009381	GAT	2	6	259874	259879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597549
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5087	NC_009381	GCGT	2	8	260119	260126	0 %	25 %	50 %	25 %	145597549
5088	NC_009381	TGG	4	12	260236	260247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597549
5089	NC_009381	CAA	2	6	260337	260342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597549
5090	NC_009381	GTT	2	6	260518	260523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597550
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5093	NC_009381	TGAT	2	8	260652	260659	25 %	50 %	25 %	0 %	145597550
5094	NC_009381	GGGCT	2	10	260666	260675	0 %	20 %	60 %	20 %	145597550
5095	NC_009381	TGA	2	6	260692	260697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597550
5096	NC_009381	AATG	2	8	260741	260748	50 %	25 %	25 %	0 %	145597550
5097	NC_009381	TTG	3	9	260822	260830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597550
5098	NC_009381	TTG	2	6	260921	260926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597550
5099	NC_009381	GTGA	2	8	260939	260946	25 %	25 %	50 %	0 %	145597550
5100	NC_009381	TTGA	2	8	260975	260982	25 %	50 %	25 %	0 %	145597550
5101	NC_009381	C	7	7	261092	261098	0 %	0 %	0 %	100 %	145597550
5102	NC_009381	CGG	2	6	261158	261163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597550
5103	NC_009381	CCAT	2	8	261236	261243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_009381	CAGT	2	8	261252	261259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_009381	G	7	7	261289	261295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009381	GACT	2	8	261308	261315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_009381	CT	3	6	261314	261319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_009381	AAAT	2	8	261358	261365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_009381	CTGT	2	8	261513	261520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_009381	GA	3	6	261579	261584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_009381	TCA	2	6	261693	261698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_009381	CAG	2	6	261707	261712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_009381	T	6	6	261756	261761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009381	ACCA	2	8	261796	261803	50 %	0 %	0 %	50 %	145597551
5115	NC_009381	AAC	2	6	262034	262039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_009381	ATA	2	6	262050	262055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_009381	TGA	2	6	262141	262146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_009381	TCA	2	6	262158	262163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_009381	GAA	2	6	262190	262195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009381	CAC	2	6	262231	262236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_009381	T	8	8	262287	262294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_009381	GCTTG	2	10	262404	262413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5123	NC_009381	AC	3	6	262432	262437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_009381	AGC	2	6	262457	262462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597552
5125	NC_009381	AAG	2	6	262536	262541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597552
5126	NC_009381	GAC	2	6	262555	262560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597552
5127	NC_009381	CGG	2	6	262629	262634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597552
5128	NC_009381	CCTG	2	8	262647	262654	0 %	25 %	25 %	50 %	145597552
5129	NC_009381	G	7	7	263065	263071	0 %	0 %	100 %	0 %	145597552
5130	NC_009381	TGA	2	6	263250	263255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597552
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5139	NC_009381	GGT	2	6	263470	263475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597552
5140	NC_009381	TCCTGT	2	12	263481	263492	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145597552
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5145	NC_009381	TAT	2	6	263677	263682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597552
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5148	NC_009381	TGG	2	6	263834	263839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_009381	TGG	2	6	263866	263871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_009381	TCA	2	6	263879	263884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5151	NC_009381	TAA	2	6	263943	263948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_009381	G	7	7	263967	263973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_009381	TCC	2	6	263978	263983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5154	NC_009381	TA	3	6	264002	264007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5156	NC_009381	T	6	6	264023	264028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_009381	A	6	6	264063	264068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5160	NC_009381	T	6	6	264164	264169	0 %	100 %	0 %	0 %	145597553
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5201	NC_009381	GCT	2	6	265750	265755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597553
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5223	NC_009381	A	6	6	267225	267230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_009381	ATAA	2	8	267347	267354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_009381	CG	3	6	267663	267668	0 %	0 %	50 %	50 %	145597555
5233	NC_009381	TC	3	6	267740	267745	0 %	50 %	0 %	50 %	145597555
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5237	NC_009381	CAT	2	6	267832	267837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597555
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5244	NC_009381	TCT	2	6	268352	268357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_009381	ATC	2	6	268372	268377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_009381	GGC	2	6	268471	268476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_009381	ATG	2	6	268500	268505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_009381	CAT	2	6	282268	282273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597569
5500	NC_009381	CCA	2	6	282342	282347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597569

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