MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid MT

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009378	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	145597193
2	NC_009378	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	145597193
3	NC_009378	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	145597193
4	NC_009378	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009378	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	145597195
6	NC_009378	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	145597195
7	NC_009378	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009378	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	145597196
9	NC_009378	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	145597196
10	NC_009378	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	145597196
11	NC_009378	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	145597196
12	NC_009378	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	145597196
13	NC_009378	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	145597196
14	NC_009378	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	145597197
15	NC_009378	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	145597198
16	NC_009378	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	145597198
17	NC_009378	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	145597198
18	NC_009378	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	145597198
19	NC_009378	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	145597198
20	NC_009378	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	145597198
21	NC_009378	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	145597198
22	NC_009378	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	145597200
23	NC_009378	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	145597201
24	NC_009378	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	145597202
25	NC_009378	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	145597203
26	NC_009378	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	145597203
27	NC_009378	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	145597203
28	NC_009378	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	145597203
29	NC_009378	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009378	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	145597206
31	NC_009378	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	145597206
32	NC_009378	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009378	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	145597208
34	NC_009378	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	145597213
35	NC_009378	AG	3	6	25328	25333	50 %	0 %	50 %	0 %	145597215
36	NC_009378	CG	4	8	26040	26047	0 %	0 %	50 %	50 %	145597215
37	NC_009378	GC	4	8	26135	26142	0 %	0 %	50 %	50 %	145597215
38	NC_009378	AT	3	6	26910	26915	50 %	50 %	0 %	0 %	145597216
39	NC_009378	CA	3	6	27018	27023	50 %	0 %	0 %	50 %	145597216
40	NC_009378	CG	3	6	27733	27738	0 %	0 %	50 %	50 %	145597216
41	NC_009378	CA	3	6	27786	27791	50 %	0 %	0 %	50 %	145597216
42	NC_009378	GT	3	6	28430	28435	0 %	50 %	50 %	0 %	145597217
43	NC_009378	TA	3	6	28646	28651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009378	TA	4	8	28673	28680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009378	CG	3	6	32691	32696	0 %	0 %	50 %	50 %	145597224
46	NC_009378	AG	3	6	33756	33761	50 %	0 %	50 %	0 %	145597224
47	NC_009378	GA	3	6	34310	34315	50 %	0 %	50 %	0 %	145597226
48	NC_009378	CG	3	6	34581	34586	0 %	0 %	50 %	50 %	145597227
49	NC_009378	TC	3	6	34628	34633	0 %	50 %	0 %	50 %	145597227
50	NC_009378	AT	3	6	35152	35157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009378	GC	3	6	36261	36266	0 %	0 %	50 %	50 %	145597315
52	NC_009378	TG	3	6	36742	36747	0 %	50 %	50 %	0 %	145597229
53	NC_009378	TG	3	6	37204	37209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009378	CT	3	6	37629	37634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009378	CA	3	6	39156	39161	50 %	0 %	0 %	50 %	145597232
56	NC_009378	AT	3	6	39549	39554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009378	GT	3	6	40305	40310	0 %	50 %	50 %	0 %	145597233
58	NC_009378	CT	3	6	40850	40855	0 %	50 %	0 %	50 %	145597234
59	NC_009378	CG	4	8	40950	40957	0 %	0 %	50 %	50 %	145597234
60	NC_009378	AG	3	6	42613	42618	50 %	0 %	50 %	0 %	145597235
61	NC_009378	GC	3	6	42868	42873	0 %	0 %	50 %	50 %	145597235
62	NC_009378	CG	3	6	43332	43337	0 %	0 %	50 %	50 %	145597235
63	NC_009378	AG	3	6	43726	43731	50 %	0 %	50 %	0 %	145597235
64	NC_009378	CG	3	6	43852	43857	0 %	0 %	50 %	50 %	145597235
65	NC_009378	GA	3	6	43886	43891	50 %	0 %	50 %	0 %	145597235
66	NC_009378	AG	3	6	45718	45723	50 %	0 %	50 %	0 %	145597237
67	NC_009378	TG	3	6	45938	45943	0 %	50 %	50 %	0 %	145597237
68	NC_009378	GT	3	6	47036	47041	0 %	50 %	50 %	0 %	145597237
69	NC_009378	AG	3	6	48380	48385	50 %	0 %	50 %	0 %	145597238
70	NC_009378	AC	3	6	49332	49337	50 %	0 %	0 %	50 %	145597239
71	NC_009378	TC	4	8	50297	50304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009378	AG	3	6	51300	51305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009378	AG	3	6	51409	51414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009378	CT	3	6	51445	51450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009378	AT	3	6	51548	51553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009378	CA	3	6	51588	51593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009378	AG	3	6	51771	51776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009378	AG	3	6	51813	51818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009378	AG	3	6	53001	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009378	CT	3	6	53203	53208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009378	CT	3	6	53408	53413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009378	CG	4	8	53515	53522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009378	TG	3	6	54046	54051	0 %	50 %	50 %	0 %	145597243
84	NC_009378	TA	3	6	54299	54304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009378	GT	3	6	54807	54812	0 %	50 %	50 %	0 %	145597245
86	NC_009378	TA	3	6	56663	56668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009378	CG	4	8	57221	57228	0 %	0 %	50 %	50 %	145597248
88	NC_009378	AG	3	6	57333	57338	50 %	0 %	50 %	0 %	145597248
89	NC_009378	CG	3	6	58467	58472	0 %	0 %	50 %	50 %	145597250
90	NC_009378	GA	3	6	58640	58645	50 %	0 %	50 %	0 %	145597250
91	NC_009378	GT	4	8	59258	59265	0 %	50 %	50 %	0 %	145597251
92	NC_009378	CA	3	6	59828	59833	50 %	0 %	0 %	50 %	145597251
93	NC_009378	GA	3	6	60295	60300	50 %	0 %	50 %	0 %	145597252
94	NC_009378	TA	3	6	60661	60666	50 %	50 %	0 %	0 %	145597252
95	NC_009378	AG	3	6	60749	60754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009378	CT	3	6	61207	61212	0 %	50 %	0 %	50 %	145597253
97	NC_009378	CA	3	6	61615	61620	50 %	0 %	0 %	50 %	145597253
98	NC_009378	CG	3	6	63463	63468	0 %	0 %	50 %	50 %	145597255
99	NC_009378	CT	3	6	63977	63982	0 %	50 %	0 %	50 %	145597255
100	NC_009378	GT	3	6	64752	64757	0 %	50 %	50 %	0 %	145597255
101	NC_009378	TC	3	6	65488	65493	0 %	50 %	0 %	50 %	145597255
102	NC_009378	TC	3	6	65657	65662	0 %	50 %	0 %	50 %	145597255
103	NC_009378	AG	3	6	65892	65897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009378	AC	3	6	66396	66401	50 %	0 %	0 %	50 %	145597256
105	NC_009378	GT	3	6	66744	66749	0 %	50 %	50 %	0 %	145597256
106	NC_009378	GA	3	6	66954	66959	50 %	0 %	50 %	0 %	145597256
107	NC_009378	TA	3	6	67195	67200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009378	AT	3	6	67202	67207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009378	TG	3	6	69224	69229	0 %	50 %	50 %	0 %	145597257
110	NC_009378	CT	3	6	69330	69335	0 %	50 %	0 %	50 %	145597257
111	NC_009378	TG	3	6	69656	69661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009378	TC	3	6	70332	70337	0 %	50 %	0 %	50 %	145597260
113	NC_009378	CG	3	6	71246	71251	0 %	0 %	50 %	50 %	145597259
114	NC_009378	CT	3	6	72236	72241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009378	GA	3	6	72597	72602	50 %	0 %	50 %	0 %	145597318
116	NC_009378	AT	3	6	72956	72961	50 %	50 %	0 %	0 %	145597318
117	NC_009378	AG	3	6	73000	73005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009378	TC	3	6	73135	73140	0 %	50 %	0 %	50 %	145597261
119	NC_009378	TC	3	6	73424	73429	0 %	50 %	0 %	50 %	145597261
120	NC_009378	AC	3	6	73769	73774	50 %	0 %	0 %	50 %	145597261
121	NC_009378	GT	3	6	74540	74545	0 %	50 %	50 %	0 %	145597261
122	NC_009378	CT	3	6	75427	75432	0 %	50 %	0 %	50 %	145597261
123	NC_009378	CA	3	6	75512	75517	50 %	0 %	0 %	50 %	145597261
124	NC_009378	AT	3	6	75944	75949	50 %	50 %	0 %	0 %	145597262
125	NC_009378	CT	3	6	75994	75999	0 %	50 %	0 %	50 %	145597262
126	NC_009378	CA	3	6	76493	76498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009378	AT	3	6	76703	76708	50 %	50 %	0 %	0 %	145597319
128	NC_009378	AT	3	6	76826	76831	50 %	50 %	0 %	0 %	145597319
129	NC_009378	AG	3	6	77069	77074	50 %	0 %	50 %	0 %	145597319
130	NC_009378	GT	3	6	77921	77926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009378	GT	3	6	78771	78776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009378	CG	3	6	80003	80008	0 %	0 %	50 %	50 %	145597265
133	NC_009378	CG	3	6	81247	81252	0 %	0 %	50 %	50 %	145597267
134	NC_009378	CG	3	6	81397	81402	0 %	0 %	50 %	50 %	145597267
135	NC_009378	TA	3	6	82220	82225	50 %	50 %	0 %	0 %	145597320
136	NC_009378	CA	3	6	82932	82937	50 %	0 %	0 %	50 %	145597268
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.