MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	GT	3	6	277	282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009377	AT	3	6	290	295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009377	AC	3	6	528	533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009377	AC	3	6	685	690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009377	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	145597105
6	NC_009377	CA	3	6	1757	1762	50 %	0 %	0 %	50 %	145597107
7	NC_009377	CG	3	6	1901	1906	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
8	NC_009377	GC	3	6	2406	2411	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
9	NC_009377	GC	3	6	3116	3121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009377	AC	3	6	4422	4427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009377	AT	3	6	4693	4698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009377	TG	3	6	4755	4760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009377	TG	3	6	4843	4848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009377	GC	3	6	4950	4955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009377	TC	3	6	5064	5069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009377	TC	3	6	5375	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	145597109
17	NC_009377	AC	3	6	5451	5456	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
18	NC_009377	AC	3	6	5874	5879	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
19	NC_009377	AC	3	6	6860	6865	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
20	NC_009377	GC	3	6	6892	6897	0 %	0 %	50 %	50 %	145597109
21	NC_009377	AG	3	6	7332	7337	50 %	0 %	50 %	0 %	145597109
22	NC_009377	AT	3	6	7428	7433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009377	TA	4	8	7512	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009377	AT	3	6	7910	7915	50 %	50 %	0 %	0 %	145597110
25	NC_009377	GA	4	8	8353	8360	50 %	0 %	50 %	0 %	145597110
26	NC_009377	TA	3	6	10179	10184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009377	AG	3	6	10400	10405	50 %	0 %	50 %	0 %	145597114
28	NC_009377	AG	3	6	10491	10496	50 %	0 %	50 %	0 %	145597114
29	NC_009377	CA	3	6	10846	10851	50 %	0 %	0 %	50 %	145597114
30	NC_009377	GC	4	8	10923	10930	0 %	0 %	50 %	50 %	145597114
31	NC_009377	GT	3	6	12241	12246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009377	GA	3	6	13615	13620	50 %	0 %	50 %	0 %	145597118
33	NC_009377	CG	3	6	13729	13734	0 %	0 %	50 %	50 %	145597118
34	NC_009377	GA	4	8	13956	13963	50 %	0 %	50 %	0 %	145597118
35	NC_009377	AG	3	6	15037	15042	50 %	0 %	50 %	0 %	145597121
36	NC_009377	TA	3	6	15271	15276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009377	TC	3	6	15614	15619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009377	AT	4	8	15790	15797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009377	AT	4	8	16354	16361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009377	GC	3	6	16939	16944	0 %	0 %	50 %	50 %	145597123
41	NC_009377	CT	3	6	17196	17201	0 %	50 %	0 %	50 %	145597124
42	NC_009377	GT	3	6	18500	18505	0 %	50 %	50 %	0 %	145597126
43	NC_009377	TC	3	6	19871	19876	0 %	50 %	0 %	50 %	145597130
44	NC_009377	CG	3	6	21027	21032	0 %	0 %	50 %	50 %	145597131
45	NC_009377	AC	3	6	21291	21296	50 %	0 %	0 %	50 %	145597132
46	NC_009377	TA	4	8	23521	23528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009377	GA	3	6	24257	24262	50 %	0 %	50 %	0 %	145597134
48	NC_009377	AT	3	6	24641	24646	50 %	50 %	0 %	0 %	145597134
49	NC_009377	TA	3	6	24757	24762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009377	AG	3	6	24967	24972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009377	TG	3	6	25119	25124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009377	CA	3	6	25263	25268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009377	TA	3	6	25609	25614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009377	AT	3	6	25632	25637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009377	AT	3	6	26250	26255	50 %	50 %	0 %	0 %	145597135
56	NC_009377	GC	3	6	26828	26833	0 %	0 %	50 %	50 %	145597135
57	NC_009377	AG	3	6	27235	27240	50 %	0 %	50 %	0 %	145597136
58	NC_009377	TG	3	6	28746	28751	0 %	50 %	50 %	0 %	145597139
59	NC_009377	CG	3	6	29843	29848	0 %	0 %	50 %	50 %	145597140
60	NC_009377	CG	3	6	29929	29934	0 %	0 %	50 %	50 %	145597140
61	NC_009377	CT	3	6	30489	30494	0 %	50 %	0 %	50 %	145597140
62	NC_009377	AG	3	6	31718	31723	50 %	0 %	50 %	0 %	145597142
63	NC_009377	GC	3	6	34786	34791	0 %	0 %	50 %	50 %	145597147
64	NC_009377	TC	3	6	35473	35478	0 %	50 %	0 %	50 %	145597148
65	NC_009377	CG	3	6	35562	35567	0 %	0 %	50 %	50 %	145597148
66	NC_009377	AT	3	6	35665	35670	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
67	NC_009377	AT	3	6	36308	36313	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
68	NC_009377	TC	3	6	36508	36513	0 %	50 %	0 %	50 %	145597148
69	NC_009377	AT	3	6	36788	36793	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
70	NC_009377	TC	3	6	37445	37450	0 %	50 %	0 %	50 %	145597149
71	NC_009377	TG	3	6	37727	37732	0 %	50 %	50 %	0 %	145597150
72	NC_009377	CT	3	6	39077	39082	0 %	50 %	0 %	50 %	145597152
73	NC_009377	AG	3	6	41177	41182	50 %	0 %	50 %	0 %	145597154
74	NC_009377	TA	3	6	41599	41604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009377	CA	3	6	42366	42371	50 %	0 %	0 %	50 %	145597155
76	NC_009377	TA	3	6	44491	44496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009377	AT	3	6	44498	44503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009377	AG	3	6	44854	44859	50 %	0 %	50 %	0 %	145597159
79	NC_009377	GA	3	6	45682	45687	50 %	0 %	50 %	0 %	145597159
80	NC_009377	TA	3	6	46568	46573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009377	AT	3	6	46667	46672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009377	TA	4	8	47854	47861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009377	TA	3	6	48072	48077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009377	GA	3	6	48777	48782	50 %	0 %	50 %	0 %	145597164
85	NC_009377	CT	3	6	49220	49225	0 %	50 %	0 %	50 %	145597164
86	NC_009377	AT	3	6	49581	49586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009377	AT	3	6	49836	49841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009377	CT	3	6	50434	50439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009377	CA	3	6	51673	51678	50 %	0 %	0 %	50 %	145597166
90	NC_009377	GT	3	6	52569	52574	0 %	50 %	50 %	0 %	145597168
91	NC_009377	AT	3	6	52582	52587	50 %	50 %	0 %	0 %	145597168
92	NC_009377	GT	3	6	52697	52702	0 %	50 %	50 %	0 %	145597168
93	NC_009377	TA	3	6	53535	53540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009377	TA	3	6	53733	53738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009377	TC	4	8	55552	55559	0 %	50 %	0 %	50 %	145597172
96	NC_009377	GA	3	6	55781	55786	50 %	0 %	50 %	0 %	145597172
97	NC_009377	GT	3	6	56719	56724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009377	AC	3	6	56805	56810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009377	AT	3	6	57036	57041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009377	AT	3	6	57200	57205	50 %	50 %	0 %	0 %	145597174
101	NC_009377	TA	3	6	57556	57561	50 %	50 %	0 %	0 %	145597175
102	NC_009377	TA	3	6	57563	57568	50 %	50 %	0 %	0 %	145597175
103	NC_009377	GA	3	6	57663	57668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009377	TA	3	6	58512	58517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009377	AT	3	6	58859	58864	50 %	50 %	0 %	0 %	145597177
106	NC_009377	TA	3	6	58952	58957	50 %	50 %	0 %	0 %	145597177
107	NC_009377	GC	3	6	59387	59392	0 %	0 %	50 %	50 %	145597178
108	NC_009377	AG	3	6	59856	59861	50 %	0 %	50 %	0 %	145597179
109	NC_009377	AC	3	6	60329	60334	50 %	0 %	0 %	50 %	145597179
110	NC_009377	GA	3	6	61744	61749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009377	TC	3	6	62989	62994	0 %	50 %	0 %	50 %	145597182
112	NC_009377	GT	3	6	63904	63909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009377	TA	3	6	64273	64278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009377	TC	3	6	64677	64682	0 %	50 %	0 %	50 %	145597184
115	NC_009377	CG	3	6	65046	65051	0 %	0 %	50 %	50 %	145597184
116	NC_009377	AC	3	6	65135	65140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009377	GT	3	6	65157	65162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009377	GA	3	6	67213	67218	50 %	0 %	50 %	0 %	145597185
119	NC_009377	CA	3	6	67691	67696	50 %	0 %	0 %	50 %	145597186
120	NC_009377	TA	3	6	68050	68055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009377	GT	3	6	68183	68188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009377	AT	3	6	68338	68343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009377	AT	3	6	68460	68465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009377	GA	3	6	69175	69180	50 %	0 %	50 %	0 %	145597187
125	NC_009377	TC	3	6	70000	70005	0 %	50 %	0 %	50 %	145597188
126	NC_009377	CG	3	6	70554	70559	0 %	0 %	50 %	50 %	145597190

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.