MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 1442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	AGC	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009377	GCA	2	6	85	90	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009377	CTG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009377	GTG	2	6	129	134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009377	GCTG	2	8	136	143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009377	GT	3	6	277	282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009377	AT	3	6	290	295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009377	TGG	2	6	314	319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009377	TCC	2	6	416	421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009377	CCT	2	6	457	462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009377	CAG	2	6	477	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009377	AC	3	6	528	533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009377	CAT	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009377	TTA	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009377	AC	3	6	685	690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009377	TGG	2	6	705	710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009377	GGAT	2	8	783	790	25 %	25 %	50 %	0 %	145597104
18	NC_009377	AGC	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597104
19	NC_009377	G	6	6	948	953	0 %	0 %	100 %	0 %	145597104
20	NC_009377	GGT	2	6	961	966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597104
21	NC_009377	ACTG	2	8	1010	1017	25 %	25 %	25 %	25 %	145597104
22	NC_009377	TCG	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597104
23	NC_009377	TGT	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009377	AAC	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597105
25	NC_009377	A	6	6	1273	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	145597105
26	NC_009377	TTCA	2	8	1303	1310	25 %	50 %	0 %	25 %	145597105
27	NC_009377	CAGA	2	8	1363	1370	50 %	0 %	25 %	25 %	145597105
28	NC_009377	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	145597105
29	NC_009377	AGTG	2	8	1460	1467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009377	TGGC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	50 %	25 %	145597106
31	NC_009377	GGCGA	2	10	1592	1601	20 %	0 %	60 %	20 %	145597106
32	NC_009377	ACC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597107
33	NC_009377	CA	3	6	1757	1762	50 %	0 %	0 %	50 %	145597107
34	NC_009377	CGC	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597107
35	NC_009377	A	7	7	1815	1821	100 %	0 %	0 %	0 %	145597107
36	NC_009377	CG	3	6	1901	1906	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
37	NC_009377	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597107
38	NC_009377	TAC	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597107
39	NC_009377	TGCGC	2	10	2099	2108	0 %	20 %	40 %	40 %	145597107
40	NC_009377	TACC	2	8	2132	2139	25 %	25 %	0 %	50 %	145597107
41	NC_009377	GCA	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597107
42	NC_009377	AAC	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597107
43	NC_009377	GATG	2	8	2309	2316	25 %	25 %	50 %	0 %	145597107
44	NC_009377	GC	3	6	2406	2411	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
45	NC_009377	CGT	2	6	2601	2606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009377	GGA	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009377	CCT	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009377	TCT	2	6	2703	2708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009377	TCG	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009377	T	6	6	2824	2829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009377	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009377	CTTTT	2	10	2901	2910	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009377	TAAA	2	8	2918	2925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009377	TCG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009377	GCCC	2	8	2967	2974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_009377	CCT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009377	TTA	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009377	ACA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009377	A	7	7	3081	3087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009377	GC	3	6	3116	3121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009377	GCC	2	6	3140	3145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009377	GAG	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009377	AACCGG	2	12	3405	3416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009377	AGCG	2	8	3628	3635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009377	GAC	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009377	GCA	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009377	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	145597108
68	NC_009377	ACT	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597108
69	NC_009377	TTA	2	6	3823	3828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597108
70	NC_009377	CAT	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597108
71	NC_009377	ACC	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597108
72	NC_009377	GCC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009377	CAA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009377	AACA	2	8	4164	4171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009377	GCT	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009377	AGGG	2	8	4212	4219	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009377	GGA	2	6	4254	4259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009377	CAT	2	6	4376	4381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009377	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009377	AC	3	6	4422	4427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009377	TGG	2	6	4442	4447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009377	CTT	2	6	4557	4562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009377	GTG	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009377	CTC	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009377	AT	3	6	4693	4698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009377	GATA	2	8	4720	4727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009377	TG	3	6	4755	4760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009377	ACC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009377	TG	3	6	4843	4848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009377	TTA	2	6	4873	4878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009377	TGA	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009377	GC	3	6	4950	4955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009377	T	7	7	4972	4978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009377	GAA	2	6	5031	5036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009377	TC	3	6	5064	5069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009377	CAG	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009377	GGA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
98	NC_009377	TC	3	6	5375	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	145597109
99	NC_009377	AC	3	6	5451	5456	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
100	NC_009377	AGCCA	2	10	5530	5539	40 %	0 %	20 %	40 %	145597109
101	NC_009377	AGC	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
102	NC_009377	CATGG	2	10	5792	5801	20 %	20 %	40 %	20 %	145597109
103	NC_009377	AGG	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
104	NC_009377	GATG	2	8	5842	5849	25 %	25 %	50 %	0 %	145597109
105	NC_009377	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597109
106	NC_009377	AC	3	6	5874	5879	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
107	NC_009377	GTA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
108	NC_009377	GTT	2	6	6059	6064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597109
109	NC_009377	AAC	2	6	6096	6101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597109
110	NC_009377	ATCCA	2	10	6303	6312	40 %	20 %	0 %	40 %	145597109
111	NC_009377	TCA	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
112	NC_009377	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
113	NC_009377	AAG	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597109
114	NC_009377	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
115	NC_009377	G	8	8	6601	6608	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
116	NC_009377	TGG	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597109
117	NC_009377	G	6	6	6661	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
118	NC_009377	ATC	2	6	6789	6794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
119	NC_009377	ATCG	2	8	6811	6818	25 %	25 %	25 %	25 %	145597109
120	NC_009377	AC	3	6	6860	6865	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
121	NC_009377	GC	3	6	6892	6897	0 %	0 %	50 %	50 %	145597109
122	NC_009377	GCA	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
123	NC_009377	CAG	4	12	7037	7048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
124	NC_009377	GAT	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
125	NC_009377	GGC	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597109
126	NC_009377	AGG	2	6	7224	7229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
127	NC_009377	TGA	2	6	7243	7248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
128	NC_009377	ACT	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
129	NC_009377	AG	3	6	7332	7337	50 %	0 %	50 %	0 %	145597109
130	NC_009377	GAC	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
131	NC_009377	AT	3	6	7428	7433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009377	AAT	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009377	TTA	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009377	A	6	6	7501	7506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009377	TA	4	8	7512	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009377	CAA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009377	TGC	2	6	7682	7687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009377	ATAA	2	8	7790	7797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009377	AAAT	2	8	7817	7824	75 %	25 %	0 %	0 %	145597110
140	NC_009377	AT	3	6	7910	7915	50 %	50 %	0 %	0 %	145597110
141	NC_009377	GGAT	2	8	7917	7924	25 %	25 %	50 %	0 %	145597110
142	NC_009377	ATT	2	6	7940	7945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597110
143	NC_009377	AATA	2	8	7993	8000	75 %	25 %	0 %	0 %	145597110
144	NC_009377	AATCTT	2	12	8011	8022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	145597110
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