MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 1442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009377	TAA	2	6	24836	24841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009377	CTC	2	6	24951	24956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_009377	AG	3	6	24967	24972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009377	AGGT	2	8	25039	25046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009377	TG	3	6	25119	25124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009377	G	7	7	25184	25190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009377	AGAAA	2	10	25208	25217	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009377	TGA	2	6	25218	25223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009377	TCCC	2	8	25248	25255	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
510	NC_009377	CA	3	6	25263	25268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_009377	AAG	2	6	25269	25274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009377	GAT	2	6	25282	25287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009377	GTG	2	6	25311	25316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009377	TAT	2	6	25322	25327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009377	AAC	2	6	25336	25341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_009377	CCA	2	6	25366	25371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_009377	ATTTA	2	10	25379	25388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009377	CTTT	2	8	25431	25438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_009377	A	7	7	25442	25448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009377	CAAA	2	8	25475	25482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_009377	TAT	2	6	25509	25514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009377	CAA	2	6	25522	25527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009377	A	7	7	25526	25532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009377	TA	3	6	25609	25614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009377	CAT	2	6	25628	25633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009377	AT	3	6	25632	25637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009377	TTG	2	6	25658	25663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009377	CAA	2	6	25766	25771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009377	TAT	2	6	25815	25820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597135
530	NC_009377	TGT	2	6	25833	25838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597135
531	NC_009377	CGA	2	6	25915	25920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597135
532	NC_009377	CTT	3	9	25975	25983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597135
533	NC_009377	GTG	2	6	26044	26049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597135
534	NC_009377	ACC	2	6	26100	26105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597135
535	NC_009377	TGA	2	6	26108	26113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597135
536	NC_009377	TGA	2	6	26154	26159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597135
537	NC_009377	GAC	2	6	26164	26169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597135
538	NC_009377	GCTT	2	8	26170	26177	0 %	50 %	25 %	25 %	145597135
539	NC_009377	AT	3	6	26250	26255	50 %	50 %	0 %	0 %	145597135
540	NC_009377	AAC	2	6	26438	26443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597135
541	NC_009377	GATT	2	8	26512	26519	25 %	50 %	25 %	0 %	145597135
542	NC_009377	T	7	7	26518	26524	0 %	100 %	0 %	0 %	145597135
543	NC_009377	CAC	2	6	26545	26550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597135
544	NC_009377	GCC	2	6	26598	26603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597135
545	NC_009377	A	7	7	26629	26635	100 %	0 %	0 %	0 %	145597135
546	NC_009377	GCTCT	2	10	26690	26699	0 %	40 %	20 %	40 %	145597135
547	NC_009377	TAG	2	6	26736	26741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597135
548	NC_009377	CGA	2	6	26773	26778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597135
549	NC_009377	GC	3	6	26828	26833	0 %	0 %	50 %	50 %	145597135
550	NC_009377	TTC	2	6	26844	26849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597135
551	NC_009377	GGGT	2	8	26851	26858	0 %	25 %	75 %	0 %	145597135
552	NC_009377	TCA	2	6	26952	26957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597136
553	NC_009377	CAA	2	6	26977	26982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597136
554	NC_009377	AAG	2	6	27033	27038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597136
555	NC_009377	TGA	2	6	27051	27056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597136
556	NC_009377	AGC	2	6	27100	27105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597136
557	NC_009377	GCG	2	6	27113	27118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597136
558	NC_009377	AG	3	6	27235	27240	50 %	0 %	50 %	0 %	145597136
559	NC_009377	GAA	2	6	27256	27261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597136
560	NC_009377	TTA	2	6	27267	27272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597136
561	NC_009377	TGG	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597136
562	NC_009377	CAAT	2	8	27417	27424	50 %	25 %	0 %	25 %	145597136
563	NC_009377	AGC	2	6	27452	27457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597136
564	NC_009377	GGTT	2	8	27488	27495	0 %	50 %	50 %	0 %	145597136
565	NC_009377	GCA	2	6	27546	27551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597136
566	NC_009377	GAG	2	6	27562	27567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597136
567	NC_009377	AACAA	2	10	27592	27601	80 %	0 %	0 %	20 %	145597136
568	NC_009377	CAG	2	6	27619	27624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597136
569	NC_009377	ATC	2	6	27662	27667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597136
570	NC_009377	TCA	2	6	27683	27688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597137
571	NC_009377	ACC	2	6	27751	27756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597137
572	NC_009377	ACC	2	6	27838	27843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597137
573	NC_009377	CGG	2	6	27858	27863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597137
574	NC_009377	GTGAA	2	10	27901	27910	40 %	20 %	40 %	0 %	145597137
575	NC_009377	AGC	2	6	27995	28000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597138
576	NC_009377	CAT	3	9	28036	28044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597138
577	NC_009377	CAA	2	6	28054	28059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597138
578	NC_009377	ACTC	2	8	28134	28141	25 %	25 %	0 %	50 %	145597138
579	NC_009377	CAA	2	6	28227	28232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597138
580	NC_009377	A	7	7	28231	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	145597138
581	NC_009377	TGC	2	6	28259	28264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597138
582	NC_009377	TCA	2	6	28295	28300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597138
583	NC_009377	GAT	2	6	28402	28407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597138
584	NC_009377	G	7	7	28432	28438	0 %	0 %	100 %	0 %	145597138
585	NC_009377	AGT	2	6	28466	28471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597138
586	NC_009377	ACC	2	6	28478	28483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597138
587	NC_009377	GAT	2	6	28549	28554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597138
588	NC_009377	AGTG	2	8	28740	28747	25 %	25 %	50 %	0 %	145597139
589	NC_009377	TG	3	6	28746	28751	0 %	50 %	50 %	0 %	145597139
590	NC_009377	GCC	2	6	28766	28771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597139
591	NC_009377	ATTT	2	8	28868	28875	25 %	75 %	0 %	0 %	145597139
592	NC_009377	CAA	2	6	28956	28961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597139
593	NC_009377	CGG	2	6	29285	29290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597139
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596	NC_009377	TTG	2	6	29430	29435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597139
597	NC_009377	TTC	2	6	29504	29509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597139
598	NC_009377	CTC	2	6	29519	29524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597140
599	NC_009377	AAG	2	6	29615	29620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597140
600	NC_009377	ATA	2	6	29712	29717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597140
601	NC_009377	GCC	2	6	29765	29770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597140
602	NC_009377	AGTTCT	2	12	29775	29786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145597140
603	NC_009377	CG	3	6	29843	29848	0 %	0 %	50 %	50 %	145597140
604	NC_009377	TTG	2	6	29851	29856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597140
605	NC_009377	CG	3	6	29929	29934	0 %	0 %	50 %	50 %	145597140
606	NC_009377	GGT	2	6	29958	29963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597140
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611	NC_009377	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	145597140
612	NC_009377	CAG	2	6	30298	30303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597140
613	NC_009377	TCA	2	6	30387	30392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597140
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615	NC_009377	CT	3	6	30489	30494	0 %	50 %	0 %	50 %	145597140
616	NC_009377	TCA	2	6	30501	30506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597140
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619	NC_009377	TTCC	2	8	30621	30628	0 %	50 %	0 %	50 %	145597140
620	NC_009377	CGC	2	6	30641	30646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597140
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623	NC_009377	CTT	2	6	30730	30735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597140
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628	NC_009377	GTTCTT	2	12	30903	30914	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	145597141
629	NC_009377	TGT	2	6	30923	30928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597141
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