MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 1835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008120	CGA	2	6	79393	79398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_008120	GAT	2	6	79405	79410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008120	CAT	2	6	79414	79419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008120	ATT	2	6	79421	79426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008120	ATG	2	6	79430	79435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008120	ATT	2	6	79456	79461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008120	TCA	2	6	79481	79486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793607
1508	NC_008120	CAA	2	6	79633	79638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793607
1509	NC_008120	AAT	2	6	79655	79660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793607
1510	NC_008120	AAT	2	6	79748	79753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793607
1511	NC_008120	TCA	2	6	79860	79865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793607
1512	NC_008120	AGA	2	6	79882	79887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793607
1513	NC_008120	CAAT	2	8	79894	79901	50 %	25 %	0 %	25 %	108793607
1514	NC_008120	AAT	2	6	79986	79991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793607
1515	NC_008120	CAG	2	6	80035	80040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793607
1516	NC_008120	GCT	2	6	80046	80051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793607
1517	NC_008120	ACA	2	6	80070	80075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793607
1518	NC_008120	AAT	2	6	80111	80116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793607
1519	NC_008120	T	9	9	80144	80152	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
1520	NC_008120	T	6	6	80202	80207	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
1521	NC_008120	ATT	2	6	80223	80228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793607
1522	NC_008120	T	6	6	80303	80308	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
1523	NC_008120	CAT	2	6	80474	80479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793607
1524	NC_008120	T	7	7	80501	80507	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
1525	NC_008120	AGA	2	6	80564	80569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793607
1526	NC_008120	CAT	2	6	80590	80595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793607
1527	NC_008120	CATGTT	2	12	80624	80635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108793607
1528	NC_008120	CCA	2	6	80640	80645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793607
1529	NC_008120	ATT	2	6	80673	80678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793607
1530	NC_008120	TG	3	6	80681	80686	0 %	50 %	50 %	0 %	108793607
1531	NC_008120	TGG	2	6	80714	80719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793607
1532	NC_008120	ATG	2	6	80746	80751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793607
1533	NC_008120	CTT	2	6	80761	80766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793607
1534	NC_008120	T	6	6	80803	80808	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
1535	NC_008120	CAA	2	6	80860	80865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793607
1536	NC_008120	GCA	2	6	80886	80891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793607
1537	NC_008120	T	7	7	80965	80971	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
1538	NC_008120	TCA	2	6	80982	80987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793607
1539	NC_008120	TGA	2	6	81035	81040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793607
1540	NC_008120	CTC	2	6	81095	81100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793607
1541	NC_008120	GTAA	2	8	81106	81113	50 %	25 %	25 %	0 %	108793607
1542	NC_008120	TGC	2	6	81117	81122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793607
1543	NC_008120	G	6	6	81157	81162	0 %	0 %	100 %	0 %	108793607
1544	NC_008120	TA	3	6	81176	81181	50 %	50 %	0 %	0 %	108793607
1545	NC_008120	GAT	2	6	81196	81201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793607
1546	NC_008120	AGT	2	6	81205	81210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793607
1547	NC_008120	ATT	2	6	81218	81223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793607
1548	NC_008120	TAA	2	6	81274	81279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008120	GCA	2	6	81291	81296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008120	CAC	2	6	81378	81383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793608
1551	NC_008120	TGG	2	6	81423	81428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793608
1552	NC_008120	ATC	2	6	81470	81475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793608
1553	NC_008120	ATG	2	6	81484	81489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793608
1554	NC_008120	GTT	2	6	81499	81504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793608
1555	NC_008120	TGT	3	9	81524	81532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793608
1556	NC_008120	CAA	2	6	81582	81587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793608
1557	NC_008120	CGAG	2	8	81669	81676	25 %	0 %	50 %	25 %	108793608
1558	NC_008120	ATT	2	6	81685	81690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793608
1559	NC_008120	GA	3	6	81729	81734	50 %	0 %	50 %	0 %	108793608
1560	NC_008120	ATG	2	6	81788	81793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793608
1561	NC_008120	A	8	8	81857	81864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008120	GGTAA	2	10	81945	81954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008120	CTT	2	6	82032	82037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008120	A	6	6	82080	82085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008120	T	6	6	82101	82106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008120	CATA	2	8	82149	82156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_008120	TA	3	6	82213	82218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008120	A	6	6	82293	82298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008120	T	7	7	82315	82321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008120	GTC	2	6	82370	82375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_008120	CCGTT	2	10	82507	82516	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1572	NC_008120	GGA	2	6	82540	82545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008120	CGT	2	6	82559	82564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793609
1574	NC_008120	GCC	2	6	82667	82672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793609
1575	NC_008120	ATG	2	6	82719	82724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793609
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1577	NC_008120	AAG	2	6	82746	82751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793609
1578	NC_008120	CCG	2	6	82772	82777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793609
1579	NC_008120	TGG	2	6	82782	82787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793609
1580	NC_008120	ACC	2	6	82789	82794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793609
1581	NC_008120	AGCG	2	8	82827	82834	25 %	0 %	50 %	25 %	108793609
1582	NC_008120	CTT	2	6	82895	82900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793610
1583	NC_008120	GTT	2	6	82973	82978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793610
1584	NC_008120	TGT	2	6	83044	83049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793610
1585	NC_008120	GCCT	2	8	83130	83137	0 %	25 %	25 %	50 %	108793610
1586	NC_008120	TAA	2	6	83139	83144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793610
1587	NC_008120	AG	3	6	83175	83180	50 %	0 %	50 %	0 %	108793610
1588	NC_008120	TGA	2	6	83236	83241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793610
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1591	NC_008120	TGC	2	6	83273	83278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793610
1592	NC_008120	ATA	2	6	83287	83292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793610
1593	NC_008120	GTC	2	6	83364	83369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793610
1594	NC_008120	ACC	2	6	83381	83386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793610
1595	NC_008120	ATC	2	6	83622	83627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793610
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1597	NC_008120	CAT	2	6	83756	83761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793610
1598	NC_008120	TCT	2	6	83783	83788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793610
1599	NC_008120	TCA	2	6	83789	83794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793610
1600	NC_008120	ATG	2	6	83811	83816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008120	CGCTTT	2	12	84014	84025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	108793611
1602	NC_008120	CAT	2	6	84098	84103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793611
1603	NC_008120	TGC	2	6	84124	84129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793611
1604	NC_008120	TGGT	2	8	84172	84179	0 %	50 %	50 %	0 %	108793611
1605	NC_008120	GCT	2	6	84202	84207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793611
1606	NC_008120	CGT	2	6	84244	84249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793611
1607	NC_008120	AAT	2	6	84284	84289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793611
1608	NC_008120	TTC	2	6	84405	84410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793611
1609	NC_008120	T	6	6	84417	84422	0 %	100 %	0 %	0 %	108793611
1610	NC_008120	T	6	6	84478	84483	0 %	100 %	0 %	0 %	108793611
1611	NC_008120	AGT	2	6	84503	84508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008120	CCTG	2	8	84719	84726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_008120	TTA	2	6	84749	84754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008120	TCC	2	6	84760	84765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_008120	ATG	2	6	84895	84900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008120	ATC	2	6	84954	84959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008120	AGT	2	6	85017	85022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793612
1618	NC_008120	AGT	2	6	85083	85088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793612
1619	NC_008120	CGT	2	6	85117	85122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793612
1620	NC_008120	TTC	2	6	85172	85177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793612
1621	NC_008120	T	8	8	85197	85204	0 %	100 %	0 %	0 %	108793612
1622	NC_008120	AAC	2	6	85232	85237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008120	TTG	2	6	85279	85284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008120	CAA	2	6	85285	85290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_008120	ACC	2	6	85341	85346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_008120	ATG	2	6	85405	85410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008120	AAT	2	6	85424	85429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_008120	T	6	6	85458	85463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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