MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 1835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008120	CAG	2	6	54247	54252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793587
1002	NC_008120	CTT	3	9	54408	54416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793587
1003	NC_008120	ATC	2	6	54436	54441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793587
1004	NC_008120	TCG	2	6	54473	54478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793587
1005	NC_008120	TCAA	2	8	54497	54504	50 %	25 %	0 %	25 %	108793587
1006	NC_008120	TCT	2	6	54530	54535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793587
1007	NC_008120	CAGA	2	8	54540	54547	50 %	0 %	25 %	25 %	108793587
1008	NC_008120	TTG	2	6	54608	54613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793587
1009	NC_008120	CA	3	6	54648	54653	50 %	0 %	0 %	50 %	108793587
1010	NC_008120	GGT	2	6	54697	54702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793587
1011	NC_008120	GAA	2	6	54757	54762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793587
1012	NC_008120	GTC	2	6	54775	54780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793587
1013	NC_008120	CGAG	2	8	54978	54985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_008120	ATA	2	6	54990	54995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008120	TACT	2	8	55002	55009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_008120	ATC	2	6	55011	55016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008120	CGG	2	6	55108	55113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793588
1018	NC_008120	GA	3	6	55115	55120	50 %	0 %	50 %	0 %	108793588
1019	NC_008120	CAT	2	6	55163	55168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793588
1020	NC_008120	GGTT	2	8	55199	55206	0 %	50 %	50 %	0 %	108793588
1021	NC_008120	T	6	6	55433	55438	0 %	100 %	0 %	0 %	108793588
1022	NC_008120	TA	3	6	55481	55486	50 %	50 %	0 %	0 %	108793588
1023	NC_008120	GAAA	2	8	55500	55507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008120	GAAG	2	8	55526	55533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008120	GGGGT	2	10	55541	55550	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008120	TGA	2	6	55559	55564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008120	GGA	2	6	55670	55675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008120	TGGGTT	2	12	55738	55749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008120	CAG	2	6	55751	55756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008120	GCTGC	2	10	55782	55791	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1031	NC_008120	CAC	2	6	55819	55824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_008120	A	6	6	55921	55926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008120	TAG	2	6	55927	55932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008120	GCC	2	6	55948	55953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_008120	CT	3	6	56027	56032	0 %	50 %	0 %	50 %	108793589
1036	NC_008120	GCGAT	2	10	56090	56099	20 %	20 %	40 %	20 %	108793589
1037	NC_008120	GTG	3	9	56312	56320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793589
1038	NC_008120	CA	3	6	56435	56440	50 %	0 %	0 %	50 %	108793589
1039	NC_008120	TAAG	2	8	56453	56460	50 %	25 %	25 %	0 %	108793589
1040	NC_008120	TTG	2	6	56498	56503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793589
1041	NC_008120	CTT	2	6	56519	56524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793589
1042	NC_008120	TCA	2	6	56544	56549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793589
1043	NC_008120	A	6	6	56565	56570	100 %	0 %	0 %	0 %	108793589
1044	NC_008120	CCG	2	6	56572	56577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_008120	CAG	2	6	56781	56786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793590
1046	NC_008120	GAC	2	6	56846	56851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793590
1047	NC_008120	CGCCAG	2	12	56883	56894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793590
1048	NC_008120	GAT	2	6	56916	56921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793590
1049	NC_008120	TGG	2	6	56942	56947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793590
1050	NC_008120	GCC	2	6	56983	56988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793590
1051	NC_008120	TCT	2	6	57002	57007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793590
1052	NC_008120	TTG	3	9	57195	57203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793591
1053	NC_008120	GTC	2	6	57404	57409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1054	NC_008120	CAT	2	6	57442	57447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793591
1055	NC_008120	GTC	2	6	57512	57517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1056	NC_008120	GCC	2	6	57534	57539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793591
1057	NC_008120	TCA	2	6	57547	57552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793591
1058	NC_008120	ACACGC	2	12	57743	57754	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108793591
1059	NC_008120	GCC	2	6	57800	57805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793591
1060	NC_008120	ATG	2	6	57825	57830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793591
1061	NC_008120	AGC	2	6	57850	57855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1062	NC_008120	CAG	2	6	57862	57867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1063	NC_008120	TGG	2	6	57944	57949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793591
1064	NC_008120	GCA	2	6	58023	58028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1065	NC_008120	CAG	2	6	58039	58044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1066	NC_008120	TTG	2	6	58107	58112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793591
1067	NC_008120	TTC	2	6	58128	58133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793591
1068	NC_008120	CAG	2	6	58201	58206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1069	NC_008120	CTT	2	6	58237	58242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793591
1070	NC_008120	CG	3	6	58283	58288	0 %	0 %	50 %	50 %	108793591
1071	NC_008120	GTG	2	6	58302	58307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793591
1072	NC_008120	ACG	2	6	58350	58355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1073	NC_008120	GTC	2	6	58571	58576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1074	NC_008120	AGC	2	6	58674	58679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1075	NC_008120	CT	3	6	58797	58802	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
1076	NC_008120	CGA	2	6	58963	58968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1077	NC_008120	CGC	2	6	59021	59026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793591
1078	NC_008120	TCC	2	6	59109	59114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793591
1079	NC_008120	GCA	2	6	59148	59153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1080	NC_008120	CGCAG	2	10	59181	59190	20 %	0 %	40 %	40 %	108793591
1081	NC_008120	TTCA	2	8	59249	59256	25 %	50 %	0 %	25 %	108793591
1082	NC_008120	TGA	2	6	59332	59337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793591
1083	NC_008120	AGA	2	6	59349	59354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793591
1084	NC_008120	CAC	2	6	59391	59396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793591
1085	NC_008120	CCA	2	6	59398	59403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793591
1086	NC_008120	TCA	2	6	59464	59469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793591
1087	NC_008120	GGT	2	6	59568	59573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793591
1088	NC_008120	GT	3	6	59572	59577	0 %	50 %	50 %	0 %	108793591
1089	NC_008120	GTA	2	6	59592	59597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793591
1090	NC_008120	CAGC	2	8	59620	59627	25 %	0 %	25 %	50 %	108793591
1091	NC_008120	TCA	2	6	59629	59634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793591
1092	NC_008120	TCG	2	6	59646	59651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
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1094	NC_008120	GTT	2	6	59724	59729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793591
1095	NC_008120	GGC	2	6	59797	59802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793591
1096	NC_008120	TGG	2	6	59826	59831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793591
1097	NC_008120	TGT	2	6	59866	59871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793591
1098	NC_008120	CGT	2	6	59905	59910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1099	NC_008120	TAA	2	6	59922	59927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793591
1100	NC_008120	TCC	2	6	60047	60052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793591
1101	NC_008120	CAG	2	6	60122	60127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1102	NC_008120	GAT	2	6	60128	60133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793591
1103	NC_008120	GCC	2	6	60153	60158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793591
1104	NC_008120	TCA	2	6	60217	60222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793591
1105	NC_008120	TC	3	6	60308	60313	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
1106	NC_008120	GGCG	2	8	60328	60335	0 %	0 %	75 %	25 %	108793591
1107	NC_008120	TCG	2	6	60354	60359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1108	NC_008120	TCG	2	6	60396	60401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1109	NC_008120	CAG	2	6	60460	60465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793591
1110	NC_008120	TC	3	6	60477	60482	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
1111	NC_008120	TGG	2	6	60649	60654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008120	AG	3	6	60712	60717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008120	TCT	2	6	60751	60756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1114	NC_008120	TGGA	2	8	60787	60794	25 %	25 %	50 %	0 %	108793592
1115	NC_008120	CAT	2	6	60842	60847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793592
1116	NC_008120	AGC	3	9	60864	60872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793592
1117	NC_008120	TGGC	2	8	60887	60894	0 %	25 %	50 %	25 %	108793592
1118	NC_008120	TGC	2	6	60903	60908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793592
1119	NC_008120	TCT	2	6	60946	60951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1120	NC_008120	CAGC	2	8	60979	60986	25 %	0 %	25 %	50 %	108793592
1121	NC_008120	CGC	2	6	61052	61057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793592
1122	NC_008120	TCG	2	6	61092	61097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793592
1123	NC_008120	TGA	2	6	61180	61185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793592
1124	NC_008120	CTGG	2	8	61207	61214	0 %	25 %	50 %	25 %	108793592
1125	NC_008120	AC	3	6	61216	61221	50 %	0 %	0 %	50 %	108793592
1126	NC_008120	TCA	2	6	61251	61256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793592
1127	NC_008120	CGCCAG	2	12	61283	61294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793592
1128	NC_008120	CGAG	2	8	61326	61333	25 %	0 %	50 %	25 %	108793592
1129	NC_008120	CTT	2	6	61354	61359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1130	NC_008120	CAG	2	6	61400	61405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793592
1131	NC_008120	GAAGA	2	10	61423	61432	60 %	0 %	40 %	0 %	108793592
1132	NC_008120	CAT	2	6	61484	61489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793592
1133	NC_008120	TTC	3	9	61530	61538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1134	NC_008120	GT	3	6	61564	61569	0 %	50 %	50 %	0 %	108793592
1135	NC_008120	AGC	2	6	61635	61640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793592
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1138	NC_008120	CAC	2	6	61817	61822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793592
1139	NC_008120	CGTCCA	2	12	61825	61836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108793592
1140	NC_008120	CAC	2	6	61914	61919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793592
1141	NC_008120	TTC	2	6	61946	61951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1142	NC_008120	TCGT	2	8	61996	62003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1143	NC_008120	TA	3	6	62015	62020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_008120	AT	3	6	62022	62027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_008120	AGTA	2	8	62038	62045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_008120	GAC	2	6	62102	62107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
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1149	NC_008120	GTCA	2	8	62171	62178	25 %	25 %	25 %	25 %	108793593
1150	NC_008120	GCA	2	6	62265	62270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
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1153	NC_008120	GCA	2	6	62458	62463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
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1158	NC_008120	TCT	2	6	62679	62684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793593
1159	NC_008120	GTC	2	6	62702	62707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
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1161	NC_008120	GCTC	2	8	62796	62803	0 %	25 %	25 %	50 %	108793593
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1500	NC_008120	ACC	2	6	79368	79373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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