MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 1835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008120	GAC	2	6	27799	27804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793557
502	NC_008120	TCA	2	6	27837	27842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793558
503	NC_008120	TCA	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793558
504	NC_008120	TCA	2	6	27927	27932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793558
505	NC_008120	TCG	2	6	27996	28001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793558
506	NC_008120	CGA	2	6	28037	28042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793558
507	NC_008120	CTT	2	6	28127	28132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793558
508	NC_008120	CCGA	2	8	28160	28167	25 %	0 %	25 %	50 %	108793558
509	NC_008120	TCG	2	6	28182	28187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793558
510	NC_008120	CGCA	2	8	28229	28236	25 %	0 %	25 %	50 %	108793558
511	NC_008120	ACG	2	6	28334	28339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793558
512	NC_008120	TCC	2	6	28353	28358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793558
513	NC_008120	GT	3	6	28369	28374	0 %	50 %	50 %	0 %	108793558
514	NC_008120	CTTCG	2	10	28391	28400	0 %	40 %	20 %	40 %	108793558
515	NC_008120	AAC	2	6	28501	28506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008120	TA	3	6	28585	28590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008120	TAA	2	6	28593	28598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008120	TA	4	8	28612	28619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008120	GGT	2	6	28714	28719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793559
520	NC_008120	GGC	2	6	28738	28743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793559
521	NC_008120	CCA	2	6	28756	28761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793559
522	NC_008120	GCA	2	6	28822	28827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793559
523	NC_008120	AGC	2	6	28833	28838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793559
524	NC_008120	TGA	2	6	28888	28893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793559
525	NC_008120	TTTG	2	8	28900	28907	0 %	75 %	25 %	0 %	108793559
526	NC_008120	CAG	2	6	28985	28990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793560
527	NC_008120	AGC	2	6	29082	29087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793560
528	NC_008120	CCA	2	6	29107	29112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793560
529	NC_008120	TCG	2	6	29134	29139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793560
530	NC_008120	ACG	3	9	29210	29218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793560
531	NC_008120	ACTC	2	8	29224	29231	25 %	25 %	0 %	50 %	108793560
532	NC_008120	CGGAA	2	10	29275	29284	40 %	0 %	40 %	20 %	108793560
533	NC_008120	CGGA	2	8	29333	29340	25 %	0 %	50 %	25 %	108793560
534	NC_008120	CGA	2	6	29387	29392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793560
535	NC_008120	GAT	2	6	29402	29407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793560
536	NC_008120	GACGCC	2	12	29453	29464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793560
537	NC_008120	AACGG	2	10	29483	29492	40 %	0 %	40 %	20 %	108793560
538	NC_008120	GTT	3	9	29507	29515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793560
539	NC_008120	GGT	2	6	29546	29551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793560
540	NC_008120	TGG	2	6	29554	29559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793560
541	NC_008120	CAG	3	9	29597	29605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793560
542	NC_008120	ACG	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793560
543	NC_008120	CCA	2	6	29632	29637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793560
544	NC_008120	GTC	2	6	29642	29647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793560
545	NC_008120	ATA	2	6	29660	29665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793560
546	NC_008120	TGA	3	9	29803	29811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793560
547	NC_008120	TGTC	2	8	29812	29819	0 %	50 %	25 %	25 %	108793560
548	NC_008120	TGA	2	6	29850	29855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793561
549	NC_008120	CGT	2	6	29934	29939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793561
550	NC_008120	ATC	2	6	29945	29950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793561
551	NC_008120	CTT	2	6	29997	30002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793561
552	NC_008120	CAG	2	6	30004	30009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793561
553	NC_008120	GTT	3	9	30025	30033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793561
554	NC_008120	TTC	2	6	30141	30146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793562
555	NC_008120	GTC	2	6	30159	30164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793562
556	NC_008120	CCA	2	6	30166	30171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793562
557	NC_008120	GCGG	2	8	30191	30198	0 %	0 %	75 %	25 %	108793562
558	NC_008120	TCG	2	6	30258	30263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793562
559	NC_008120	CAG	2	6	30386	30391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793562
560	NC_008120	TGG	2	6	30406	30411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793562
561	NC_008120	TTG	2	6	30444	30449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793562
562	NC_008120	GCA	2	6	30514	30519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793562
563	NC_008120	CAGC	2	8	30714	30721	25 %	0 %	25 %	50 %	108793563
564	NC_008120	AGA	2	6	30727	30732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793563
565	NC_008120	TCC	2	6	30785	30790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793563
566	NC_008120	GCAA	2	8	30797	30804	50 %	0 %	25 %	25 %	108793563
567	NC_008120	CAG	2	6	30828	30833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793563
568	NC_008120	CTT	2	6	30870	30875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793563
569	NC_008120	CTT	2	6	30909	30914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793563
570	NC_008120	TGC	2	6	30978	30983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
571	NC_008120	CTG	2	6	31057	31062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
572	NC_008120	CGT	2	6	31074	31079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
573	NC_008120	CTT	3	9	31125	31133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793563
574	NC_008120	GTC	2	6	31141	31146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
575	NC_008120	CCAG	2	8	31175	31182	25 %	0 %	25 %	50 %	108793563
576	NC_008120	GCC	2	6	31187	31192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793563
577	NC_008120	CGA	2	6	31196	31201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793563
578	NC_008120	ATG	2	6	31214	31219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793563
579	NC_008120	CGT	2	6	31221	31226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
580	NC_008120	GGC	2	6	31270	31275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793563
581	NC_008120	CTG	2	6	31291	31296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
582	NC_008120	T	6	6	31306	31311	0 %	100 %	0 %	0 %	108793563
583	NC_008120	GTA	2	6	31392	31397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793564
584	NC_008120	TGA	2	6	31466	31471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793564
585	NC_008120	CTCG	2	8	31550	31557	0 %	25 %	25 %	50 %	108793564
586	NC_008120	GCC	2	6	31654	31659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793564
587	NC_008120	TCG	2	6	31663	31668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793564
588	NC_008120	TTC	2	6	31716	31721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793564
589	NC_008120	CGA	2	6	31772	31777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793564
590	NC_008120	CCA	2	6	31793	31798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793564
591	NC_008120	A	6	6	31929	31934	100 %	0 %	0 %	0 %	108793564
592	NC_008120	TA	3	6	32076	32081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008120	TACT	3	12	32084	32095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_008120	ATA	2	6	32096	32101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008120	TGA	2	6	32190	32195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793565
596	NC_008120	GAT	3	9	32475	32483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793565
597	NC_008120	GCT	2	6	32533	32538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793565
598	NC_008120	AATC	2	8	32612	32619	50 %	25 %	0 %	25 %	108793565
599	NC_008120	CG	3	6	32626	32631	0 %	0 %	50 %	50 %	108793565
600	NC_008120	GCC	2	6	32751	32756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793565
601	NC_008120	A	6	6	32776	32781	100 %	0 %	0 %	0 %	108793565
602	NC_008120	ACC	2	6	32786	32791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793565
603	NC_008120	CTG	2	6	32836	32841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793565
604	NC_008120	ATC	2	6	32862	32867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793565
605	NC_008120	ATG	2	6	33298	33303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793565
606	NC_008120	CAG	2	6	33372	33377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793565
607	NC_008120	GGC	2	6	33381	33386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793565
608	NC_008120	GGTGGC	2	12	33466	33477	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108793565
609	NC_008120	TTA	2	6	33551	33556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793565
610	NC_008120	AATA	2	8	33577	33584	75 %	25 %	0 %	0 %	108793565
611	NC_008120	ACG	2	6	33625	33630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793565
612	NC_008120	AG	3	6	33691	33696	50 %	0 %	50 %	0 %	108793565
613	NC_008120	TCA	2	6	33820	33825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793566
614	NC_008120	GGC	2	6	33866	33871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793566
615	NC_008120	AGA	2	6	33944	33949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793566
616	NC_008120	TGG	2	6	34182	34187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793567
617	NC_008120	CATC	2	8	34227	34234	25 %	25 %	0 %	50 %	108793567
618	NC_008120	GA	3	6	34245	34250	50 %	0 %	50 %	0 %	108793567
619	NC_008120	TTG	2	6	34311	34316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793567
620	NC_008120	CG	3	6	34516	34521	0 %	0 %	50 %	50 %	108793568
621	NC_008120	TC	3	6	34563	34568	0 %	50 %	0 %	50 %	108793568
622	NC_008120	GTC	2	6	34631	34636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793568
623	NC_008120	CAA	2	6	34640	34645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793568
624	NC_008120	TGCCC	2	10	34656	34665	0 %	20 %	20 %	60 %	108793568
625	NC_008120	G	7	7	34889	34895	0 %	0 %	100 %	0 %	108793568
626	NC_008120	GTC	2	6	34953	34958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793568
627	NC_008120	TAA	2	6	35006	35011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008120	TTA	2	6	35026	35031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008120	AT	3	6	35087	35092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008120	ATTT	2	8	35116	35123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008120	GAA	2	6	35176	35181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008120	T	8	8	35184	35191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008120	A	6	6	35202	35207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008120	ATAA	3	12	35268	35279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_008120	TTG	2	6	36868	36873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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