MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	108793733
2	NC_008118	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	108793734
3	NC_008118	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008118	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	108793737
5	NC_008118	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	108793737
6	NC_008118	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	108793738
7	NC_008118	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	108793739
8	NC_008118	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	108793746
9	NC_008118	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	108793752
10	NC_008118	T	6	6	25064	25069	0 %	100 %	0 %	0 %	108793756
11	NC_008118	T	6	6	26452	26457	0 %	100 %	0 %	0 %	108793756
12	NC_008118	T	6	6	31301	31306	0 %	100 %	0 %	0 %	108793763
13	NC_008118	A	6	6	31924	31929	100 %	0 %	0 %	0 %	108793764
14	NC_008118	A	6	6	32771	32776	100 %	0 %	0 %	0 %	108793765
15	NC_008118	G	7	7	34884	34890	0 %	0 %	100 %	0 %	108793768
16	NC_008118	T	8	8	35179	35186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008118	A	6	6	35198	35203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008118	A	6	6	35334	35339	100 %	0 %	0 %	0 %	108793769
19	NC_008118	A	6	6	35778	35783	100 %	0 %	0 %	0 %	108793769
20	NC_008118	T	6	6	36029	36034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008118	T	6	6	36301	36306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008118	T	6	6	36349	36354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008118	A	6	6	36454	36459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008118	A	6	6	37951	37956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008118	A	6	6	38685	38690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008118	T	6	6	39319	39324	0 %	100 %	0 %	0 %	108793773
27	NC_008118	T	7	7	41752	41758	0 %	100 %	0 %	0 %	108793774
28	NC_008118	T	7	7	43670	43676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008118	G	7	7	43834	43840	0 %	0 %	100 %	0 %	108793776
30	NC_008118	A	6	6	43885	43890	100 %	0 %	0 %	0 %	108793776
31	NC_008118	A	6	6	44608	44613	100 %	0 %	0 %	0 %	108793776
32	NC_008118	T	6	6	48295	48300	0 %	100 %	0 %	0 %	108793829
33	NC_008118	T	6	6	49628	49633	0 %	100 %	0 %	0 %	108793781
34	NC_008118	T	6	6	49638	49643	0 %	100 %	0 %	0 %	108793782
35	NC_008118	A	6	6	50103	50108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008118	T	6	6	55175	55180	0 %	100 %	0 %	0 %	108793788
37	NC_008118	A	6	6	55663	55668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008118	A	6	6	56307	56312	100 %	0 %	0 %	0 %	108793789
39	NC_008118	T	7	7	62044	62050	0 %	100 %	0 %	0 %	108793793
40	NC_008118	A	6	6	65063	65068	100 %	0 %	0 %	0 %	108793796
41	NC_008118	A	7	7	66433	66439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008118	A	6	6	66582	66587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008118	A	7	7	66708	66714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008118	T	7	7	67512	67518	0 %	100 %	0 %	0 %	108793832
45	NC_008118	T	6	6	67655	67660	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
46	NC_008118	T	6	6	67728	67733	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
47	NC_008118	T	6	6	68114	68119	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
48	NC_008118	T	6	6	68462	68467	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
49	NC_008118	A	7	7	68529	68535	100 %	0 %	0 %	0 %	108793797
50	NC_008118	T	6	6	68587	68592	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
51	NC_008118	T	8	8	68838	68845	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
52	NC_008118	C	6	6	69055	69060	0 %	0 %	0 %	100 %	108793797
53	NC_008118	C	6	6	69177	69182	0 %	0 %	0 %	100 %	108793797
54	NC_008118	C	6	6	70341	70346	0 %	0 %	0 %	100 %	108793798
55	NC_008118	T	6	6	71473	71478	0 %	100 %	0 %	0 %	108793833
56	NC_008118	T	6	6	71876	71881	0 %	100 %	0 %	0 %	108793833
57	NC_008118	A	6	6	72242	72247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008118	G	6	6	74875	74880	0 %	0 %	100 %	0 %	108793802
59	NC_008118	T	6	6	75472	75477	0 %	100 %	0 %	0 %	108793803
60	NC_008118	A	6	6	77313	77318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008118	T	6	6	77622	77627	0 %	100 %	0 %	0 %	108793806
62	NC_008118	T	6	6	78565	78570	0 %	100 %	0 %	0 %	108793834
63	NC_008118	A	6	6	78705	78710	100 %	0 %	0 %	0 %	108793834
64	NC_008118	T	6	6	78723	78728	0 %	100 %	0 %	0 %	108793834
65	NC_008118	A	6	6	79042	79047	100 %	0 %	0 %	0 %	108793834
66	NC_008118	A	6	6	79077	79082	100 %	0 %	0 %	0 %	108793834
67	NC_008118	A	7	7	80273	80279	100 %	0 %	0 %	0 %	108793807
68	NC_008118	T	6	6	80401	80406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008118	T	7	7	80477	80483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008118	A	7	7	80502	80508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008118	A	6	6	80578	80583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008118	A	6	6	80733	80738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008118	T	9	9	84590	84598	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
74	NC_008118	T	6	6	84648	84653	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
75	NC_008118	T	6	6	84749	84754	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
76	NC_008118	T	7	7	84947	84953	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
77	NC_008118	T	6	6	85249	85254	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
78	NC_008118	T	7	7	85411	85417	0 %	100 %	0 %	0 %	108793811
79	NC_008118	G	6	6	85603	85608	0 %	0 %	100 %	0 %	108793811
80	NC_008118	A	8	8	86303	86310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008118	A	6	6	86526	86531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008118	T	6	6	86547	86552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008118	A	6	6	86739	86744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008118	T	7	7	86761	86767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008118	T	6	6	88862	88867	0 %	100 %	0 %	0 %	108793815
86	NC_008118	T	6	6	88923	88928	0 %	100 %	0 %	0 %	108793815
87	NC_008118	T	8	8	89642	89649	0 %	100 %	0 %	0 %	108793816
88	NC_008118	T	6	6	89903	89908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008118	T	6	6	92177	92182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008118	A	6	6	94976	94981	100 %	0 %	0 %	0 %	108793820
91	NC_008118	A	6	6	96110	96115	100 %	0 %	0 %	0 %	108793822
92	NC_008118	T	6	6	97344	97349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008118	A	6	6	98905	98910	100 %	0 %	0 %	0 %	108793826
94	NC_008118	A	7	7	98920	98926	100 %	0 %	0 %	0 %	108793826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.