MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 chromosome

Total Repeats: 3109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006155	GTGTT	2	10	7317	7326	0 %	60 %	40 %	0 %	51594365
2	NC_006155	TCCAT	2	10	9226	9235	20 %	40 %	0 %	40 %	51594367
3	NC_006155	TGCAA	2	10	9881	9890	40 %	20 %	20 %	20 %	51594369
4	NC_006155	AGGCT	2	10	15688	15697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006155	GATTG	2	10	17213	17222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006155	TTCTC	2	10	17702	17711	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_006155	ATTAA	2	10	17831	17840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006155	CTCTT	2	10	19761	19770	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_006155	CCTGA	2	10	20891	20900	20 %	20 %	20 %	40 %	51594374
10	NC_006155	GATTG	2	10	24012	24021	20 %	40 %	40 %	0 %	51594376
11	NC_006155	GCCCC	2	10	24165	24174	0 %	0 %	20 %	80 %	51594376
12	NC_006155	TTGGC	2	10	25303	25312	0 %	40 %	40 %	20 %	51594376
13	NC_006155	GAGAA	2	10	28106	28115	60 %	0 %	40 %	0 %	51594378
14	NC_006155	CGCAA	2	10	28257	28266	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_006155	GTCAG	2	10	28664	28673	20 %	20 %	40 %	20 %	51594379
16	NC_006155	TTGAT	2	10	28979	28988	20 %	60 %	20 %	0 %	51594379
17	NC_006155	GCTGA	2	10	29044	29053	20 %	20 %	40 %	20 %	51594379
18	NC_006155	TTGGG	2	10	29321	29330	0 %	40 %	60 %	0 %	51594379
19	NC_006155	AACGC	2	10	29948	29957	40 %	0 %	20 %	40 %	51594380
20	NC_006155	CCCGA	2	10	30399	30408	20 %	0 %	20 %	60 %	51594380
21	NC_006155	TGTGA	2	10	35342	35351	20 %	40 %	40 %	0 %	51594383
22	NC_006155	TTCCT	2	10	36150	36159	0 %	60 %	0 %	40 %	51594383
23	NC_006155	GTGTG	2	10	39134	39143	0 %	40 %	60 %	0 %	51594387
24	NC_006155	TGAGT	2	10	39585	39594	20 %	40 %	40 %	0 %	51594387
25	NC_006155	CAGCC	2	10	40766	40775	20 %	0 %	20 %	60 %	51594388
26	NC_006155	AGCAC	2	10	41525	41534	40 %	0 %	20 %	40 %	51594388
27	NC_006155	TAAGT	2	10	41759	41768	40 %	40 %	20 %	0 %	51594389
28	NC_006155	GCTGG	2	10	43525	43534	0 %	20 %	60 %	20 %	51594390
29	NC_006155	TTTGG	2	10	43859	43868	0 %	60 %	40 %	0 %	51594390
30	NC_006155	ATCAC	2	10	43994	44003	40 %	20 %	0 %	40 %	51594390
31	NC_006155	TCAAT	2	10	46461	46470	40 %	40 %	0 %	20 %	51594391
32	NC_006155	TCAGA	2	10	50265	50274	40 %	20 %	20 %	20 %	51594395
33	NC_006155	GGCGG	2	10	51565	51574	0 %	0 %	80 %	20 %	51594396
34	NC_006155	GGGTG	2	10	51805	51814	0 %	20 %	80 %	0 %	51594396
35	NC_006155	AAAGA	2	10	54945	54954	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006155	GGAGA	2	10	55920	55929	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006155	TCATC	2	10	59557	59566	20 %	40 %	0 %	40 %	51594404
38	NC_006155	TGATT	2	10	60191	60200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006155	GCAGC	2	10	61483	61492	20 %	0 %	40 %	40 %	51594407
40	NC_006155	GCGGT	2	10	63369	63378	0 %	20 %	60 %	20 %	51594410
41	NC_006155	CTGCC	2	10	65767	65776	0 %	20 %	20 %	60 %	51594412
42	NC_006155	CGCCA	2	10	66183	66192	20 %	0 %	20 %	60 %	51594412
43	NC_006155	CATCA	2	10	66406	66415	40 %	20 %	0 %	40 %	51594412
44	NC_006155	GCCAG	2	10	66561	66570	20 %	0 %	40 %	40 %	51594413
45	NC_006155	CACCC	2	10	67514	67523	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_006155	ATAAG	2	10	67643	67652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006155	GTTTT	2	10	70363	70372	0 %	80 %	20 %	0 %	51594416
48	NC_006155	CTGTG	2	10	71051	71060	0 %	40 %	40 %	20 %	51594416
49	NC_006155	AACAA	2	10	75361	75370	80 %	0 %	0 %	20 %	51594421
50	NC_006155	AAATA	2	10	76878	76887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006155	TTGGG	2	10	79499	79508	0 %	40 %	60 %	0 %	51594426
52	NC_006155	CCAAA	2	10	89693	89702	60 %	0 %	0 %	40 %	51594435
53	NC_006155	AATGC	2	10	90368	90377	40 %	20 %	20 %	20 %	51594435
54	NC_006155	AACAA	2	10	90515	90524	80 %	0 %	0 %	20 %	51594435
55	NC_006155	ACGCC	2	10	92507	92516	20 %	0 %	20 %	60 %	51594438
56	NC_006155	ACGCG	2	10	93459	93468	20 %	0 %	40 %	40 %	51594438
57	NC_006155	GCTTT	2	10	94665	94674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_006155	TCAAA	2	10	95145	95154	60 %	20 %	0 %	20 %	51594440
59	NC_006155	TTGGC	2	10	97870	97879	0 %	40 %	40 %	20 %	51594443
60	NC_006155	TTCAC	2	10	99028	99037	20 %	40 %	0 %	40 %	51594444
61	NC_006155	TAAAG	2	10	101947	101956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006155	GTTTT	2	10	102199	102208	0 %	80 %	20 %	0 %	51594448
63	NC_006155	GCAAT	2	10	102596	102605	40 %	20 %	20 %	20 %	51594448
64	NC_006155	GCAAG	2	10	102921	102930	40 %	0 %	40 %	20 %	51594448
65	NC_006155	TAAAT	2	10	104146	104155	60 %	40 %	0 %	0 %	51594448
66	NC_006155	TTTAT	2	10	106348	106357	20 %	80 %	0 %	0 %	51594451
67	NC_006155	AATGC	2	10	106935	106944	40 %	20 %	20 %	20 %	51594452
68	NC_006155	GATAA	2	10	107397	107406	60 %	20 %	20 %	0 %	51594453
69	NC_006155	TGTAC	2	10	110516	110525	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_006155	AGGTA	2	10	113520	113529	40 %	20 %	40 %	0 %	51594459
71	NC_006155	TGCTA	2	10	117982	117991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_006155	TTCTG	2	10	121793	121802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_006155	TGAGT	2	10	122846	122855	20 %	40 %	40 %	0 %	51594465
74	NC_006155	TCCAC	2	10	124231	124240	20 %	20 %	0 %	60 %	51594466
75	NC_006155	AGTTC	2	10	125054	125063	20 %	40 %	20 %	20 %	51594466
76	NC_006155	ATCAA	2	10	127259	127268	60 %	20 %	0 %	20 %	51594467
77	NC_006155	TGAAC	2	10	128132	128141	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006155	CTTGG	2	10	129591	129600	0 %	40 %	40 %	20 %	51594469
79	NC_006155	ATGGT	2	10	129962	129971	20 %	40 %	40 %	0 %	51594469
80	NC_006155	TGGTA	2	10	131002	131011	20 %	40 %	40 %	0 %	51594470
81	NC_006155	GCAGT	2	10	135999	136008	20 %	20 %	40 %	20 %	51594473
82	NC_006155	GGCTC	2	10	138172	138181	0 %	20 %	40 %	40 %	51594474
83	NC_006155	TATCT	2	10	142336	142345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_006155	TGTCA	2	10	142449	142458	20 %	40 %	20 %	20 %	51594478
85	NC_006155	ATCAC	2	10	143740	143749	40 %	20 %	0 %	40 %	51594479
86	NC_006155	CGTTT	2	10	145208	145217	0 %	60 %	20 %	20 %	51594480
87	NC_006155	ATATT	2	10	146433	146442	40 %	60 %	0 %	0 %	51594482
88	NC_006155	CATCT	2	10	149423	149432	20 %	40 %	0 %	40 %	229310108
89	NC_006155	GGCTT	2	10	150202	150211	0 %	40 %	40 %	20 %	51594484
90	NC_006155	AGGCT	2	10	154245	154254	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_006155	GATTG	2	10	155770	155779	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006155	ACAGC	2	10	159144	159153	40 %	0 %	20 %	40 %	51594486
93	NC_006155	TTATT	2	10	159849	159858	20 %	80 %	0 %	0 %	51594487
94	NC_006155	CGGTA	2	10	161562	161571	20 %	20 %	40 %	20 %	51594488
95	NC_006155	CACTT	2	10	162071	162080	20 %	40 %	0 %	40 %	51594489
96	NC_006155	TGTTT	2	10	162673	162682	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006155	GGTCT	2	10	162983	162992	0 %	40 %	40 %	20 %	51594490
98	NC_006155	CGGGG	2	10	164134	164143	0 %	0 %	80 %	20 %	51594491
99	NC_006155	CTGCC	2	10	168188	168197	0 %	20 %	20 %	60 %	51594494
100	NC_006155	TTGGT	2	10	170394	170403	0 %	60 %	40 %	0 %	51594495
101	NC_006155	CCATT	2	10	174056	174065	20 %	40 %	0 %	40 %	51594500
102	NC_006155	TACAG	2	10	174609	174618	40 %	20 %	20 %	20 %	51594500
103	NC_006155	CGCAC	2	10	175923	175932	20 %	0 %	20 %	60 %	51594502
104	NC_006155	CACAA	3	15	176622	176636	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_006155	ATGAA	2	10	177965	177974	60 %	20 %	20 %	0 %	51594503
106	NC_006155	AGCAG	2	10	178989	178998	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_006155	CTGGA	2	10	179881	179890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006155	TGCCT	2	10	185331	185340	0 %	40 %	20 %	40 %	51594512
109	NC_006155	ATTAT	2	10	185863	185872	40 %	60 %	0 %	0 %	51594513
110	NC_006155	ATACC	2	10	186020	186029	40 %	20 %	0 %	40 %	51594513
111	NC_006155	AACAG	2	10	191141	191150	60 %	0 %	20 %	20 %	51594516
112	NC_006155	CTAAA	2	10	191778	191787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_006155	TATTT	2	10	192109	192118	20 %	80 %	0 %	0 %	51594517
114	NC_006155	ATTTT	2	10	192865	192874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006155	TGCAG	2	10	193335	193344	20 %	20 %	40 %	20 %	51594518
116	NC_006155	AGCGG	2	10	194532	194541	20 %	0 %	60 %	20 %	51594519
117	NC_006155	GCCCA	2	10	195039	195048	20 %	0 %	20 %	60 %	51594519
118	NC_006155	TCTGA	2	10	199497	199506	20 %	40 %	20 %	20 %	51594523
119	NC_006155	ACGCC	2	10	200874	200883	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_006155	GGCTG	2	10	204150	204159	0 %	20 %	60 %	20 %	51594526
121	NC_006155	TGATT	2	10	207040	207049	20 %	60 %	20 %	0 %	51594528
122	NC_006155	CTGGG	2	10	208434	208443	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006155	GATGA	2	10	209140	209149	40 %	20 %	40 %	0 %	51594530
124	NC_006155	ATATT	2	10	210763	210772	40 %	60 %	0 %	0 %	51594532
125	NC_006155	GTTTT	2	10	212747	212756	0 %	80 %	20 %	0 %	51594534
126	NC_006155	CAAGG	2	10	213743	213752	40 %	0 %	40 %	20 %	51594534
127	NC_006155	TCACT	9	45	214821	214865	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_006155	TAGCG	2	10	221153	221162	20 %	20 %	40 %	20 %	51594539
129	NC_006155	GACGA	2	10	221961	221970	40 %	0 %	40 %	20 %	51594540
130	NC_006155	ATTTT	2	10	227208	227217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006155	TATTT	2	10	227699	227708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006155	GGCCA	2	10	230039	230048	20 %	0 %	40 %	40 %	51594545
133	NC_006155	GCCGC	2	10	232652	232661	0 %	0 %	40 %	60 %	51594549
134	NC_006155	GGCGC	2	10	233364	233373	0 %	0 %	60 %	40 %	51594549
135	NC_006155	CCGTA	2	10	233714	233723	20 %	20 %	20 %	40 %	51594549
136	NC_006155	GCCAA	2	10	235299	235308	40 %	0 %	20 %	40 %	51594550
137	NC_006155	CCACG	2	10	236608	236617	20 %	0 %	20 %	60 %	51594551
138	NC_006155	TGACC	2	10	236677	236686	20 %	20 %	20 %	40 %	51594551
139	NC_006155	TGTGC	2	10	237890	237899	0 %	40 %	40 %	20 %	51594552
140	NC_006155	CGTTT	2	10	239036	239045	0 %	60 %	20 %	20 %	51594553
141	NC_006155	AAATA	2	10	240586	240595	80 %	20 %	0 %	0 %	51594554
142	NC_006155	TTCTC	2	10	241210	241219	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006155	TTTAT	2	10	241284	241293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006155	TGGCT	2	10	244515	244524	0 %	40 %	40 %	20 %	51594558
145	NC_006155	TTTAA	2	10	247892	247901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006155	GAAGA	2	10	249167	249176	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_006155	GCCGC	2	10	258217	258226	0 %	0 %	40 %	60 %	51594570
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152	NC_006155	CTGGT	2	10	266006	266015	0 %	40 %	40 %	20 %	51594578
153	NC_006155	ATTCA	2	10	268561	268570	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_006155	GTTTG	2	10	271700	271709	0 %	60 %	40 %	0 %	51594583
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159	NC_006155	ACTTT	2	10	277424	277433	20 %	60 %	0 %	20 %	51594590
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166	NC_006155	ATTTT	2	10	280777	280786	20 %	80 %	0 %	0 %	51594592
167	NC_006155	AATGG	2	10	280974	280983	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_006155	TTTCA	2	10	281296	281305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_006155	GCCGG	2	10	283696	283705	0 %	0 %	60 %	40 %	51594594
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173	NC_006155	TGATT	2	10	287889	287898	20 %	60 %	20 %	0 %	51594599
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175	NC_006155	GTTGC	2	10	291612	291621	0 %	40 %	40 %	20 %	51594602
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181	NC_006155	TTTAT	2	10	300610	300619	20 %	80 %	0 %	0 %	51594609
182	NC_006155	AGCTA	2	10	301902	301911	40 %	20 %	20 %	20 %	51594609
183	NC_006155	TAATT	2	10	302102	302111	40 %	60 %	0 %	0 %	51594609
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192	NC_006155	ATTCT	2	10	318321	318330	20 %	60 %	0 %	20 %	51594625
193	NC_006155	AGGCT	2	10	323925	323934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
194	NC_006155	GATTG	2	10	325450	325459	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_006155	CTACG	2	10	328704	328713	20 %	20 %	20 %	40 %	51594629
197	NC_006155	TTTGC	2	10	332195	332204	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_006155	ACATG	2	10	332733	332742	40 %	20 %	20 %	20 %	51594633
199	NC_006155	GTCTT	2	10	333213	333222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_006155	GATCA	2	10	334109	334118	40 %	20 %	20 %	20 %	51594635
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202	NC_006155	GCTGC	2	10	335340	335349	0 %	20 %	40 %	40 %	51594636
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220	NC_006155	TTTGA	2	10	367782	367791	20 %	60 %	20 %	0 %	51594658
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234	NC_006155	TCTCC	2	10	391551	391560	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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242	NC_006155	AAAAT	2	10	398765	398774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_006155	TTCTT	2	10	399899	399908	0 %	80 %	0 %	20 %	51594689
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253	NC_006155	ATGAT	2	10	417819	417828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_006155	TGGTG	2	10	418954	418963	0 %	40 %	60 %	0 %	51594708
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257	NC_006155	CTTTT	2	10	421406	421415	0 %	80 %	0 %	20 %	51594711
258	NC_006155	AATAT	2	10	422827	422836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_006155	ATTTT	2	10	423271	423280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_006155	GGCTG	2	10	423800	423809	0 %	20 %	60 %	20 %	51594713
261	NC_006155	TGTAT	2	10	426554	426563	20 %	60 %	20 %	0 %	51594714
262	NC_006155	TCACA	2	10	427742	427751	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_006155	TTTAC	2	10	432012	432021	20 %	60 %	0 %	20 %	51594718
264	NC_006155	ATTTT	2	10	432178	432187	20 %	80 %	0 %	0 %	51594718
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270	NC_006155	GATCT	2	10	443684	443693	20 %	40 %	20 %	20 %	51594724
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272	NC_006155	TCTGA	2	10	451423	451432	20 %	40 %	20 %	20 %	51594731
273	NC_006155	AATAA	2	10	452092	452101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_006155	GATGT	2	10	452678	452687	20 %	40 %	40 %	0 %	51594732
275	NC_006155	CCGTG	2	10	453076	453085	0 %	20 %	40 %	40 %	51594733
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277	NC_006155	TATTT	2	10	453539	453548	20 %	80 %	0 %	0 %	51594733
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283	NC_006155	ATTTA	2	10	466060	466069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_006155	ATGTT	2	10	468171	468180	20 %	60 %	20 %	0 %	51594746
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294	NC_006155	ACCTC	2	10	485182	485191	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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304	NC_006155	TTGGG	2	10	502975	502984	0 %	40 %	60 %	0 %	51594772
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322	NC_006155	TACTT	2	10	522750	522759	20 %	60 %	0 %	20 %	51594788
323	NC_006155	TAAAA	2	10	526299	526308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_006155	ATCCC	2	10	526995	527004	20 %	20 %	0 %	60 %	51594796
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383	NC_006155	TTCAG	2	10	614042	614051	20 %	40 %	20 %	20 %	51594876
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393	NC_006155	AAAGA	2	10	627416	627425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
394	NC_006155	CATCA	2	10	628815	628824	40 %	20 %	0 %	40 %	51594886
395	NC_006155	TTACC	2	10	633086	633095	20 %	40 %	0 %	40 %	51594887
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401	NC_006155	CACCC	2	10	643341	643350	20 %	0 %	0 %	80 %	51594896
402	NC_006155	TTTCA	2	10	645543	645552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
403	NC_006155	TCGGT	2	10	648518	648527	0 %	40 %	40 %	20 %	51594900
404	NC_006155	ATGCG	2	10	648629	648638	20 %	20 %	40 %	20 %	51594900
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