MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 chromosome

Total Repeats: 94209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006155	CA	3	6	156402	156407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_006155	CAG	2	6	156453	156458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_006155	CGT	2	6	156462	156467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_006155	TA	3	6	156487	156492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_006155	G	8	8	156514	156521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_006155	GTT	2	6	156792	156797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_006155	GAT	2	6	156814	156819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_006155	CATTTT	2	12	156825	156836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3009	NC_006155	ATG	2	6	156851	156856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_006155	TC	3	6	156876	156881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_006155	ATC	2	6	156886	156891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_006155	T	7	7	156892	156898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_006155	TA	3	6	156909	156914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_006155	CGC	2	6	156993	156998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_006155	ATT	2	6	157001	157006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_006155	A	6	6	157065	157070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_006155	ATC	2	6	157141	157146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_006155	GAG	2	6	157202	157207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_006155	AGC	3	9	157234	157242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594485
3020	NC_006155	AAG	2	6	157353	157358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594485
3021	NC_006155	CAA	2	6	157397	157402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594485
3022	NC_006155	AAG	2	6	157515	157520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594485
3023	NC_006155	CTT	2	6	157569	157574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594485
3024	NC_006155	CGG	2	6	157581	157586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594485
3025	NC_006155	GTA	2	6	157646	157651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594485
3026	NC_006155	TGT	2	6	157666	157671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594485
3027	NC_006155	TCAG	2	8	157771	157778	25 %	25 %	25 %	25 %	51594485
3028	NC_006155	AAG	2	6	157803	157808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594485
3029	NC_006155	AAG	2	6	157908	157913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594485
3030	NC_006155	AGT	2	6	157985	157990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594485
3031	NC_006155	GGCC	2	8	158029	158036	0 %	0 %	50 %	50 %	51594485
3032	NC_006155	AAGA	2	8	158063	158070	75 %	0 %	25 %	0 %	51594485
3033	NC_006155	ATTC	2	8	158089	158096	25 %	50 %	0 %	25 %	51594485
3034	NC_006155	CCAG	2	8	158116	158123	25 %	0 %	25 %	50 %	51594485
3035	NC_006155	GAA	2	6	158149	158154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594485
3036	NC_006155	GTT	2	6	158230	158235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_006155	GTT	2	6	158349	158354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594486
3038	NC_006155	TTA	2	6	158358	158363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594486
3039	NC_006155	GA	3	6	158365	158370	50 %	0 %	50 %	0 %	51594486
3040	NC_006155	TAA	2	6	158392	158397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594486
3041	NC_006155	TG	3	6	158456	158461	0 %	50 %	50 %	0 %	51594486
3042	NC_006155	TGC	2	6	158543	158548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594486
3043	NC_006155	ATTT	2	8	158551	158558	25 %	75 %	0 %	0 %	51594486
3044	NC_006155	AGCA	2	8	158611	158618	50 %	0 %	25 %	25 %	51594486
3045	NC_006155	CAG	2	6	158658	158663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594486
3046	NC_006155	ACA	2	6	158690	158695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594486
3047	NC_006155	AAG	2	6	158776	158781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594486
3048	NC_006155	TCG	2	6	158908	158913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594486
3049	NC_006155	ATG	2	6	158958	158963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594486
3050	NC_006155	TGA	2	6	158978	158983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594486
3051	NC_006155	GTG	2	6	158998	159003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594486
3052	NC_006155	TTA	2	6	159120	159125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594486
3053	NC_006155	GGAC	2	8	159132	159139	25 %	0 %	50 %	25 %	51594486
3054	NC_006155	ACAGC	2	10	159144	159153	40 %	0 %	20 %	40 %	51594486
3055	NC_006155	AGA	2	6	159263	159268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594486
3056	NC_006155	TTG	2	6	159286	159291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594486
3057	NC_006155	CAT	2	6	159314	159319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594486
3058	NC_006155	GTGG	2	8	159340	159347	0 %	25 %	75 %	0 %	51594486
3059	NC_006155	TC	3	6	159446	159451	0 %	50 %	0 %	50 %	51594486
3060	NC_006155	CAA	2	6	159462	159467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594486
3061	NC_006155	ATT	2	6	159561	159566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594486
3062	NC_006155	TG	3	6	159583	159588	0 %	50 %	50 %	0 %	51594486
3063	NC_006155	AGA	2	6	159626	159631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594486
3064	NC_006155	TTC	2	6	159661	159666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594486
3065	NC_006155	TCG	2	6	159671	159676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594486
3066	NC_006155	TTATT	2	10	159849	159858	20 %	80 %	0 %	0 %	51594487
3067	NC_006155	TCT	2	6	159885	159890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594487
3068	NC_006155	TAT	2	6	159925	159930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594487
3069	NC_006155	TCGG	2	8	160013	160020	0 %	25 %	50 %	25 %	51594487
3070	NC_006155	TTA	2	6	160218	160223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594487
3071	NC_006155	GTT	2	6	160366	160371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594487
3072	NC_006155	AGTC	2	8	160377	160384	25 %	25 %	25 %	25 %	51594487
3073	NC_006155	GT	3	6	160461	160466	0 %	50 %	50 %	0 %	51594487
3074	NC_006155	TAT	2	6	160483	160488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594487
3075	NC_006155	GTG	2	6	160506	160511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594487
3076	NC_006155	GGT	2	6	160571	160576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594487
3077	NC_006155	CTA	2	6	160604	160609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594487
3078	NC_006155	ATT	2	6	160631	160636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594487
3079	NC_006155	GAT	2	6	160738	160743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594487
3080	NC_006155	AAT	2	6	160773	160778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594487
3081	NC_006155	TCTG	2	8	160838	160845	0 %	50 %	25 %	25 %	51594488
3082	NC_006155	TCC	2	6	160864	160869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51594488
3083	NC_006155	ACTG	2	8	160890	160897	25 %	25 %	25 %	25 %	51594488
3084	NC_006155	TTG	2	6	160916	160921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594488
3085	NC_006155	G	7	7	160950	160956	0 %	0 %	100 %	0 %	51594488
3086	NC_006155	TGC	2	6	160997	161002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594488
3087	NC_006155	ATT	2	6	161098	161103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594488
3088	NC_006155	T	6	6	161149	161154	0 %	100 %	0 %	0 %	51594488
3089	NC_006155	ACC	2	6	161201	161206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594488
3090	NC_006155	AT	3	6	161209	161214	50 %	50 %	0 %	0 %	51594488
3091	NC_006155	TAT	2	6	161277	161282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594488
3092	NC_006155	TCA	2	6	161316	161321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594488
3093	NC_006155	TC	4	8	161459	161466	0 %	50 %	0 %	50 %	51594488
3094	NC_006155	GGC	2	6	161490	161495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594488
3095	NC_006155	GTG	2	6	161498	161503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594488
3096	NC_006155	TGC	2	6	161520	161525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594488
3097	NC_006155	TGG	2	6	161535	161540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594488
3098	NC_006155	GGCG	2	8	161550	161557	0 %	0 %	75 %	25 %	51594488
3099	NC_006155	CGGTA	2	10	161562	161571	20 %	20 %	40 %	20 %	51594488
3100	NC_006155	GTT	2	6	161580	161585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594488
3101	NC_006155	GT	3	6	161588	161593	0 %	50 %	50 %	0 %	51594488
3102	NC_006155	GTG	2	6	161646	161651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594488
3103	NC_006155	TGCT	2	8	161819	161826	0 %	50 %	25 %	25 %	51594489
3104	NC_006155	ATGA	2	8	161885	161892	50 %	25 %	25 %	0 %	51594489
3105	NC_006155	CTG	2	6	162029	162034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594489
3106	NC_006155	C	6	6	162046	162051	0 %	0 %	0 %	100 %	51594489
3107	NC_006155	CACTT	2	10	162071	162080	20 %	40 %	0 %	40 %	51594489
3108	NC_006155	TCT	2	6	162108	162113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594489
3109	NC_006155	ACG	2	6	162133	162138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594489
3110	NC_006155	GCAG	2	8	162169	162176	25 %	0 %	50 %	25 %	51594489
3111	NC_006155	CAA	2	6	162212	162217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594489
3112	NC_006155	TTG	2	6	162293	162298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594489
3113	NC_006155	GT	3	6	162372	162377	0 %	50 %	50 %	0 %	51594489
3114	NC_006155	CTT	2	6	162394	162399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594489
3115	NC_006155	T	6	6	162398	162403	0 %	100 %	0 %	0 %	51594489
3116	NC_006155	CAG	2	6	162422	162427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594489
3117	NC_006155	ATT	2	6	162476	162481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594489
3118	NC_006155	CCG	2	6	162544	162549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594489
3119	NC_006155	T	8	8	162649	162656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_006155	TGTTT	2	10	162673	162682	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_006155	GA	3	6	162734	162739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_006155	TCA	2	6	162769	162774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594490
3123	NC_006155	T	7	7	162785	162791	0 %	100 %	0 %	0 %	51594490
3124	NC_006155	ATA	2	6	162793	162798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594490
3125	NC_006155	GAA	2	6	162918	162923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594490
3126	NC_006155	GAG	2	6	162975	162980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51594490
3127	NC_006155	GGTCT	2	10	162983	162992	0 %	40 %	40 %	20 %	51594490
3128	NC_006155	GATG	2	8	163055	163062	25 %	25 %	50 %	0 %	51594490
3129	NC_006155	GGA	2	6	163067	163072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51594490
3130	NC_006155	CGA	2	6	163085	163090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594490
3131	NC_006155	GTT	2	6	163121	163126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_006155	GGT	2	6	163436	163441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_006155	T	6	6	163549	163554	0 %	100 %	0 %	0 %	51594491
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3135	NC_006155	GCT	2	6	163771	163776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594491
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3142	NC_006155	GCA	2	6	164239	164244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594491
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3156	NC_006155	CTT	2	6	164866	164871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594491
3157	NC_006155	GTT	2	6	164877	164882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594491
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3160	NC_006155	A	7	7	165211	165217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_006155	GCG	2	6	165224	165229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_006155	TGAT	2	8	165243	165250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_006155	ATA	2	6	165291	165296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_006155	TAAA	2	8	165300	165307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_006155	TTCG	2	8	165348	165355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3166	NC_006155	TAGA	2	8	165360	165367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_006155	AAC	2	6	165370	165375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_006155	GTG	3	9	165424	165432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_006155	ATT	2	6	165433	165438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3171	NC_006155	T	7	7	165530	165536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_006155	GAG	2	6	165557	165562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_006155	CAG	2	6	165574	165579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3178	NC_006155	ATG	2	6	165725	165730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594492
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3202	NC_006155	GCA	2	6	167013	167018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594492
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3212	NC_006155	GAA	2	6	167550	167555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594494
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3220	NC_006155	CAA	2	6	168397	168402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594494
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3223	NC_006155	GGT	2	6	168573	168578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3225	NC_006155	ATTT	2	8	168638	168645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3226	NC_006155	GACA	2	8	168666	168673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3227	NC_006155	ATTT	2	8	168674	168681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_006155	GACA	2	8	168684	168691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3229	NC_006155	ATTT	2	8	168692	168699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_006155	AC	3	6	168703	168708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3231	NC_006155	ATTT	2	8	168710	168717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_006155	AC	3	6	168721	168726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3233	NC_006155	GACA	2	8	168738	168745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3234	NC_006155	ACC	3	9	168803	168811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594495
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3238	NC_006155	GAT	2	6	169019	169024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594495
3239	NC_006155	CT	3	6	169057	169062	0 %	50 %	0 %	50 %	51594495
3240	NC_006155	GT	3	6	169130	169135	0 %	50 %	50 %	0 %	51594495
3241	NC_006155	TGG	2	6	169213	169218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594495
3242	NC_006155	ATC	2	6	169256	169261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594495
3243	NC_006155	AG	3	6	169318	169323	50 %	0 %	50 %	0 %	51594495
3244	NC_006155	TGAA	2	8	169401	169408	50 %	25 %	25 %	0 %	51594495
3245	NC_006155	TTG	2	6	169442	169447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594495
3246	NC_006155	TTG	2	6	169497	169502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594495
3247	NC_006155	TTA	2	6	169516	169521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594495
3248	NC_006155	GGC	3	9	169639	169647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594495
3249	NC_006155	ATCG	2	8	169682	169689	25 %	25 %	25 %	25 %	51594495
3250	NC_006155	G	8	8	169768	169775	0 %	0 %	100 %	0 %	51594495
3251	NC_006155	CGC	2	6	169915	169920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594495
3252	NC_006155	CAC	2	6	169939	169944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594495
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3254	NC_006155	GGT	2	6	170180	170185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594495
3255	NC_006155	GTT	2	6	170207	170212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594495
3256	NC_006155	G	6	6	170234	170239	0 %	0 %	100 %	0 %	51594495
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3374	NC_006155	GAT	2	6	176477	176482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3375	NC_006155	AT	3	6	176540	176545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_006155	CACAA	3	15	176622	176636	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3377	NC_006155	CAC	2	6	176716	176721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3378	NC_006155	CAG	2	6	176779	176784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594503
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3500	NC_006155	A	6	6	181929	181934	100 %	0 %	0 %	0 %	51594507

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