MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 chromosome

Total Repeats: 94209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006155	GTT	2	6	52721	52726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594396
1002	NC_006155	CCA	2	6	52779	52784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594396
1003	NC_006155	T	6	6	52825	52830	0 %	100 %	0 %	0 %	51594396
1004	NC_006155	GTT	2	6	52880	52885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594396
1005	NC_006155	TCC	2	6	52908	52913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_006155	CAGG	2	8	52955	52962	25 %	0 %	50 %	25 %	51594397
1007	NC_006155	TGA	2	6	53006	53011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594397
1008	NC_006155	TAATGA	2	12	53015	53026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51594397
1009	NC_006155	GCG	2	6	53042	53047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594397
1010	NC_006155	TTTC	2	8	53102	53109	0 %	75 %	0 %	25 %	51594397
1011	NC_006155	GTA	2	6	53147	53152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594397
1012	NC_006155	CCA	2	6	53155	53160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594397
1013	NC_006155	CGG	2	6	53177	53182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594397
1014	NC_006155	AAT	2	6	53193	53198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594397
1015	NC_006155	AAT	2	6	53235	53240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594397
1016	NC_006155	TCA	2	6	53297	53302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594397
1017	NC_006155	GGT	2	6	53316	53321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594397
1018	NC_006155	CGA	2	6	53339	53344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594397
1019	NC_006155	CCAA	2	8	53370	53377	50 %	0 %	0 %	50 %	51594397
1020	NC_006155	AAT	3	9	53439	53447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594397
1021	NC_006155	GGC	2	6	53468	53473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594397
1022	NC_006155	AAT	2	6	53517	53522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594397
1023	NC_006155	GTTA	2	8	53635	53642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_006155	CATT	2	8	53662	53669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_006155	ATTT	2	8	53672	53679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_006155	A	7	7	53684	53690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_006155	GGT	2	6	53727	53732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_006155	CAT	2	6	53800	53805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_006155	AATG	2	8	53813	53820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_006155	AGT	2	6	53825	53830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006155	TCA	2	6	53850	53855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_006155	AAT	2	6	53950	53955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_006155	AATC	2	8	53966	53973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_006155	T	6	6	54032	54037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_006155	TCAA	2	8	54098	54105	50 %	25 %	0 %	25 %	51594398
1036	NC_006155	CAT	2	6	54190	54195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594398
1037	NC_006155	GGC	3	9	54204	54212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594398
1038	NC_006155	CTT	2	6	54219	54224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594398
1039	NC_006155	TCT	2	6	54225	54230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594398
1040	NC_006155	TGT	2	6	54237	54242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594398
1041	NC_006155	CTT	2	6	54354	54359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594398
1042	NC_006155	GCT	2	6	54453	54458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594398
1043	NC_006155	TGC	2	6	54475	54480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594398
1044	NC_006155	CAG	2	6	54573	54578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594398
1045	NC_006155	TCA	2	6	54626	54631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594398
1046	NC_006155	AACT	2	8	54661	54668	50 %	25 %	0 %	25 %	51594398
1047	NC_006155	TGC	2	6	54915	54920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594398
1048	NC_006155	ATC	2	6	54923	54928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594398
1049	NC_006155	AAAGA	2	10	54945	54954	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006155	G	6	6	54956	54961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_006155	CAG	2	6	55061	55066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594399
1052	NC_006155	AGC	2	6	55071	55076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594399
1053	NC_006155	CAA	2	6	55078	55083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594399
1054	NC_006155	GTTG	2	8	55137	55144	0 %	50 %	50 %	0 %	51594399
1055	NC_006155	GAA	2	6	55183	55188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594399
1056	NC_006155	GC	3	6	55276	55281	0 %	0 %	50 %	50 %	51594399
1057	NC_006155	TGG	2	6	55419	55424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594399
1058	NC_006155	GTG	2	6	55445	55450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594399
1059	NC_006155	TGC	2	6	55530	55535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594399
1060	NC_006155	TGTC	2	8	55538	55545	0 %	50 %	25 %	25 %	51594399
1061	NC_006155	AGA	2	6	55587	55592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594399
1062	NC_006155	TGA	2	6	55622	55627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594399
1063	NC_006155	GAT	2	6	55641	55646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594399
1064	NC_006155	GAA	2	6	55687	55692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594399
1065	NC_006155	GGC	2	6	55752	55757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594399
1066	NC_006155	TTA	2	6	55773	55778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006155	T	7	7	55796	55802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_006155	TTA	2	6	55895	55900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_006155	GGAGA	2	10	55920	55929	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_006155	TTC	2	6	56036	56041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594400
1071	NC_006155	GTT	2	6	56050	56055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594400
1072	NC_006155	TGC	3	9	56095	56103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594400
1073	NC_006155	ACA	2	6	56171	56176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594400
1074	NC_006155	CCG	2	6	56178	56183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594400
1075	NC_006155	CAT	2	6	56198	56203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594400
1076	NC_006155	AAG	2	6	56235	56240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594400
1077	NC_006155	GAT	2	6	56306	56311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594400
1078	NC_006155	CCG	2	6	56319	56324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594400
1079	NC_006155	TGA	2	6	56385	56390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594400
1080	NC_006155	GCGTGG	2	12	56410	56421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	51594400
1081	NC_006155	ATG	2	6	56490	56495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594400
1082	NC_006155	TGG	2	6	56538	56543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594400
1083	NC_006155	TAA	2	6	56594	56599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_006155	TC	3	6	56670	56675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_006155	CAAT	2	8	56736	56743	50 %	25 %	0 %	25 %	51594401
1086	NC_006155	GAAC	2	8	56789	56796	50 %	0 %	25 %	25 %	51594401
1087	NC_006155	CAA	2	6	56827	56832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594401
1088	NC_006155	TCA	2	6	56852	56857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594401
1089	NC_006155	CAG	2	6	57037	57042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594401
1090	NC_006155	GCT	2	6	57176	57181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594401
1091	NC_006155	GCG	2	6	57200	57205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594401
1092	NC_006155	GTA	2	6	57215	57220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594401
1093	NC_006155	TTTTCT	2	12	57299	57310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	51594401
1094	NC_006155	TAA	2	6	57345	57350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_006155	GGC	2	6	57390	57395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_006155	T	6	6	57408	57413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_006155	GGTT	2	8	57431	57438	0 %	50 %	50 %	0 %	51594402
1098	NC_006155	ACC	2	6	57461	57466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594402
1099	NC_006155	GCT	2	6	57574	57579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594402
1100	NC_006155	GTT	2	6	57750	57755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594402
1101	NC_006155	T	7	7	57883	57889	0 %	100 %	0 %	0 %	51594402
1102	NC_006155	CAT	2	6	57890	57895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594402
1103	NC_006155	TC	3	6	57962	57967	0 %	50 %	0 %	50 %	161760595
1104	NC_006155	A	6	6	57977	57982	100 %	0 %	0 %	0 %	161760595
1105	NC_006155	CAT	2	6	58031	58036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161760595
1106	NC_006155	T	6	6	58057	58062	0 %	100 %	0 %	0 %	161760595
1107	NC_006155	CG	3	6	58078	58083	0 %	0 %	50 %	50 %	161760595
1108	NC_006155	TTC	2	6	58086	58091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161760595
1109	NC_006155	CAA	3	9	58118	58126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161760595
1110	NC_006155	CAA	2	6	58160	58165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161760595
1111	NC_006155	T	7	7	58209	58215	0 %	100 %	0 %	0 %	161760595
1112	NC_006155	CG	3	6	58239	58244	0 %	0 %	50 %	50 %	161760595
1113	NC_006155	CTG	3	9	58281	58289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161760595
1114	NC_006155	T	6	6	58295	58300	0 %	100 %	0 %	0 %	161760595
1115	NC_006155	CTG	2	6	58308	58313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161760595
1116	NC_006155	CGG	2	6	58499	58504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161760595
1117	NC_006155	TG	3	6	58681	58686	0 %	50 %	50 %	0 %	161760595
1118	NC_006155	CAAA	2	8	58749	58756	75 %	0 %	0 %	25 %	161760595
1119	NC_006155	GGT	2	6	58758	58763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161760595
1120	NC_006155	CCG	2	6	58808	58813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161760595
1121	NC_006155	AAT	2	6	58824	58829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161760595
1122	NC_006155	ATC	2	6	58896	58901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161760595
1123	NC_006155	GTG	2	6	58937	58942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161760595
1124	NC_006155	GCG	2	6	58957	58962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161760595
1125	NC_006155	TCA	2	6	58967	58972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161760595
1126	NC_006155	TCA	2	6	59084	59089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161760595
1127	NC_006155	CT	3	6	59161	59166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_006155	GTG	2	6	59223	59228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_006155	AG	3	6	59314	59319	50 %	0 %	50 %	0 %	51594404
1130	NC_006155	TGC	2	6	59337	59342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594404
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1132	NC_006155	ACT	2	6	59361	59366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594404
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1138	NC_006155	GA	3	6	59642	59647	50 %	0 %	50 %	0 %	51594404
1139	NC_006155	T	7	7	59648	59654	0 %	100 %	0 %	0 %	51594404
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1260	NC_006155	GGC	2	6	65731	65736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594412
1261	NC_006155	CTGCC	2	10	65767	65776	0 %	20 %	20 %	60 %	51594412
1262	NC_006155	GAC	2	6	65863	65868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594412
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1264	NC_006155	CAAT	2	8	65883	65890	50 %	25 %	0 %	25 %	51594412
1265	NC_006155	AAT	2	6	65965	65970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594412
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1269	NC_006155	GCTT	2	8	66134	66141	0 %	50 %	25 %	25 %	51594412
1270	NC_006155	CGCCA	2	10	66183	66192	20 %	0 %	20 %	60 %	51594412
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1274	NC_006155	CTG	2	6	66420	66425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594412
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1277	NC_006155	GCCAG	2	10	66561	66570	20 %	0 %	40 %	40 %	51594413
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1291	NC_006155	ACC	2	6	67388	67393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594413
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1300	NC_006155	ATAAG	2	10	67643	67652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1301	NC_006155	CCA	2	6	67670	67675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1302	NC_006155	TG	3	6	67689	67694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1336	NC_006155	TGA	2	6	69896	69901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594415
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1338	NC_006155	GCC	2	6	70049	70054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1363	NC_006155	GTT	2	6	71132	71137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1371	NC_006155	CTT	2	6	71640	71645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161760594
1372	NC_006155	CTG	2	6	71740	71745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161760594
1373	NC_006155	T	6	6	71781	71786	0 %	100 %	0 %	0 %	161760594
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1376	NC_006155	TTCA	2	8	71941	71948	25 %	50 %	0 %	25 %	161760594
1377	NC_006155	CT	3	6	71987	71992	0 %	50 %	0 %	50 %	161760594
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1383	NC_006155	T	6	6	72255	72260	0 %	100 %	0 %	0 %	161760594
1384	NC_006155	A	6	6	72378	72383	100 %	0 %	0 %	0 %	161760594
1385	NC_006155	GAC	2	6	72411	72416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161760594
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1387	NC_006155	AG	3	6	72434	72439	50 %	0 %	50 %	0 %	161760594
1388	NC_006155	CT	3	6	72445	72450	0 %	50 %	0 %	50 %	161760594
1389	NC_006155	CT	3	6	72496	72501	0 %	50 %	0 %	50 %	161760594
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1471	NC_006155	A	6	6	76833	76838	100 %	0 %	0 %	0 %	51594422
1472	NC_006155	AGA	2	6	76856	76861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1489	NC_006155	GCA	2	6	77899	77904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594424
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