MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 chromosome

Total Repeats: 94209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006155	GTC	2	6	26965	26970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_006155	GCG	2	6	26982	26987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_006155	A	6	6	27029	27034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006155	TAT	2	6	27040	27045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_006155	CT	3	6	27052	27057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_006155	TTG	2	6	27076	27081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006155	AGG	2	6	27342	27347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006155	A	6	6	27414	27419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006155	GCC	2	6	27436	27441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_006155	T	6	6	27442	27447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_006155	TCT	2	6	27453	27458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_006155	GGC	2	6	27512	27517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_006155	TA	3	6	27561	27566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006155	AGC	2	6	27608	27613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594378
515	NC_006155	CAC	2	6	27623	27628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594378
516	NC_006155	AGA	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594378
517	NC_006155	TGA	2	6	27687	27692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594378
518	NC_006155	AGA	2	6	27725	27730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594378
519	NC_006155	GCA	2	6	27773	27778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594378
520	NC_006155	GTA	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594378
521	NC_006155	GAA	2	6	27925	27930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594378
522	NC_006155	GCT	2	6	27969	27974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594378
523	NC_006155	AGA	2	6	28008	28013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594378
524	NC_006155	TGA	2	6	28083	28088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594378
525	NC_006155	GAT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594378
526	NC_006155	GAGAA	2	10	28106	28115	60 %	0 %	40 %	0 %	51594378
527	NC_006155	TTAA	2	8	28167	28174	50 %	50 %	0 %	0 %	51594378
528	NC_006155	GGT	2	6	28186	28191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006155	CTA	2	6	28205	28210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_006155	TTA	2	6	28232	28237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_006155	GGC	2	6	28248	28253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_006155	CGCAA	2	10	28257	28266	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
533	NC_006155	ACA	2	6	28297	28302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_006155	ATT	2	6	28406	28411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594379
535	NC_006155	CAG	2	6	28480	28485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594379
536	NC_006155	TGA	2	6	28602	28607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594379
537	NC_006155	TGG	2	6	28613	28618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594379
538	NC_006155	GCC	2	6	28645	28650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594379
539	NC_006155	GTCAG	2	10	28664	28673	20 %	20 %	40 %	20 %	51594379
540	NC_006155	G	10	10	28685	28694	0 %	0 %	100 %	0 %	51594379
541	NC_006155	TGC	2	6	28742	28747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594379
542	NC_006155	TTGAT	2	10	28979	28988	20 %	60 %	20 %	0 %	51594379
543	NC_006155	GCTGA	2	10	29044	29053	20 %	20 %	40 %	20 %	51594379
544	NC_006155	GCC	2	6	29104	29109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594379
545	NC_006155	CGG	2	6	29141	29146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594379
546	NC_006155	GCA	2	6	29166	29171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594379
547	NC_006155	GGAT	2	8	29213	29220	25 %	25 %	50 %	0 %	51594379
548	NC_006155	GAT	2	6	29236	29241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594379
549	NC_006155	CAG	2	6	29257	29262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594379
550	NC_006155	TTGGG	2	10	29321	29330	0 %	40 %	60 %	0 %	51594379
551	NC_006155	AGC	2	6	29522	29527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594379
552	NC_006155	ATT	2	6	29549	29554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594379
553	NC_006155	GCT	2	6	29571	29576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594379
554	NC_006155	TGG	2	6	29600	29605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594379
555	NC_006155	C	6	6	29633	29638	0 %	0 %	0 %	100 %	51594379
556	NC_006155	GC	3	6	29698	29703	0 %	0 %	50 %	50 %	51594379
557	NC_006155	AGC	2	6	29705	29710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594379
558	NC_006155	ACT	2	6	29783	29788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594380
559	NC_006155	CAG	2	6	29838	29843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594380
560	NC_006155	TGC	2	6	29847	29852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594380
561	NC_006155	GGT	2	6	29886	29891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594380
562	NC_006155	TGA	2	6	29938	29943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594380
563	NC_006155	AACGC	2	10	29948	29957	40 %	0 %	20 %	40 %	51594380
564	NC_006155	AAT	2	6	30037	30042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594380
565	NC_006155	CTT	2	6	30323	30328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594380
566	NC_006155	CCCGA	2	10	30399	30408	20 %	0 %	20 %	60 %	51594380
567	NC_006155	A	7	7	30481	30487	100 %	0 %	0 %	0 %	51594380
568	NC_006155	GCC	2	6	30598	30603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594380
569	NC_006155	TACCGG	2	12	30674	30685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	51594380
570	NC_006155	GAG	2	6	30712	30717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51594380
571	NC_006155	ATA	2	6	30772	30777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594380
572	NC_006155	ACTG	2	8	30792	30799	25 %	25 %	25 %	25 %	51594380
573	NC_006155	CGGG	2	8	30808	30815	0 %	0 %	75 %	25 %	51594380
574	NC_006155	TTG	3	9	30816	30824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594380
575	NC_006155	TCG	2	6	30868	30873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594380
576	NC_006155	CGG	2	6	30926	30931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594380
577	NC_006155	ATG	2	6	30958	30963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594380
578	NC_006155	TTTG	2	8	30992	30999	0 %	75 %	25 %	0 %	51594380
579	NC_006155	CCAT	2	8	31012	31019	25 %	25 %	0 %	50 %	51594380
580	NC_006155	AAC	2	6	31042	31047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594380
581	NC_006155	CAGT	2	8	31124	31131	25 %	25 %	25 %	25 %	51594380
582	NC_006155	GC	3	6	31132	31137	0 %	0 %	50 %	50 %	51594380
583	NC_006155	CGA	2	6	31169	31174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594380
584	NC_006155	GT	3	6	31238	31243	0 %	50 %	50 %	0 %	51594381
585	NC_006155	GATA	2	8	31300	31307	50 %	25 %	25 %	0 %	51594381
586	NC_006155	GCC	2	6	31480	31485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594381
587	NC_006155	CAG	2	6	31525	31530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594381
588	NC_006155	TGA	2	6	31652	31657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594381
589	NC_006155	AAT	2	6	31738	31743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594381
590	NC_006155	TAA	2	6	31789	31794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594381
591	NC_006155	TTG	2	6	31873	31878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51594381
592	NC_006155	CAA	2	6	31998	32003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594381
593	NC_006155	CT	3	6	32048	32053	0 %	50 %	0 %	50 %	51594381
594	NC_006155	TAA	2	6	32086	32091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51594381
595	NC_006155	ATC	3	9	32176	32184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594381
596	NC_006155	CAG	2	6	32188	32193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594381
597	NC_006155	GAT	2	6	32356	32361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006155	ACGAAA	2	12	32363	32374	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
599	NC_006155	A	6	6	32382	32387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006155	CAA	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_006155	GT	3	6	32449	32454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_006155	GCT	2	6	32457	32462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_006155	TCGC	2	8	32464	32471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_006155	ACGC	2	8	32551	32558	25 %	0 %	25 %	50 %	51594382
605	NC_006155	TCT	2	6	32567	32572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594382
606	NC_006155	CAT	2	6	32601	32606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51594382
607	NC_006155	CCA	2	6	32618	32623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594382
608	NC_006155	CTT	3	9	32700	32708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51594382
609	NC_006155	CGG	2	6	32710	32715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594382
610	NC_006155	TGA	2	6	32763	32768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594382
611	NC_006155	GCCA	2	8	32779	32786	25 %	0 %	25 %	50 %	51594382
612	NC_006155	GCG	2	6	32795	32800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51594382
613	NC_006155	ACG	2	6	32848	32853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594382
614	NC_006155	CAA	2	6	32868	32873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594382
615	NC_006155	TGG	2	6	32964	32969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594382
616	NC_006155	TGA	2	6	33006	33011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51594382
617	NC_006155	CCG	2	6	33014	33019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594382
618	NC_006155	GCC	2	6	33046	33051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594382
619	NC_006155	TTA	2	6	33074	33079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51594382
620	NC_006155	TGCG	2	8	33169	33176	0 %	25 %	50 %	25 %	51594382
621	NC_006155	ACG	2	6	33188	33193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51594382
622	NC_006155	GTG	3	9	33280	33288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51594382
623	NC_006155	ACC	2	6	33296	33301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594382
624	NC_006155	GGA	2	6	33362	33367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51594382
625	NC_006155	GCC	2	6	33412	33417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51594382
626	NC_006155	TGC	2	6	33483	33488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51594382
627	NC_006155	GAA	2	6	33514	33519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594382
628	NC_006155	TTCTGG	2	12	33520	33531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	51594382
629	NC_006155	AAC	2	6	33536	33541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51594382
630	NC_006155	GAA	2	6	33673	33678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51594382
631	NC_006155	CCA	2	6	33746	33751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51594382
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650	NC_006155	A	6	6	34469	34474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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