MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	GTC	2	6	55	60	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
2	NC_006153	AGT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
3	NC_006153	ATC	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
4	NC_006153	CCT	2	6	185	190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
5	NC_006153	GCC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593847
6	NC_006153	ATC	2	6	217	222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
7	NC_006153	CTG	4	12	366	377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
8	NC_006153	TGC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
9	NC_006153	CGA	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593847
10	NC_006153	GAT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
11	NC_006153	CCA	2	6	776	781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593847
12	NC_006153	TGC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
13	NC_006153	CTT	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593847
14	NC_006153	CTC	2	6	963	968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
15	NC_006153	TGA	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
16	NC_006153	GTT	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593847
17	NC_006153	AAC	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593847
18	NC_006153	TAC	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
19	NC_006153	AAC	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593847
20	NC_006153	TCC	2	6	1582	1587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
21	NC_006153	CAC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593847
22	NC_006153	GCT	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
23	NC_006153	TAT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593847
24	NC_006153	TCC	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
25	NC_006153	CTG	2	6	2266	2271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
26	NC_006153	CTG	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
27	NC_006153	TCG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
28	NC_006153	TTC	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593848
29	NC_006153	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593848
30	NC_006153	TCA	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593848
31	NC_006153	ATA	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593848
32	NC_006153	GGT	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593848
33	NC_006153	AGG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006153	CAC	2	6	2832	2837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_006153	GAA	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006153	CCA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593849
37	NC_006153	TAA	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593849
38	NC_006153	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593849
39	NC_006153	TCC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593849
40	NC_006153	CAG	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593849
41	NC_006153	TTG	2	6	3292	3297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006153	GGC	2	6	3309	3314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006153	TGT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006153	GGT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593850
45	NC_006153	TGA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593850
46	NC_006153	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593850
47	NC_006153	AGT	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593850
48	NC_006153	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006153	GTC	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006153	CGC	2	6	3785	3790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_006153	TCC	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_006153	ACA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006153	TGT	2	6	4357	4362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006153	TAA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006153	AGG	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006153	GAC	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006153	CGA	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006153	AGA	2	6	4715	4720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006153	AGG	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006153	TCC	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006153	ACG	2	6	4817	4822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006153	GTT	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229310098
63	NC_006153	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229310098
64	NC_006153	GTA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229310098
65	NC_006153	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229310098
66	NC_006153	ATG	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229310098
67	NC_006153	TGG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229310098
68	NC_006153	GTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593853
69	NC_006153	ACA	2	6	6297	6302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006153	ACG	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006153	TGC	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006153	ACC	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_006153	GCT	2	6	6511	6516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006153	CCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_006153	TAA	2	6	6741	6746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006153	ATG	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593854
77	NC_006153	GCT	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593854
78	NC_006153	AGG	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593854
79	NC_006153	GGA	2	6	7002	7007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593854
80	NC_006153	CCA	2	6	7104	7109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593854
81	NC_006153	CAG	2	6	7316	7321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006153	GCT	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006153	GGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006153	TCA	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593855
85	NC_006153	CTT	3	9	7644	7652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593855
86	NC_006153	AAC	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006153	CTG	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593856
88	NC_006153	GGC	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593856
89	NC_006153	GCC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593856
90	NC_006153	AGA	2	6	8612	8617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593857
91	NC_006153	TGA	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593857
92	NC_006153	GCC	2	6	8814	8819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593858
93	NC_006153	TAA	2	6	9036	9041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006153	ATG	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593859
95	NC_006153	ACT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
96	NC_006153	GAA	2	6	9467	9472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593859
97	NC_006153	TTC	2	6	9532	9537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593859
98	NC_006153	GTT	2	6	9551	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593859
99	NC_006153	CAT	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
100	NC_006153	TAC	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
101	NC_006153	CTG	3	9	10044	10052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
102	NC_006153	GCT	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
103	NC_006153	CAG	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593859
104	NC_006153	CTG	2	6	10281	10286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
105	NC_006153	CTC	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593859
106	NC_006153	AAC	2	6	10349	10354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593859
107	NC_006153	AGA	2	6	10495	10500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006153	ACT	2	6	10580	10585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006153	ATA	2	6	10676	10681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006153	ACA	2	6	10796	10801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006153	TAT	2	6	10831	10836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006153	TAA	2	6	10871	10876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006153	GAG	2	6	10963	10968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006153	CGC	2	6	11130	11135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006153	AAC	2	6	11143	11148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006153	GAT	2	6	11243	11248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006153	TCA	2	6	11304	11309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006153	ATC	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
119	NC_006153	TCT	2	6	11537	11542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593860
120	NC_006153	GGC	2	6	11709	11714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593860
121	NC_006153	CGA	2	6	11747	11752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
122	NC_006153	TCA	3	9	11759	11767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
123	NC_006153	AAG	2	6	11776	11781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593860
124	NC_006153	ATG	2	6	11813	11818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593860
125	NC_006153	AGT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593860
126	NC_006153	CAT	2	6	11914	11919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
127	NC_006153	TCA	2	6	11972	11977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
128	NC_006153	CTG	2	6	12139	12144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593860
129	NC_006153	CGC	2	6	12342	12347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593860
130	NC_006153	GCG	2	6	12355	12360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593860
131	NC_006153	GGT	2	6	12650	12655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593860
132	NC_006153	CTC	2	6	12700	12705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593860
133	NC_006153	CTG	2	6	12719	12724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593860
134	NC_006153	TGT	2	6	12830	12835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593860
135	NC_006153	CAA	2	6	12913	12918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593860
136	NC_006153	CAG	2	6	12997	13002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
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140	NC_006153	AGC	2	6	13241	13246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
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143	NC_006153	TAA	2	6	13503	13508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593860
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155	NC_006153	AAT	2	6	14510	14515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_006153	ATT	3	9	14541	14549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_006153	CAA	2	6	14664	14669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_006153	CTT	2	6	14825	14830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_006153	TAC	2	6	15059	15064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_006153	CAA	2	6	15079	15084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_006153	AAC	2	6	15112	15117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_006153	TAA	2	6	15177	15182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_006153	GAG	2	6	15223	15228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_006153	TGA	2	6	15292	15297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_006153	TAA	2	6	15300	15305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_006153	TAA	2	6	20471	20476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_006153	TCT	2	6	23036	23041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_006153	TTC	2	6	23159	23164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593875
259	NC_006153	GTT	2	6	23275	23280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593875
260	NC_006153	TTC	2	6	23309	23314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593875
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393	NC_006153	AAT	2	6	32480	32485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_006153	AAT	2	6	32519	32524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593887
395	NC_006153	AAC	2	6	32533	32538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593887
396	NC_006153	GTC	2	6	32637	32642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593887
397	NC_006153	CAA	2	6	32878	32883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_006153	TAA	2	6	33187	33192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593888
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403	NC_006153	TGG	2	6	33571	33576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593889
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432	NC_006153	TAT	2	6	35226	35231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593891
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