MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCRY

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005814	ATCC	2	8	119	126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005814	GTAA	2	8	495	502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005814	TATG	2	8	1149	1156	25 %	50 %	25 %	0 %	45476500
4	NC_005814	CCCG	2	8	1442	1449	0 %	0 %	25 %	75 %	45476500
5	NC_005814	CTAT	2	8	1815	1822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_005814	ACAT	2	8	2286	2293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_005814	TATG	2	8	2507	2514	25 %	50 %	25 %	0 %	45476503
8	NC_005814	GATG	2	8	3178	3185	25 %	25 %	50 %	0 %	45476504
9	NC_005814	GCTG	2	8	3527	3534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005814	CGAA	2	8	3725	3732	50 %	0 %	25 %	25 %	45476506
11	NC_005814	GTTC	2	8	4991	4998	0 %	50 %	25 %	25 %	45476508
12	NC_005814	CTGC	2	8	6449	6456	0 %	25 %	25 %	50 %	45476508
13	NC_005814	GGAA	2	8	7300	7307	50 %	0 %	50 %	0 %	45476508
14	NC_005814	TACC	2	8	7330	7337	25 %	25 %	0 %	50 %	45476508
15	NC_005814	TGGA	2	8	7501	7508	25 %	25 %	50 %	0 %	45476509
16	NC_005814	CTGG	2	8	8481	8488	0 %	25 %	50 %	25 %	45476511
17	NC_005814	TATG	2	8	8748	8755	25 %	50 %	25 %	0 %	45476511
18	NC_005814	GTTT	2	8	8789	8796	0 %	75 %	25 %	0 %	45476511
19	NC_005814	GTCT	2	8	9039	9046	0 %	50 %	25 %	25 %	45476511
20	NC_005814	GACG	2	8	9783	9790	25 %	0 %	50 %	25 %	45476512
21	NC_005814	GACC	2	8	10275	10282	25 %	0 %	25 %	50 %	45476512
22	NC_005814	TTCC	2	8	10978	10985	0 %	50 %	0 %	50 %	45476513
23	NC_005814	CGGG	2	8	11968	11975	0 %	0 %	75 %	25 %	45476514
24	NC_005814	GGGC	2	8	12103	12110	0 %	0 %	75 %	25 %	45476514
25	NC_005814	GTTG	2	8	12165	12172	0 %	50 %	50 %	0 %	45476514
26	NC_005814	AATT	2	8	12909	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	45476515
27	NC_005814	ATGA	2	8	13457	13464	50 %	25 %	25 %	0 %	45476515
28	NC_005814	TTCC	2	8	13661	13668	0 %	50 %	0 %	50 %	45476516
29	NC_005814	TATT	2	8	13896	13903	25 %	75 %	0 %	0 %	45476516
30	NC_005814	GAAA	2	8	14720	14727	75 %	0 %	25 %	0 %	45476519
31	NC_005814	GAAA	2	8	15515	15522	75 %	0 %	25 %	0 %	45476521
32	NC_005814	GCGT	2	8	15551	15558	0 %	25 %	50 %	25 %	45476521
33	NC_005814	AAAG	2	8	15868	15875	75 %	0 %	25 %	0 %	45476521
34	NC_005814	ATTT	2	8	16308	16315	25 %	75 %	0 %	0 %	45476521
35	NC_005814	ATCA	2	8	17095	17102	50 %	25 %	0 %	25 %	45476521
36	NC_005814	GGCT	2	8	17503	17510	0 %	25 %	50 %	25 %	45476522
37	NC_005814	ATGT	2	8	17701	17708	25 %	50 %	25 %	0 %	45476522
38	NC_005814	AGCA	2	8	17846	17853	50 %	0 %	25 %	25 %	45476522
39	NC_005814	GCTG	2	8	18179	18186	0 %	25 %	50 %	25 %	45476523
40	NC_005814	AATA	2	8	18376	18383	75 %	25 %	0 %	0 %	45476523
41	NC_005814	GACG	2	8	18429	18436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_005814	TTTG	2	8	18580	18587	0 %	75 %	25 %	0 %	45476524
43	NC_005814	GTCG	2	8	19118	19125	0 %	25 %	50 %	25 %	45476526
44	NC_005814	TCGT	2	8	19385	19392	0 %	50 %	25 %	25 %	45476526
45	NC_005814	ATCA	2	8	19440	19447	50 %	25 %	0 %	25 %	45476526
46	NC_005814	CGGG	2	8	20037	20044	0 %	0 %	75 %	25 %	45476527
47	NC_005814	GCCA	2	8	20104	20111	25 %	0 %	25 %	50 %	45476527
48	NC_005814	TTTC	2	8	21344	21351	0 %	75 %	0 %	25 %	45476529

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.