MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	45478503
2	NC_005813	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	45478504
3	NC_005813	G	6	6	2937	2942	0 %	0 %	100 %	0 %	45478507
4	NC_005813	A	6	6	3262	3267	100 %	0 %	0 %	0 %	45478508
5	NC_005813	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	45478510
6	NC_005813	T	6	6	4813	4818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005813	A	7	7	5070	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005813	A	6	6	5768	5773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005813	T	7	7	6961	6967	0 %	100 %	0 %	0 %	45478513
10	NC_005813	G	8	8	8601	8608	0 %	0 %	100 %	0 %	45478514
11	NC_005813	G	6	6	8661	8666	0 %	0 %	100 %	0 %	45478514
12	NC_005813	A	6	6	9501	9506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005813	A	6	6	10055	10060	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
14	NC_005813	A	7	7	10337	10343	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
15	NC_005813	A	6	6	10482	10487	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
16	NC_005813	A	8	8	10542	10549	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
17	NC_005813	A	6	6	10904	10909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005813	A	6	6	11166	11171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005813	T	6	6	12150	12155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005813	A	6	6	12156	12161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005813	A	6	6	12201	12206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005813	A	6	6	12292	12297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005813	T	6	6	12300	12305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005813	A	6	6	13368	13373	100 %	0 %	0 %	0 %	45478518
25	NC_005813	T	6	6	14058	14063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005813	T	7	7	15034	15040	0 %	100 %	0 %	0 %	45478521
27	NC_005813	G	6	6	15356	15361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005813	C	6	6	15510	15515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_005813	C	6	6	16127	16132	0 %	0 %	0 %	100 %	45478522
30	NC_005813	T	7	7	16269	16275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005813	A	6	6	16304	16309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005813	C	7	7	18398	18404	0 %	0 %	0 %	100 %	45478526
33	NC_005813	T	6	6	19961	19966	0 %	100 %	0 %	0 %	45478530
34	NC_005813	C	6	6	20257	20262	0 %	0 %	0 %	100 %	45478531
35	NC_005813	T	6	6	20523	20528	0 %	100 %	0 %	0 %	45478531
36	NC_005813	T	6	6	20770	20775	0 %	100 %	0 %	0 %	45478531
37	NC_005813	A	6	6	20894	20899	100 %	0 %	0 %	0 %	45478531
38	NC_005813	A	6	6	21041	21046	100 %	0 %	0 %	0 %	45478531
39	NC_005813	T	6	6	22592	22597	0 %	100 %	0 %	0 %	45478532
40	NC_005813	A	6	6	23101	23106	100 %	0 %	0 %	0 %	45478532
41	NC_005813	T	6	6	23526	23531	0 %	100 %	0 %	0 %	45478533
42	NC_005813	A	7	7	23657	23663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005813	A	8	8	23929	23936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005813	A	6	6	24513	24518	100 %	0 %	0 %	0 %	45478535
45	NC_005813	A	6	6	24525	24530	100 %	0 %	0 %	0 %	45478535
46	NC_005813	G	7	7	25224	25230	0 %	0 %	100 %	0 %	45478536
47	NC_005813	A	7	7	25482	25488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005813	A	8	8	25566	25573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005813	T	7	7	26559	26565	0 %	100 %	0 %	0 %	45478537
50	NC_005813	A	7	7	26670	26676	100 %	0 %	0 %	0 %	45478537
51	NC_005813	A	7	7	28272	28278	100 %	0 %	0 %	0 %	45478540
52	NC_005813	G	7	7	28473	28479	0 %	0 %	100 %	0 %	45478540
53	NC_005813	T	6	6	30278	30283	0 %	100 %	0 %	0 %	45478542
54	NC_005813	T	6	6	30730	30735	0 %	100 %	0 %	0 %	45478542
55	NC_005813	T	6	6	31192	31197	0 %	100 %	0 %	0 %	45478543
56	NC_005813	C	9	9	32168	32176	0 %	0 %	0 %	100 %	45478544
57	NC_005813	C	6	6	32336	32341	0 %	0 %	0 %	100 %	45478544
58	NC_005813	A	6	6	32741	32746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005813	T	7	7	33727	33733	0 %	100 %	0 %	0 %	45478545
60	NC_005813	C	6	6	34401	34406	0 %	0 %	0 %	100 %	45478548
61	NC_005813	C	8	8	35182	35189	0 %	0 %	0 %	100 %	45478550
62	NC_005813	A	6	6	36924	36929	100 %	0 %	0 %	0 %	45478550
63	NC_005813	A	7	7	38650	38656	100 %	0 %	0 %	0 %	45478553
64	NC_005813	A	6	6	38816	38821	100 %	0 %	0 %	0 %	45478553
65	NC_005813	C	6	6	39500	39505	0 %	0 %	0 %	100 %	45478555
66	NC_005813	A	7	7	40741	40747	100 %	0 %	0 %	0 %	45478556
67	NC_005813	A	6	6	41907	41912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005813	G	7	7	41961	41967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005813	T	6	6	42165	42170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005813	T	6	6	42722	42727	0 %	100 %	0 %	0 %	45478558
71	NC_005813	T	6	6	43326	43331	0 %	100 %	0 %	0 %	45478559
72	NC_005813	A	6	6	43789	43794	100 %	0 %	0 %	0 %	45478559
73	NC_005813	T	6	6	44030	44035	0 %	100 %	0 %	0 %	45478559
74	NC_005813	T	6	6	44713	44718	0 %	100 %	0 %	0 %	45478560
75	NC_005813	A	6	6	44908	44913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005813	C	7	7	45111	45117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_005813	A	6	6	45519	45524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005813	T	6	6	45527	45532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005813	T	6	6	45594	45599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005813	T	7	7	45601	45607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005813	T	6	6	45762	45767	0 %	100 %	0 %	0 %	45478561
82	NC_005813	G	8	8	46057	46064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005813	T	6	6	46262	46267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005813	T	6	6	46373	46378	0 %	100 %	0 %	0 %	45478562
85	NC_005813	T	7	7	47379	47385	0 %	100 %	0 %	0 %	45478564
86	NC_005813	T	6	6	48291	48296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005813	A	6	6	48983	48988	100 %	0 %	0 %	0 %	45478565
88	NC_005813	A	7	7	49054	49060	100 %	0 %	0 %	0 %	45478565
89	NC_005813	A	6	6	49237	49242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005813	A	7	7	49750	49756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005813	A	6	6	49837	49842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005813	C	6	6	49872	49877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_005813	C	7	7	51573	51579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_005813	T	6	6	52069	52074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005813	T	6	6	52361	52366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005813	A	7	7	54401	54407	100 %	0 %	0 %	0 %	45478569
97	NC_005813	T	7	7	54966	54972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005813	T	8	8	55318	55325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005813	A	6	6	55354	55359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005813	T	7	7	55360	55366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005813	T	6	6	56008	56013	0 %	100 %	0 %	0 %	45478571
102	NC_005813	A	6	6	56381	56386	100 %	0 %	0 %	0 %	45478573
103	NC_005813	A	6	6	57199	57204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005813	G	6	6	57576	57581	0 %	0 %	100 %	0 %	45478575
105	NC_005813	A	6	6	59785	59790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005813	T	9	9	60248	60256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005813	A	7	7	60435	60441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005813	T	6	6	61889	61894	0 %	100 %	0 %	0 %	45478581
109	NC_005813	A	6	6	62563	62568	100 %	0 %	0 %	0 %	45478582
110	NC_005813	T	7	7	63249	63255	0 %	100 %	0 %	0 %	45478584
111	NC_005813	A	6	6	63799	63804	100 %	0 %	0 %	0 %	45478584
112	NC_005813	A	6	6	64505	64510	100 %	0 %	0 %	0 %	45478585
113	NC_005813	C	6	6	65568	65573	0 %	0 %	0 %	100 %	45478585
114	NC_005813	T	7	7	66630	66636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005813	T	7	7	66751	66757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005813	T	6	6	66761	66766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005813	A	7	7	66788	66794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005813	T	7	7	66847	66853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005813	T	9	9	66922	66930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005813	T	6	6	67067	67072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005813	A	8	8	67444	67451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005813	A	6	6	68036	68041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005813	A	6	6	68096	68101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005813	T	6	6	68599	68604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.