MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 1421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005813	TAA	2	6	24876	24881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_005813	CTC	2	6	24991	24996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478536
503	NC_005813	AG	3	6	25007	25012	50 %	0 %	50 %	0 %	45478536
504	NC_005813	AGGT	2	8	25079	25086	25 %	25 %	50 %	0 %	45478536
505	NC_005813	TG	3	6	25159	25164	0 %	50 %	50 %	0 %	45478536
506	NC_005813	G	7	7	25224	25230	0 %	0 %	100 %	0 %	45478536
507	NC_005813	AGAAA	2	10	25248	25257	80 %	0 %	20 %	0 %	45478536
508	NC_005813	TGA	2	6	25258	25263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478536
509	NC_005813	TCCC	2	8	25288	25295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
510	NC_005813	CA	3	6	25303	25308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_005813	AAG	2	6	25309	25314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_005813	GAT	2	6	25322	25327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_005813	GTG	2	6	25351	25356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_005813	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_005813	AAC	2	6	25376	25381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_005813	CCA	2	6	25406	25411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_005813	ATTTA	2	10	25419	25428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_005813	CTTT	2	8	25471	25478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_005813	A	7	7	25482	25488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_005813	CAAA	2	8	25515	25522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_005813	TAT	2	6	25549	25554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_005813	CAA	2	6	25562	25567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_005813	A	8	8	25566	25573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_005813	TA	3	6	25650	25655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_005813	CAT	2	6	25669	25674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_005813	AT	3	6	25673	25678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_005813	TTG	2	6	25699	25704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_005813	CAA	2	6	25807	25812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_005813	TAT	2	6	25856	25861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478537
530	NC_005813	TGT	2	6	25874	25879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478537
531	NC_005813	CGA	2	6	25956	25961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478537
532	NC_005813	CTT	3	9	26016	26024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478537
533	NC_005813	GTG	2	6	26085	26090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478537
534	NC_005813	ACC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
535	NC_005813	TGA	2	6	26149	26154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
536	NC_005813	TGA	2	6	26195	26200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
537	NC_005813	GAC	2	6	26205	26210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478537
538	NC_005813	GCTT	2	8	26211	26218	0 %	50 %	25 %	25 %	45478537
539	NC_005813	AT	3	6	26291	26296	50 %	50 %	0 %	0 %	45478537
540	NC_005813	AAC	2	6	26479	26484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478537
541	NC_005813	GATT	2	8	26553	26560	25 %	50 %	25 %	0 %	45478537
542	NC_005813	T	7	7	26559	26565	0 %	100 %	0 %	0 %	45478537
543	NC_005813	CAC	2	6	26586	26591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
544	NC_005813	GCC	2	6	26639	26644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478537
545	NC_005813	A	7	7	26670	26676	100 %	0 %	0 %	0 %	45478537
546	NC_005813	GCTCT	2	10	26731	26740	0 %	40 %	20 %	40 %	45478537
547	NC_005813	TAG	2	6	26777	26782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
548	NC_005813	CGA	2	6	26814	26819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478537
549	NC_005813	GC	3	6	26869	26874	0 %	0 %	50 %	50 %	45478537
550	NC_005813	TTC	2	6	26885	26890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478537
551	NC_005813	GGGT	2	8	26892	26899	0 %	25 %	75 %	0 %	45478537
552	NC_005813	TCA	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478538
553	NC_005813	CAA	2	6	27018	27023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478538
554	NC_005813	AAG	2	6	27074	27079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478538
555	NC_005813	TGA	2	6	27092	27097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478538
556	NC_005813	AGC	2	6	27141	27146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478538
557	NC_005813	GCG	2	6	27154	27159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478538
558	NC_005813	AG	3	6	27276	27281	50 %	0 %	50 %	0 %	45478538
559	NC_005813	GAA	2	6	27297	27302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478538
560	NC_005813	TTA	2	6	27308	27313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478538
561	NC_005813	TGG	2	6	27443	27448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478538
562	NC_005813	CAAT	2	8	27458	27465	50 %	25 %	0 %	25 %	45478538
563	NC_005813	AGC	2	6	27493	27498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478538
564	NC_005813	GGTT	2	8	27529	27536	0 %	50 %	50 %	0 %	45478538
565	NC_005813	GCA	2	6	27587	27592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478538
566	NC_005813	GAG	2	6	27603	27608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478538
567	NC_005813	AACAA	2	10	27633	27642	80 %	0 %	0 %	20 %	45478538
568	NC_005813	CAG	2	6	27660	27665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478538
569	NC_005813	ATC	2	6	27703	27708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478538
570	NC_005813	TCA	2	6	27724	27729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478539
571	NC_005813	ACC	2	6	27792	27797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478539
572	NC_005813	ACC	2	6	27879	27884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478539
573	NC_005813	CGG	2	6	27899	27904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478539
574	NC_005813	GTGAA	2	10	27942	27951	40 %	20 %	40 %	0 %	45478539
575	NC_005813	AGC	2	6	28036	28041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478540
576	NC_005813	CAT	3	9	28077	28085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478540
577	NC_005813	CAA	2	6	28095	28100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478540
578	NC_005813	ACTC	2	8	28175	28182	25 %	25 %	0 %	50 %	45478540
579	NC_005813	CAA	2	6	28268	28273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478540
580	NC_005813	A	7	7	28272	28278	100 %	0 %	0 %	0 %	45478540
581	NC_005813	TGC	2	6	28300	28305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478540
582	NC_005813	TCA	2	6	28336	28341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478540
583	NC_005813	GAT	2	6	28443	28448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478540
584	NC_005813	G	7	7	28473	28479	0 %	0 %	100 %	0 %	45478540
585	NC_005813	AGT	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478540
586	NC_005813	ACC	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478540
587	NC_005813	GAT	2	6	28590	28595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478540
588	NC_005813	AGTG	2	8	28781	28788	25 %	25 %	50 %	0 %	45478541
589	NC_005813	TG	3	6	28787	28792	0 %	50 %	50 %	0 %	45478541
590	NC_005813	GCC	2	6	28807	28812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478541
591	NC_005813	ATTT	2	8	28909	28916	25 %	75 %	0 %	0 %	45478541
592	NC_005813	CAA	2	6	28997	29002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478541
593	NC_005813	CGG	2	6	29326	29331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478541
594	NC_005813	AGG	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478541
595	NC_005813	AGT	2	6	29464	29469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478541
596	NC_005813	TTG	2	6	29471	29476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478541
597	NC_005813	TTC	2	6	29545	29550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478541
598	NC_005813	CTC	2	6	29560	29565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478542
599	NC_005813	AAG	2	6	29656	29661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478542
600	NC_005813	ATA	2	6	29753	29758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478542
601	NC_005813	GCC	2	6	29806	29811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478542
602	NC_005813	AGTTCT	2	12	29816	29827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45478542
603	NC_005813	CG	3	6	29884	29889	0 %	0 %	50 %	50 %	45478542
604	NC_005813	TTG	2	6	29892	29897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478542
605	NC_005813	CG	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	45478542
606	NC_005813	GGT	2	6	29999	30004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478542
607	NC_005813	TGC	2	6	30018	30023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478542
608	NC_005813	ATC	2	6	30172	30177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478542
609	NC_005813	TGA	2	6	30224	30229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478542
610	NC_005813	TTC	2	6	30241	30246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478542
611	NC_005813	T	6	6	30278	30283	0 %	100 %	0 %	0 %	45478542
612	NC_005813	CAG	2	6	30339	30344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478542
613	NC_005813	TCA	2	6	30428	30433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478542
614	NC_005813	TAA	2	6	30522	30527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478542
615	NC_005813	CT	3	6	30530	30535	0 %	50 %	0 %	50 %	45478542
616	NC_005813	TCA	2	6	30542	30547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478542
617	NC_005813	CTG	2	6	30559	30564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478542
618	NC_005813	ATT	2	6	30622	30627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478542
619	NC_005813	TTCC	2	8	30662	30669	0 %	50 %	0 %	50 %	45478542
620	NC_005813	CGC	2	6	30682	30687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478542
621	NC_005813	CTT	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478542
622	NC_005813	T	6	6	30730	30735	0 %	100 %	0 %	0 %	45478542
623	NC_005813	CTT	2	6	30771	30776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478542
624	NC_005813	TTA	3	9	30794	30802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478542
625	NC_005813	ATG	2	6	30844	30849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478542
626	NC_005813	GTG	2	6	30893	30898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478542
627	NC_005813	CTT	2	6	30938	30943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478543
628	NC_005813	GTTCTT	2	12	30944	30955	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45478543
629	NC_005813	TGT	2	6	30964	30969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478543
630	NC_005813	TCATCT	2	12	30979	30990	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45478543
631	NC_005813	TCG	2	6	30993	30998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478543
632	NC_005813	GCA	2	6	31040	31045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478543
633	NC_005813	AAT	2	6	31093	31098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478543
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