MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004838	CAAT	2	8	56198	56205	50 %	25 %	0 %	25 %	31795399
1002	NC_004838	AAT	2	6	56290	56295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795399
1003	NC_004838	CAG	2	6	56339	56344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795399
1004	NC_004838	GCT	2	6	56350	56355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795399
1005	NC_004838	ACA	2	6	56374	56379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795399
1006	NC_004838	AAT	2	6	56415	56420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795399
1007	NC_004838	T	9	9	56448	56456	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
1008	NC_004838	T	6	6	56506	56511	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
1009	NC_004838	ATT	2	6	56527	56532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795399
1010	NC_004838	T	6	6	56607	56612	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
1011	NC_004838	CAT	2	6	56778	56783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795399
1012	NC_004838	T	7	7	56805	56811	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
1013	NC_004838	AGA	2	6	56868	56873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795399
1014	NC_004838	CAT	2	6	56894	56899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795399
1015	NC_004838	CATGTT	2	12	56928	56939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31795399
1016	NC_004838	CCA	2	6	56944	56949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795399
1017	NC_004838	ATT	2	6	56977	56982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795399
1018	NC_004838	TG	3	6	56985	56990	0 %	50 %	50 %	0 %	31795399
1019	NC_004838	TGG	2	6	57018	57023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795399
1020	NC_004838	ATG	2	6	57050	57055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795399
1021	NC_004838	CTT	2	6	57065	57070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795399
1022	NC_004838	T	6	6	57107	57112	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
1023	NC_004838	CAA	2	6	57164	57169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795399
1024	NC_004838	GCA	2	6	57190	57195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795399
1025	NC_004838	T	7	7	57269	57275	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
1026	NC_004838	TCA	2	6	57286	57291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795399
1027	NC_004838	TGA	2	6	57339	57344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795399
1028	NC_004838	CTC	2	6	57399	57404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795399
1029	NC_004838	GTAA	2	8	57410	57417	50 %	25 %	25 %	0 %	31795399
1030	NC_004838	TGC	2	6	57421	57426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795399
1031	NC_004838	G	6	6	57461	57466	0 %	0 %	100 %	0 %	31795399
1032	NC_004838	TA	3	6	57480	57485	50 %	50 %	0 %	0 %	31795399
1033	NC_004838	GAT	2	6	57500	57505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795399
1034	NC_004838	AGT	2	6	57509	57514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795399
1035	NC_004838	ATT	2	6	57522	57527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795399
1036	NC_004838	TAA	2	6	57578	57583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004838	GCA	2	6	57595	57600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_004838	CAC	2	6	57682	57687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795400
1039	NC_004838	TGG	2	6	57727	57732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795400
1040	NC_004838	ATC	2	6	57774	57779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795400
1041	NC_004838	ATG	2	6	57788	57793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795400
1042	NC_004838	GTT	2	6	57803	57808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795400
1043	NC_004838	TGT	3	9	57828	57836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795400
1044	NC_004838	CAA	2	6	57886	57891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795400
1045	NC_004838	CGAG	2	8	57973	57980	25 %	0 %	50 %	25 %	31795400
1046	NC_004838	ATT	2	6	57989	57994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795400
1047	NC_004838	GA	3	6	58033	58038	50 %	0 %	50 %	0 %	31795400
1048	NC_004838	ATG	2	6	58092	58097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795400
1049	NC_004838	A	8	8	58161	58168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004838	GGTAA	2	10	58249	58258	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_004838	CTT	2	6	58336	58341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_004838	A	6	6	58384	58389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004838	T	6	6	58405	58410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004838	CATA	2	8	58453	58460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_004838	TA	3	6	58517	58522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004838	A	6	6	58597	58602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004838	T	7	7	58619	58625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004838	GTC	2	6	58673	58678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_004838	CCGTT	2	10	58810	58819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_004838	GGA	2	6	58843	58848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004838	CGT	2	6	58862	58867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39980773
1062	NC_004838	GCC	2	6	58970	58975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39980773
1063	NC_004838	ATG	2	6	59022	59027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980773
1064	NC_004838	CTA	2	6	59030	59035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39980773
1065	NC_004838	AAG	2	6	59049	59054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39980773
1066	NC_004838	CCG	2	6	59075	59080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39980773
1067	NC_004838	TGG	2	6	59085	59090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39980773
1068	NC_004838	ACC	2	6	59092	59097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39980773
1069	NC_004838	AGCG	2	8	59130	59137	25 %	0 %	50 %	25 %	39980773
1070	NC_004838	CTT	2	6	59198	59203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795402
1071	NC_004838	GTT	2	6	59276	59281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795402
1072	NC_004838	TGT	2	6	59347	59352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795402
1073	NC_004838	GCCT	2	8	59433	59440	0 %	25 %	25 %	50 %	31795402
1074	NC_004838	TAA	2	6	59442	59447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795402
1075	NC_004838	AG	3	6	59478	59483	50 %	0 %	50 %	0 %	31795402
1076	NC_004838	TGA	2	6	59539	59544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795402
1077	NC_004838	GCA	2	6	59555	59560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795402
1078	NC_004838	GCC	2	6	59569	59574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795402
1079	NC_004838	TGC	2	6	59576	59581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795402
1080	NC_004838	ATA	2	6	59590	59595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795402
1081	NC_004838	GTC	2	6	59667	59672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795402
1082	NC_004838	ACC	2	6	59684	59689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795402
1083	NC_004838	ATC	2	6	59925	59930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795402
1084	NC_004838	CAA	2	6	59933	59938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795402
1085	NC_004838	CAT	2	6	60059	60064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795402
1086	NC_004838	TCT	2	6	60086	60091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795402
1087	NC_004838	TCA	2	6	60092	60097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795402
1088	NC_004838	ATG	2	6	60114	60119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795402
1089	NC_004838	CGCTTT	2	12	60317	60328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	31795403
1090	NC_004838	CAT	2	6	60401	60406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795403
1091	NC_004838	TGC	2	6	60427	60432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795403
1092	NC_004838	TGGT	2	8	60475	60482	0 %	50 %	50 %	0 %	31795403
1093	NC_004838	GCT	2	6	60505	60510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795403
1094	NC_004838	CGT	2	6	60547	60552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795403
1095	NC_004838	AAT	2	6	60587	60592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795403
1096	NC_004838	TTC	2	6	60708	60713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795403
1097	NC_004838	T	6	6	60720	60725	0 %	100 %	0 %	0 %	31795403
1098	NC_004838	T	6	6	60781	60786	0 %	100 %	0 %	0 %	31795403
1099	NC_004838	AGT	2	6	60806	60811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004838	CCTG	2	8	61022	61029	0 %	25 %	25 %	50 %	31795404
1101	NC_004838	TTA	2	6	61052	61057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795404
1102	NC_004838	TCC	2	6	61063	61068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795404
1103	NC_004838	ATG	2	6	61198	61203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795404
1104	NC_004838	ATC	2	6	61257	61262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795404
1105	NC_004838	AGT	2	6	61320	61325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795405
1106	NC_004838	AGT	2	6	61386	61391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795405
1107	NC_004838	CGT	2	6	61420	61425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795405
1108	NC_004838	TTC	2	6	61475	61480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795405
1109	NC_004838	T	8	8	61500	61507	0 %	100 %	0 %	0 %	31795405
1110	NC_004838	AAC	2	6	61535	61540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795405
1111	NC_004838	TTG	2	6	61582	61587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004838	CAA	2	6	61588	61593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_004838	ACC	2	6	61644	61649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_004838	ATG	2	6	61708	61713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004838	AAT	2	6	61727	61732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004838	TGT	2	6	61752	61757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_004838	T	6	6	61761	61766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004838	GT	3	6	61767	61772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004838	AT	3	6	61802	61807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004838	ATCT	2	8	61817	61824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_004838	AAAGA	2	10	61921	61930	80 %	0 %	20 %	0 %	39980774
1122	NC_004838	ATC	2	6	61948	61953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39980774
1123	NC_004838	GAA	2	6	62031	62036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39980774
1124	NC_004838	TAA	2	6	62051	62056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39980774
1125	NC_004838	AT	4	8	62110	62117	50 %	50 %	0 %	0 %	39980774
1126	NC_004838	GTC	2	6	62175	62180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39980774
1127	NC_004838	CAGT	2	8	62206	62213	25 %	25 %	25 %	25 %	39980774
1128	NC_004838	CCG	2	6	62356	62361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39980774
1129	NC_004838	TAT	2	6	62423	62428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39980774
1130	NC_004838	TGA	2	6	62459	62464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980774
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1132	NC_004838	GAA	3	9	62733	62741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39980774
1133	NC_004838	CAT	2	6	62912	62917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39980774
1134	NC_004838	AT	3	6	63017	63022	50 %	50 %	0 %	0 %	39980774
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1248	NC_004838	ACC	2	6	69220	69225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795418
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1257	NC_004838	CG	3	6	69750	69755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1259	NC_004838	CGC	2	6	69791	69796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1383	NC_004838	GGC	2	6	76345	76350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795424
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