MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 6592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004088	CG	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004088	GA	3	6	5668	5673	50 %	0 %	50 %	0 %	22123928
3	NC_004088	AT	4	8	6581	6588	50 %	50 %	0 %	0 %	22123928
4	NC_004088	CA	3	6	7909	7914	50 %	0 %	0 %	50 %	22123929
5	NC_004088	TG	3	6	8299	8304	0 %	50 %	50 %	0 %	22123930
6	NC_004088	TG	3	6	9731	9736	0 %	50 %	50 %	0 %	22123932
7	NC_004088	AT	3	6	9960	9965	50 %	50 %	0 %	0 %	22123932
8	NC_004088	AT	3	6	10133	10138	50 %	50 %	0 %	0 %	22123932
9	NC_004088	GC	3	6	10669	10674	0 %	0 %	50 %	50 %	22123932
10	NC_004088	TA	3	6	10733	10738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004088	GT	3	6	11081	11086	0 %	50 %	50 %	0 %	22123933
12	NC_004088	AC	3	6	11665	11670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004088	TG	3	6	11834	11839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004088	GT	3	6	12418	12423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004088	AC	3	6	13240	13245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004088	AC	3	6	13409	13414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004088	CA	3	6	13584	13589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004088	TC	3	6	13959	13964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_004088	TG	3	6	14307	14312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004088	AC	3	6	14963	14968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004088	GA	3	6	15672	15677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004088	GT	3	6	16868	16873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004088	GA	4	8	16953	16960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004088	AT	3	6	17547	17552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004088	CA	3	6	17787	17792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004088	AT	3	6	17926	17931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004088	TA	3	6	17946	17951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004088	TA	3	6	17997	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004088	AT	3	6	18121	18126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004088	CT	3	6	18311	18316	0 %	50 %	0 %	50 %	22123935
31	NC_004088	CG	3	6	18615	18620	0 %	0 %	50 %	50 %	22123935
32	NC_004088	CT	3	6	18629	18634	0 %	50 %	0 %	50 %	22123935
33	NC_004088	TA	3	6	20332	20337	50 %	50 %	0 %	0 %	22123937
34	NC_004088	TG	3	6	20797	20802	0 %	50 %	50 %	0 %	22123937
35	NC_004088	TC	3	6	21141	21146	0 %	50 %	0 %	50 %	22123938
36	NC_004088	AG	3	6	23398	23403	50 %	0 %	50 %	0 %	22123939
37	NC_004088	GC	3	6	24250	24255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_004088	GA	3	6	24695	24700	50 %	0 %	50 %	0 %	22123941
39	NC_004088	AT	3	6	25087	25092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004088	TG	3	6	25153	25158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004088	GC	3	6	25550	25555	0 %	0 %	50 %	50 %	22123942
42	NC_004088	CG	3	6	25936	25941	0 %	0 %	50 %	50 %	22123942
43	NC_004088	GC	3	6	27475	27480	0 %	0 %	50 %	50 %	22123942
44	NC_004088	GT	3	6	31921	31926	0 %	50 %	50 %	0 %	22123943
45	NC_004088	AG	3	6	32821	32826	50 %	0 %	50 %	0 %	22123943
46	NC_004088	TC	3	6	32967	32972	0 %	50 %	0 %	50 %	22123943
47	NC_004088	GT	3	6	34105	34110	0 %	50 %	50 %	0 %	22123943
48	NC_004088	CT	3	6	36364	36369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004088	AG	3	6	36670	36675	50 %	0 %	50 %	0 %	22123944
50	NC_004088	GC	3	6	36793	36798	0 %	0 %	50 %	50 %	22123944
51	NC_004088	CG	3	6	36828	36833	0 %	0 %	50 %	50 %	22123944
52	NC_004088	TA	3	6	37113	37118	50 %	50 %	0 %	0 %	22123944
53	NC_004088	TG	3	6	37250	37255	0 %	50 %	50 %	0 %	22123944
54	NC_004088	GA	3	6	38097	38102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004088	GC	3	6	38861	38866	0 %	0 %	50 %	50 %	22123945
56	NC_004088	AT	3	6	39219	39224	50 %	50 %	0 %	0 %	22123945
57	NC_004088	AT	3	6	40970	40975	50 %	50 %	0 %	0 %	22123947
58	NC_004088	AG	3	6	44327	44332	50 %	0 %	50 %	0 %	22123949
59	NC_004088	TC	3	6	44768	44773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004088	GC	3	6	45113	45118	0 %	0 %	50 %	50 %	22123950
61	NC_004088	GA	3	6	45122	45127	50 %	0 %	50 %	0 %	22123950
62	NC_004088	CA	3	6	48433	48438	50 %	0 %	0 %	50 %	22123954
63	NC_004088	GC	3	6	49008	49013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004088	AT	3	6	49471	49476	50 %	50 %	0 %	0 %	22123956
65	NC_004088	AT	3	6	49506	49511	50 %	50 %	0 %	0 %	22123956
66	NC_004088	AT	3	6	49590	49595	50 %	50 %	0 %	0 %	22123956
67	NC_004088	AC	3	6	53545	53550	50 %	0 %	0 %	50 %	22123961
68	NC_004088	TG	3	6	53699	53704	0 %	50 %	50 %	0 %	22123961
69	NC_004088	CA	3	6	53858	53863	50 %	0 %	0 %	50 %	22123961
70	NC_004088	TC	3	6	54112	54117	0 %	50 %	0 %	50 %	22123961
71	NC_004088	TC	3	6	54130	54135	0 %	50 %	0 %	50 %	22123961
72	NC_004088	AT	3	6	54478	54483	50 %	50 %	0 %	0 %	22123961
73	NC_004088	GA	3	6	55836	55841	50 %	0 %	50 %	0 %	22123964
74	NC_004088	CG	3	6	55950	55955	0 %	0 %	50 %	50 %	22123964
75	NC_004088	GA	4	8	56177	56184	50 %	0 %	50 %	0 %	22123964
76	NC_004088	TG	3	6	56698	56703	0 %	50 %	50 %	0 %	22123965
77	NC_004088	GT	3	6	57324	57329	0 %	50 %	50 %	0 %	22123966
78	NC_004088	TA	3	6	57547	57552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004088	GC	3	6	58256	58261	0 %	0 %	50 %	50 %	22123967
80	NC_004088	TG	3	6	58851	58856	0 %	50 %	50 %	0 %	22123967
81	NC_004088	GC	3	6	59561	59566	0 %	0 %	50 %	50 %	22123968
82	NC_004088	GT	3	6	60124	60129	0 %	50 %	50 %	0 %	22123968
83	NC_004088	TG	3	6	62641	62646	0 %	50 %	50 %	0 %	22123970
84	NC_004088	CT	3	6	63647	63652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004088	TA	3	6	65274	65279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004088	GC	3	6	65935	65940	0 %	0 %	50 %	50 %	22123974
87	NC_004088	GT	3	6	66526	66531	0 %	50 %	50 %	0 %	22123974
88	NC_004088	GC	3	6	66876	66881	0 %	0 %	50 %	50 %	22123975
89	NC_004088	CT	3	6	66937	66942	0 %	50 %	0 %	50 %	22123975
90	NC_004088	GC	3	6	67872	67877	0 %	0 %	50 %	50 %	22123976
91	NC_004088	TG	3	6	67946	67951	0 %	50 %	50 %	0 %	22123976
92	NC_004088	AT	3	6	69864	69869	50 %	50 %	0 %	0 %	22123978
93	NC_004088	AC	3	6	71185	71190	50 %	0 %	0 %	50 %	22123979
94	NC_004088	AC	3	6	72177	72182	50 %	0 %	0 %	50 %	22123980
95	NC_004088	AT	3	6	73285	73290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004088	TG	3	6	73782	73787	0 %	50 %	50 %	0 %	22123981
97	NC_004088	AG	3	6	74021	74026	50 %	0 %	50 %	0 %	22123981
98	NC_004088	AG	3	6	74051	74056	50 %	0 %	50 %	0 %	22123981
99	NC_004088	GT	3	6	74400	74405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004088	AG	3	6	75660	75665	50 %	0 %	50 %	0 %	22123983
101	NC_004088	AG	3	6	77055	77060	50 %	0 %	50 %	0 %	22123988
102	NC_004088	CG	3	6	77405	77410	0 %	0 %	50 %	50 %	22123988
103	NC_004088	GC	3	6	77460	77465	0 %	0 %	50 %	50 %	22123988
104	NC_004088	CG	3	6	77654	77659	0 %	0 %	50 %	50 %	22123988
105	NC_004088	CT	3	6	79222	79227	0 %	50 %	0 %	50 %	22123991
106	NC_004088	AT	3	6	80158	80163	50 %	50 %	0 %	0 %	22123991
107	NC_004088	CA	3	6	80334	80339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_004088	CA	3	6	80666	80671	50 %	0 %	0 %	50 %	22123992
109	NC_004088	AG	3	6	80946	80951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004088	CT	3	6	81132	81137	0 %	50 %	0 %	50 %	161484923
111	NC_004088	GA	3	6	83281	83286	50 %	0 %	50 %	0 %	22123995
112	NC_004088	CG	3	6	83305	83310	0 %	0 %	50 %	50 %	22123995
113	NC_004088	CA	3	6	83410	83415	50 %	0 %	0 %	50 %	22123995
114	NC_004088	CG	3	6	83749	83754	0 %	0 %	50 %	50 %	22123996
115	NC_004088	CG	3	6	84101	84106	0 %	0 %	50 %	50 %	22123997
116	NC_004088	CA	3	6	85053	85058	50 %	0 %	0 %	50 %	22123998
117	NC_004088	CA	3	6	86302	86307	50 %	0 %	0 %	50 %	22123998
118	NC_004088	AG	3	6	86490	86495	50 %	0 %	50 %	0 %	22123999
119	NC_004088	AG	3	6	86541	86546	50 %	0 %	50 %	0 %	22123999
120	NC_004088	CT	3	6	86552	86557	0 %	50 %	0 %	50 %	22123999
121	NC_004088	AG	3	6	86999	87004	50 %	0 %	50 %	0 %	22123999
122	NC_004088	GC	3	6	87447	87452	0 %	0 %	50 %	50 %	22123999
123	NC_004088	AC	3	6	87888	87893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_004088	CT	3	6	87950	87955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_004088	AG	3	6	88058	88063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004088	TC	4	8	88530	88537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_004088	CA	3	6	90587	90592	50 %	0 %	0 %	50 %	161484922
128	NC_004088	CA	3	6	91221	91226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004088	AT	3	6	91290	91295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004088	GC	3	6	94137	94142	0 %	0 %	50 %	50 %	22124005
131	NC_004088	CT	3	6	94384	94389	0 %	50 %	0 %	50 %	22124005
132	NC_004088	CT	3	6	94703	94708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_004088	CA	3	6	95567	95572	50 %	0 %	0 %	50 %	22124006
134	NC_004088	CT	3	6	96179	96184	0 %	50 %	0 %	50 %	22124007
135	NC_004088	CG	3	6	96975	96980	0 %	0 %	50 %	50 %	22124008
136	NC_004088	GC	3	6	97313	97318	0 %	0 %	50 %	50 %	22124008
137	NC_004088	TA	3	6	98235	98240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004088	TC	3	6	99171	99176	0 %	50 %	0 %	50 %	22124012
139	NC_004088	TC	3	6	99268	99273	0 %	50 %	0 %	50 %	22124012
140	NC_004088	TG	3	6	99309	99314	0 %	50 %	50 %	0 %	22124012
141	NC_004088	TC	3	6	99595	99600	0 %	50 %	0 %	50 %	22124012
142	NC_004088	AG	3	6	99749	99754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004088	CA	3	6	100229	100234	50 %	0 %	0 %	50 %	161484919
144	NC_004088	CG	3	6	100671	100676	0 %	0 %	50 %	50 %	161484919
145	NC_004088	CG	3	6	100832	100837	0 %	0 %	50 %	50 %	161484919
146	NC_004088	GA	3	6	100948	100953	50 %	0 %	50 %	0 %	161484919
147	NC_004088	AG	3	6	102239	102244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004088	CG	3	6	103633	103638	0 %	0 %	50 %	50 %	22124017
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