MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004088	ATT	2	6	158010	158015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124067
3002	NC_004088	GAT	2	6	158033	158038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124067
3003	NC_004088	ATC	2	6	158190	158195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124067
3004	NC_004088	CTG	2	6	158241	158246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124067
3005	NC_004088	ATT	2	6	158284	158289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124067
3006	NC_004088	GTG	2	6	158310	158315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124067
3007	NC_004088	CTT	2	6	158322	158327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124067
3008	NC_004088	TTA	2	6	158373	158378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124067
3009	NC_004088	GTT	2	6	158405	158410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124067
3010	NC_004088	T	6	6	158409	158414	0 %	100 %	0 %	0 %	22124067
3011	NC_004088	CAAC	2	8	158485	158492	50 %	0 %	0 %	50 %	22124068
3012	NC_004088	AC	3	6	158491	158496	50 %	0 %	0 %	50 %	22124068
3013	NC_004088	CAG	2	6	158582	158587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124068
3014	NC_004088	GGCT	2	8	158622	158629	0 %	25 %	50 %	25 %	22124068
3015	NC_004088	GTC	2	6	158699	158704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124068
3016	NC_004088	T	6	6	158780	158785	0 %	100 %	0 %	0 %	22124068
3017	NC_004088	AGCC	2	8	158800	158807	25 %	0 %	25 %	50 %	22124068
3018	NC_004088	ACC	2	6	159026	159031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124068
3019	NC_004088	CT	3	6	159116	159121	0 %	50 %	0 %	50 %	22124068
3020	NC_004088	GC	3	6	159132	159137	0 %	0 %	50 %	50 %	22124068
3021	NC_004088	TGC	3	9	159150	159158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124068
3022	NC_004088	CAT	2	6	159213	159218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124068
3023	NC_004088	AAT	2	6	159350	159355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124068
3024	NC_004088	TCG	2	6	159462	159467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124068
3025	NC_004088	TCAG	2	8	159571	159578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_004088	GTGA	2	8	159587	159594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_004088	TGT	2	6	159608	159613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004088	AAG	2	6	159641	159646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_004088	GCA	2	6	159679	159684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_004088	GAAT	2	8	159688	159695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_004088	CAGT	2	8	159712	159719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_004088	AAC	2	6	159743	159748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_004088	AAG	2	6	159764	159769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_004088	AT	3	6	159795	159800	50 %	50 %	0 %	0 %	22124070
3035	NC_004088	GCA	2	6	159844	159849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124070
3036	NC_004088	CGTG	2	8	159942	159949	0 %	25 %	50 %	25 %	22124070
3037	NC_004088	GCC	2	6	160007	160012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124070
3038	NC_004088	ATT	2	6	160020	160025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124070
3039	NC_004088	TGG	2	6	160085	160090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124070
3040	NC_004088	ATT	2	6	160101	160106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124070
3041	NC_004088	TGA	2	6	160149	160154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124070
3042	NC_004088	TTGA	2	8	160156	160163	25 %	50 %	25 %	0 %	22124070
3043	NC_004088	G	6	6	160257	160262	0 %	0 %	100 %	0 %	22124070
3044	NC_004088	G	6	6	160265	160270	0 %	0 %	100 %	0 %	22124070
3045	NC_004088	ATT	2	6	160296	160301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124070
3046	NC_004088	CAAGA	2	10	160346	160355	60 %	0 %	20 %	20 %	22124071
3047	NC_004088	CAA	2	6	160425	160430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124071
3048	NC_004088	AGT	2	6	160439	160444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124071
3049	NC_004088	TGA	2	6	160448	160453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124071
3050	NC_004088	TCG	2	6	160464	160469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124071
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3052	NC_004088	GC	3	6	160631	160636	0 %	0 %	50 %	50 %	22124071
3053	NC_004088	CTGA	2	8	160650	160657	25 %	25 %	25 %	25 %	22124071
3054	NC_004088	CCG	2	6	160705	160710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124071
3055	NC_004088	A	8	8	160721	160728	100 %	0 %	0 %	0 %	22124071
3056	NC_004088	GCTGA	2	10	160857	160866	20 %	20 %	40 %	20 %	22124071
3057	NC_004088	AAAAT	2	10	160898	160907	80 %	20 %	0 %	0 %	22124071
3058	NC_004088	AAC	2	6	160979	160984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124072
3059	NC_004088	ACAA	2	8	161003	161010	75 %	0 %	0 %	25 %	22124072
3060	NC_004088	GTG	2	6	161053	161058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124072
3061	NC_004088	GTC	2	6	161098	161103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124072
3062	NC_004088	TTACG	2	10	161215	161224	20 %	40 %	20 %	20 %	22124072
3063	NC_004088	AGC	2	6	161321	161326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124072
3064	NC_004088	TTA	2	6	161371	161376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124072
3065	NC_004088	CAG	2	6	161402	161407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124072
3066	NC_004088	AGA	2	6	161420	161425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124072
3067	NC_004088	GTAA	2	8	161426	161433	50 %	25 %	25 %	0 %	22124072
3068	NC_004088	GCCG	2	8	161608	161615	0 %	0 %	50 %	50 %	22124073
3069	NC_004088	TGAT	2	8	161621	161628	25 %	50 %	25 %	0 %	22124073
3070	NC_004088	GC	3	6	161665	161670	0 %	0 %	50 %	50 %	22124073
3071	NC_004088	AAG	2	6	161693	161698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124073
3072	NC_004088	TCG	2	6	161709	161714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124073
3073	NC_004088	TAA	2	6	161727	161732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124073
3074	NC_004088	CGG	2	6	161768	161773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124073
3075	NC_004088	GAA	2	6	161794	161799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124073
3076	NC_004088	TGG	2	6	161856	161861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124073
3077	NC_004088	CGC	2	6	161866	161871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124073
3078	NC_004088	TTG	2	6	161917	161922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124073
3079	NC_004088	ATC	2	6	161974	161979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124073
3080	NC_004088	CTC	2	6	162185	162190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_004088	GTC	2	6	162196	162201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_004088	CAA	2	6	162257	162262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124074
3083	NC_004088	TTG	2	6	162299	162304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124074
3084	NC_004088	CAG	2	6	162326	162331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124074
3085	NC_004088	CTT	2	6	162362	162367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124074
3086	NC_004088	AGAT	2	8	162390	162397	50 %	25 %	25 %	0 %	22124074
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3089	NC_004088	CGC	2	6	162637	162642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124074
3090	NC_004088	TGA	2	6	162670	162675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124074
3091	NC_004088	TGA	2	6	162724	162729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124074
3092	NC_004088	TGCT	2	8	162818	162825	0 %	50 %	25 %	25 %	22124074
3093	NC_004088	ATG	2	6	162926	162931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124074
3094	NC_004088	AGA	2	6	162952	162957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124074
3095	NC_004088	AAG	2	6	162966	162971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124074
3096	NC_004088	CAA	2	6	163127	163132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124074
3097	NC_004088	AAG	2	6	163197	163202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124074
3098	NC_004088	GCT	2	6	163243	163248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124074
3099	NC_004088	CAA	2	6	163362	163367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124074
3100	NC_004088	TC	3	6	163368	163373	0 %	50 %	0 %	50 %	22124074
3101	NC_004088	TCT	2	6	163431	163436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124074
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3103	NC_004088	GGC	2	6	163510	163515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124074
3104	NC_004088	TAT	2	6	163560	163565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124074
3105	NC_004088	ATCC	2	8	163621	163628	25 %	25 %	0 %	50 %	22124074
3106	NC_004088	TCA	2	6	163704	163709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124075
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3108	NC_004088	GCA	2	6	163897	163902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124076
3109	NC_004088	ACA	2	6	163962	163967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124076
3110	NC_004088	TTG	2	6	163978	163983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_004088	TTA	2	6	163987	163992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004088	AGATG	2	10	164082	164091	40 %	20 %	40 %	0 %	22124077
3113	NC_004088	A	6	6	164167	164172	100 %	0 %	0 %	0 %	22124077
3114	NC_004088	AGC	2	6	164207	164212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124077
3115	NC_004088	GC	3	6	164328	164333	0 %	0 %	50 %	50 %	22124077
3116	NC_004088	GGTG	2	8	164334	164341	0 %	25 %	75 %	0 %	22124077
3117	NC_004088	TATT	2	8	164342	164349	25 %	75 %	0 %	0 %	22124077
3118	NC_004088	AACC	2	8	164386	164393	50 %	0 %	0 %	50 %	22124077
3119	NC_004088	TGT	2	6	164402	164407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124077
3120	NC_004088	TTG	2	6	164413	164418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124077
3121	NC_004088	CAG	2	6	164423	164428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124077
3122	NC_004088	GT	3	6	164491	164496	0 %	50 %	50 %	0 %	22124077
3123	NC_004088	CGC	2	6	164497	164502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124077
3124	NC_004088	TGA	3	9	164520	164528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124077
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3126	NC_004088	GAA	2	6	164713	164718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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