MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004088	TTTC	2	8	25170	25177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_004088	AATCGG	2	12	25185	25196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
503	NC_004088	GCG	2	6	25373	25378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_004088	GTC	2	6	25380	25385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004088	GGCA	2	8	25393	25400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_004088	TGG	2	6	25421	25426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
507	NC_004088	ATA	2	6	25439	25444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123942
508	NC_004088	CAG	2	6	25462	25467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123942
509	NC_004088	TGG	2	6	25494	25499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
510	NC_004088	AGA	2	6	25530	25535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123942
511	NC_004088	GC	3	6	25550	25555	0 %	0 %	50 %	50 %	22123942
512	NC_004088	TCA	2	6	25622	25627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123942
513	NC_004088	GCC	2	6	25753	25758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
514	NC_004088	CCAA	2	8	25837	25844	50 %	0 %	0 %	50 %	22123942
515	NC_004088	CG	3	6	25936	25941	0 %	0 %	50 %	50 %	22123942
516	NC_004088	TGA	2	6	26060	26065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
517	NC_004088	ACG	2	6	26113	26118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123942
518	NC_004088	CGG	2	6	26355	26360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123942
519	NC_004088	TGC	2	6	26362	26367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123942
520	NC_004088	GCG	2	6	26389	26394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123942
521	NC_004088	TGCC	2	8	26448	26455	0 %	25 %	25 %	50 %	22123942
522	NC_004088	AGA	2	6	26562	26567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123942
523	NC_004088	GCG	2	6	26612	26617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123942
524	NC_004088	ATC	2	6	26623	26628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123942
525	NC_004088	CTC	2	6	26736	26741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123942
526	NC_004088	AAGGCA	2	12	26780	26791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22123942
527	NC_004088	TCA	2	6	26835	26840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123942
528	NC_004088	GCC	2	6	26866	26871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
529	NC_004088	TGG	2	6	26873	26878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
530	NC_004088	TGA	2	6	26889	26894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
531	NC_004088	CGCA	2	8	26916	26923	25 %	0 %	25 %	50 %	22123942
532	NC_004088	GCC	2	6	26936	26941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
533	NC_004088	AGA	2	6	26982	26987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123942
534	NC_004088	TAT	2	6	26988	26993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123942
535	NC_004088	GAC	2	6	27250	27255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123942
536	NC_004088	TGA	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
537	NC_004088	CCG	2	6	27300	27305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
538	NC_004088	TGA	2	6	27306	27311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
539	NC_004088	CTG	2	6	27325	27330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123942
540	NC_004088	AGCA	2	8	27380	27387	50 %	0 %	25 %	25 %	22123942
541	NC_004088	GGT	2	6	27405	27410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
542	NC_004088	GAA	2	6	27469	27474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123942
543	NC_004088	GC	3	6	27475	27480	0 %	0 %	50 %	50 %	22123942
544	NC_004088	CAG	2	6	27481	27486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123942
545	NC_004088	TGGT	2	8	27539	27546	0 %	50 %	50 %	0 %	22123942
546	NC_004088	ACC	2	6	27661	27666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123942
547	NC_004088	TTA	2	6	27679	27684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123942
548	NC_004088	TAA	2	6	27747	27752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123942
549	NC_004088	ATC	2	6	27760	27765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123942
550	NC_004088	A	6	6	27791	27796	100 %	0 %	0 %	0 %	22123942
551	NC_004088	GTCTG	2	10	27840	27849	0 %	40 %	40 %	20 %	22123942
552	NC_004088	TGG	2	6	27927	27932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
553	NC_004088	CCA	2	6	27989	27994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123942
554	NC_004088	A	6	6	28120	28125	100 %	0 %	0 %	0 %	22123942
555	NC_004088	CCG	2	6	28135	28140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
556	NC_004088	TGAT	2	8	28175	28182	25 %	50 %	25 %	0 %	22123942
557	NC_004088	GGT	2	6	28227	28232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
558	NC_004088	GGCA	2	8	28299	28306	25 %	0 %	50 %	25 %	22123942
559	NC_004088	AGA	2	6	28323	28328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123942
560	NC_004088	GGT	2	6	28332	28337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123942
561	NC_004088	GAG	2	6	28342	28347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22123942
562	NC_004088	TTG	2	6	28378	28383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123942
563	NC_004088	CCG	2	6	28394	28399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
564	NC_004088	CTG	2	6	28405	28410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123942
565	NC_004088	TGGT	2	8	28424	28431	0 %	50 %	50 %	0 %	22123942
566	NC_004088	GAT	2	6	28456	28461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
567	NC_004088	TGA	2	6	28476	28481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
568	NC_004088	GCG	2	6	28482	28487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123942
569	NC_004088	A	6	6	28532	28537	100 %	0 %	0 %	0 %	22123942
570	NC_004088	ACT	2	6	28550	28555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123942
571	NC_004088	ATT	2	6	28598	28603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123942
572	NC_004088	GAA	2	6	28633	28638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123942
573	NC_004088	ATG	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
574	NC_004088	ATG	2	6	28670	28675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123942
575	NC_004088	CGAA	2	8	28778	28785	50 %	0 %	25 %	25 %	22123942
576	NC_004088	GTT	2	6	28890	28895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123942
577	NC_004088	GCC	2	6	29041	29046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123942
578	NC_004088	TAAT	2	8	29196	29203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004088	ACC	2	6	29226	29231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123943
580	NC_004088	CCAT	2	8	29284	29291	25 %	25 %	0 %	50 %	22123943
581	NC_004088	GAA	2	6	29332	29337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123943
582	NC_004088	CTC	2	6	29508	29513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123943
583	NC_004088	CGA	2	6	29567	29572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123943
584	NC_004088	CCA	2	6	29631	29636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123943
585	NC_004088	CTT	2	6	29652	29657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123943
586	NC_004088	CTTTT	2	10	29727	29736	0 %	80 %	0 %	20 %	22123943
587	NC_004088	ATTT	2	8	29750	29757	25 %	75 %	0 %	0 %	22123943
588	NC_004088	GCC	2	6	29880	29885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123943
589	NC_004088	TTG	2	6	30051	30056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123943
590	NC_004088	ACA	2	6	30136	30141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123943
591	NC_004088	ATC	2	6	30147	30152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123943
592	NC_004088	TGA	2	6	30281	30286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123943
593	NC_004088	GATG	2	8	30302	30309	25 %	25 %	50 %	0 %	22123943
594	NC_004088	TAA	2	6	30359	30364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123943
595	NC_004088	GCC	2	6	30366	30371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123943
596	NC_004088	TCA	2	6	30391	30396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123943
597	NC_004088	TGT	2	6	30437	30442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123943
598	NC_004088	CAT	3	9	30461	30469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123943
599	NC_004088	CGG	2	6	30578	30583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123943
600	NC_004088	TGC	2	6	30716	30721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123943
601	NC_004088	GCC	3	9	30732	30740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123943
602	NC_004088	GCC	3	9	30744	30752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123943
603	NC_004088	CTG	2	6	30863	30868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123943
604	NC_004088	ATA	3	9	30937	30945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123943
605	NC_004088	TGC	2	6	30962	30967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123943
606	NC_004088	CGC	2	6	31073	31078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123943
607	NC_004088	TTC	2	6	31098	31103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123943
608	NC_004088	GCA	2	6	31138	31143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123943
609	NC_004088	CAC	2	6	31223	31228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123943
610	NC_004088	CCA	2	6	31354	31359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123943
611	NC_004088	T	6	6	31368	31373	0 %	100 %	0 %	0 %	22123943
612	NC_004088	ACC	2	6	31428	31433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123943
613	NC_004088	TGG	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123943
614	NC_004088	TGG	3	9	31463	31471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123943
615	NC_004088	ATT	2	6	31494	31499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123943
616	NC_004088	CGC	2	6	31515	31520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123943
617	NC_004088	GTTA	2	8	31554	31561	25 %	50 %	25 %	0 %	22123943
618	NC_004088	ATCC	2	8	31683	31690	25 %	25 %	0 %	50 %	22123943
619	NC_004088	TGG	3	9	31739	31747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123943
620	NC_004088	CAG	2	6	31778	31783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123943
621	NC_004088	TGG	2	6	31802	31807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123943
622	NC_004088	C	6	6	31864	31869	0 %	0 %	0 %	100 %	22123943
623	NC_004088	T	6	6	31904	31909	0 %	100 %	0 %	0 %	22123943
624	NC_004088	GT	3	6	31921	31926	0 %	50 %	50 %	0 %	22123943
625	NC_004088	TCA	2	6	31963	31968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123943
626	NC_004088	T	6	6	31997	32002	0 %	100 %	0 %	0 %	22123943
627	NC_004088	GCG	2	6	32032	32037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123943
628	NC_004088	T	6	6	32112	32117	0 %	100 %	0 %	0 %	22123943
629	NC_004088	TGA	2	6	32120	32125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123943
630	NC_004088	GAC	2	6	32145	32150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123943
631	NC_004088	TTC	2	6	32169	32174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123943
632	NC_004088	T	6	6	32187	32192	0 %	100 %	0 %	0 %	22123943
633	NC_004088	TCA	2	6	32230	32235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123943
634	NC_004088	TTTAC	2	10	32317	32326	20 %	60 %	0 %	20 %	22123943
635	NC_004088	TGA	2	6	32357	32362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123943
636	NC_004088	TTA	2	6	32419	32424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123943
637	NC_004088	ACC	2	6	32436	32441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123943
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639	NC_004088	GTT	2	6	32473	32478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123943
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644	NC_004088	ATTTT	2	10	32572	32581	20 %	80 %	0 %	0 %	22123943
645	NC_004088	GTTT	2	8	32632	32639	0 %	75 %	25 %	0 %	22123943
646	NC_004088	GGT	2	6	32640	32645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123943
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648	NC_004088	TGAAT	2	10	32701	32710	40 %	40 %	20 %	0 %	22123943
649	NC_004088	T	6	6	32742	32747	0 %	100 %	0 %	0 %	22123943
650	NC_004088	ATC	2	6	32802	32807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123943
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652	NC_004088	ATT	2	6	32829	32834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123943
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655	NC_004088	TGA	2	6	32934	32939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123943
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692	NC_004088	TTA	2	6	35158	35163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_004088	CAAT	2	8	38151	38158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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765	NC_004088	CTGG	2	8	38422	38429	0 %	25 %	50 %	25 %	22123945
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875	NC_004088	C	7	7	44633	44639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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883	NC_004088	ATT	2	6	45007	45012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123950
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891	NC_004088	GCAA	2	8	45219	45226	50 %	0 %	25 %	25 %	22123950
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