MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004088	GCG	2	6	310766	310771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257168074
6002	NC_004088	GTG	3	9	310850	310858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257168074
6003	NC_004088	G	6	6	310868	310873	0 %	0 %	100 %	0 %	257168074
6004	NC_004088	TG	3	6	310902	310907	0 %	50 %	50 %	0 %	257168074
6005	NC_004088	TTC	2	6	310928	310933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257168074
6006	NC_004088	GAA	2	6	311027	311032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_004088	CAGA	2	8	311068	311075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_004088	TAT	2	6	311076	311081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_004088	GATAA	2	10	311117	311126	60 %	20 %	20 %	0 %	22124210
6010	NC_004088	GAA	2	6	311161	311166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124210
6011	NC_004088	TCA	2	6	311213	311218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124210
6012	NC_004088	ACA	2	6	311303	311308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124210
6013	NC_004088	ACC	2	6	311377	311382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124210
6014	NC_004088	ACA	2	6	311433	311438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124210
6015	NC_004088	GTA	2	6	311465	311470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124210
6016	NC_004088	CCA	2	6	311477	311482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124210
6017	NC_004088	CCA	2	6	311495	311500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124210
6018	NC_004088	ATC	2	6	311641	311646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_004088	CTG	2	6	311802	311807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124211
6020	NC_004088	AAAC	2	8	311823	311830	75 %	0 %	0 %	25 %	22124211
6021	NC_004088	TAA	2	6	311860	311865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124211
6022	NC_004088	AGA	2	6	311919	311924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124211
6023	NC_004088	GGC	2	6	311926	311931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124211
6024	NC_004088	ATA	2	6	311950	311955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124211
6025	NC_004088	TTA	2	6	312032	312037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124211
6026	NC_004088	CCG	2	6	312048	312053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124211
6027	NC_004088	GCA	2	6	312081	312086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124211
6028	NC_004088	ATA	2	6	312118	312123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124211
6029	NC_004088	AACC	2	8	312140	312147	50 %	0 %	0 %	50 %	22124211
6030	NC_004088	GAA	2	6	312148	312153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124211
6031	NC_004088	GTAA	2	8	312211	312218	50 %	25 %	25 %	0 %	22124211
6032	NC_004088	GGC	2	6	312220	312225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124211
6033	NC_004088	TGG	2	6	312356	312361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124211
6034	NC_004088	TTC	2	6	312403	312408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124211
6035	NC_004088	CGG	2	6	312501	312506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124211
6036	NC_004088	TTGA	2	8	312620	312627	25 %	50 %	25 %	0 %	22124211
6037	NC_004088	TTCA	2	8	312644	312651	25 %	50 %	0 %	25 %	22124211
6038	NC_004088	TAA	2	6	312719	312724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_004088	A	6	6	312737	312742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_004088	ATA	2	6	312779	312784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_004088	GAT	2	6	312838	312843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_004088	TG	3	6	313013	313018	0 %	50 %	50 %	0 %	22124212
6043	NC_004088	CGG	2	6	313023	313028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124212
6044	NC_004088	CGTT	2	8	313047	313054	0 %	50 %	25 %	25 %	22124212
6045	NC_004088	TGT	2	6	313193	313198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124212
6046	NC_004088	TCA	2	6	313434	313439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124212
6047	NC_004088	GTT	2	6	313456	313461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124212
6048	NC_004088	TGC	2	6	313511	313516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124212
6049	NC_004088	TTC	3	9	313517	313525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
6050	NC_004088	CTT	2	6	313543	313548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
6051	NC_004088	TGATTT	2	12	313549	313560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	22124212
6052	NC_004088	GTTTCT	2	12	313567	313578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	22124212
6053	NC_004088	AGG	2	6	313634	313639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124212
6054	NC_004088	ATCT	2	8	313676	313683	25 %	50 %	0 %	25 %	22124212
6055	NC_004088	ATC	2	6	313694	313699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124212
6056	NC_004088	CTT	2	6	313718	313723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
6057	NC_004088	GTT	2	6	313778	313783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124212
6058	NC_004088	TTC	2	6	313817	313822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
6059	NC_004088	CTT	2	6	313918	313923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
6060	NC_004088	TGA	2	6	313966	313971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124212
6061	NC_004088	CGG	2	6	313998	314003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124212
6062	NC_004088	ATC	2	6	314037	314042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124212
6063	NC_004088	ACG	2	6	314093	314098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124212
6064	NC_004088	GAT	2	6	314150	314155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124212
6065	NC_004088	ATT	2	6	314204	314209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_004088	TGTAC	2	10	314237	314246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6067	NC_004088	ATTA	2	8	314247	314254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_004088	TTC	2	6	314286	314291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124213
6069	NC_004088	AAC	2	6	314386	314391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124213
6070	NC_004088	TGC	2	6	314397	314402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124213
6071	NC_004088	ATC	2	6	314442	314447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124213
6072	NC_004088	GCA	2	6	314531	314536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124213
6073	NC_004088	CGGT	2	8	314539	314546	0 %	25 %	50 %	25 %	22124213
6074	NC_004088	CAG	2	6	314642	314647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124213
6075	NC_004088	C	7	7	314649	314655	0 %	0 %	0 %	100 %	22124213
6076	NC_004088	TTG	2	6	314674	314679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124213
6077	NC_004088	CGG	2	6	314689	314694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124213
6078	NC_004088	T	6	6	314697	314702	0 %	100 %	0 %	0 %	22124213
6079	NC_004088	TCA	2	6	314714	314719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124213
6080	NC_004088	CCA	2	6	314749	314754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124213
6081	NC_004088	TTG	2	6	314789	314794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124213
6082	NC_004088	A	6	6	314845	314850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_004088	GGA	2	6	314882	314887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_004088	AG	3	6	314910	314915	50 %	0 %	50 %	0 %	22124214
6085	NC_004088	CAC	2	6	314997	315002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124214
6086	NC_004088	T	6	6	315125	315130	0 %	100 %	0 %	0 %	22124214
6087	NC_004088	GGC	2	6	315151	315156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124214
6088	NC_004088	GCG	2	6	315178	315183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124214
6089	NC_004088	CGG	2	6	315240	315245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124214
6090	NC_004088	TGG	2	6	315269	315274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124214
6091	NC_004088	GGT	2	6	315277	315282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124214
6092	NC_004088	CTG	2	6	315309	315314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124214
6093	NC_004088	GTT	2	6	315353	315358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124214
6094	NC_004088	CTGC	2	8	315368	315375	0 %	25 %	25 %	50 %	22124214
6095	NC_004088	GTT	2	6	315395	315400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124214
6096	NC_004088	TTC	2	6	315507	315512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124214
6097	NC_004088	GCC	2	6	315603	315608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124214
6098	NC_004088	AACA	2	8	315609	315616	75 %	0 %	0 %	25 %	22124214
6099	NC_004088	T	6	6	315675	315680	0 %	100 %	0 %	0 %	22124214
6100	NC_004088	CGT	2	6	315757	315762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_004088	ATG	2	6	315764	315769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_004088	GCA	2	6	315822	315827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124215
6103	NC_004088	TGA	2	6	315838	315843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124215
6104	NC_004088	G	6	6	315963	315968	0 %	0 %	100 %	0 %	22124215
6105	NC_004088	TCA	2	6	315993	315998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124215
6106	NC_004088	CAT	2	6	316075	316080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124215
6107	NC_004088	G	7	7	316100	316106	0 %	0 %	100 %	0 %	22124215
6108	NC_004088	ACG	2	6	316202	316207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124215
6109	NC_004088	GCG	2	6	316323	316328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124215
6110	NC_004088	GCT	2	6	316408	316413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124215
6111	NC_004088	CTT	2	6	316414	316419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124215
6112	NC_004088	AGC	2	6	316452	316457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124215
6113	NC_004088	TGT	2	6	316515	316520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124215
6114	NC_004088	GGC	2	6	316556	316561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124215
6115	NC_004088	A	6	6	316592	316597	100 %	0 %	0 %	0 %	22124215
6116	NC_004088	GAG	2	6	316672	316677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124215
6117	NC_004088	TCA	2	6	316744	316749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124215
6118	NC_004088	CG	3	6	316751	316756	0 %	0 %	50 %	50 %	22124215
6119	NC_004088	TTCT	2	8	316820	316827	0 %	75 %	0 %	25 %	22124215
6120	NC_004088	GC	3	6	316872	316877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_004088	GTT	2	6	316898	316903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_004088	A	6	6	316971	316976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_004088	T	6	6	316992	316997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_004088	GTG	2	6	317036	317041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6381	NC_004088	GCA	2	6	329445	329450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484909
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6421	NC_004088	CTTA	2	8	331603	331610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6481	NC_004088	GTAA	2	8	335303	335310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6482	NC_004088	AAC	2	6	335336	335341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6488	NC_004088	CGG	2	6	335784	335789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124229
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6499	NC_004088	GATGAC	2	12	336310	336321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22124229
6500	NC_004088	GCCT	2	8	336330	336337	0 %	25 %	25 %	50 %	22124229

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