MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004088	GAG	2	6	285331	285336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124188
5502	NC_004088	CCA	2	6	285359	285364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124188
5503	NC_004088	CGT	2	6	285393	285398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124188
5504	NC_004088	CGC	3	9	285444	285452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124188
5505	NC_004088	CCCG	2	8	285480	285487	0 %	0 %	25 %	75 %	22124188
5506	NC_004088	CGC	2	6	285509	285514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124188
5507	NC_004088	CGG	2	6	285560	285565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124188
5508	NC_004088	C	6	6	285612	285617	0 %	0 %	0 %	100 %	22124188
5509	NC_004088	GGGCC	2	10	285653	285662	0 %	0 %	60 %	40 %	22124188
5510	NC_004088	TCG	2	6	285677	285682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124188
5511	NC_004088	CGC	2	6	285689	285694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124188
5512	NC_004088	CGG	2	6	285740	285745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124188
5513	NC_004088	TGAT	2	8	285748	285755	25 %	50 %	25 %	0 %	22124188
5514	NC_004088	GCC	2	6	285771	285776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124188
5515	NC_004088	C	6	6	285792	285797	0 %	0 %	0 %	100 %	22124188
5516	NC_004088	GGC	2	6	285834	285839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124188
5517	NC_004088	TAT	3	9	285893	285901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124188
5518	NC_004088	CTG	2	6	285963	285968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_004088	GTG	2	6	285975	285980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_004088	TCA	2	6	286009	286014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_004088	CGG	2	6	286055	286060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_004088	CTC	2	6	286083	286088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_004088	CTG	2	6	286130	286135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_004088	GCT	2	6	286211	286216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_004088	GCT	2	6	286230	286235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_004088	CCA	2	6	286265	286270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_004088	CGG	2	6	286349	286354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_004088	CCA	2	6	286523	286528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_004088	C	6	6	286571	286576	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5530	NC_004088	G	7	7	286588	286594	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_004088	GCTGCC	2	12	286629	286640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_004088	GA	3	6	286668	286673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_004088	GGC	2	6	286683	286688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_004088	CGC	2	6	286721	286726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_004088	T	6	6	286745	286750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_004088	GGCCA	2	10	287027	287036	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5537	NC_004088	T	7	7	287037	287043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_004088	CCG	2	6	287068	287073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_004088	TCAA	2	8	287121	287128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_004088	GGT	2	6	287155	287160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_004088	TTG	2	6	287166	287171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_004088	CCGG	2	8	287197	287204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_004088	ATG	2	6	287229	287234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124189
5544	NC_004088	GCC	2	6	287285	287290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124189
5545	NC_004088	AGC	2	6	287293	287298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124189
5546	NC_004088	TGA	2	6	287308	287313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124189
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5548	NC_004088	CCGC	2	8	287422	287429	0 %	0 %	25 %	75 %	22124189
5549	NC_004088	TCA	2	6	287446	287451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124189
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5551	NC_004088	CGC	2	6	287672	287677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_004088	GCG	2	6	287727	287732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_004088	TTG	2	6	287734	287739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_004088	TG	3	6	287770	287775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_004088	GAA	2	6	287796	287801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_004088	GTT	2	6	287886	287891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_004088	CTG	2	6	287913	287918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_004088	GAA	2	6	287949	287954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_004088	AGGT	2	8	288019	288026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_004088	TCCAC	2	10	288053	288062	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5561	NC_004088	CAT	2	6	288084	288089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_004088	CAC	2	6	288090	288095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_004088	CCCA	2	8	288121	288128	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5564	NC_004088	TGT	2	6	288188	288193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_004088	CGC	2	6	288225	288230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5570	NC_004088	TGC	2	6	288412	288417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_004088	CGG	2	6	288484	288489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_004088	GTT	2	6	288494	288499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_004088	TGA	2	6	288731	288736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_004088	CAG	2	6	288780	288785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_004088	GTC	2	6	288810	288815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5577	NC_004088	TGC	2	6	288928	288933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_004088	GTG	2	6	289011	289016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_004088	TTG	2	6	289079	289084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_004088	AT	3	6	289101	289106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_004088	CGGCG	2	10	289193	289202	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5582	NC_004088	GTT	2	6	289207	289212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_004088	TCA	2	6	289225	289230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5585	NC_004088	ATT	2	6	289292	289297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_004088	TAG	2	6	289497	289502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_004088	CACC	2	8	289537	289544	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5592	NC_004088	CGT	2	6	289658	289663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5597	NC_004088	CAT	2	6	289916	289921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5599	NC_004088	TCCG	2	8	289977	289984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_004088	CCG	2	6	289999	290004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_004088	CAG	2	6	290084	290089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_004088	TGA	2	6	290160	290165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_004088	TCA	2	6	290206	290211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_004088	TGA	2	6	290214	290219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_004088	ATA	2	6	290370	290375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_004088	CAG	2	6	290394	290399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_004088	CTG	2	6	290413	290418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5612	NC_004088	GC	3	6	290501	290506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_004088	TTG	2	6	290600	290605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_004088	GTC	2	6	290627	290632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_004088	CAA	2	6	290703	290708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5619	NC_004088	AAT	2	6	290751	290756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_004088	ACC	2	6	290844	290849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_004088	TGC	2	6	291019	291024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124190
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5631	NC_004088	A	6	6	291300	291305	100 %	0 %	0 %	0 %	22124190
5632	NC_004088	A	7	7	291334	291340	100 %	0 %	0 %	0 %	22124190
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5755	NC_004088	CTG	2	6	298191	298196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124195
5756	NC_004088	CAT	2	6	298262	298267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124195
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5789	NC_004088	AG	3	6	300185	300190	50 %	0 %	50 %	0 %	22124197
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5866	NC_004088	TC	3	6	304245	304250	0 %	50 %	0 %	50 %	22124202
5867	NC_004088	AAGGT	2	10	304284	304293	40 %	20 %	40 %	0 %	22124202
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5873	NC_004088	TGA	2	6	304616	304621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124202
5874	NC_004088	AGCGC	2	10	304684	304693	20 %	0 %	40 %	40 %	22124203
5875	NC_004088	GAA	2	6	304762	304767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124203
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