MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004088	T	6	6	234209	234214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_004088	GGC	2	6	234262	234267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_004088	ACG	2	6	234275	234280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_004088	CGC	2	6	234342	234347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124139
4505	NC_004088	TCA	2	6	234442	234447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124139
4506	NC_004088	TCA	2	6	234550	234555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124139
4507	NC_004088	ATT	2	6	234632	234637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124139
4508	NC_004088	CAA	2	6	234673	234678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124139
4509	NC_004088	T	7	7	234776	234782	0 %	100 %	0 %	0 %	22124139
4510	NC_004088	CAGC	2	8	234826	234833	25 %	0 %	25 %	50 %	22124139
4511	NC_004088	GAC	2	6	234844	234849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124139
4512	NC_004088	GGA	2	6	234866	234871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124139
4513	NC_004088	CAC	2	6	234884	234889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124139
4514	NC_004088	GTGA	2	8	235014	235021	25 %	25 %	50 %	0 %	22124139
4515	NC_004088	GTT	2	6	235162	235167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124139
4516	NC_004088	TGAG	2	8	235246	235253	25 %	25 %	50 %	0 %	22124140
4517	NC_004088	G	6	6	235253	235258	0 %	0 %	100 %	0 %	22124140
4518	NC_004088	AAT	2	6	235341	235346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124140
4519	NC_004088	GAAT	2	8	235353	235360	50 %	25 %	25 %	0 %	22124140
4520	NC_004088	GT	3	6	235376	235381	0 %	50 %	50 %	0 %	22124140
4521	NC_004088	ACC	2	6	235477	235482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124140
4522	NC_004088	GT	3	6	235495	235500	0 %	50 %	50 %	0 %	22124140
4523	NC_004088	TCT	2	6	235630	235635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124140
4524	NC_004088	CG	3	6	235717	235722	0 %	0 %	50 %	50 %	22124140
4525	NC_004088	AAT	2	6	235770	235775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124140
4526	NC_004088	CAATG	2	10	235826	235835	40 %	20 %	20 %	20 %	22124140
4527	NC_004088	GCA	2	6	235867	235872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124140
4528	NC_004088	ATCGGC	2	12	235936	235947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22124140
4529	NC_004088	CGT	2	6	235949	235954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124140
4530	NC_004088	C	6	6	235963	235968	0 %	0 %	0 %	100 %	22124140
4531	NC_004088	GGT	2	6	235991	235996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124140
4532	NC_004088	TGCC	2	8	236077	236084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_004088	A	6	6	236158	236163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_004088	ATA	2	6	236173	236178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_004088	AAT	2	6	236188	236193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_004088	G	7	7	236233	236239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_004088	TTC	2	6	236265	236270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_004088	GT	3	6	236278	236283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_004088	ATT	2	6	236395	236400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_004088	CTAT	2	8	236406	236413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_004088	AAT	2	6	236420	236425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_004088	AT	3	6	236475	236480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_004088	TGAA	2	8	236485	236492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_004088	GCC	2	6	236554	236559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124141
4545	NC_004088	GCCC	2	8	236662	236669	0 %	0 %	25 %	75 %	22124141
4546	NC_004088	AAT	4	12	236689	236700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124141
4547	NC_004088	GTGG	2	8	236728	236735	0 %	25 %	75 %	0 %	22124141
4548	NC_004088	GGT	2	6	236788	236793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124141
4549	NC_004088	TGG	2	6	236802	236807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124141
4550	NC_004088	TGA	2	6	236874	236879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124141
4551	NC_004088	GCA	2	6	236882	236887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124141
4552	NC_004088	TTG	3	9	236891	236899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124141
4553	NC_004088	G	6	6	237003	237008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_004088	CCA	2	6	237110	237115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124142
4555	NC_004088	GTT	2	6	237223	237228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124142
4556	NC_004088	A	6	6	237270	237275	100 %	0 %	0 %	0 %	22124142
4557	NC_004088	TCC	2	6	237435	237440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124143
4558	NC_004088	AGAC	2	8	237469	237476	50 %	0 %	25 %	25 %	22124143
4559	NC_004088	AAT	2	6	237502	237507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124143
4560	NC_004088	TAA	2	6	237529	237534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124143
4561	NC_004088	TCA	2	6	237582	237587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124143
4562	NC_004088	GCA	2	6	237600	237605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124143
4563	NC_004088	GTTC	2	8	237613	237620	0 %	50 %	25 %	25 %	22124143
4564	NC_004088	CAG	2	6	237711	237716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124143
4565	NC_004088	GAG	2	6	237750	237755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_004088	CAGA	2	8	237885	237892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_004088	GGC	2	6	237961	237966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124144
4568	NC_004088	ATT	2	6	237975	237980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124144
4569	NC_004088	GAAG	2	8	237981	237988	50 %	0 %	50 %	0 %	22124144
4570	NC_004088	TAA	2	6	238001	238006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124144
4571	NC_004088	TCA	2	6	238054	238059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124144
4572	NC_004088	GCA	2	6	238072	238077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124144
4573	NC_004088	GTTC	2	8	238085	238092	0 %	50 %	25 %	25 %	22124144
4574	NC_004088	AAT	2	6	238214	238219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_004088	AAT	2	6	238280	238285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_004088	TCC	2	6	238291	238296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_004088	TTAC	2	8	238391	238398	25 %	50 %	0 %	25 %	22124145
4578	NC_004088	CA	3	6	238673	238678	50 %	0 %	0 %	50 %	22124145
4579	NC_004088	TTG	2	6	238870	238875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124145
4580	NC_004088	T	7	7	239017	239023	0 %	100 %	0 %	0 %	22124146
4581	NC_004088	A	6	6	239049	239054	100 %	0 %	0 %	0 %	22124146
4582	NC_004088	CAT	2	6	239091	239096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124146
4583	NC_004088	AGA	2	6	239105	239110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124146
4584	NC_004088	TTCA	2	8	239176	239183	25 %	50 %	0 %	25 %	22124146
4585	NC_004088	GTT	2	6	239203	239208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124146
4586	NC_004088	A	6	6	239257	239262	100 %	0 %	0 %	0 %	22124147
4587	NC_004088	ATC	2	6	239281	239286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124147
4588	NC_004088	GAC	2	6	239311	239316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124147
4589	NC_004088	ATT	2	6	239317	239322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124147
4590	NC_004088	CCA	2	6	239325	239330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124147
4591	NC_004088	CTGG	2	8	239433	239440	0 %	25 %	50 %	25 %	22124147
4592	NC_004088	AAGC	2	8	239442	239449	50 %	0 %	25 %	25 %	22124147
4593	NC_004088	GGA	2	6	239511	239516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124147
4594	NC_004088	AATT	2	8	239528	239535	50 %	50 %	0 %	0 %	22124147
4595	NC_004088	TGA	2	6	239606	239611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124147
4596	NC_004088	CAA	2	6	239707	239712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124147
4597	NC_004088	GGT	2	6	239756	239761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124147
4598	NC_004088	ACAG	2	8	239817	239824	50 %	0 %	25 %	25 %	22124147
4599	NC_004088	GAA	2	6	239911	239916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124147
4600	NC_004088	CAG	2	6	239947	239952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124147
4601	NC_004088	AAC	2	6	239963	239968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124147
4602	NC_004088	CTC	2	6	239991	239996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124147
4603	NC_004088	GGC	2	6	240026	240031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124147
4604	NC_004088	AGCC	2	8	240033	240040	25 %	0 %	25 %	50 %	22124147
4605	NC_004088	TCAA	2	8	240107	240114	50 %	25 %	0 %	25 %	22124147
4606	NC_004088	GAT	2	6	240205	240210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124147
4607	NC_004088	GGC	2	6	240302	240307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124147
4608	NC_004088	ATA	2	6	240441	240446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_004088	A	6	6	240461	240466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_004088	GGC	2	6	240601	240606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124148
4611	NC_004088	GGA	2	6	240608	240613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124148
4612	NC_004088	TTA	2	6	240624	240629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124148
4613	NC_004088	GTT	2	6	240707	240712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124148
4614	NC_004088	AT	3	6	240762	240767	50 %	50 %	0 %	0 %	22124148
4615	NC_004088	TCA	2	6	240798	240803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124148
4616	NC_004088	ATCA	2	8	240938	240945	50 %	25 %	0 %	25 %	22124148
4617	NC_004088	TGC	2	6	241117	241122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124148
4618	NC_004088	GC	3	6	241160	241165	0 %	0 %	50 %	50 %	22124148
4619	NC_004088	ACG	2	6	241233	241238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124148
4620	NC_004088	TCA	2	6	241314	241319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124148
4621	NC_004088	CAT	2	6	241333	241338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124148
4622	NC_004088	T	6	6	241424	241429	0 %	100 %	0 %	0 %	22124148
4623	NC_004088	TGC	2	6	241534	241539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124148
4624	NC_004088	TGT	2	6	241716	241721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124148
4625	NC_004088	ACG	2	6	241819	241824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124148
4626	NC_004088	CAG	2	6	241850	241855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124148
4627	NC_004088	TGAT	2	8	241978	241985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_004088	ATT	2	6	242003	242008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_004088	GGC	2	6	242045	242050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_004088	GA	3	6	242055	242060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_004088	ATTC	2	8	242109	242116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4651	NC_004088	TGA	2	6	243085	243090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4652	NC_004088	A	7	7	243111	243117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4653	NC_004088	CG	3	6	243121	243126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4658	NC_004088	GCA	2	6	243449	243454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124150
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4752	NC_004088	CAA	2	6	248314	248319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124154
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