MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 1819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003134	ATC	2	6	54754	54759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_003134	CGG	2	6	54851	54856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082844
1003	NC_003134	GA	3	6	54858	54863	50 %	0 %	50 %	0 %	16082844
1004	NC_003134	CAT	2	6	54906	54911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082844
1005	NC_003134	GGTT	2	8	54942	54949	0 %	50 %	50 %	0 %	16082844
1006	NC_003134	T	6	6	55176	55181	0 %	100 %	0 %	0 %	16082844
1007	NC_003134	TA	3	6	55224	55229	50 %	50 %	0 %	0 %	16082844
1008	NC_003134	GAAA	2	8	55243	55250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_003134	GAAG	2	8	55269	55276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003134	GGGGT	2	10	55284	55293	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003134	TGA	2	6	55302	55307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003134	GGA	2	6	55413	55418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003134	TGGGTT	2	12	55481	55492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003134	CAG	2	6	55494	55499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_003134	GCTGC	2	10	55525	55534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_003134	CAC	2	6	55562	55567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_003134	A	6	6	55664	55669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003134	TAG	2	6	55670	55675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003134	GCC	2	6	55691	55696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_003134	CT	3	6	55770	55775	0 %	50 %	0 %	50 %	16082845
1021	NC_003134	GCGAT	2	10	55833	55842	20 %	20 %	40 %	20 %	16082845
1022	NC_003134	GTG	3	9	56055	56063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082845
1023	NC_003134	CA	3	6	56178	56183	50 %	0 %	0 %	50 %	16082845
1024	NC_003134	TAAG	2	8	56196	56203	50 %	25 %	25 %	0 %	16082845
1025	NC_003134	TTG	2	6	56241	56246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082845
1026	NC_003134	CTT	2	6	56262	56267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082845
1027	NC_003134	TCA	2	6	56287	56292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082845
1028	NC_003134	A	6	6	56308	56313	100 %	0 %	0 %	0 %	16082845
1029	NC_003134	CCG	2	6	56315	56320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_003134	CAG	2	6	56524	56529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082846
1031	NC_003134	GAC	2	6	56589	56594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082846
1032	NC_003134	CGCCAG	2	12	56626	56637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082846
1033	NC_003134	GAT	2	6	56659	56664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082846
1034	NC_003134	TGG	2	6	56685	56690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082846
1035	NC_003134	GCC	2	6	56726	56731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082846
1036	NC_003134	TCT	2	6	56745	56750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082846
1037	NC_003134	TTG	3	9	56938	56946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003134	GTC	2	6	57147	57152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_003134	CAT	2	6	57185	57190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_003134	GTC	2	6	57255	57260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_003134	ACG	2	6	57272	57277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_003134	CCA	2	6	57303	57308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_003134	TCTG	2	8	57374	57381	0 %	50 %	25 %	25 %	16082847
1044	NC_003134	TTTGA	2	10	57399	57408	20 %	60 %	20 %	0 %	16082847
1045	NC_003134	GTG	2	6	57420	57425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082847
1046	NC_003134	TGC	2	6	57456	57461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082847
1047	NC_003134	GAA	2	6	57552	57557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082847
1048	NC_003134	CTT	2	6	57566	57571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082847
1049	NC_003134	CTGA	2	8	57573	57580	25 %	25 %	25 %	25 %	16082847
1050	NC_003134	TCA	2	6	57598	57603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082847
1051	NC_003134	ATG	2	6	57604	57609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082847
1052	NC_003134	G	6	6	57617	57622	0 %	0 %	100 %	0 %	16082847
1053	NC_003134	CGT	2	6	57642	57647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082847
1054	NC_003134	CTG	3	9	57695	57703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082847
1055	NC_003134	TGAG	2	8	57824	57831	25 %	25 %	50 %	0 %	16082847
1056	NC_003134	CCG	2	6	57902	57907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082847
1057	NC_003134	TGA	2	6	57946	57951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082847
1058	NC_003134	TTC	2	6	57963	57968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082847
1059	NC_003134	TGT	2	6	58021	58026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082847
1060	NC_003134	GCGCT	2	10	58037	58046	0 %	20 %	40 %	40 %	16082847
1061	NC_003134	CAT	2	6	58107	58112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082847
1062	NC_003134	CTC	2	6	58120	58125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082848
1063	NC_003134	GAT	2	6	58153	58158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082848
1064	NC_003134	TCA	2	6	58191	58196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082848
1065	NC_003134	T	6	6	58214	58219	0 %	100 %	0 %	0 %	16082848
1066	NC_003134	CTG	2	6	58244	58249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082848
1067	NC_003134	CAGC	2	8	58319	58326	25 %	0 %	25 %	50 %	16082848
1068	NC_003134	ACCTT	2	10	58437	58446	20 %	40 %	0 %	40 %	16082848
1069	NC_003134	GA	3	6	58480	58485	50 %	0 %	50 %	0 %	16082848
1070	NC_003134	ACA	2	6	58585	58590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082848
1071	NC_003134	CG	3	6	58594	58599	0 %	0 %	50 %	50 %	16082848
1072	NC_003134	CAC	2	6	58603	58608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082848
1073	NC_003134	AAG	2	6	58611	58616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082848
1074	NC_003134	GTC	2	6	58768	58773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082848
1075	NC_003134	CGAAC	2	10	58786	58795	40 %	0 %	20 %	40 %	16082848
1076	NC_003134	GCTCCT	2	12	58801	58812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16082848
1077	NC_003134	GA	4	8	58821	58828	50 %	0 %	50 %	0 %	16082848
1078	NC_003134	GAAT	2	8	58831	58838	50 %	25 %	25 %	0 %	16082848
1079	NC_003134	GCGA	2	8	58886	58893	25 %	0 %	50 %	25 %	16082848
1080	NC_003134	CAG	2	6	58978	58983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082848
1081	NC_003134	GGC	2	6	59001	59006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082848
1082	NC_003134	CGTT	2	8	59210	59217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_003134	GCC	2	6	59224	59229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_003134	CA	3	6	59235	59240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_003134	GGC	2	6	59243	59248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_003134	GGC	2	6	59261	59266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082849
1087	NC_003134	TGG	2	6	59278	59283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082849
1088	NC_003134	CGT	2	6	59317	59322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1089	NC_003134	TGC	2	6	59382	59387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1090	NC_003134	GCT	2	6	59406	59411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1091	NC_003134	CTT	2	6	59420	59425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082849
1092	NC_003134	TCT	2	6	59428	59433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082849
1093	NC_003134	CGC	2	6	59444	59449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082849
1094	NC_003134	TCG	2	6	59521	59526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1095	NC_003134	CCA	2	6	59531	59536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082849
1096	NC_003134	GCC	2	6	59559	59564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082849
1097	NC_003134	CCG	2	6	59667	59672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082849
1098	NC_003134	GGT	2	6	59687	59692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082849
1099	NC_003134	GCA	2	6	59716	59721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1100	NC_003134	CGT	2	6	59840	59845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1101	NC_003134	GCT	2	6	59911	59916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1102	NC_003134	GCC	2	6	59925	59930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082849
1103	NC_003134	AGC	2	6	59967	59972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1104	NC_003134	GCG	2	6	59991	59996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082849
1105	NC_003134	GCT	2	6	60029	60034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1106	NC_003134	TTC	2	6	60044	60049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082849
1107	NC_003134	GTC	2	6	60137	60142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1108	NC_003134	GCC	2	6	60162	60167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082849
1109	NC_003134	TCG	2	6	60207	60212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1110	NC_003134	GCT	4	12	60259	60270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1111	NC_003134	GCT	2	6	60379	60384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1112	NC_003134	TGCCG	2	10	60446	60455	0 %	20 %	40 %	40 %	16082849
1113	NC_003134	CTG	2	6	60499	60504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1114	NC_003134	AGCCGA	2	12	60766	60777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1115	NC_003134	CGG	2	6	60844	60849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082849
1116	NC_003134	GGC	2	6	60857	60862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082849
1117	NC_003134	GC	3	6	60861	60866	0 %	0 %	50 %	50 %	16082849
1118	NC_003134	CGAGG	2	10	60884	60893	20 %	0 %	60 %	20 %	16082849
1119	NC_003134	GTC	2	6	60902	60907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1120	NC_003134	CAG	2	6	60962	60967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1121	NC_003134	CAGT	2	8	60976	60983	25 %	25 %	25 %	25 %	16082849
1122	NC_003134	ACC	2	6	60989	60994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082849
1123	NC_003134	GTCC	2	8	61012	61019	0 %	25 %	25 %	50 %	16082849
1124	NC_003134	GCA	2	6	61045	61050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1125	NC_003134	GGC	2	6	61178	61183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082849
1126	NC_003134	CTT	2	6	61192	61197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082849
1127	NC_003134	T	7	7	61213	61219	0 %	100 %	0 %	0 %	16082849
1128	NC_003134	GCT	2	6	61220	61225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1129	NC_003134	T	6	6	61229	61234	0 %	100 %	0 %	0 %	16082849
1130	NC_003134	TGA	2	6	61289	61294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_003134	TTG	2	6	68307	68312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082858
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1291	NC_003134	AT	3	6	70190	70195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1293	NC_003134	CA	3	6	70226	70231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1294	NC_003134	A	6	6	70231	70236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1295	NC_003134	ACA	2	6	70240	70245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1296	NC_003134	ATT	2	6	70265	70270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1299	NC_003134	TTG	2	6	70404	70409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1301	NC_003134	GTT	2	6	70457	70462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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