MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 1819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003134	TCA	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082807
502	NC_003134	TCA	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082807
503	NC_003134	TCA	2	6	27925	27930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082807
504	NC_003134	TCG	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082807
505	NC_003134	CGA	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082807
506	NC_003134	CTT	2	6	28125	28130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082807
507	NC_003134	CCGA	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	16082807
508	NC_003134	TCG	2	6	28180	28185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082807
509	NC_003134	CGCA	2	8	28227	28234	25 %	0 %	25 %	50 %	16082807
510	NC_003134	ACG	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082807
511	NC_003134	TCC	2	6	28351	28356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082807
512	NC_003134	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	16082807
513	NC_003134	CTTCG	2	10	28389	28398	0 %	40 %	20 %	40 %	16082807
514	NC_003134	AAC	2	6	28499	28504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_003134	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003134	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003134	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003134	GGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082808
519	NC_003134	GGC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082808
520	NC_003134	CCA	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082808
521	NC_003134	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082808
522	NC_003134	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082808
523	NC_003134	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082808
524	NC_003134	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	16082808
525	NC_003134	CAG	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
526	NC_003134	AGC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
527	NC_003134	CCA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082809
528	NC_003134	TCG	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082809
529	NC_003134	ACG	3	9	29208	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
530	NC_003134	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	16082809
531	NC_003134	CGGAA	2	10	29273	29282	40 %	0 %	40 %	20 %	16082809
532	NC_003134	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	16082809
533	NC_003134	CGA	2	6	29385	29390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
534	NC_003134	GAT	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082809
535	NC_003134	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082809
536	NC_003134	AACGG	2	10	29481	29490	40 %	0 %	40 %	20 %	16082809
537	NC_003134	GTT	3	9	29505	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082809
538	NC_003134	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082809
539	NC_003134	TGG	2	6	29552	29557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082809
540	NC_003134	CAG	3	9	29595	29603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
541	NC_003134	ACG	2	6	29623	29628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
542	NC_003134	CCA	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082809
543	NC_003134	GTC	2	6	29640	29645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082809
544	NC_003134	ATA	2	6	29658	29663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082809
545	NC_003134	TGA	3	9	29801	29809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082809
546	NC_003134	TGTC	2	8	29810	29817	0 %	50 %	25 %	25 %	16082809
547	NC_003134	TGA	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082810
548	NC_003134	CGT	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082810
549	NC_003134	ATC	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082810
550	NC_003134	CTT	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082810
551	NC_003134	CAG	2	6	30002	30007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082810
552	NC_003134	GTT	3	9	30023	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082810
553	NC_003134	TTC	2	6	30139	30144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	40787863
554	NC_003134	GTC	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	40787863
555	NC_003134	CCA	2	6	30164	30169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	40787863
556	NC_003134	GCGG	2	8	30189	30196	0 %	0 %	75 %	25 %	40787863
557	NC_003134	TCG	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	40787863
558	NC_003134	CAG	2	6	30384	30389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40787863
559	NC_003134	TGG	2	6	30404	30409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	40787863
560	NC_003134	TTG	2	6	30442	30447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	40787863
561	NC_003134	GCA	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40787863
562	NC_003134	CAGC	2	8	30712	30719	25 %	0 %	25 %	50 %	16082812
563	NC_003134	AGA	2	6	30725	30730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082812
564	NC_003134	TCC	2	6	30783	30788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082812
565	NC_003134	GCAA	2	8	30795	30802	50 %	0 %	25 %	25 %	16082812
566	NC_003134	CAG	2	6	30826	30831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082812
567	NC_003134	CTT	2	6	30868	30873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082812
568	NC_003134	CTT	2	6	30907	30912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082812
569	NC_003134	TGC	2	6	30976	30981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
570	NC_003134	CTG	2	6	31055	31060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
571	NC_003134	CGT	2	6	31072	31077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
572	NC_003134	CTT	3	9	31123	31131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082812
573	NC_003134	GTC	2	6	31139	31144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
574	NC_003134	CCAG	2	8	31173	31180	25 %	0 %	25 %	50 %	16082812
575	NC_003134	GCC	2	6	31185	31190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082812
576	NC_003134	CGA	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082812
577	NC_003134	ATG	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082812
578	NC_003134	CGT	2	6	31219	31224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
579	NC_003134	GGC	2	6	31268	31273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082812
580	NC_003134	CTG	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
581	NC_003134	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	16082812
582	NC_003134	GTA	2	6	31390	31395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082813
583	NC_003134	TGA	2	6	31464	31469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082813
584	NC_003134	CTCG	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	16082813
585	NC_003134	GCC	2	6	31652	31657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082813
586	NC_003134	TCG	2	6	31661	31666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082813
587	NC_003134	TTC	2	6	31714	31719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082813
588	NC_003134	CGA	2	6	31770	31775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082813
589	NC_003134	CCA	2	6	31791	31796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082813
590	NC_003134	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	16082813
591	NC_003134	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_003134	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_003134	ATA	2	6	32094	32099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003134	TGA	2	6	32188	32193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082814
595	NC_003134	GAT	3	9	32473	32481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082814
596	NC_003134	GCT	2	6	32531	32536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082814
597	NC_003134	CTCG	2	8	32568	32575	0 %	25 %	25 %	50 %	16082814
598	NC_003134	AATC	2	8	32610	32617	50 %	25 %	0 %	25 %	16082814
599	NC_003134	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	16082814
600	NC_003134	GCC	2	6	32749	32754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082814
601	NC_003134	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	16082814
602	NC_003134	ACC	2	6	32784	32789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082814
603	NC_003134	CTG	2	6	32834	32839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082814
604	NC_003134	ATC	2	6	32860	32865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082814
605	NC_003134	ATG	2	6	33296	33301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082814
606	NC_003134	CAG	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082814
607	NC_003134	GGC	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082814
608	NC_003134	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16082814
609	NC_003134	TTA	2	6	33549	33554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082814
610	NC_003134	AATA	2	8	33575	33582	75 %	25 %	0 %	0 %	16082814
611	NC_003134	ACG	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082814
612	NC_003134	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	16082814
613	NC_003134	TCA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082815
614	NC_003134	GGC	2	6	33864	33869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082815
615	NC_003134	AGA	2	6	33942	33947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082815
616	NC_003134	TGG	2	6	34180	34185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082816
617	NC_003134	CATC	2	8	34225	34232	25 %	25 %	0 %	50 %	16082816
618	NC_003134	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	16082816
619	NC_003134	TTG	2	6	34309	34314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082816
620	NC_003134	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	16082817
621	NC_003134	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	16082817
622	NC_003134	GTC	2	6	34629	34634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082817
623	NC_003134	CAA	2	6	34638	34643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082817
624	NC_003134	TGCCC	2	10	34654	34663	0 %	20 %	20 %	60 %	16082817
625	NC_003134	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	16082817
626	NC_003134	GTC	2	6	34951	34956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082817
627	NC_003134	TAA	2	6	35004	35009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_003134	TTA	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_003134	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003134	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_003134	GAA	2	6	35174	35179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_003134	T	7	7	35182	35188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_003134	A	6	6	35199	35204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_003134	ATAA	3	12	35265	35276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_003134	A	6	6	36455	36460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_003134	TGTGGT	2	12	42685	42696	0 %	50 %	50 %	0 %	16082827
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763	NC_003134	ACA	2	6	43366	43371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_003134	AGA	2	6	43378	43383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
765	NC_003134	TAAG	2	8	43417	43424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
766	NC_003134	CGTCA	2	10	43478	43487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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