MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 1425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003131	TGT	2	6	46974	46979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003131	ATT	2	6	46997	47002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003131	CAG	2	6	47006	47011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_003131	GTG	2	6	47070	47075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003131	TTTA	2	8	47092	47099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003131	AATA	2	8	47108	47115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_003131	TAA	2	6	47131	47136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082755
1008	NC_003131	ATA	2	6	47198	47203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082755
1009	NC_003131	TCT	2	6	47237	47242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082755
1010	NC_003131	TCAT	2	8	47267	47274	25 %	50 %	0 %	25 %	16082755
1011	NC_003131	CATA	2	8	47379	47386	50 %	25 %	0 %	25 %	16082755
1012	NC_003131	CTG	2	6	47400	47405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082755
1013	NC_003131	T	6	6	47502	47507	0 %	100 %	0 %	0 %	16082755
1014	NC_003131	AAT	2	6	47625	47630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082755
1015	NC_003131	CCG	2	6	47861	47866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082755
1016	NC_003131	GTAA	2	8	47874	47881	50 %	25 %	25 %	0 %	16082755
1017	NC_003131	GGC	2	6	47928	47933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082755
1018	NC_003131	GC	4	8	47945	47952	0 %	0 %	50 %	50 %	16082755
1019	NC_003131	GT	3	6	48023	48028	0 %	50 %	50 %	0 %	16082755
1020	NC_003131	TGAATG	2	12	48118	48129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082755
1021	NC_003131	GAT	2	6	48131	48136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082755
1022	NC_003131	CTT	2	6	48254	48259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082755
1023	NC_003131	ATT	2	6	48268	48273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082755
1024	NC_003131	TCT	2	6	48314	48319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082755
1025	NC_003131	AAC	2	6	48328	48333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082755
1026	NC_003131	CT	3	6	48379	48384	0 %	50 %	0 %	50 %	16082755
1027	NC_003131	GCA	2	6	48431	48436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082755
1028	NC_003131	CT	3	6	48470	48475	0 %	50 %	0 %	50 %	16082755
1029	NC_003131	TGC	2	6	48476	48481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082755
1030	NC_003131	TTAA	2	8	48539	48546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003131	CTATA	2	10	48555	48564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_003131	A	6	6	48570	48575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003131	T	6	6	48578	48583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003131	TAT	2	6	48600	48605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003131	TAA	2	6	48608	48613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003131	ATT	2	6	48649	48654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003131	T	6	6	48669	48674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003131	AT	3	6	48690	48695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003131	T	6	6	48714	48719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003131	A	6	6	48720	48725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003131	AAT	2	6	48785	48790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003131	AGC	2	6	48839	48844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_003131	GCTG	2	8	48852	48859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_003131	CAG	2	6	48937	48942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_003131	AAC	2	6	48989	48994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_003131	CGGA	2	8	49018	49025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_003131	CGG	2	6	49080	49085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_003131	AGGCAC	2	12	49098	49109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_003131	GGTC	2	8	49241	49248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_003131	GAT	2	6	49263	49268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003131	CAGA	2	8	49326	49333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_003131	GGC	2	6	49528	49533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_003131	TTC	2	6	49559	49564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_003131	TCA	2	6	49601	49606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_003131	GGGA	2	8	49647	49654	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003131	CTG	2	6	49686	49691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_003131	T	6	6	49704	49709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003131	CTA	2	6	49835	49840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_003131	TAC	2	6	49877	49882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_003131	AAT	2	6	49895	49900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003131	TAA	2	6	49904	49909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003131	T	6	6	49966	49971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003131	CTTT	2	8	49976	49983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_003131	GAA	2	6	49995	50000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003131	ACC	2	6	50033	50038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_003131	AGC	2	6	50047	50052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_003131	CAGG	2	8	50119	50126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_003131	AGAA	2	8	50161	50168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003131	T	8	8	50326	50333	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
1070	NC_003131	AAC	2	6	50337	50342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082759
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1072	NC_003131	TAT	2	6	50486	50491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082759
1073	NC_003131	TC	4	8	50515	50522	0 %	50 %	0 %	50 %	16082759
1074	NC_003131	T	7	7	50532	50538	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
1075	NC_003131	CCA	2	6	50594	50599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082759
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1077	NC_003131	AAGATT	2	12	50853	50864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082759
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1080	NC_003131	AT	3	6	50960	50965	50 %	50 %	0 %	0 %	16082759
1081	NC_003131	ATTT	2	8	51051	51058	25 %	75 %	0 %	0 %	16082759
1082	NC_003131	ATTT	2	8	51076	51083	25 %	75 %	0 %	0 %	16082759
1083	NC_003131	GCA	2	6	51188	51193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_003131	TTG	2	6	51324	51329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_003131	TA	4	8	51356	51363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_003131	T	6	6	51369	51374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_003131	TAA	2	6	51389	51394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_003131	ATT	2	6	51402	51407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003131	AT	3	6	51442	51447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_003131	GTC	2	6	51516	51521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082760
1091	NC_003131	TC	3	6	51537	51542	0 %	50 %	0 %	50 %	16082760
1092	NC_003131	AGT	2	6	51591	51596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082760
1093	NC_003131	ATC	2	6	51626	51631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082760
1094	NC_003131	CCT	2	6	51646	51651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082760
1095	NC_003131	GCC	2	6	51672	51677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082760
1096	NC_003131	ATC	2	6	51678	51683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082760
1097	NC_003131	CTG	4	12	51827	51838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082760
1098	NC_003131	TGC	2	6	51852	51857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082760
1099	NC_003131	GC	3	6	51978	51983	0 %	0 %	50 %	50 %	16082760
1100	NC_003131	GT	3	6	52010	52015	0 %	50 %	50 %	0 %	16082760
1101	NC_003131	CGA	2	6	52054	52059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082760
1102	NC_003131	GAT	2	6	52081	52086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082760
1103	NC_003131	C	6	6	52209	52214	0 %	0 %	0 %	100 %	16082760
1104	NC_003131	CCA	2	6	52237	52242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082760
1105	NC_003131	C	8	8	52267	52274	0 %	0 %	0 %	100 %	16082760
1106	NC_003131	TGC	2	6	52292	52297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082760
1107	NC_003131	CTT	2	6	52340	52345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082760
1108	NC_003131	CTC	2	6	52424	52429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082760
1109	NC_003131	TGA	2	6	52516	52521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082760
1110	NC_003131	TGGAT	2	10	52563	52572	20 %	40 %	40 %	0 %	16082760
1111	NC_003131	GTT	2	6	52774	52779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082760
1112	NC_003131	AAC	2	6	52811	52816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082760
1113	NC_003131	TAC	2	6	52871	52876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082760
1114	NC_003131	GT	3	6	52996	53001	0 %	50 %	50 %	0 %	16082760
1115	NC_003131	AAC	2	6	53005	53010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082760
1116	NC_003131	CATC	2	8	53026	53033	25 %	25 %	0 %	50 %	16082760
1117	NC_003131	TCC	2	6	53043	53048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082760
1118	NC_003131	CAC	2	6	53066	53071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082760
1119	NC_003131	GCCAT	2	10	53073	53082	20 %	20 %	20 %	40 %	16082760
1120	NC_003131	GCT	2	6	53197	53202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082760
1121	NC_003131	TAT	2	6	53216	53221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082760
1122	NC_003131	TGGCT	2	10	53336	53345	0 %	40 %	40 %	20 %	16082760
1123	NC_003131	GT	3	6	53419	53424	0 %	50 %	50 %	0 %	16082760
1124	NC_003131	AG	3	6	53494	53499	50 %	0 %	50 %	0 %	16082760
1125	NC_003131	TCC	2	6	53558	53563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082760
1126	NC_003131	CTG	2	6	53727	53732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082761
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1128	NC_003131	TCG	2	6	53812	53817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082761
1129	NC_003131	TTC	2	6	53850	53855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082761
1130	NC_003131	A	7	7	53908	53914	100 %	0 %	0 %	0 %	16082761
1131	NC_003131	GCG	2	6	53923	53928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082761
1132	NC_003131	GC	3	6	53931	53936	0 %	0 %	50 %	50 %	16082761
1133	NC_003131	TCA	2	6	53992	53997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082761
1134	NC_003131	ATA	2	6	54007	54012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082761
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1148	NC_003131	CAG	2	6	54688	54693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1152	NC_003131	GGT	2	6	55027	55032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_003131	TGA	2	6	55040	55045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_003131	TGC	2	6	55142	55147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1167	NC_003131	TGT	2	6	55825	55830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1173	NC_003131	AAG	2	6	55999	56004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_003131	A	6	6	62008	62013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_003131	AT	3	6	62055	62060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_003131	AATCG	2	10	62079	62088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1269	NC_003131	ATA	2	6	62143	62148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_003131	A	9	9	62150	62158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_003131	CCTCA	2	10	62161	62170	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1273	NC_003131	A	7	7	62227	62233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1278	NC_003131	A	7	7	62323	62329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_003131	CTC	2	6	68936	68941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1404	NC_003131	GCT	2	6	69014	69019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082779
1405	NC_003131	GGA	2	6	69062	69067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082779
1406	NC_003131	CAG	2	6	69070	69075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082779
1407	NC_003131	CGAT	2	8	69134	69141	25 %	25 %	25 %	25 %	16082779
1408	NC_003131	T	6	6	69289	69294	0 %	100 %	0 %	0 %	16082779
1409	NC_003131	GCC	2	6	69296	69301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082779
1410	NC_003131	CAG	2	6	69307	69312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082779
1411	NC_003131	CAG	2	6	69355	69360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082779
1412	NC_003131	CTC	2	6	69387	69392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082780
1413	NC_003131	GTG	2	6	69447	69452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082780
1414	NC_003131	GCCA	2	8	69467	69474	25 %	0 %	25 %	50 %	16082780
1415	NC_003131	CTG	2	6	69507	69512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082780
1416	NC_003131	GCC	2	6	69603	69608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082780
1417	NC_003131	ACCTT	2	10	69865	69874	20 %	40 %	0 %	40 %	16082780
1418	NC_003131	GCGG	2	8	69890	69897	0 %	0 %	75 %	25 %	16082780
1419	NC_003131	CAA	2	6	69930	69935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082780
1420	NC_003131	GTT	2	6	69966	69971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082780
1421	NC_003131	GCC	2	6	70023	70028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082780
1422	NC_003131	GT	3	6	70063	70068	0 %	50 %	50 %	0 %	16082780
1423	NC_003131	GTA	2	6	70266	70271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082780
1424	NC_003131	GCA	2	6	70274	70279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082780
1425	NC_003131	CGCC	2	8	70285	70292	0 %	0 %	25 %	75 %	16082780

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