MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017562	TCA	2	6	741952	741957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017562	GAC	2	6	741959	741964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017562	TCG	2	6	742023	742028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017562	TGC	2	6	742072	742077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017562	GCT	2	6	742078	742083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017562	CGG	2	6	742133	742138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017562	ACG	2	6	742159	742164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017562	T	6	6	742168	742173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017562	GCA	2	6	742203	742208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017562	GAT	2	6	744618	744623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017562	TCT	2	6	744652	744657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017562	GGATC	2	10	744702	744711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_017562	TGC	2	6	744744	744749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017562	TGC	2	6	744786	744791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017562	GCGCC	2	10	744804	744813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4016	NC_017562	GCA	2	6	746705	746710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017562	CCA	2	6	746759	746764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_017562	GAGC	2	8	746773	746780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_017562	CTG	2	6	746856	746861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017562	TGA	2	6	746871	746876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017562	TCA	2	6	746945	746950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017562	GC	3	6	746970	746975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_017562	TAA	2	6	751687	751692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017562	AAT	2	6	751727	751732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017562	CAC	2	6	751835	751840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_017562	CAC	2	6	751915	751920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_017562	GGC	2	6	751935	751940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017562	GC	3	6	751953	751958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_017562	A	7	7	751963	751969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017562	ACCTTG	2	12	751989	752000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017562	GCC	2	6	752016	752021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_017562	AG	3	6	752179	752184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017562	GGC	2	6	752198	752203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017562	ATG	2	6	752217	752222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017562	CGG	3	9	752233	752241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017562	GCGAT	2	10	754751	754760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_017562	CCT	2	6	754783	754788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_017562	CAC	2	6	754826	754831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_017562	AC	3	6	754833	754838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_017562	CA	3	6	754874	754879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_017562	CCA	2	6	754885	754890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_017562	CA	3	6	754924	754929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_017562	AGG	2	6	754983	754988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017562	TGA	2	6	755008	755013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017562	TGG	2	6	756137	756142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017562	CGG	3	9	756144	756152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017562	CA	3	6	757613	757618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_017562	ATC	2	6	758638	758643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017562	CAAG	2	8	758650	758657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_017562	CA	3	6	758819	758824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_017562	AC	4	8	758842	758849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_017562	CTG	2	6	759275	759280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017562	AGGA	2	8	760046	760053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017562	TGC	2	6	760101	760106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017562	ATC	2	6	761434	761439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017562	CAGC	2	8	761518	761525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_017562	AAG	2	6	761545	761550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017562	CTG	2	6	761612	761617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017562	CTT	2	6	762651	762656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017562	CCCTA	2	10	762676	762685	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4061	NC_017562	AAC	2	6	762774	762779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017562	AC	3	6	762798	762803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_017562	CAC	2	6	762813	762818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_017562	CAC	2	6	762823	762828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_017562	AC	3	6	762827	762832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_017562	CCA	2	6	762849	762854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_017562	AC	4	8	762857	762864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_017562	CT	3	6	762870	762875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_017562	AGA	2	6	762887	762892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017562	CCAGTG	2	12	762906	762917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017562	AGCA	2	8	763010	763017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_017562	GCA	2	6	763055	763060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017562	CATC	2	8	763067	763074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_017562	CAT	2	6	763107	763112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017562	CAAG	2	8	763113	763120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_017562	ACC	2	6	763123	763128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_017562	CAC	2	6	763150	763155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_017562	CA	3	6	763176	763181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_017562	A	7	7	763288	763294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017562	TCT	2	6	763331	763336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017562	CTA	2	6	763365	763370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017562	AC	3	6	763427	763432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_017562	GCA	2	6	764966	764971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_017562	GACA	2	8	764972	764979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_017562	CAT	2	6	764982	764987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017562	TCA	2	6	764995	765000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017562	ACA	2	6	765002	765007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017562	GCA	2	6	765045	765050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017562	CCA	2	6	765074	765079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_017562	TCA	2	6	765109	765114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017562	CAA	2	6	765132	765137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017562	CAA	2	6	765146	765151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017562	CAA	3	9	765156	765164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017562	AC	3	6	765262	765267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_017562	AC	3	6	765279	765284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_017562	GC	3	6	765297	765302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_017562	CCG	2	6	765317	765322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_017562	CCG	2	6	765358	765363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_017562	TCAC	2	8	766621	766628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_017562	AC	3	6	766657	766662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_017562	CCT	2	6	766692	766697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017562	CA	3	6	766716	766721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_017562	CAT	2	6	766731	766736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017562	CCA	3	9	766769	766777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_017562	ACC	2	6	766805	766810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_017562	CGG	2	6	766856	766861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017562	AAG	2	6	769109	769114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017562	CAC	2	6	769121	769126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_017562	A	6	6	770993	770998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017562	CCA	2	6	771074	771079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_017562	CGA	2	6	771083	771088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017562	GGA	2	6	771090	771095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017562	AGA	2	6	771105	771110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017562	CCCT	2	8	771117	771124	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4115	NC_017562	GCG	2	6	773091	773096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017562	CAAT	2	8	773100	773107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_017562	GAT	2	6	773130	773135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017562	CCT	2	6	773159	773164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_017562	AAC	2	6	773173	773178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017562	CAG	2	6	773380	773385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017562	TTCA	2	8	773404	773411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_017562	CGC	2	6	773439	773444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_017562	CCT	2	6	773447	773452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_017562	TGC	2	6	773489	773494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017562	TCA	2	6	773510	773515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017562	TCTCGG	2	12	773523	773534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017562	CAT	2	6	776500	776505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017562	GAATC	2	10	776577	776586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4129	NC_017562	TCA	2	6	776623	776628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017562	GAG	2	6	776645	776650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017562	GAA	2	6	776678	776683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017562	CAA	2	6	776707	776712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4134	NC_017562	AGC	3	9	776807	776815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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