MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017562	CAAT	2	8	592819	592826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_017562	CATG	2	8	594069	594076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_017562	CAA	2	6	594182	594187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017562	TTC	2	6	594220	594225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017562	T	6	6	594307	594312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017562	AGA	2	6	594331	594336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017562	CACC	2	8	594352	594359	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3008	NC_017562	GCA	2	6	594398	594403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017562	CAA	2	6	594426	594431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017562	TGC	2	6	594445	594450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017562	AACG	2	8	594531	594538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_017562	AG	3	6	594552	594557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017562	CGCAC	2	10	594604	594613	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3014	NC_017562	AGA	2	6	597252	597257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017562	CTA	2	6	597297	597302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017562	CGA	2	6	599570	599575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017562	AGG	2	6	599644	599649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017562	AAT	2	6	599729	599734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017562	ATCA	2	8	599863	599870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_017562	GT	4	8	599873	599880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017562	AGC	2	6	599912	599917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017562	CAAT	2	8	599927	599934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_017562	GAT	2	6	600207	600212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017562	TGA	2	6	600232	600237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017562	CTA	2	6	600338	600343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_017562	TCA	2	6	600353	600358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017562	AAG	2	6	600396	600401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017562	ATG	2	6	600413	600418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017562	TCCCC	2	10	600428	600437	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3030	NC_017562	TGG	2	6	600463	600468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017562	C	6	6	600513	600518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3032	NC_017562	TCT	2	6	600536	600541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017562	GGCA	2	8	600567	600574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_017562	TCA	2	6	600658	600663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017562	ACA	2	6	600707	600712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017562	TGC	2	6	600781	600786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017562	TGA	2	6	600837	600842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017562	TGC	2	6	602575	602580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017562	AAAT	2	8	602626	602633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017562	TGA	2	6	602665	602670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017562	GAT	2	6	602711	602716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017562	A	6	6	602727	602732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017562	ATC	2	6	602754	602759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017562	TCA	2	6	602789	602794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_017562	GCAC	2	8	602806	602813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_017562	A	8	8	602823	602830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017562	CATT	2	8	602896	602903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_017562	ACTTC	2	10	602984	602993	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3049	NC_017562	GTCA	2	8	602994	603001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_017562	ACA	2	6	603048	603053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017562	CATGCA	3	18	603054	603071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017562	ACA	2	6	603111	603116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017562	ATAA	2	8	603125	603132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017562	CAG	2	6	603179	603184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017562	A	7	7	603213	603219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017562	CAA	2	6	603223	603228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017562	AAG	2	6	603253	603258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017562	CCT	2	6	603294	603299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_017562	AAG	2	6	603305	603310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017562	CCA	2	6	603334	603339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_017562	A	6	6	603619	603624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017562	CAAAA	2	10	603711	603720	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_017562	GAAG	2	8	603735	603742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017562	A	6	6	603817	603822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017562	T	6	6	603884	603889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017562	AAG	2	6	603890	603895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017562	AT	3	6	603933	603938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017562	GAG	2	6	603958	603963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017562	GCC	2	6	604046	604051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_017562	GT	3	6	604056	604061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017562	CTG	2	6	604066	604071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017562	CAT	2	6	604087	604092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017562	ACA	2	6	604101	604106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017562	T	6	6	604117	604122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017562	CTG	2	6	604167	604172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017562	AGAA	2	8	605330	605337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017562	A	6	6	605336	605341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017562	TCT	2	6	605354	605359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017562	GC	3	6	605436	605441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_017562	TTGC	2	8	605444	605451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_017562	CTA	2	6	605567	605572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017562	TCT	2	6	605597	605602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_017562	CTA	2	6	605976	605981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017562	TAA	3	9	605994	606002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017562	AAAT	2	8	606003	606010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017562	AT	3	6	606022	606027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017562	AATG	2	8	606230	606237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017562	ACT	2	6	606811	606816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017562	TGC	2	6	606844	606849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017562	CAA	2	6	606906	606911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_017562	A	6	6	607066	607071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017562	ACC	2	6	607112	607117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_017562	AGCG	2	8	607134	607141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_017562	TCG	2	6	609967	609972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017562	GTTGT	2	10	610017	610026	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017562	TTCA	2	8	610028	610035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_017562	ATGCAA	2	12	610045	610056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3098	NC_017562	TGA	2	6	610117	610122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017562	TAT	2	6	610639	610644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017562	TAA	2	6	610654	610659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017562	CATC	2	8	610733	610740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_017562	A	6	6	610766	610771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017562	AT	3	6	610837	610842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017562	TAT	3	9	610840	610848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017562	ATC	2	6	610892	610897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_017562	GAA	2	6	610899	610904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017562	GTT	2	6	610909	610914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017562	GGCA	2	8	611155	611162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_017562	GCA	2	6	611208	611213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017562	CA	3	6	611443	611448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_017562	AAG	2	6	611460	611465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017562	ACT	2	6	611626	611631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_017562	TGC	2	6	611671	611676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017562	TCA	2	6	611690	611695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017562	T	6	6	611736	611741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017562	ATCT	2	8	611758	611765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_017562	AGC	2	6	612174	612179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017562	TG	3	6	612218	612223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017562	CAA	2	6	612225	612230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017562	CGC	2	6	612273	612278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_017562	CTT	3	9	612293	612301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017562	CATC	2	8	612339	612346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_017562	GAT	2	6	612460	612465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017562	TCC	2	6	612468	612473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017562	AAG	2	6	612497	612502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017562	A	6	6	612519	612524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017562	CGC	2	6	612537	612542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_017562	CCT	2	6	612551	612556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_017562	TGG	2	6	612720	612725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017562	T	6	6	612733	612738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017562	GTC	2	6	612760	612765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_017562	GC	3	6	612800	612805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_017562	CAT	2	6	612843	612848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_017562	ATA	2	6	612864	612869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017562	TTA	2	6	612894	612899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017562	GCTAT	2	10	613506	613515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3137	NC_017562	CTG	2	6	614081	614086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_017562	GTT	2	6	614820	614825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_017562	ATT	2	6	615452	615457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_017562	TGA	2	6	642281	642286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3254	NC_017562	CCA	2	6	643018	643023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3255	NC_017562	GCC	2	6	643063	643068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3257	NC_017562	CAACT	2	10	643107	643116	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3260	NC_017562	AAG	2	6	643182	643187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_017562	AATC	2	8	643208	643215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3262	NC_017562	TCA	2	6	643222	643227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_017562	TAA	2	6	643259	643264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_017562	ATAG	2	8	643269	643276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_017562	CCA	2	6	643281	643286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3408	NC_017562	AC	3	6	674302	674307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3409	NC_017562	CGAAT	2	10	674340	674349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3410	NC_017562	CCAA	2	8	674365	674372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3411	NC_017562	AC	3	6	674413	674418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3412	NC_017562	CAA	2	6	674515	674520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3414	NC_017562	A	6	6	674562	674567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3424	NC_017562	AAT	2	6	674896	674901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3443	NC_017562	CAA	2	6	677151	677156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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