MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017562	TGC	2	6	405611	405616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_017562	CA	3	6	405676	405681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_017562	CT	3	6	405684	405689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2004	NC_017562	ACCCT	2	10	405762	405771	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2005	NC_017562	GCA	2	6	405783	405788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_017562	TCA	3	9	407090	407098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_017562	AAG	2	6	407116	407121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_017562	CAT	2	6	407132	407137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_017562	ATG	3	9	407164	407172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_017562	CAT	2	6	407258	407263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_017562	CT	3	6	407295	407300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2012	NC_017562	TGC	2	6	407442	407447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_017562	CATT	2	8	407494	407501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2014	NC_017562	A	7	7	409813	409819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_017562	CA	3	6	409858	409863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_017562	AGC	3	9	409888	409896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_017562	GACG	2	8	409907	409914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2018	NC_017562	TGC	2	6	410038	410043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_017562	CCA	2	6	410066	410071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_017562	ACC	2	6	410094	410099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2021	NC_017562	CCAG	2	8	410159	410166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2022	NC_017562	ATC	2	6	410234	410239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_017562	CCA	2	6	410301	410306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2024	NC_017562	T	7	7	410353	410359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_017562	CA	3	6	410385	410390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_017562	ACTG	2	8	410430	410437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2027	NC_017562	CTG	2	6	410491	410496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2028	NC_017562	TCC	2	6	411765	411770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2029	NC_017562	AAC	2	6	412591	412596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_017562	TCA	2	6	412601	412606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_017562	AC	3	6	412629	412634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2032	NC_017562	TAA	2	6	413662	413667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_017562	CTA	2	6	413673	413678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_017562	GCT	2	6	413818	413823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_017562	ACA	2	6	413824	413829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_017562	GAT	2	6	414036	414041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_017562	CAAC	2	8	414062	414069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2038	NC_017562	CATC	2	8	414080	414087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_017562	A	6	6	414195	414200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_017562	ACC	2	6	414225	414230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2041	NC_017562	GAC	2	6	414232	414237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_017562	CAT	2	6	414301	414306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_017562	TATTT	2	10	414697	414706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_017562	A	6	6	414762	414767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_017562	ACC	2	6	414777	414782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2046	NC_017562	AAC	2	6	414840	414845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_017562	CT	3	6	414876	414881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_017562	TAAA	2	8	414930	414937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_017562	CAA	2	6	414951	414956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_017562	CAT	2	6	414959	414964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_017562	AC	3	6	414993	414998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_017562	TGA	2	6	415004	415009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_017562	AGC	2	6	415048	415053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_017562	GAA	2	6	416105	416110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_017562	GCCAC	2	10	416116	416125	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2056	NC_017562	GCA	2	6	416180	416185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_017562	AC	3	6	417007	417012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2058	NC_017562	AGA	2	6	417080	417085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_017562	GCC	2	6	420174	420179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_017562	C	11	11	420195	420205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2061	NC_017562	CCACA	2	10	421263	421272	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2062	NC_017562	CAC	2	6	421273	421278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2063	NC_017562	CTG	2	6	421289	421294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_017562	CAA	2	6	421323	421328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_017562	CTTG	2	8	421337	421344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2066	NC_017562	AAT	2	6	421351	421356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_017562	CATTG	2	10	421435	421444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2068	NC_017562	CAA	2	6	421460	421465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_017562	AC	4	8	421485	421492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2070	NC_017562	ACCA	2	8	421502	421509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2071	NC_017562	CTC	2	6	421567	421572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2072	NC_017562	ACC	2	6	422269	422274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2073	NC_017562	CCT	2	6	423910	423915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2074	NC_017562	AGAC	2	8	423921	423928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2075	NC_017562	T	6	6	423931	423936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_017562	CAA	2	6	423945	423950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_017562	ACAA	2	8	423953	423960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2078	NC_017562	CAC	2	6	423978	423983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2079	NC_017562	CAC	2	6	423991	423996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2080	NC_017562	ATG	2	6	424016	424021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_017562	AC	3	6	424058	424063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2082	NC_017562	CCACA	2	10	424120	424129	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2083	NC_017562	GCA	2	6	424133	424138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_017562	GCT	2	6	424178	424183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2085	NC_017562	TGA	2	6	424254	424259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2088	NC_017562	ACCT	2	8	424365	424372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2089	NC_017562	GTT	2	6	424380	424385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_017562	ACA	2	6	424405	424410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_017562	CA	3	6	424412	424417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2092	NC_017562	TAA	2	6	425104	425109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_017562	CCT	2	6	425111	425116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2094	NC_017562	AAC	2	6	425123	425128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_017562	CA	3	6	425143	425148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2096	NC_017562	ACACC	2	10	425192	425201	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2097	NC_017562	CAA	2	6	425211	425216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_017562	CGC	2	6	425225	425230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2099	NC_017562	AATC	2	8	425247	425254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2100	NC_017562	AC	3	6	425270	425275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2101	NC_017562	GCA	2	6	425297	425302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_017562	ATC	2	6	425372	425377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2104	NC_017562	CAT	2	6	425589	425594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_017562	AGA	2	6	425631	425636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_017562	ACTC	2	8	425652	425659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2107	NC_017562	CAA	2	6	425674	425679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_017562	AAC	2	6	425698	425703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_017562	GTAGA	2	10	425749	425758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_017562	CAA	2	6	425764	425769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_017562	AC	3	6	425779	425784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2112	NC_017562	CTA	2	6	425807	425812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_017562	GGGC	3	12	427981	427992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2114	NC_017562	TCA	2	6	428013	428018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_017562	CAAA	2	8	428069	428076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2116	NC_017562	A	6	6	428368	428373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_017562	CTC	2	6	428389	428394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2118	NC_017562	TAC	2	6	428438	428443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_017562	GAA	2	6	428516	428521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_017562	ACA	2	6	428527	428532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_017562	ACGCA	2	10	428573	428582	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2122	NC_017562	ACC	2	6	428583	428588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2123	NC_017562	TATG	2	8	428659	428666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_017562	GCA	2	6	428697	428702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2127	NC_017562	AC	3	6	428847	428852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2128	NC_017562	CCT	2	6	428863	428868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_017562	ACA	2	6	428895	428900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_017562	TTCA	2	8	428933	428940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2131	NC_017562	A	6	6	429001	429006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_017562	CACAT	2	10	429046	429055	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2133	NC_017562	TGGA	2	8	429684	429691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_017562	CCT	2	6	429707	429712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2135	NC_017562	GGC	2	6	429721	429726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_017562	CACAA	2	10	429735	429744	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2137	NC_017562	CAT	3	9	429782	429790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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