MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017562	ATC	2	6	199145	199150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017562	CACGCA	2	12	199177	199188	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_017562	CAG	2	6	199276	199281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017562	AAT	2	6	199352	199357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017562	CCG	2	6	199368	199373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_017562	CTG	2	6	199388	199393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017562	TCT	2	6	199467	199472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017562	CTT	2	6	199546	199551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017562	CAC	2	6	199585	199590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017562	GC	5	10	199599	199608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_017562	CGTAT	2	10	199703	199712	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_017562	GCC	2	6	199769	199774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_017562	GGT	2	6	199806	199811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017562	CGA	2	6	199826	199831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017562	T	6	6	199837	199842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017562	ATC	2	6	199846	199851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017562	GTA	2	6	199885	199890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017562	GTT	2	6	199924	199929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017562	AG	3	6	199958	199963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017562	T	6	6	200049	200054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017562	AAC	2	6	202090	202095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017562	CGCC	2	8	202638	202645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_017562	CAACCC	2	12	202647	202658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017562	GCC	2	6	202671	202676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017562	CCAT	2	8	202687	202694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017562	TCA	2	6	202702	202707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017562	CGG	2	6	203824	203829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017562	T	6	6	203877	203882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017562	CAC	2	6	205675	205680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017562	ATC	2	6	206202	206207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017562	TCC	2	6	206253	206258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_017562	ATA	2	6	207338	207343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017562	AAC	2	6	207415	207420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017562	CAT	2	6	207986	207991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017562	CAA	2	6	208003	208008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017562	ATTT	2	8	208034	208041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017562	A	6	6	208063	208068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017562	TAA	3	9	208101	208109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017562	GCC	2	6	208124	208129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_017562	CAT	2	6	210172	210177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017562	TTTG	2	8	210200	210207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017562	ACA	2	6	210237	210242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017562	CATA	2	8	210250	210257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_017562	T	6	6	210289	210294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017562	AAT	2	6	210315	210320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017562	ATCA	2	8	210340	210347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_017562	TAA	2	6	210350	210355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017562	TTA	2	6	210359	210364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017562	AAC	2	6	210388	210393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017562	AGT	2	6	210397	210402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017562	T	6	6	210409	210414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017562	AAT	2	6	210439	210444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017562	AGCA	2	8	210523	210530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_017562	TTA	2	6	210534	210539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017562	A	6	6	210554	210559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017562	TTC	2	6	210598	210603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017562	AAAC	2	8	210616	210623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_017562	ATC	2	6	210655	210660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017562	CA	3	6	210677	210682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_017562	ATA	2	6	210750	210755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017562	AACAC	2	10	210756	210765	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1062	NC_017562	CAAAAT	2	12	210847	210858	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1063	NC_017562	CAAC	2	8	210920	210927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017562	AACT	2	8	210988	210995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_017562	T	6	6	211142	211147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017562	CA	4	8	211150	211157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017562	AAAT	2	8	212836	212843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017562	CCAA	2	8	212887	212894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_017562	AGC	2	6	212923	212928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017562	ACG	2	6	212938	212943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017562	CAG	2	6	212952	212957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017562	AC	3	6	212986	212991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_017562	CA	3	6	213028	213033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_017562	CAA	2	6	213036	213041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017562	CAC	2	6	213042	213047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_017562	CAG	2	6	213060	213065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017562	TCA	2	6	213077	213082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017562	A	6	6	213084	213089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017562	CAT	2	6	213189	213194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017562	GCA	2	6	213211	213216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017562	TGCC	2	8	213218	213225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_017562	ACGC	2	8	213263	213270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_017562	TCC	2	6	213298	213303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_017562	CAG	2	6	213350	213355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017562	CGC	2	6	213387	213392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_017562	CAC	2	6	213393	213398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_017562	ATC	2	6	213405	213410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017562	ACC	2	6	213457	213462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_017562	CAC	2	6	213482	213487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_017562	GCC	2	6	213541	213546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_017562	TACA	2	8	213558	213565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_017562	TGG	2	6	213585	213590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017562	CCT	2	6	213632	213637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_017562	CAA	2	6	213648	213653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017562	CGCAG	2	10	213676	213685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_017562	ACA	2	6	213731	213736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017562	CCT	2	6	213773	213778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_017562	CGT	2	6	213789	213794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017562	CAA	2	6	213868	213873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017562	GC	3	6	213882	213887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017562	CCA	2	6	213914	213919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017562	TAC	2	6	213927	213932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017562	AC	3	6	213948	213953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_017562	AACA	2	8	213959	213966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_017562	CAC	2	6	213970	213975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017562	ACA	2	6	213977	213982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017562	CA	3	6	213996	214001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017562	CCA	2	6	215966	215971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_017562	ATCC	2	8	215979	215986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_017562	A	6	6	215991	215996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017562	AAC	2	6	216002	216007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017562	TGT	2	6	216008	216013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017562	AAAT	2	8	216016	216023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017562	AG	3	6	216043	216048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017562	ACAT	2	8	216055	216062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_017562	AGC	2	6	216089	216094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017562	C	6	6	216828	216833	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1118	NC_017562	A	9	9	216886	216894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017562	TAT	2	6	216896	216901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017562	AC	3	6	216912	216917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_017562	ATAA	2	8	216986	216993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017562	A	6	6	216992	216997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017562	ATC	2	6	217826	217831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017562	AC	3	6	217860	217865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_017562	CAC	2	6	217916	217921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017562	AAT	2	6	217923	217928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017562	ACA	2	6	218946	218951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017562	A	6	6	218969	218974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017562	CAC	2	6	218982	218987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_017562	AATGA	2	10	219007	219016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017562	ACG	2	6	219025	219030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017562	GCTC	2	8	219144	219151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_017562	A	7	7	219187	219193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017562	CTC	2	6	219230	219235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_017562	AGA	2	6	219245	219250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017562	AGA	2	6	219253	219258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017562	GAA	2	6	219266	219271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017562	ACG	2	6	219304	219309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1140	NC_017562	CATA	2	8	219414	219421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1141	NC_017562	CA	3	6	219432	219437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_017562	CGCA	2	8	219454	219461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1150	NC_017562	AAC	2	6	219809	219814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1159	NC_017562	ACC	2	6	220114	220119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1246	NC_017562	ATTT	2	8	229086	229093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_017562	T	7	7	229099	229105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_017562	AAAT	2	8	229353	229360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_017562	TTA	2	6	229375	229380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_017562	ACA	2	6	230783	230788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_017562	A	8	8	230801	230808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_017562	GCA	2	6	231076	231081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_017562	GCAC	2	8	231105	231112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1267	NC_017562	AAAT	2	8	231188	231195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_017562	CAA	2	6	231223	231228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_017562	GCT	2	6	231948	231953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_017562	A	6	6	232018	232023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_017562	ACA	2	6	232076	232081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_017562	TCA	2	6	232088	232093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_017562	CAT	2	6	232097	232102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NC_017562	ACA	2	6	233538	233543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_017562	GTTG	2	8	233563	233570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1282	NC_017562	A	6	6	233855	233860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1283	NC_017562	CTG	2	6	233881	233886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1308	NC_017562	TCA	2	6	235753	235758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1392	NC_017562	G	6	6	271790	271795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1393	NC_017562	GTCA	2	8	272149	272156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1399	NC_017562	CCT	2	6	272450	272455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1400	NC_017562	ACC	2	6	272491	272496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1401	NC_017562	TTG	2	6	272611	272616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_017562	AAG	2	6	272653	272658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_017562	CAC	2	6	272676	272681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1404	NC_017562	ATC	2	6	272763	272768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_017562	ACG	2	6	272773	272778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_017562	CGA	2	6	272786	272791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_017562	CTG	2	6	272970	272975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_017562	GCAC	2	8	273076	273083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1410	NC_017562	TTC	2	6	273085	273090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_017562	GCT	2	6	273104	273109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_017562	GAA	2	6	274347	274352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_017562	GTC	2	6	274364	274369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_017562	GTA	2	6	274424	274429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_017562	TTC	2	6	274478	274483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_017562	AAG	2	6	274557	274562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_017562	GAT	3	9	274819	274827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_017562	AGG	2	6	274896	274901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_017562	ATG	2	6	274929	274934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_017562	GA	3	6	275038	275043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_017562	CCAT	2	8	275116	275123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_017562	CATTG	2	10	275130	275139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1480	NC_017562	GGCAC	2	10	276612	276621	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1499	NC_017562	GCT	2	6	277477	277482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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