MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017562	GAT	2	6	1112117	1112122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017562	CGG	2	6	1112134	1112139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_017562	CCAG	2	8	1112140	1112147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_017562	TGGGTC	2	12	1112175	1112186	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6005	NC_017562	GTT	2	6	1112198	1112203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017562	TTG	2	6	1112234	1112239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017562	GCTGG	2	10	1112262	1112271	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6008	NC_017562	G	6	6	1112290	1112295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017562	GGC	2	6	1112306	1112311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_017562	GTT	2	6	1112326	1112331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017562	CCA	2	6	1112353	1112358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_017562	GATGG	2	10	1112420	1112429	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017562	AGGC	2	8	1112430	1112437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_017562	CCG	2	6	1112478	1112483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_017562	G	6	6	1112606	1112611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017562	GAA	2	6	1112662	1112667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017562	GGA	2	6	1112682	1112687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017562	GGATGT	2	12	1112695	1112706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017562	G	7	7	1112735	1112741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017562	G	6	6	1112744	1112749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017562	AGG	2	6	1112788	1112793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017562	TG	3	6	1112795	1112800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017562	T	6	6	1112805	1112810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017562	T	6	6	1112833	1112838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017562	GT	3	6	1112866	1112871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017562	T	7	7	1112874	1112880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017562	T	8	8	1112898	1112905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017562	G	6	6	1112906	1112911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017562	GGT	2	6	1112964	1112969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017562	G	6	6	1113013	1113018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017562	G	6	6	1113020	1113025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017562	TGC	2	6	1113062	1113067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_017562	TCGGT	2	10	1113087	1113096	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6034	NC_017562	CGG	2	6	1113130	1113135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017562	TGC	3	9	1113249	1113257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017562	GGT	2	6	1113260	1113265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017562	CCA	3	9	1113270	1113278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_017562	GTTGG	2	10	1113284	1113293	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017562	GT	3	6	1113301	1113306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017562	GTTT	2	8	1113382	1113389	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017562	A	6	6	1113398	1113403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017562	TGC	2	6	1113466	1113471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017562	TTC	2	6	1113509	1113514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_017562	ATC	2	6	1117606	1117611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_017562	ACC	2	6	1117635	1117640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_017562	CAT	2	6	1117683	1117688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017562	CAT	2	6	1117716	1117721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_017562	CG	3	6	1117820	1117825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_017562	CAAC	2	8	1117880	1117887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_017562	CACC	2	8	1117936	1117943	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6051	NC_017562	TCTT	2	8	1117959	1117966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_017562	CAT	2	6	1117976	1117981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017562	GCT	2	6	1118026	1118031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017562	CAAT	2	8	1118194	1118201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_017562	CAA	2	6	1118227	1118232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_017562	GACC	2	8	1118284	1118291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_017562	CGT	2	6	1118306	1118311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_017562	TAA	2	6	1118384	1118389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017562	A	6	6	1118430	1118435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017562	ACC	3	9	1118459	1118467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_017562	CAT	2	6	1118488	1118493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_017562	ACC	2	6	1118525	1118530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_017562	CG	3	6	1118585	1118590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_017562	TAGGTA	2	12	1118602	1118613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017562	GCT	2	6	1118809	1118814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_017562	GAA	2	6	1118818	1118823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_017562	AGT	2	6	1118870	1118875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017562	ATC	2	6	1118897	1118902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_017562	TAA	2	6	1118954	1118959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017562	CAG	2	6	1118962	1118967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_017562	GTT	2	6	1119009	1119014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017562	AGC	2	6	1119038	1119043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_017562	AATT	2	8	1119047	1119054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017562	CTCCAA	2	12	1119107	1119118	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_017562	ATTTTT	2	12	1119167	1119178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_017562	ATCC	2	8	1119185	1119192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_017562	TTTA	2	8	1119294	1119301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_017562	GAA	2	6	1119319	1119324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_017562	GCA	2	6	1119327	1119332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_017562	ATA	2	6	1119643	1119648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017562	CAAA	2	8	1119658	1119665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_017562	TTAA	2	8	1119757	1119764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017562	ACG	2	6	1119791	1119796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_017562	ACGCTT	2	12	1119854	1119865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_017562	GCT	2	6	1120063	1120068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_017562	CAT	2	6	1120073	1120078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_017562	TGA	2	6	1120113	1120118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_017562	CCA	2	6	1120172	1120177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_017562	ACA	2	6	1121633	1121638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_017562	A	7	7	1121658	1121664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017562	ACC	4	12	1121670	1121681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_017562	GTA	2	6	1121784	1121789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017562	TAA	2	6	1121827	1121832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017562	TAA	2	6	1122972	1122977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017562	TTTA	2	8	1122978	1122985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_017562	TGT	2	6	1123008	1123013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017562	ATG	2	6	1123029	1123034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017562	TTA	2	6	1123053	1123058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017562	TCA	2	6	1123070	1123075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017562	TTC	2	6	1123076	1123081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_017562	GTT	2	6	1123165	1123170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017562	TTTC	2	8	1123184	1123191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_017562	T	6	6	1123208	1123213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017562	ATT	2	6	1124404	1124409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017562	AT	3	6	1124450	1124455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017562	T	6	6	1124460	1124465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017562	AGAA	2	8	1124495	1124502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017562	TCA	2	6	1127322	1127327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017562	CAGT	2	8	1127414	1127421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_017562	TGG	2	6	1127463	1127468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017562	ATTG	2	8	1127470	1127477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017562	GTT	3	9	1127494	1127502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017562	TGA	2	6	1127530	1127535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017562	CAT	2	6	1127540	1127545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_017562	GC	3	6	1127546	1127551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_017562	T	7	7	1127609	1127615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017562	GC	3	6	1127698	1127703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_017562	TTTG	2	8	1127709	1127716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017562	TCG	2	6	1127726	1127731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_017562	ATT	2	6	1127757	1127762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017562	GT	3	6	1127771	1127776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017562	ATT	2	6	1127890	1127895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017562	TAC	2	6	1127976	1127981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_017562	GAA	2	6	1128065	1128070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017562	TGA	2	6	1128102	1128107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017562	A	6	6	1128107	1128112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017562	GTG	2	6	1128195	1128200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017562	CTG	2	6	1129050	1129055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_017562	GGT	2	6	1129083	1129088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017562	CTG	2	6	1129099	1129104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_017562	TTTA	2	8	1130341	1130348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017562	TAC	2	6	1130381	1130386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_017562	T	6	6	1130470	1130475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_017562	CAAT	2	8	1130477	1130484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6135	NC_017562	TGG	2	6	1130544	1130549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6141	NC_017562	CGC	4	12	1130856	1130867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6153	NC_017562	CTG	2	6	1131284	1131289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6262	NC_017562	GTT	2	6	1150642	1150647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6266	NC_017562	CTT	2	6	1150802	1150807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6392	NC_017562	CGA	2	6	1162035	1162040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6393	NC_017562	AGC	2	6	1162043	1162048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6394	NC_017562	AGG	2	6	1162067	1162072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6395	NC_017562	TTG	2	6	1162102	1162107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6396	NC_017562	ACC	2	6	1162185	1162190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6423	NC_017562	GATA	2	8	1163718	1163725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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